Таблицы кодонов ДНК и РНК
(Перенаправлено из таблицы кодонов )
Стандартная таблица кодонов РНК, организованная в виде колеса.
Таблицу кодонов можно использовать для перевода генетического кода в последовательность аминокислот . [1] [2] Стандартный генетический код традиционно представляется в виде таблицы кодонов РНК , поскольку, когда , именно информационная РНК белки создаются в клетке рибосомами ( мРНК ) управляет синтезом белка . [2] [3] Последовательность мРНК определяется последовательностью геномной ДНК . [4] В этом контексте стандартный генетический код называется таблицей трансляции 1. [3] Его также можно представить в таблице кодонов ДНК. Кодоны ДНК в таких таблицах встречаются на смысловой цепи ДНК и располагаются в от 5' - к-3 ' направлении . В зависимости от источника генетического кода, например, из ядра клетки , митохондрии , пластиды или гидрогеносомы , используются разные таблицы с альтернативными кодонами. [5]
В генетическом коде и таблицах ниже содержится 64 различных кодона; большинство из них указывают аминокислоту. [6] Три последовательности UAG, UGA и UAA, известные как стоп-кодоны , [примечание 1] не кодируют аминокислоту, а вместо этого сигнализируют о высвобождении образующегося полипептида из рибосомы. [7] В стандартном коде последовательность AUG, читаемая как метионин , может служить стартовым кодоном и вместе с такими последовательностями, как фактор инициации , инициирует трансляцию. [3] [8] [9] В редких случаях стартовые кодоны стандартного кода могут также включать GUG или UUG; эти кодоны обычно представляют собой валин и лейцин соответственно, но в качестве стартовых кодонов они транслируются как метионин или формилметионин . [3] [9]
Классическая таблица/колесо стандартного генетического кода организована произвольно на основе позиции кодона 1. Сайер [11] , следуя наблюдениям [12] , показали, что реорганизация колеса вместо этого на основе положения кодона 2 (и изменение порядка с UCAG на UCGA) лучше упорядочивает кодоны за счет гидрофобности кодируемых ими аминокислот. Это предполагает, что ранние рибосомы наиболее тщательно считывают вторую позицию кодона, чтобы контролировать паттерны гидрофобности в белковых последовательностях.
Первая таблица — стандартная таблица — может использоваться для трансляции триплетов нуклеотидов в соответствующую аминокислоту или соответствующий сигнал, если это стартовый или стоп-кодон. Вторая таблица, называемая обратной, действует наоборот: ее можно использовать для вывода возможного триплетного кода, если аминокислота известна. Поскольку одну и ту же аминокислоту могут кодировать несколько кодонов, Международного союза теоретической и прикладной химии (IUPAC) обозначения нуклеиновых кислот в некоторых случаях приводятся .
Таблица перевода 1
[ редактировать ]Стандартная таблица кодонов РНК
[ редактировать ]| аминокислот Биохимические свойства | Неполярный (нп) | Полярный (п) | Базовый (б) | Кислый (а) | Терминация: стоп-кодон * | Инициация: возможный стартовый кодон ⇒ |
| 1-й база | 2-я база | 3-й база | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| В | С | А | Г | ||||||
| В | Ууу | (Phe/F) Фенилаланин (np) | КОНЧИК | (Ser/S) Серин (p) | УХ ТЫ | (Tyr/Y) Тирозин (p) | САМЫЙ | (Cys/C) Цистеин (p) | В |
| УУК | УКК | ОАК | Пользовательский контент | С | |||||
| УАА | (Лей/л) Лейцин (np) | УЦА | УАА | Стоп ( Охра )* [примечание 2] | УГА | Стоп ( Опал ) * [примечание 2] | А | ||
| УУГ ⇒ | УКГ | УАГ | Стоп ( Желтый ) * [примечание 2] | Угги | (Trp/W) Триптофан (np) | Г | |||
| С | КУУ | CCU | (Про/П) Пролин (np) | КАУ | (His/H) Гистидин (б) | ЕГДС | (Arg/R) Аргинин (б) | В | |
| CUC | CCC | САС | КГК | С | |||||
| ВОЗДУХ | Приблизительно | САА | (Gln/Q) Глутамин (p) | CGA | А | ||||
| КУГ | CCG | ЦАГ | КГГ | Г | |||||
| А | Австралия | (Ile/I) Изолейцин (np) | АКУ | (Thr/T) Треонин (p) | ААУ | (Asn/N) Аспарагин (p) | АГУ | (Ser/S) Серин (p) | В |
| АУК | АСС | ААС | АРУ | С | |||||
| НЕ | АСА | ААА | (Lys/K) Лизин (б) | НО | (Arg/R) Аргинин (б) | А | |||
| АВГ ⇒ | (Met/M) Метионин (np) | АКГ | ААГ | АГГ | Г | ||||
| Г | ГУУ | (Val/V) Валин (np) | ГКУ | (Ala/A) Аланин (np) | НОЧЬ | (Asp/D) Аспарагиновая кислота (а) | ГГУ | (Gly/G) Глицин (np) | В |
| GUC | GCC | ПКК | ГГК | С | |||||
| ПЕЩЕРА | ГКА | ИДТИ | (Glu/E) Глутаминовая кислота (а) | ГГА | А | ||||
| ГУГ ⇒ | ГКГ | кляп | ГГГ | Г | |||||
Как показано в приведенной выше таблице, таблица 1 NCBI включает менее канонические стартовые кодоны GUG и UUG. [3]
Обратная таблица кодонов РНК
[ редактировать ]| Аминокислота | Кодоны РНК | Сжатый | Аминокислота | Кодоны РНК | Сжатый | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Увы, А. | GCU, GCC, GCA, GCG | GCN | Сколько, я | ОМГ, ОМГ, ОМГ | АУХ | |
| Арг, Р | CGU, CGC, CGA, CGG; АГА, АГГ | CGN, СМА; или КГГ, МГР | Лео, Л | КУУ, КУК, КУА, КУГ; УУА, УУГ | С, УУР; сейчас CUY, YUR | |
| Асн, Н | ААУ, ААК | ДА | Лис, К. | ААА, ААГ | ГОД | |
| Асп, Д | ГАУ, ГАЦ | ГЕЙ | Мет, М | АВГ | ||
| Асн или Асп, Б | ААУ, ААС; ГАУ, ГАЦ | РЭЙ | Пхе, Ф | УУУ, УУК | УУЙ | |
| Цис, С | УГУ, УГК | БИЗНЕС | Про, П | CCU, CCC, CCA, CCG | CCN | |
| Глн, Кью | САА, ЦАГ | МАШИНА | Будь, С | УКУ, УКК, УЦА, UCG; АГУ, АГК | УХН, МОЗГ | |
| Клей | ГАА, ГАГ | ДАЖЕ | Тр, Т | АКУ, АКК, АСА, АЧГ | АКС | |
| Глн или Глю, Z | САА, ЦАГ; ГАА, ГАГ | САР | Трп, Вт | Угги | ||
| Гли, Г | ГГУ, ГГК, ГГА, ГГГ | ГГН | Тир, Ю. | УАУ, ОАК | УАЙ | |
| Его, Х | КАУ, САС | ПРЯНЫЙ | Val, V | ГУУ, ГУК, ГУА, ГУГ | ПИСТОЛЕТ | |
| НАЧИНАТЬ | АУГ, КУГ, УУГ | ОБНИМАТЬ | ОСТАНАВЛИВАТЬСЯ | УАА, УГА, УАГ | УРА, УАГ; или СУХОЙ, УАР | |
Стандартная таблица кодонов ДНК
[ редактировать ]| аминокислот Биохимические свойства | Неполярный (нп) | Полярный (п) | Базовый (б) | Кислый (а) | Терминация: стоп-кодон * | Инициация: возможный стартовый кодон ⇒ |
| 1-й база | 2-я база | 3-й база | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Т | С | А | Г | ||||||
| Т | ТТТ | (Phe/F) Фенилаланин (np) | ТСТ | (Ser/S) Серин (p) | ТАТ | (Tyr/Y) Тирозин (p) | ТГТ | (Cys/C) Цистеин (p) | Т |
| ТТС | ТСС | ТАС | ТГК | С | |||||
| ТТА | (Лей/л) Лейцин (np) | ТСА | СЕГОДНЯ | Стоп ( Охра )* [примечание 2] | ТГА | Стоп ( Опал ) * [примечание 2] | А | ||
| ТТГ ⇒ | ТКГ | ЯРЛЫК | Стоп ( Желтый ) * [примечание 2] | ТГГ | (Trp/W) Триптофан (np) | Г | |||
| С | СТТ | ЦКТ | (Про/П) Пролин (np) | КОТ | (His/H) Гистидин (б) | ВКТ | (Arg/R) Аргинин (б) | Т | |
| СТС | CCC | САС | КГК | С | |||||
| призыв к действию | Приблизительно | САА | (Gln/Q) Глутамин (p) | CGA | А | ||||
| КТГ | CCG | ЦАГ | КГГ | Г | |||||
| А | К | (Ile/I) Изолейцин (np) | ДЕЙСТВОВАТЬ | (Thr/T) Треонин (p) | ААТ | (Asn/N) Аспарагин (p) | ВОСЕМЬ | (Ser/S) Серин (p) | Т |
| УВД | АСС | ААС | АРУ | С | |||||
| МИНУТЫ | АСА | ААА | (Lys/K) Лизин (б) | НО | (Arg/R) Аргинин (б) | А | |||
| АТГ ⇒ | (Met/M) Метионин (np) | АКГ | ААГ | АГГ | Г | ||||
| Г | ГТТ | (Val/V) Валин (np) | GCT | (Ala/A) Аланин (np) | ДЫРА | (Asp/D) Аспарагиновая кислота (а) | ГГТ | (Gly/G) Глицин (np) | Т |
| ГТК | GCC | ПКК | ГГК | С | |||||
| ГТА | ГКА | ИДТИ | (Glu/E) Глутаминовая кислота (а) | ГГА | А | ||||
| ГТГ ⇒ | ГКГ | кляп | ГГГ | Г | |||||
Обратная таблица кодонов ДНК
[ редактировать ]| Аминокислота | Кодоны ДНК | Сжатый | Аминокислота | Кодоны ДНК | Сжатый | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Увы, А. | GCT, GCC, GCA, GCG | GCN | Сколько, я | АТТ, АТЦ, АТА | АТН | |
| Арг, Р | CGT, CGC, CGA, CGG; АГА, АГГ | CGN, СМА; или КГГ, МГР | Лео, Л | СТТ, КТК, СТА, КТГ; ТТА, ТТГ | КТН, ТТР; или КТЮ, ЮТР | |
| Асн, Н | ААТ, ААК | ДА | Лис, К. | ААА, ААГ | ГОД | |
| Асп, Д | ГАТ, ГАК | ГЕЙ | Мет, М | АТГ | ||
| Асн или Асп, Б | ААТ, ААС; ГАТ, ГАК | РЭЙ | Пхе, Ф | ТТТ, ТТЦ | телетайп | |
| Цис, С | ТГТ, ТГК | ТГИ | Про, П | CCT, CCC, CCA, CCG | CCN | |
| Глн, Кью | САА, ЦАГ | МАШИНА | Будь, С | ТСТ, ТСС, ТСА, ТКГ; АГТ, АГК | ТЦН, МОЗГ | |
| Клей | ГАА, ГАГ | ДАЖЕ | Тр, Т | АСТ, АКК, АСА, АКГ | АКС | |
| Глн или Глю, Z | САА, ЦАГ; ГАА, ГАГ | САР | Трп, Вт | ТГГ | ||
| Гли, Г | ГГТ, ГГК, ГГА, ГГГ | ГГН | Тир, Ю. | ПАПА, ЗАТКНИСЬ | РУКА | |
| Его, Х | КПП, САС | ПРЯНЫЙ | Val, V | ГТТ, ГТЦ, ГТА, ГТГ | ГТН | |
| НАЧИНАТЬ | АТГ, КТГ, УТГ | ХТГ | ОСТАНАВЛИВАТЬСЯ | ТАА, ТГА, ТАГ | ОБРАЩАТЬСЯ | |
Альтернативные кодоны в других таблицах перевода
[ редактировать ]Когда-то считалось, что генетический код универсален: [19] Кодон будет кодировать одну и ту же аминокислоту независимо от организма или источника. Однако сейчас признано, что генетический код развивается, [20] что приводит к различиям в том, как транслируется кодон, в зависимости от генетического источника. [19] [20] Например, в 1981 г. было обнаружено, что использование кодонов AUA, UGA, AGA и AGG кодирующей системой митохондрий млекопитающих отличается от универсального кода. [19] Также могут быть затронуты стоп-кодоны: у мерцательных простейших универсальные стоп-кодоны UAA и UAG кодируют глутамин. [20] [примечание 4] Четыре новых альтернативных генетических кода (под номерами 34–37) были обнаружены в бактериальных геномах Шульгиной и Эдди, что выявило первые изменения смысловых кодонов у бактерий. [21] В следующей таблице показаны эти альтернативные кодоны.
| аминокислот Биохимические свойства | Неполярный (нп) | Полярный (п) | Базовый (б) | Кислый (а) | Терминация: стоп-кодон * |
| Код | Перевод стол | задействован кодон ДНК | задействованный кодон РНК | Перевод с этим кодом | Стандартный перевод | Примечания | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Стандартный | 1 | Включает таблицу перевода 8 ( хлоропласты растений ). | ||||||
| Митохондрии позвоночных | 2 | НО | НО | Останавливаться * | Арг (R) (б) | |||
| АГГ | АГГ | Останавливаться * | Арг (R) (б) | |||||
| МИНУТЫ | НЕ | Мет (М) (np) | Сколько (я) (например) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Дрожжевые митохондрии | 3 | МИНУТЫ | НЕ | Мет (М) (np) | Сколько (я) (например) | |||
| СТТ | КУУ | Тр(Т)(п) | Лей (L) (np) | |||||
| СТС | CUC | Тр(Т)(п) | Лей (L) (np) | |||||
| призыв к действию | ВОЗДУХ | Тр(Т)(п) | Лей (L) (np) | |||||
| КТГ | КУГ | Тр(Т)(п) | Лей (L) (np) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| CGA | CGA | отсутствующий | Арг (R) (б) | |||||
| КГК | КГК | отсутствующий | Арг (R) (б) | |||||
| Митохондриальные плесени, простейшие и кишечнополостные + микоплазма/спироплазма | 4 | ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | Включает таблицу перевода 7 ( кинетопласты ). | ||
| Митохондриальные беспозвоночных | 5 | НО | НО | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||
| АГГ | АГГ | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| МИНУТЫ | НЕ | Мет (М) (np) | Сколько (я) (например) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Инфузория, дазикладацея и гексамита ядерная. | 6 | СЕГОДНЯ | УАА | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |||
| ЯРЛЫК | УАГ | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |||||
| Митохондрии иглокожих и плоских червей | 9 | ААА | ААА | Асн (Н) (п) | Лис (К) (б) | |||
| НО | НО | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| АГГ | АГГ | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Эуплотидный ядерный | 10 | ТГА | УГА | Цис (С) (п) | Останавливаться * | |||
| Бактериальные, архейные и растительные пластиды | 11 | См. таблицу перевода 1 . | ||||||
| Альтернативные ядерные дрожжи | 12 | КТГ | КУГ | Будь (С) (р) | Лей (L) (np) | |||
| Асцидии митохондриальные | 13 | НО | НО | Гли (G) (np) | Арг (R) (б) | |||
| АГГ | АГГ | Гли (G) (np) | Арг (R) (б) | |||||
| МИНУТЫ | НЕ | Мет (М) (np) | Сколько (я) (например) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Альтернативные митохондрии плоских червей | 14 | ААА | ААА | Асн (Н) (п) | Лис (К) (б) | |||
| НО | НО | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| АГГ | АГГ | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| СЕГОДНЯ | УАА | Башня (Y) (п) | Останавливаться * | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Блефаризма ядерная | 15 | ЯРЛЫК | УАГ | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | По состоянию на 18 ноября 2016 г.: отсутствует в обновлении NCBI. Аналогично таблице перевода 6 . | ||
| Хлорофиковые митохондриальные | 16 | ЯРЛЫК | УАГ | Лей (L) (np) | Останавливаться * | |||
| Трематода митохондриальная | 21 | ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||
| МИНУТЫ | НЕ | Мет (М) (np) | Сколько (я) (например) | |||||
| НО | НО | быть | Арг (R) (б) | |||||
| АГГ | АГГ | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||||
| ААА | ААА | Асн (Н) (п) | Лис (К) (б) | |||||
| косая последовательность Митохондриальная | 22 | ТСА | УЦА | Останавливаться * | Будь (С) (р) | |||
| ЯРЛЫК | УАГ | Лей (L) (np) | Останавливаться * | |||||
| Траустохитрий митохондриальный | 23 | ТТА | УАА | Останавливаться * | Лей (L) (np) | Аналогично таблице перевода 11 . | ||
| Митохондрии птеробранхии | 24 | НО | НО | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | |||
| АГГ | АГГ | Лис (К) (б) | Арг (R) (б) | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Кандидат в подразделение SR1 и Gracilibacteria | 25 | ТГА | УГА | Гли (G) (np) | Останавливаться * | |||
| Пахисолен tannophilus ядерный | 26 | КТГ | КУГ | Ала (A) (np) | Лей (L) (np) | |||
| Кариореликтовый ядерный | 27 | СЕГОДНЯ | УАА | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |||
| ЯРЛЫК | УАГ | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |||||
| ТГ | УГА | Останавливаться * | или | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||
| Кондилостома ядерная | 28 | СЕГОДНЯ | УАА | Останавливаться * | или | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |
| ЯРЛЫК | УАГ | Останавливаться * | или | Глн (Q) (п) | Останавливаться * | |||
| ТГА | УГА | Останавливаться * | или | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||
| Мезодиний ядерный | 29 | СЕГОДНЯ | УАА | Башня (Y) (п) | Останавливаться * | |||
| ЯРЛЫК | УАГ | Башня (Y) (п) | Останавливаться * | |||||
| Перитрих ядерный | 30 | ОБЛИЦОВКА | УАА | Глу (Е) (а) | Останавливаться * | |||
| ЯРЛЫК | УАГ | Глу (Е) (а) | Останавливаться * | |||||
| Бластокритидии ядерные | 31 | СЕГОДНЯ | УАА | Останавливаться * | или | Глу (Е) (а) | Останавливаться * | |
| ЯРЛЫК | УАГ | Останавливаться * | или | Глу (Е) (а) | Останавливаться * | |||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| Митохондриальный код Cephalodiscidae | 33 | НО | НО | Будь (С) (р) | Арг (R) (б) | Аналогично таблице перевода 24 . | ||
| АГГ | АГГ | Лис (К) (б) | Арг (R) (б) | |||||
| СЕГОДНЯ | УАА | Башня (Y) (п) | Останавливаться * | |||||
| ТГА | УГА | Трп (Вт) (нп) | Останавливаться * | |||||
| УБА4682 [21] | 34 | АГГ | АГГ | Мет (М) (np) | Арг (R) (б) | |||
| Пептацетобактерия [21] | 35 | КГГ | КГГ | Глн (Q) (п) | Арг (R) (б) | |||
| Анаэрококк [21] | 36 | КГГ | КГГ | Трп (Вт) (нп) | Арг (R) (б) | |||
| Absconditabacterales [21] | 37 | CGA | CGA | Трп (Вт) (нп) | Арг (R) (б) | |||
| КГГ | КГГ | Трп (Вт) (нп) | Арг (R) (б) | |||||
| ТГА | УГА | Гли (G) (np) | Останавливаться * | |||||
См. также
[ редактировать ]
Примечания
[ редактировать ]- ^ Каждый стоп-кодон имеет определенное название: UAG — янтарь , UGA — опал или умбра , а UAA — охра . [7] В ДНК этими стоп-кодонами являются TAG, TGA и TAA соответственно.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Историческая основа обозначения стоп-кодонов янтарем, охрой и опалом описана в автобиографии Сиднея Бреннера. [14] и в исторической статье Боба Эдгара. [15]
- ^ Основное различие между ДНК и РНК заключается в том, что тимин (Т) содержится только в первой. В РНК он заменен урацилом (U). [18] Это единственное различие между стандартной таблицей кодонов РНК и стандартной таблицей кодонов ДНК.
- ^ Euplotes Octacarinatus является исключением. [20]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Таблица трансляции аминокислот» . Государственный университет Орегона. Архивировано из оригинала 29 мая 2020 года . Проверено 2 декабря 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б Барти, Лиза; Брук, Джек. MHCC Biology 112: Биология для медицинских профессий . Откройте Орегон. п. 42. Архивировано из оригинала 6 декабря 2020 года . Проверено 6 декабря 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Эльжановский А., Остелл Дж. (7 января 2019 г.). «Генетические коды» . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 5 октября 2020 года . Проверено 21 февраля 2019 г.
- ^ «Функции РНК» . Возбудимый . Природное образование. Архивировано из оригинала 18 октября 2008 года . Проверено 5 января 2021 г.
- ^ «Генетические коды» . Национальный центр биотехнологической информации. Архивировано из оригинала 13 мая 2011 года . Проверено 2 декабря 2020 г.
- ^ «Кодон» . Национальный институт исследования генома человека . Архивировано из оригинала 22 октября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б Малой С. (29 ноября 2003 г.). «Как бессмысленные мутации получили свои названия» . Курс микробной генетики . Государственный университет Сан-Диего. Архивировано из оригинала 23 сентября 2020 года . Проверено 10 октября 2020 г.
- ^ Хиннебуш АГ (2011). «Молекулярный механизм сканирования и отбора стартовых кодонов у эукариот» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 75 (3): 434–467. дои : 10.1128/MMBR.00008-11 . ПМК 3165540 . ПМИД 21885680 .
- ^ Перейти обратно: а б Туриоль С., Борнс С., Боннал С., Одижье С., Пратс Х., Пратс А.С., Вагнер С. (2003). «Поколение разнообразия изоформ белка путем альтернативной инициации трансляции кодонов, отличных от AUG» . Биология клетки . 95 (3–4): 169–78. дои : 10.1016/S0248-4900(03)00033-9 . ПМИД 12867081 .
- ^ Бандиопадхьяй, Дебашри; Мелер, Эрнест Л. (август 2008 г.). «Количественное выражение гетерогенности белка: реакция боковых цепей аминокислот на их локальное окружение». Белки . 72 (2): 646–59. дои : 10.1002/прот.21958 . ПМИД 18247345 .
- ^ Сайер, Милтон Х. младший (10 июля 2019 г.). «Понимание генетического кода» . J Бактериол . 201 (15): e00091-19. дои : 10.1128/JB.00091-19 . ПМК 6620406 . ПМИД 31010904 .
- ^ Муто, А.; Осава, С. (январь 1987 г.). «Содержание гуанина и цитозина в геномной ДНК и эволюция бактерий» . Proc Natl Acad Sci США . 84 (1): 166–9. дои : 10.1073/pnas.84.1.166 . ПМК 304163 . ПМИД 3467347 .
- ^ «Информация в ДНК определяет клеточную функцию посредством трансляции» . Возбудимый . Природное образование. Архивировано из оригинала 23 сентября 2017 года . Проверено 5 декабря 2020 г.
- ^ Бреннер, Сидней; Вулперт, Льюис (2001). Жизнь в науке . Биомед Централ Лимитед. стр. 101–104. ISBN 9780954027803 .
- ^ Эдгар Б. (2004). «Геном бактериофага Т4: археологические раскопки» . Генетика . 168 (2): 575–82. дои : 10.1093/генетика/168.2.575 . ПМЦ 1448817 . ПМИД 15514035 . см. стр. 580–581
- ^ Перейти обратно: а б IUPAC — Комиссия IUB по биохимической номенклатуре. «Сокращения и символы нуклеиновых кислот, полинуклеотидов и их составляющих» (PDF) . Международный союз теоретической и прикладной химии. Архивировано (PDF) из оригинала 9 июля 2021 года . Проверено 5 декабря 2020 г.
- ^ «Что делает ДНК?» . Ваш геном . Добро пожаловать в кампус Генома. Архивировано из оригинала 29 ноября 2020 года . Проверено 12 января 2021 г.
- ^ «Гены» . ДНК, генетика и эволюция . Бостонский университет. Архивировано из оригинала 28 апреля 2020 года . Проверено 10 декабря 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Осава, А. (ноябрь 1993 г.). «Эволюционные изменения генетического кода» . Сравнительная биохимия и физиология . 106 (2): 489–94. дои : 10.1016/0305-0491(93)90122-л . ПМИД 8281749 . Архивировано из оригинала 06 декабря 2020 г. Проверено 5 декабря 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д Осава С., Джукс Т.Х., Ватанабэ К., Муто А. (март 1992 г.). «Недавние доказательства эволюции генетического кода» . Микробиологические обзоры . 56 (1): 229–64. дои : 10.1128/MR.56.1.229-264.1992 . ПМЦ 372862 . ПМИД 1579111 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Шульгина, Екатерина; Эдди, Шон Р. (9 ноября 2021 г.). «Вычислительный экран для альтернативных генетических кодов в более чем 250 000 геномах» . электронная жизнь . 10 . doi : 10.7554/eLife.71402 . ПМЦ 8629427 . ПМИД 34751130 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Чеванс Ф.В., Хьюз К.Т. (2 мая 2017 г.). «Дело о том, что генетический код представляет собой тройку троек» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (18): 4745–4750. Бибкод : 2017PNAS..114.4745C . дои : 10.1073/pnas.1614896114 . JSTOR 26481868 . ПМЦ 5422812 . ПМИД 28416671 .
- Девер Т.Е. (29 июня 2012 г.). «Новый старт синтеза белка» . Наука . 336 (6089). Американская ассоциация содействия развитию науки: 1645–1646. Бибкод : 2012Sci...336.1645D . дои : 10.1126/science.1224439 . JSTOR 41585146 . ПМИД 22745408 . S2CID 44326947 . Архивировано из оригинала 8 июня 2022 года . Проверено 17 октября 2020 г.
- Гарднер Р.С., Вахба А.Дж., Базилио С., Миллер Р.С., Лендьел П., Спейер Дж.Ф. (декабрь 1962 г.). «Синтетические полинуклеотиды и код аминокислоты. VII» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 48 (12): 2087–2094. Бибкод : 1962PNAS...48.2087G . дои : 10.1073/pnas.48.12.2087 . ПМК 221128 . ПМИД 13946552 .
- Накамото Т. (март 2009 г.). «Эволюция и универсальность механизма инициации синтеза белка». Джин . 432 (1–2): 1–6. дои : 10.1016/j.gene.2008.11.001 . ПМИД 19056476 .
- Вахба А.Дж., Гарднер Р.С., Базилио С., Миллер Р.С., Спейер Дж.Ф., Лендьел П. (январь 1963 г.). «Синтетические полинуклеотиды и код аминокислоты. VIII» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 49 (1): 116–122. Бибкод : 1963PNAS...49..116W . дои : 10.1073/pnas.49.1.116 . ПМК 300638 . ПМИД 13998282 .
- Янофски С (9 марта 2007 г.). «Установление тройной природы генетического кода» . Клетка . 128 (5): 815–818. дои : 10.1016/j.cell.2007.02.029 . ПМИД 17350564 . S2CID 14249277 .
- Заневельд Дж., Хамади М., Суеока Н., Найт Р. (28 февраля 2009 г.). «CodonExplorer: интерактивная онлайн-база данных для анализа использования кодонов и состава последовательностей». Биоинформатика для анализа последовательностей ДНК . Методы молекулярной биологии. Том. 537. стр. 207–232. дои : 10.1007/978-1-59745-251-9_10 . ISBN 978-1-58829-910-9 . ПМЦ 2953947 . ПМИД 19378146 .