Методы нуклеиновых кислот
(Перенаправлено с Молекулярные инструменты для изучения генов )
Нуклеиновые методы — это методы, используемые для изучения нуклеиновых кислот : ДНК и РНК .
Очистка
[ редактировать ]- экстракция ДНК
- Фенол-хлороформная экстракция
- Миниколоночная очистка
- экстракция РНК
- Стреловой метод
- Очистка ДНК с помощью синхронного коэффициента изменения сопротивления (SCODA)
Количественная оценка
[ редактировать ]- Изобилие по весу: спектроскопическое количественное определение нуклеиновых кислот
- Абсолютная численность в количестве: полимеразная цепная реакция в реальном времени (количественная ПЦР)
- Относительная численность с высокой пропускной способностью: ДНК-микрочип
- Высокопроизводительное абсолютное изобилие: серийный анализ экспрессии генов (SAGE)
- Размер: гель-электрофорез
Синтез
[ редактировать ]- De novo : синтез олигонуклеотидов
- Амплификация: полимеразная цепная реакция (ПЦР), петлевая изотермическая амплификация (LAMP), опосредованная транскрипцией амплификация (ТМА).
Кинетика
[ редактировать ]- Многопараметрический поверхностный плазмонный резонанс [1] [2]
- Двухполяризационная интерферометрия [3]
- Кварцевые микровесы с контролем рассеяния (QCM-D) [4]
Функция гена
[ редактировать ]Другой
[ редактировать ]- Бисульфитное секвенирование
- секвенирование ДНК
- Клонирование выражений
- Флуоресцентная гибридизация in situ
- Лаборатория на чипе
- Сравнение программного обеспечения для моделирования нуклеиновых кислот
- Нозерн-блот
- Ядерный анализ
- Радиоактивность в науках о жизни
- Южное пятно
- Дифференциальное центрифугирование (градиент сахарозы)
- Анализ отпечатка пальцев
- Несколько биоинформатики методов , как показано в списке программного обеспечения для прогнозирования структуры РНК.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Тан, Вэй; Ху, Шичао; Ван, Хуамин; Чжао, Ян; Ли, На; Лю, Фэн (23 сентября 2014 г.). «Универсальный молекулярный транслятор для мишеней, не связанных с нуклеиновыми кислотами, который обеспечивает динамические сборки ДНК и логические операции». хим. Коммун . 50 (92): 14352–14355. дои : 10.1039/C4CC07041K . ПМИД 25295484 .
- ^ Ихалайнен, Петри; Петтерссон, Фредрик; Песонен, Маркус; Витала, Тапани; Мяттанен, Анни; Остербака, Рональд; Пелтонен, Йоуко (7 марта 2014 г.). «Импедиметрическое исследование гибридизации ДНК на золотых электродах, напечатанных струйной печатью на бумаге» . Нанотехнологии . 25 (9): 094009. Бибкод : 2014Nanot..25i4009I . дои : 10.1088/0957-4484/25/9/094009 . ПМИД 24522116 . S2CID 206070778 .
- ^ Берни, Х.; Оливер, К. (2005). «Характеристика размера и плотности двойной поляризационной интерферометрии иммобилизации и гибридизации ДНК». Биосенсоры и биоэлектроника . 21 (4): 618–626. дои : 10.1016/j.bios.2004.12.024 . ПМИД 16202875 .
- ^ Диксон, Мэтью К. (июль 2008 г.). «Кварцево-кристаллические микровесы с контролем рассеяния: возможность определения характеристик биологических материалов и их взаимодействий в реальном времени» . Журнал биомолекулярных методов . 19 (3): 151–158. ПМК 2563918 . ПМИД 19137101 .
- ^ Хэннон, Грегори Дж. (июль 2002 г.). «РНК-интерференция» . Природа . 418 (6894): 244–251. Бибкод : 2002Natur.418..244H . дои : 10.1038/418244a . ISSN 1476-4687 . ПМИД 12110901 . S2CID 4426281 .