Jump to content

Гаплогруппа E-P2

Гаплогруппа E-P2
Возможное время происхождения 41 400–49 800 лет назад. [1]
Возраст слияния 39 200–41 400 лет назад. [1]
Возможное место происхождения Восточная Африка [2] [3]
Предок E-P177
Потомки Э-В38 , Э-М215
Определение мутаций ДИС391п, Л337, Л339, Л342, Л487, Л492, Л613, П2/ПН2, П179, П180, П181

Гаплогруппа E-P2 , также известная как E1b1 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . E-P2 имеет две базальные ветви: E-V38 и E-M215 . E-P2 издревле присутствовал в Восточной Африке и Леванте ; в настоящее время он в основном распространен в Африке, где он, возможно, и возник, и реже встречается на Ближнем Востоке и в Европе .

Происхождение

[ редактировать ]

Семино и др. (2004) предположили происхождение из Восточной Африки , заявив: «И филогеография, и микросателлитная изменчивость предполагают, что E-P2 и его производное, E-M35, вероятно, произошли из Восточной Африки». [2]

Тромбетта и др. (2011) также предположили бы происхождение из Восточной Африки :

Представленная здесь новая топология имеет важные последствия для происхождения гаплогруппы E-P2. Используя принцип филогеографической экономии, разрешение трифуркации E-M215 в пользу общего предка E-M2 и E-M329 убедительно подтверждает гипотезу о том, что гаплогруппа E-P2 возникла в Восточной Африке, как предполагалось ранее, и что Хромосомы E-M2, так часто наблюдаемые в странах Африки к югу от Сахары, ведут свое происхождение от общего предка, обитающего в Восточной Африке. [3]

Древняя ДНК

[ редактировать ]

Было обнаружено, что образец натуфийских останков несет гаплогруппу E1b1 (1/5; 20%). [4]

В Мота пещере в Эфиопии останки древнего эфиопского мужчины, датированные 4500 годом до нашей эры, несли отцовскую гаплогруппу E1b1 и материнскую гаплогруппу L3x2a . [5] [6]

Распределение

[ редактировать ]
Основные субклады E1b1 (E-P2): E1b1a (E-V38) и E1b1b (E-M215) в данных популяциях. [7]

E-P2 сейчас встречается преимущественно в Африке , преимущественно в виде преобладающих субкладов E-M215 и E-V38 . E-M215 чаще встречается в Северной Африке и на Африканском Роге , а также встречается с более низкими частотами на Ближнем Востоке , в Европе и Южной Африке . E-V38 более распространен в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и Великих африканских озерах , а с меньшей частотой встречается в Северной Африке и на Ближнем Востоке.

Параклада, обозначаемая как E-P2*, включая случаи, которых нет ни в E-V38, ни в E-M215, либо редка, либо отсутствует, и до сих пор ни одна из них не обнаружена. [3]

Семино и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35,xM2) у 10,4% из 48 эфиопских амхаров , 12,8% из 78 эфиопских оромо , 1,9% из 53 южноафриканских банту и 2,9% из 139 сенегальцев . [8]

Вуд и др. (2005) сообщили об обнаружении E-P2(xP1, xM35) у 11% (1/9) выборки оромо из Эфиопии, 11% (1/9) выборки иракцев из Танзании, 10% (2/ 20) смешанной выборки носителей различных южносемитских языков из Эфиопии, 6% (1/18) выборки амхара из Эфиопии, 3% (1/30) выборки эве из Ганы, 3% (1 /32) выборки фанте из Ганы и 3% (1/34) выборки волофов из Гамбии/Сенегала. [9]

Стеффлова и др. (2009) сообщили об одном человеке из выборки из 199 афроамериканцев из Филадельфии с E-P2 (xM35, xM2). [10]

По данным Кручиани и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у: 18% из 22 эфиопских евреев , 2% из 49 мосси из Буркина-Фасо , 3% из 37 римайбе также из Буркина-Фасо и 6% из 17 фульбе из Камеруна . [11]

Семино и др. (2002) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у 18,2% из 88 эфиопов. [12] [13]

Моран и др. (2004) обнаружили E-P2 (xM35, xM2) у эфиопских спортсменов и контрольных групп и сообщили о следующих результатах; Общий контроль: 4% (4/95), контроль Арси: 8% (7/85), 5-10К: 22% (5/23) и легкая атлетика: 11% (2/11). [14]

Субклады

[ редактировать ]

Гаплогруппа E-M215 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

Гаплогруппа E-V38 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

Основная статья: Гаплогруппа E-M329

Гаплогруппа E-M329 является субкладом гаплогруппы E-P2. [1]

Филогенетика

[ редактировать ]

Филогенетическая история

[ редактировать ]

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть прежде всего своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (сокращенно) (а) (б) (с) (г) (е) (г) (или) YCC 2002 (от руки) YCC 2005 (от руки) YCC 2008 (от руки) YCC 2010r (от руки) ИСОГГ 2006 г. ИСОГГ 2007 ИСОГГ 2008 ИСОГГ 2009 ИСОГГ 2010 ИЗОГГ 2011 ИЗОГГ 2012
E-P29 21 III 13 Еу3 Н2 Б И* И И И И И И И И И И
Э-М33 21 III 13 Еу3 Н2 Б Е1* Е1 Е1а Е1а Е1 Е1 Е1а Е1а Е1а Е1а Е1а
Э-М44 21 III 13 Еу3 Н2 Б Е1а Е1а Е1а1 Е1а1 Е1а Е1а Е1а1 Е1а1 Е1а1 Е1а1 Е1а1
Э-М75 21 III 13 Еу3 Н2 Б Е2а Е2 Е2 Е2 Е2 Е2 Е2 Е2 Е2 Е2 Е2
Э-М54 21 III 13 Еу3 Н2 Б Е2б Е2б Е2б E2b1 - - - - - - -
Е-П2 25 III 4 14 Еу3 Н2 Б Е3* Е3 Е1б E1b1 Е3 Е3 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1 E1b1
Э-М2 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а* Е3а E1b1 E1b1a Е3а Е3а E1b1a E1b1a E1b1a E1b1a1 E1b1a1
Э-М58 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а1 Е3а1 E1b1a1 E1b1a1 Е3а1 Е3а1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1 E1b1a1a1a E1b1a1a1a
Э-М116.2 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E3a2 E3a2 E1b1a2 E1b1a2 E1ba12 удаленный удаленный
Э-М149 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а3 Е3а3 E1b1a3 E1b1a3 Е3а3 Е3а3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a3 E1b1a1a1c E1b1a1a1c
Э-М154 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а4 Е3а4 E1b1a4 E1b1a4 Е3а4 Е3а4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a4 E1b1a1a1g1c E1b1a1a1g1c
Э-М155 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а5 Е3а5 E1b1a5 E1b1a5 Е3а5 Е3а5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a5 E1b1a1a1d E1b1a1a1d
Э-М10 8 III 5 15 ЕС2 Н2 Б Е3а6 Е3а6 E1b1a6 E1b1a6 Е3а6 Е3а6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a6 E1b1a1a1e E1b1a1a1e
Э-М35 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b* E3b E1b1b1 E1b1b1 E3b1 E3b1 E1b1b1 E1b1b1 E1b1b1 удаленный удаленный
Э-М78 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b1* E3b1 E1b1b1a E1b1b1a1 E3b1a E3b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a E1b1b1a1 E1b1b1a1
Э-М148 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b1a E3b1a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E3b1a3a E3b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a3a E1b1b1a1c1 E1b1b1a1c1
Э-М81 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b2* E3b2 E1b1b1b E1b1b1b1 E3b1b E3b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b E1b1b1b1 E1b1b1b1a
Э-М107 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b2a E3b2a E1b1b1b1 E1b1b1b1a E3b1b1 E3b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1 E1b1b1b1a E1b1b1b1a1
Э-М165 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b2b E3b2b E1b1b1b2 E1b1b1b1b1 E3b1b2 E3b1b2 E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b2a E1b1b1b1a2a
Э-М123 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b3* E3b3 E1b1b1c E1b1b1c E3b1c E3b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1c E1b1b1b2a
Э-М34 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3b3a* E3b3a E1b1b1c1 E1b1b1c1 E3b1c1 E3b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1c1 E1b1b1b2a1
Э-М136 25 III 4 14 Еу4 Н2 Б E3ba1 E3b3a1 E1b1b1c1a E1b1b1c1a1 E3b1c1a E3b1c1a E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1c1a1 E1b1b1b2a1a1

Научные публикации

[ редактировать ]

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.

Филогенетические деревья

[ редактировать ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве Карафета YCC 2008 (2008). [15] и последующие опубликованные исследования.

E1b1 ( P2

См. также

[ редактировать ]

Генетика

[ редактировать ]

Y-ДНК и субклады

[ редактировать ]

Основополагающее дерево Y-ДНК

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с д и «E-P177 YДерево» .
  2. ^ Jump up to: а б Семино, Орнелла; и др. (май 2004 г.). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–1034. дои : 10.1086/386295 . ISSN   0002-9297 . OCLC   4922408279 . ПМК   1181965 . ПМИД   15069642 . 17859431.
  3. ^ Jump up to: а б с Тромбетта и др. (2011)
  4. ^ Мартиниано, Руи; Санктис, Бьянка Де; Халласт, Таблетки; Дурбин, Ричард (20 декабря 2020 г.). «Дополнительный материал: размещение древних последовательностей ДНК в эталонных филогениях» . Молекулярная биология и эволюция . 39 (2):2020.12.19.423614. bioRxiv   10.1101/2020.12.19.423614 . дои : 10.1093/molbev/msac017 . ПМЦ   8857924 . ПМИД   35084493 . S2CID   229549849 .
  5. ^ Льоренте, М. Гальего; и др. (13 ноября 2015 г.). «Древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке» . Наука . 350 (6262): 820–822. Бибкод : 2015Sci...350..820L . дои : 10.1126/science.aad2879 . hdl : 2318/1661894 . ПМИД   26449472 . S2CID   25743789 .
  6. ^ Льоренте, М. Гальего; и др. (13 ноября 2015 г.). «Дополнительные материалы: древний эфиопский геном обнаруживает обширную евразийскую примесь в Восточной Африке» (PDF) . Наука . 350 (6262): 820–822. Бибкод : 2015Sci...350..820L . дои : 10.1126/science.aad2879 . hdl : 2318/1661894 . ПМИД   26449472 . S2CID   25743789 .
  7. ^ Бадро, Даниэль А.; Дуэи, Бушра; Хабер, Марк; Юханна, Соня С.; Саллум, Анжелика; Гассибе-Саббах, Мишелла; Джонсруд, Брайан; Хазен, Жорж; Матису-Смит, Элизабет; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Уэллс, Р. Спенсер; Тайлер-Смит, Крис; Платт, Дэниел Э.; Заллуа, Пьер А.; Консорциум, The Genographic (30 января 2013 г.). «Генетика Y-хромосомы и мтДНК выявляет значительные различия в сходстве современного населения Ближнего Востока с населением Европы и Африки» . ПЛОС ОДИН . 8 (1): e54616. Бибкод : 2013PLoSO...854616B . дои : 10.1371/journal.pone.0054616 . ISSN   1932-6203 . ПМЦ   559847 . ПМИД   23382925 .
  8. ^ Семино и др. (2004)
  9. ^ Вуд и др. (2005)
  10. ^ Стеффлова и др. (2009)
  11. ^ Кручиани и др. (2002)
  12. ^ Семино и др. (2002)
  13. ^ Андерхилл и др. (2000)
  14. ^ Моран и др. (2004)
  15. ^ Карафет и др. (2008)

Библиография

[ редактировать ]
  • Кручиани, Фульвио; Сантоламазца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олкерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; Дестро-Бисоль, Джованни; Койя, Валентина; Уоллес, Дуглас К.; Офнер, Питер Дж.; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Скоццари, Розария; Андерхилл, Питер А. (2002), «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары поддерживается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением», Американский журнал генетики человека , 70 (5): 1197–214. , doi : 10.1086/340257 , PMC   447595 , PMID   11910562
  • Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламазца, Пьеро; Селитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Уотсон, Элизабет; Гид Валентина; Коломб, Элиан Беро; Захарова, Бориана; Лавинья, Жуан; Вона, Джузеппе; Аман, Рашид; Кали, Франческо; Акар, Неджат; Ричардс, Мартин; Торрони, Антонио; Новеллетто, Андреа; Скоццари, Розария (2004), «Филогеографический анализ Y-хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события внутри и из Африки», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1014–22, doi : 10.1086 /386294 , PMC   1181964 , PMID   15042509
  • Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, М.Ф. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi : 10.1101/gr.7172008 , PMC   2336805 , PMID   18385274
  • Моран, Колин Н.; Скотт, Роберт А.; Адамс, Сьюзен М.; Уоррингтон, Саманта Дж.; Джоблинг, Марк А.; Уилсон, Ричард Х.; Гудвин, Уильям Х.; Георгиадес, Эвелина; Вольде, Безабхе; Питсиладис, Яннис П. (2004), «Гаплогруппы Y-хромосомы элитных эфиопских бегунов на выносливость», Human Genetics , 115 (6): 492–7, doi : 10.1007/s00439-004-1202-y , PMID   15503146 , S2CID   13960753
  • Семино, Орнелла; Сантакьяра-Бенерекетти, А. Сильвана; Фаласки, Франческо; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А. (2002), «Эфиопы и койсанцы разделяют самые глубокие клады филогении Y-хромосомы человека», Американский журнал генетики человека , 70 (1): 265–268, doi : 10.1086/338306 , PMC   384897 , PMID   11719903
  • Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А.; Аль-Захери, Надя; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Триантафиллидис, Костас; Шен, Пейдун; Офнер, Питер Дж.; Животовский Лев А.; Кинг, Рой; Торрони, Антонио; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Андерхилл, Питер А.; Сантакьяра-Бенерекетти, А. Сильвана (2004), «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье», Американский журнал генетики человека , 74 (5): 1023–34, doi : 10.1086/386295 , PMC   1181965 , PMID   15069642
  • Стеффлова, Клара; Дулик, Мэтью С.; Пай, Атма А.; Уокер, Эми Х.; Зейглер-Джонсон, Чарнита М.; Гуйе, Серинь М.; Шурр, Теодор Г.; Реббек, Тимоти Р. (2009), Релетфорд, Джон (ред.), «Оценка группового генетического происхождения популяций из Филадельфии и Дакара в контексте примеси по признаку пола в Америке», PLOS ONE , 4 (11): e7842, Bibcode : 2009PLoSO...4.7842S , doi : 10.1371/journal.pone.0007842 , PMC   2776971 , PMID   19946364
  • Тромбетта, Бениамино; Кручиани, Фульвио; Селитто, Даниэле; Скоццари, Розария (2011), Маколей, Винсент (редактор), «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов», PLOS ONE , 6 (1): e16073, Bibcode : 2011PLoSO...616073T , doi : 10.1371/journal.pone.0016073 , PMC   3017091 , PMID   21253605
  • Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; Пассарино, Джузеппе; Ян, Вэй Х.; Кауфман, Эрин; Бонне-Тамир, Батшева; Бертранпети, Жауме; Франкалаччи, Паоло; Ибрагим, Мунтасер; Дженкинс, Трефор; Кидд, Джудит Р.; Мехди, С. Касим; Зейлстад, Марк Т.; Уэллс, Р. Спенсер; Пьяцца, Альберто; Дэвис, Рональд В.; Фельдман, Маркус В.; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Офнер, Питер. J. (2000), «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций», Nature Genetics , 26 (3): 358–61, doi : 10.1038/81685 , PMID   11062480 , S2CID   12893406
  • Вуд, Элизабет Т; Стовер, Дарин А; Эрет, Кристофер; Дестро-Бисоль, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; Штрассманн, Беверли I; Судьял, Химла; Хаммер, Майкл Ф. (2005), «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов, связанных с полом», European Journal of Human Genetics , 13 (7): 867–76, doi : 10.1038/sj. ejhg.5201408 , PMID   15856073

Источники таблиц преобразования

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 44572fa74380abcab3ece9e1f85329cc__1722712260
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/44/cc/44572fa74380abcab3ece9e1f85329cc.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Haplogroup E-P2 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)