Гаплогруппа E-M329

Гаплогруппа E-M329 (бывшая E3*/E1b1c)
Гаплогруппа E-M329 (бывшая E3*/E1b1c)
Возможное время происхождения	39 200 лет назад
Возраст слияния	25700 лет назад
Возможное место происхождения	Восточная Африка
Предок	Э-В38
Потомки	Э-В2403, Э-М329*
Определение мутаций	М329

Гаплогруппа E-M329 , также известная как E1b1a2 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . ^{[ а ]} E-M329 в основном встречается в Восточной Африке . ^{[ 2 ]}

Источник

Тромбетта и др. (2011) предположили происхождение из Восточной Африки :

Представленная здесь новая топология имеет важные последствия для происхождения гаплогруппы E-P2. Используя принцип филогеографической экономии, разрешение трифуркации E-M215 в пользу общего предка E-M2 и E-M329 убедительно подтверждает гипотезу о том, что гаплогруппа E-P2 возникла в Восточной Африке, как предполагалось ранее, и что Хромосомы E-M2, так часто наблюдаемые в странах Африки к югу от Сахары, ведут свое происхождение от общего предка, обитающего в Восточной Африке. ^{[ 2 ]}

Распределение

E-M329 в основном встречается в Восточной Африке . ^{[ 2 ]} E-M329 часто встречается на юго-западе Эфиопии , особенно среди населения, говорящего на языке омот . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} Семино и др. (2004) обнаружили 2 случая E-M329 у эфиопских оромо из 2400 особей, включая 78 оромо. ^{[ 5 ]} Каденас и др. (2007) обнаружили один случай E-M329 из 72 человек в Катаре . ^{[ 6 ]}

Субклады

E-V2403

E-V2403 является субкладом гаплогруппы E-M329. ^{[ 1 ]}

Э-М329*

E-M329* — субклад гаплогруппы E-M329. ^{[ 1 ]}

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть прежде всего своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (сокращенно)	(а)	(б)	(с)	(г)	(е)	(г)	(или)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ИСОГГ 2006 г.	ИСОГГ 2007	ИСОГГ 2008	ИСОГГ 2009	ИСОГГ 2010	ИЗОГГ 2011	ИЗОГГ 2012
E-P29	21	III	3А	13	Еу3	Н2	Б	И*	И	И	И	И	И	И	И	И	И	И
Э-М33	21	III	3А	13	Еу3	Н2	Б	Е1*	Е1	Е1а	Е1а	Е1	Е1	Е1а	Е1а	Е1а	Е1а	Е1а
Э-М44	21	III	3А	13	Еу3	Н2	Б	Е1а	Е1а	Е1а1	Е1а1	Е1а	Е1а	Е1а1	Е1а1	Е1а1	Е1а1	Е1а1
Э-М75	21	III	3А	13	Еу3	Н2	Б	Е2а	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2	Е2
Э-М54	21	III	3А	13	Еу3	Н2	Б	Е2б	Е2б	Е2б	E2b1	-	-	-	-	-	-	-
Е-П2	25	III	4	14	Еу3	Н2	Б	Е3*	Е3	Е1б	E1b1	Е3	Е3	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1
Э-М2	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а*	Е3а	E1b1	E1b1a	Е3а	Е3а	E1b1a	E1b1a	E1b1a	E1b1a1	E1b1a1
Э-М58	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а1	Е3а1	E1b1a1	E1b1a1	Е3а1	Е3а1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1a1a	E1b1a1a1a
Э-М116.2	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	E3a2	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E3a2	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E1ba12	удаленный	удаленный
Э-М149	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а3	Е3а3	E1b1a3	E1b1a3	Е3а3	Е3а3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a1a1c	E1b1a1a1c
Э-М154	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а4	Е3а4	E1b1a4	E1b1a4	Е3а4	Е3а4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a1a1g1c	E1b1a1a1g1c
Э-М155	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а5	Е3а5	E1b1a5	E1b1a5	Е3а5	Е3а5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a1a1d	E1b1a1a1d
Э-М10	8	III	5	15	ЕС2	Н2	Б	Е3а6	Е3а6	E1b1a6	E1b1a6	Е3а6	Е3а6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a1a1e	E1b1a1a1e
Э-М35	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b*	E3b	E1b1b1	E1b1b1	E3b1	E3b1	E1b1b1	E1b1b1	E1b1b1	удаленный	удаленный
Э-М78	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b1*	E3b1	E1b1b1a	E1b1b1a1	E3b1a	E3b1a	E1b1b1a	E1b1b1a	E1b1b1a	E1b1b1a1	E1b1b1a1
Э-М148	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b1a	E3b1a	E1b1b1a3a	E1b1b1a1c1	E3b1a3a	E3b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a1c1	E1b1b1a1c1
Э-М81	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b2*	E3b2	E1b1b1b	E1b1b1b1	E3b1b	E3b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b1	E1b1b1b1a
Э-М107	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b2a	E3b2a	E1b1b1b1	E1b1b1b1a	E3b1b1	E3b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1a	E1b1b1b1a1
Э-М165	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b2b	E3b2b	E1b1b1b2	E1b1b1b1b1	E3b1b2	E3b1b2	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b1a2a
Э-М123	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b3*	E3b3	E1b1b1c	E1b1b1c	E3b1c	E3b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1b2a
Э-М34	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3b3a*	E3b3a	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E3b1c1	E3b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1b2a1
Э-М136	25	III	4	14	Еу4	Н2	Б	E3ba1	E3b3a1	E1b1b1c1a	E1b1b1c1a1	E3b1c1a	E3b1c1a	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1b2a1a1

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Хаммер 2001
δ Графин 2001 г.
ε Семино 2000
ζ Вс 1999 г.
η Волосы 2001

Филогенетические деревья

Это филогенетическое древо субкладов гаплогрупп основано на дереве 2008 года Консорциума Y-хромосом (YCC), ^{[ 7 ]} дерево гаплогруппы E ISOGG Y-ДНК, ^{[ 8 ]} и последующие опубликованные исследования.

E1b1a (L222.1, V38, V100)
- E1b1a1 (DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43, V95, Z1101, Z1107, Z1116, Z1120, Z1122, Z1123, Z1124, Z1125, Z1127, Z1130, Z1133)
- E1b1a2 (M329)

См. также

Генетика

Y-ДНК и субклады

Основополагающее дерево Y-ДНК

Примечания

^ E-M329 ранее был известен как E1b1c.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «E-M329 YTree» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тромбетта, Бениамино; Фульвио Кручиани; Даниэле Селитто; Розария Скоццари (6 января 2011 г.). Маколей, Винсент (ред.). «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов» . ПЛОС ОДИН . 6 (1): e16073. Бибкод : 2011PLoSO...616073T . дои : 10.1371/journal.pone.0016073 . ПМК 3017091 . ПМИД 21253605 .
^ Jump up to: ^а ^б «Plaster et al. Субклады Y-ДНК E, предсказанные Пассой» .
^ Jump up to: ^а ^б Калифорния, Гипс (28 сентября 2011 г.). Вариации Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и идентификационных меток в Эфиопии . Discovery.ucl.ac.uk (докторская степень) . Проверено 27 июня 2018 г.
^ Семино, Орнелла; Магри, К; Бенуцци, Дж; Лин, А.А.; Аль-Захери, Н.; Батталья, В; Макчиони, Л; Триантафиллидис, С; и др. (2004). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–1034. дои : 10.1086/386295 . ПМК 1181965 . ПМИД 15069642 .
^ Каденас, Алисия М.; Лев А. Животовский, Лука Л. Кавалли-Сфорца, Питер Андерхилл и Рене Дж. Эррера (10 октября 2007 г.). «Разнообразие Y-хромосом характеризует Оманский залив» . Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–386. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ПМИД 17928816 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ Карафет Татьяна М.; Фернандо Л. Мендес; Моника Б. Мейлерман; Питер А. Андерхилл; Стивен Л. Зегура; Майкл Ф. Хаммер (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–838. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
^ Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). «Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады - 2010» . Проверено 17 декабря 2010 г.

Источники таблиц преобразования

Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и др. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891 .
Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360 .
Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
Каладжиева, преп.; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД 11313742 .
Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы» . Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299 . ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588 .
Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494. 1155 , ПМИД 11073453
Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Y-хромосома свидетельствует о миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926 .
Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685 . ПМИД 11062480 . S2CID 12893406 .

[vanOven2014-10] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome". Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.

[ISOGG2015-11] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)

[A0-T-12] Haplogroup A0-T is also known as A-L1085 (and previously as A0'1'2'3'4).

[A1-13] Haplogroup A1 is also known as A1'2'3'4.

[F-Y27277-14] F-Y27277, sometimes known as F2'4, is both the parent clade of F2 and F4 and a child of F-M89.

[LT-15] Haplogroup LT (L298/P326) is also known as Haplogroup K1.

[K2-16] Between 2002 and 2008, Haplogroup T-M184 was known as "Haplogroup K2". That name has since been re-assigned to K-M526, the sibling of Haplogroup LT.

[K2b-17] Haplogroup K2b (M1221/P331/PF5911) is also known as Haplogroup MPS.

[K2b1-18] Haplogroup K2b1 (P397/P399) is also known as Haplogroup MS, but has a broader and more complex internal structure.

[P-19] Haplogroup P (P295) is also klnown as K2b2.

[K-M2313-20] K-M2313*, which as yet has no phylogenetic name, has been documented in two living individuals, who have ethnic ties to India and South East Asia. In addition, K-Y28299, which appears to be a primary branch of K-M2313, has been found in three living individuals from India. See: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Access date of these pages: 9 December 2017)

[S-21] Haplogroup S, as of 2017, is also known as K2b1a. (Previously the name Haplogroup S was assigned to K2b1a4.)

[M-22] Haplogroup M, as of 2017, is also known as K2b1b. (Previously the name Haplogroup M was assigned to K2b1d.)

[5] E-M329 ранее был известен как E1b1c.

[yfull-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «E-M329 YTree» .

[Trombetta2011-2] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Тромбетта, Бениамино; Фульвио Кручиани; Даниэле Селитто; Розария Скоццари (6 января 2011 г.). Маколей, Винсент (ред.). «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов» . ПЛОС ОДИН . 6 (1): e16073. Бибкод : 2011PLoSO...616073T . дои : 10.1371/journal.pone.0016073 . ПМК 3017091 . ПМИД 21253605 .

[plaster1-3] Jump up to: ^а ^б «Plaster et al. Субклады Y-ДНК E, предсказанные Пассой» .

[plaster2-4] Jump up to: ^а ^б Калифорния, Гипс (28 сентября 2011 г.). Вариации Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и идентификационных меток в Эфиопии . Discovery.ucl.ac.uk (докторская степень) . Проверено 27 июня 2018 г.

[semino2004-6] Семино, Орнелла; Магри, К; Бенуцци, Дж; Лин, А.А.; Аль-Захери, Н.; Батталья, В; Макчиони, Л; Триантафиллидис, С; и др. (2004). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–1034. дои : 10.1086/386295 . ПМК 1181965 . ПМИД 15069642 .

[Cadenas2008-7] Каденас, Алисия М.; Лев А. Животовский, Лука Л. Кавалли-Сфорца, Питер Андерхилл и Рене Дж. Эррера (10 октября 2007 г.). «Разнообразие Y-хромосом характеризует Оманский залив» . Европейский журнал генетики человека . 16 (3): 374–386. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201934 . ПМИД 17928816 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[Karafet2008-8] Карафет Татьяна М.; Фернандо Л. Мендес; Моника Б. Мейлерман; Питер А. Андерхилл; Стивен Л. Зегура; Майкл Ф. Хаммер (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–838. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .

[International_Society_of_Genetic_Genealogy-9] Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). «Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады - 2010» . Проверено 17 декабря 2010 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ а ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ х 1 ]

[ х 2 ]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]