Ацетил-КоА-синтетаза

Ацетил-КоА-синтетаза (ACS) или ацетат-КоА-лигаза представляет собой фермент ( EC 6.2.1.1 ), участвующий в метаболизме ацетата . Он относится к классу ферментов лигаз , что означает, что он катализирует образование новой химической связи между двумя большими молекулами.

Реакция

Две соединенные молекулы, составляющие ацетил-КоА, представляют собой ацетат и кофермент А (КоА). Полная реакция со всеми включенными субстратами и продуктами:

АТФ + Ацетат + КоА → АМФ + Пирофосфат + Ацетил-КоА ^{[ 1 ]}

После образования ацетил-КоА его можно использовать в цикле ТСА при аэробном дыхании для производства энергии и переносчиков электронов. Это альтернативный метод запуска цикла, поскольку более распространенным способом является получение ацетил-КоА из пирувата через комплекс пируватдегидрогеназы . Активность фермента осуществляется в митохондриальном матриксе , поэтому продукты находятся в нужном месте для использования на следующих метаболических этапах. ^{[ 2 ]} Ацетил-Ко-А также можно использовать в синтезе жирных кислот , и общей функцией синтетазы является производство ацетил-Ко-А для этой цели. ^{[ 3 ]}

Реакция, катализируемая ацетил-КоА-синтетазой, протекает в две стадии. Во-первых, АМФ должен быть связан с ферментом, чтобы вызвать конформационные изменения в активном центре , которые позволяют протекать реакции. Активный сайт называется А-кластером. ^{[ 4 ]} В активном центре должен присутствовать решающий остаток лизина , чтобы катализировать первую реакцию, в которой связывается Ко-А. Затем Со-А поворачивается в активном центре в положение, в котором ацетат может ковалентно связываться с КоА. Ковалентная связь образуется между атомом серы в Со-А и центральным атомом углерода ацетата. ^{[ 5 ]}

Форма ацетил-КоА-синтетазы ACS1 кодируется геном facA, который активируется ацетатом и деактивируется глюкозой. ^{[ 6 ]}

Структура

Трехмерная структура асимметричной ACS (идентификатор RCSB PDB: 1PG3) показывает, что она состоит из двух субъединиц. Каждая субъединица состоит в основном из двух доменов. Более крупный N-концевой домен состоит из 517 остатков, а меньший С-концевой домен состоит из 130 остатков. ^{[ 7 ]} Каждая субъединица имеет активный сайт , в котором удерживаются лиганды. Кристаллическую структуру АКС определяли с помощью КоА и аденозин - 5'-пропилфосфата, связанных с ферментом. Причина использования аденозин-5'-пропилфосфата заключается в том, что он является конкурентным ингибитором АТФ , который предотвращает любые конформационные изменения фермента. Адениновое кольцо АМФ/АТФ удерживается в гидрофобном кармане, образованном остатками Ile (512) и Trp (413). ^{[ 7 ]}

Источником кристаллической структуры является организм Salmonella typhimurium (штамм LT2/SGSC1412/ATCC 700720). Ген ACS затем трансфицировали в Escherichia coli BL21(DE3) для экспрессии. При хроматографии в процессе выделения фермента субъединицы выделялись индивидуально, и общая структура определялась отдельно. ^{[ 7 ]} Для определения структуры использовался метод рентгеновской дифракции с разрешением 2,3 ангстрема. Значения и углы элементарной ячейки представлены в следующей таблице:

Элементарная ячейка
Длина (Å)	Угол (°)
а = 59,981	а= 90,00
б= 143,160	β= 91,57
с = 71,934	с= 90,00

Функция

Роль фермента ACS заключается в объединении ацетата и кофермента А с образованием ацетил-КоА, однако его значение гораздо больше. Наиболее известной функцией продукта этой ферментативной реакции является использование ацетил-КоА в цикле ТСА, а также в производстве жирных кислот . Этот фермент жизненно важен для ацетилирования гистонов, а также для регуляции генов. ^{[ 9 ]} Эффект этого ацетилирования имеет далеко идущие последствия у млекопитающих. Было показано, что подавление гена acs в области гиппокампа мышей приводит к снижению уровня ацетилирования гистонов, но также ухудшает долговременную пространственную память животного. Этот результат указывает на связь между клеточным метаболизмом, регуляцией генов и когнитивной функцией. ^{[ 9 ]} Было показано, что этот фермент является интересным биомаркером наличия опухолей при колоректальном раке. Когда ген присутствует, клетки способны поглощать ацетат в качестве источника пищи, чтобы преобразовать его в ацетил-КоА во время стрессовых состояний. В случаях опухолей карциномы на поздних стадиях гены этого фермента были подавлены, что указывало на плохую 5-летнюю выживаемость . ^{[ 10 ]} Экспрессия фермента также связана с развитием метастатических опухолевых узлов, что приводит к плохой выживаемости пациентов с почечно-клеточным раком. ^{[ 11 ]}

Регулирование

Активность фермента контролируют несколькими способами. Незаменимый остаток лизина в активном центре играет важную роль в регуляции активности. Молекула лизина может быть деацетилирована ферментом другого класса, называемым сиртуинами . У млекопитающих цитоплазматическая ядерная синтетаза (AceCS1) активируется SIRT1 , тогда как митохондриальная синтетаза (AceCS2) активируется SIRT3 . Это действие увеличивает активность этого фермента. ^{[ 2 ]} Точное расположение остатка лизина варьируется у разных видов, у людей он встречается на уровне Lys-642, но всегда присутствует в активном центре фермента. ^{[ 12 ]} Поскольку при связывании молекулы АМФ происходит существенное аллостерическое изменение, присутствие АМФ может способствовать регуляции фермента. Концентрация АМФ должна быть достаточно высокой, чтобы он мог связываться в аллостерическом сайте связывания и позволять другим субстратам проникать в активный сайт. Кроме того, ионы меди дезактивируют ацетил-Ко-А-синтетазу, занимая проксимальный участок активного сайта А-кластера, что не позволяет ферменту принять метильную группу для участия в пути Вуда-Люнгдала. ^{[ 4 ]} Присутствие всех реагентов в правильной концентрации также необходимо для правильного функционирования, как и во всех ферментах. Ацетил-КоА-синтетаза также вырабатывается, когда она необходима для синтеза жирных кислот , но в нормальных условиях ген неактивен и имеет определенные транскрипционные факторы, которые при необходимости активируют транскрипцию. ^{[ 3 ]} Помимо сиртуинов, протеиндеацетилаза (AcuC) также может модифицировать ацетил-КоА-синтетазу по остатку лизина. Однако, в отличие от сиртуинов, AcuC не нуждается в НАД+ в качестве косубстрата. ^{[ 13 ]}

Роль в экспрессии генов

Хотя активность ацетил-КоА-синтетазы обычно связана с метаболическими путями, фермент также участвует в экспрессии генов. У дрожжей ацетил-КоА-синтетаза доставляет ацетил-КоА к гистон-ацетилтрансферазам для ацетилирования гистонов. Без правильного ацетилирования ДНК не может должным образом конденсироваться в хроматин , что неизбежно приводит к ошибкам транскрипции. ^{[ 14 ]}

Промышленное применение

FAEE (C12), полученный с использованием пути биосинтеза Кислинга в сконструированной E. coli (A2A). Возможны разные типы в зависимости от количества включенных звеньев ацетил-КоА (в результате образуются цепочки с четным числом).

Типичная молекула жирной кислоты (пальмитиновая кислота, C16)

Воспользовавшись преимуществами путей, использующих ацетил-КоА в качестве субстрата, можно получить инженерные продукты, которые потенциально могут стать потребительскими товарами. Путем сверхэкспрессии гена acs и использования ацетата в качестве сырья можно увеличить выработку жирных кислот (ЖК). ^{[ 15 ]} Использование ацетата в качестве исходного сырья встречается редко, поскольку ацетат является обычным отходом метаболизма E. coli и в высоких концентрациях токсичен для организма. Приспособив кишечную палочку к использованию ацетата в качестве сырья, эти микробы смогли выжить и производить свои модифицированные продукты. Эти жирные кислоты затем можно использовать в качестве биотоплива после отделения от среды, требуя дальнейшей обработки ( переэтерификации ) для получения пригодного к использованию биодизельного топлива. Оригинальный протокол адаптации для индукции высокого уровня поглощения ацетата был разработан в 1959 году как средство, индуцирующее механизмы голодания у E. coli . ^{[ 16 ]}

Переэтерификация жирных кислот в сложноэфирный механизм

Внутриклеточный

$Acetate\Longrightarrow Acetyl-CoA$

$Acetyl-CoA\Longrightarrow FAs$

Ацетил-КоА, образующийся при расщеплении сахаров при гликолизе, использовался для образования жирных кислот. Однако разница заключается в том, что штамм Кислинга способен синтезировать собственный этанол и перерабатывать ( путем переэтерификации ) жирные кислоты для создания стабильных этиловых эфиров жирных кислот (FAEE). Устранение необходимости дальнейшей обработки перед получением годного к использованию топливного продукта в дизельных двигателях. ^{[ 17 ]}

$glucose\Longrightarrow Acetyl-CoA$

Ацетил-КоА используется при производстве этанола и жирных кислот.

$Acetyl-CoA\Longrightarrow fatty\;acid+ethanol$

Трансэтерификация

$fatty\;acid+ethanol\Longrightarrow FAEE$

Были проведены предварительные исследования, в которых сочетание этих двух методов привело к получению FAEE с использованием ацетата в качестве единственного источника углерода с использованием комбинации методов, описанных выше. ^{[ 18 ]}^{[ ненадежный источник ]} Уровни производства всех упомянутых методов не достигают уровня, необходимого для крупномасштабных применений (пока).

Ссылки

^ КЕГГ
^ Перейти обратно: ^а ^б Швер Б., Банкенборг Дж., Вердин Р.О., Андерсен Дж.С., Вердин Э. (июль 2006 г.). «Обратимое ацетилирование лизина контролирует активность митохондриального фермента ацетил-КоА-синтетазы 2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (27): 10224–10229. дои : 10.1073/pnas.0603968103 . ПМЦ 1502439 . ПМИД 16788062 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Икеда Ю., Ямамото Дж., Окамура М., Фуджино Т., Такахаси С., Такеучи К., Осборн Т.Ф., Ямамото Т.Т., Ито С., Сакаи Дж. (сентябрь 2001 г.). «Регуляция транскрипции гена мышиной ацетил-КоА-синтетазы 1 через несколько кластерных сайтов связывания для белков, связывающих регуляторные элементы стерола, и один соседний сайт для Sp1» . Журнал биологической химии . 276 (36): 34259–69. дои : 10.1074/jbc.M103848200 . ПМИД 11435428 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Брамлетт М.Р., Тан X, Линдал П.А. (август 2003 г.). «Инактивация ацетил-КоА-синтазы/дегидрогеназы монооксида углерода медью» . Журнал Американского химического общества . 125 (31): 9316–7. дои : 10.1021/ja0352855 . ПМИД 12889960 .
^ PDB : 1RY2 ; Джогл Г., Тонг Л. (февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура дрожжевой ацетил-коэнзима А-синтетазы в комплексе с АМФ». Биохимия . 43 (6): 1425–31. дои : 10.1021/bi035911a . ПМИД 14769018 .
^ Де Сима С., Руа Х., Пердигеро Э., дель Валье П., Бусто Ф., Бароха-Мазо А., де Арриага Д. (7 апреля 2005 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза, не кодируемая геном facA, экспрессируется при углеродном голодании у Phycomyces blakesleeanus» . Исследования в области микробиологии . 156 (5–6): 663–9. дои : 10.1016/j.resmic.2005.03.003 . ПМИД 15921892 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ВВП : 1PG3 ; Гулик А.М., Старай В.Дж., Хорсвилл А.Р., Хомик К.М., Эскаланте-Семерена Дж.К. (март 2003 г.). «Кристаллическая структура 1,75 А ацетил-КоА-синтетазы, связанной с аденозин-5'-пропилфосфатом и коферментом А». Биохимия . 42 (10): 2866–73. дои : 10.1021/bi0271603 . ПМИД 12627952 .
^ Система молекулярной графики PyMOL, версия 2.0 Schrödinger, LLC.
^ Перейти обратно: ^а ^б Мьюс П., Донахью Г., Дрейк А.М., Лузак В., Абель Т., Бергер С.Л. (июнь 2017 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза регулирует ацетилирование гистонов и память гиппокампа» . Природа . 546 (7658): 381–386. дои : 10.1038/nature22405 . ПМК 5505514 . ПМИД 28562591 .
^ Пэ Дж.М., Ким Дж.Х., О Х.Дж., Пак Х.Э., Ли Т.Х., Чо Нью-Йорк, Кан Г.Х. (февраль 2017 г.). «Понижение уровня ацетил-КоА-синтетазы 2 является метаболическим признаком прогрессирования и агрессивности опухоли при колоректальной карциноме» . Современная патология . 30 (2): 267–277. дои : 10.1038/modpathol.2016.172 . ПМИД 27713423 . S2CID 2474320 .
^ Чжан С., Хэ Дж., Цзя З., Ян З., Ян Дж. (март 2018 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза 2 усиливает онкогенез и указывает на плохой прогноз для пациентов с почечно-клеточной карциномой». Урологическая онкология . 36 (5): 243.e9–243.e20. дои : 10.1016/j.urolonc.2018.01.013 . ПМИД 29503142 .
^ Hallows WC, Ли С., Дену Дж. М. (июль 2006 г.). «Сиртуины деацетилируют и активируют ацетил-КоА-синтетазу млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (27): 10230–10235. дои : 10.1073/pnas.0604392103 . ПМЦ 1480596 . ПМИД 16790548 .
^ Гарднер Дж.Г., Гранди Ф.Дж., Хенкин Т.М., Эскаланте-Семерена Дж.К. (август 2006 г.). «Контроль активности ацетил-коэнзима А-синтетазы (AcsA) путем ацетилирования/деацетилирования без участия НАД (+) в Bacillus subtilis» . Журнал бактериологии . 188 (15): 5460–8. дои : 10.1128/JB.00215-06 . ПМК 1540023 . ПМИД 16855235 .
^ Такахаши Х., Маккаффери Дж.М., Иризарри Р.А., Буке Дж.Д. (июль 2006 г.). «Нуклеоцитозольная ацетил-кофермент а-синтетаза необходима для ацетилирования гистонов и глобальной транскрипции» . Молекулярная клетка . 23 (2): 207–17. doi : 10.1016/j.molcel.2006.05.040 . ПМИД 16857587 .
^ Сяо Ю, Жуань З, Лю З, Ву С.Г., Варман А.М., Лю Ю, Тан Ю.Дж. (2013). «Разработка Escherichia coli для преобразования уксусной кислоты в свободные жирные кислоты». Журнал биохимической инженерии . 76 : 60–69. дои : 10.1016/j.bej.2013.04.013 .
^ Гласки А.Дж., Рафельсон М.Е. (август 1959 г.). «Использование ацетата-C14 Escherichia coli, выращенной на ацетате, в качестве единственного источника углерода» . Журнал биологической химии . 234 (8): 2118–22. дои : 10.1016/S0021-9258(18)69876-X . ПМИД 13673023 .
^ Стин Э.Дж., Кан Ю., Бокински Г., Ху З., Ширмер А., МакКлюр А., Дель Кардайр С.Б., Кислинг Дж.Д. (январь 2010 г.). «Микробное производство топлива и химикатов на основе жирных кислот из растительной биомассы». Природа . 463 (7280): 559–62. дои : 10.1038/nature08721 . ПМИД 20111002 . S2CID 4425677 .
^ Бануэлос С., Сервантес Е., Перес Е., Тан С. (март 2017 г.). От токсичных побочных продуктов к биотопливу: адаптация модифицированной Escherichia coli для производства этиловых эфиров жирных кислот из ацетата. Курс Стэнфордского университета: CHEMENG 185B (Отчет).

[1] КЕГГ

[Schwer_2006-2] Перейти обратно: ^а ^б Швер Б., Банкенборг Дж., Вердин Р.О., Андерсен Дж.С., Вердин Э. (июль 2006 г.). «Обратимое ацетилирование лизина контролирует активность митохондриального фермента ацетил-КоА-синтетазы 2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (27): 10224–10229. дои : 10.1073/pnas.0603968103 . ПМЦ 1502439 . ПМИД 16788062 .

[Ikeda_2001_34259–69-3] Перейти обратно: ^а ^б Икеда Ю., Ямамото Дж., Окамура М., Фуджино Т., Такахаси С., Такеучи К., Осборн Т.Ф., Ямамото Т.Т., Ито С., Сакаи Дж. (сентябрь 2001 г.). «Регуляция транскрипции гена мышиной ацетил-КоА-синтетазы 1 через несколько кластерных сайтов связывания для белков, связывающих регуляторные элементы стерола, и один соседний сайт для Sp1» . Журнал биологической химии . 276 (36): 34259–69. дои : 10.1074/jbc.M103848200 . ПМИД 11435428 .

[Bramlett_2003_9316–7-4] Перейти обратно: ^а ^б Брамлетт М.Р., Тан X, Линдал П.А. (август 2003 г.). «Инактивация ацетил-КоА-синтазы/дегидрогеназы монооксида углерода медью» . Журнал Американского химического общества . 125 (31): 9316–7. дои : 10.1021/ja0352855 . ПМИД 12889960 .

[5] PDB : 1RY2 ; Джогл Г., Тонг Л. (февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура дрожжевой ацетил-коэнзима А-синтетазы в комплексе с АМФ». Биохимия . 43 (6): 1425–31. дои : 10.1021/bi035911a . ПМИД 14769018 .

[6] Де Сима С., Руа Х., Пердигеро Э., дель Валье П., Бусто Ф., Бароха-Мазо А., де Арриага Д. (7 апреля 2005 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза, не кодируемая геном facA, экспрессируется при углеродном голодании у Phycomyces blakesleeanus» . Исследования в области микробиологии . 156 (5–6): 663–9. дои : 10.1016/j.resmic.2005.03.003 . ПМИД 15921892 .

[Gulick_2003-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с ВВП : 1PG3 ; Гулик А.М., Старай В.Дж., Хорсвилл А.Р., Хомик К.М., Эскаланте-Семерена Дж.К. (март 2003 г.). «Кристаллическая структура 1,75 А ацетил-КоА-синтетазы, связанной с аденозин-5'-пропилфосфатом и коферментом А». Биохимия . 42 (10): 2866–73. дои : 10.1021/bi0271603 . ПМИД 12627952 .

[8] Система молекулярной графики PyMOL, версия 2.0 Schrödinger, LLC.

[:1-9] Перейти обратно: ^а ^б Мьюс П., Донахью Г., Дрейк А.М., Лузак В., Абель Т., Бергер С.Л. (июнь 2017 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза регулирует ацетилирование гистонов и память гиппокампа» . Природа . 546 (7658): 381–386. дои : 10.1038/nature22405 . ПМК 5505514 . ПМИД 28562591 .

[10] Пэ Дж.М., Ким Дж.Х., О Х.Дж., Пак Х.Э., Ли Т.Х., Чо Нью-Йорк, Кан Г.Х. (февраль 2017 г.). «Понижение уровня ацетил-КоА-синтетазы 2 является метаболическим признаком прогрессирования и агрессивности опухоли при колоректальной карциноме» . Современная патология . 30 (2): 267–277. дои : 10.1038/modpathol.2016.172 . ПМИД 27713423 . S2CID 2474320 .

[11] Чжан С., Хэ Дж., Цзя З., Ян З., Ян Дж. (март 2018 г.). «Ацетил-КоА-синтетаза 2 усиливает онкогенез и указывает на плохой прогноз для пациентов с почечно-клеточной карциномой». Урологическая онкология . 36 (5): 243.e9–243.e20. дои : 10.1016/j.urolonc.2018.01.013 . ПМИД 29503142 .

[12] Hallows WC, Ли С., Дену Дж. М. (июль 2006 г.). «Сиртуины деацетилируют и активируют ацетил-КоА-синтетазу млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (27): 10230–10235. дои : 10.1073/pnas.0604392103 . ПМЦ 1480596 . ПМИД 16790548 .

[13] Гарднер Дж.Г., Гранди Ф.Дж., Хенкин Т.М., Эскаланте-Семерена Дж.К. (август 2006 г.). «Контроль активности ацетил-коэнзима А-синтетазы (AcsA) путем ацетилирования/деацетилирования без участия НАД (+) в Bacillus subtilis» . Журнал бактериологии . 188 (15): 5460–8. дои : 10.1128/JB.00215-06 . ПМК 1540023 . ПМИД 16855235 .

[14] Такахаши Х., Маккаффери Дж.М., Иризарри Р.А., Буке Дж.Д. (июль 2006 г.). «Нуклеоцитозольная ацетил-кофермент а-синтетаза необходима для ацетилирования гистонов и глобальной транскрипции» . Молекулярная клетка . 23 (2): 207–17. doi : 10.1016/j.molcel.2006.05.040 . ПМИД 16857587 .

[15] Сяо Ю, Жуань З, Лю З, Ву С.Г., Варман А.М., Лю Ю, Тан Ю.Дж. (2013). «Разработка Escherichia coli для преобразования уксусной кислоты в свободные жирные кислоты». Журнал биохимической инженерии . 76 : 60–69. дои : 10.1016/j.bej.2013.04.013 .

[16] Гласки А.Дж., Рафельсон М.Е. (август 1959 г.). «Использование ацетата-C14 Escherichia coli, выращенной на ацетате, в качестве единственного источника углерода» . Журнал биологической химии . 234 (8): 2118–22. дои : 10.1016/S0021-9258(18)69876-X . ПМИД 13673023 .

[17] Стин Э.Дж., Кан Ю., Бокински Г., Ху З., Ширмер А., МакКлюр А., Дель Кардайр С.Б., Кислинг Дж.Д. (январь 2010 г.). «Микробное производство топлива и химикатов на основе жирных кислот из растительной биомассы». Природа . 463 (7280): 559–62. дои : 10.1038/nature08721 . ПМИД 20111002 . S2CID 4425677 .

[18] Бануэлос С., Сервантес Е., Перес Е., Тан С. (март 2017 г.). От токсичных побочных продуктов к биотопливу: адаптация модифицированной Escherichia coli для производства этиловых эфиров жирных кислот из ацетата. Курс Стэнфордского университета: CHEMENG 185B (Отчет).

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

v т и Ферменты : CO CS и CN лигазы ( EC 6.1-6.3).
6.1: Carbon-Oxygen	Aminoacyl tRNA synthetase Alanine Arginine Asparagine Aspartate Cysteine D-alanine—poly(phosphoribitol) ligase Glutamate Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine
6.2: Carbon-Sulfur	Succinyl coenzyme A synthetase Acetyl—CoA synthetase Long-chain-fatty-acid—CoA ligase
6.3: Carbon-Nitrogen	Glutamine synthetase Ubiquitin ligase Cullin Von Hippel–Lindau tumor suppressor UBE3A Mdm2 Anaphase-promoting complex UBR1 Glutathione synthetase CTP synthetase Adenylosuccinate synthase Argininosuccinate synthase Holocarboxylase synthetase GMP synthase Asparagine synthetase Carbamoyl phosphate synthetase I II Glutamate–cysteine ligase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)