C21orf58

C21orf58
Идентификаторы
Псевдонимы	C21orf58 , хромосома 21, открытая рамка считывания 58
Внешние идентификаторы	Гомологен : 137684 ; Генные карты : C21orf58 ; ОМА : C21orf58 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	46,323,875 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; bronchial epithelial cell; ; ventricular zone; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; mucosa of paranasal sinus; ; trabecular bone; ; ganglionic eminence; ; mucosa of transverse colon;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	54058
	н/д
	ENSG00000160298
	н/д
	P58505
	н/д
showНМ_001286462 ; НМ_001286463 ; НМ_001286476 ; НМ_001286477 ; НМ_058180 ;
	NM_199071
	н/д
	НП_001273391 ; НП_001273392 ; НП_001273405 ; НП_001273406 ; НП_478060
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

Открытая рамка считывания 58 хромосомы 21 (C21orf58) — это белок, который у человека кодируется геном C21orf58. ^{[ 3 ]}

Ген

Локус

Ген расположен на минусовой цепи дистальной половины длинного плеча 21 хромосомы в районе 21q22.3. ^{[ 4 ]} Транскрипт 1, включая UTR, имеет длину 22 740 п.н. и охватывает хромосомный локус 46 301 130–46 323 875. ^{[ 4 ]}

мРНК

Альтернативный сплайсинг

мРНК Варианты транскрипта 1–5 кодируют две подтвержденные изоформы белка C21orf58. ^{[ 5 ]}^{[ 4 ]} Вариант транскрипта 1 кодирует более длинную первичную изоформу (1) (Доступ: NP_470860). ^{[ 3 ]} Варианты транскрипта 2–5 кодируют более короткую изоформу (2). ^{[ 4 ]} Изоформа 2 имеет отличный N-конец по сравнению с изоформой 1, возникающий в результате использования альтернативного стартового кодона . ^{[ 4 ]} Домен неизвестной функции , DUF4587, консервативен во всех вариантах. ^{[ 4 ]}


Стенограмма ^{[ 4 ]}	Белок ^{[ 4 ]}	Длина (б.н.) ^{[ 4 ]}	Длина (аа) ^{[ 4 ]}	Экзоны ^{[ 4 ]}	DUF4587 (аа) ^{[ 4 ]}
1	Изоформа 1	2975	322	8	234-291
2	Изоформа 2	1674	216	9	128-185
3	Изоформа 2	2900	216	7	128-185
4	Изоформа 2	2941	216	9	128-185
5	Изоформа 2	2624	216	9	128-185

Белок

Общие свойства

Первично кодируемый белок состоит из 322 аминокислот , 8 экзонов и имеет молекулярную массу 39,0 кДа. ^{[ 3 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Прогнозируемая изоэлектрическая точка составляет 10,06, что подтверждает прогнозируемую ядерную локализацию. ^{[ 7 ]}^{[ 6 ]}

Состав

Человеческий белок C21orf58 Изоформа 1 богат пролином и глютамином и беден цистеином , фенилаланином и тирозином . ^{[ 7 ]} Белок особенно беден тирозином и не содержит остатков тирозина. ^{[ 7 ]} Изоформа 1 содержит на 20 положительно заряженных остатков больше, чем отрицательно заряженных остатков, что обеспечивает дополнительную поддержку предсказанной изоэлектрической точки. ^{[ 7 ]}

Домены и мотивы

Изоформа 1 C21orf58 имеет три консервативных домена: домен, богатый пролином, домен, богатый гистидином, и DUF4587. Домен, богатый пролином, Pro ¹⁷⁵-Про ³²², по прогнозам, опосредует белок-белковые взаимодействия. ^{[ 8 ]} Богатый гистидином повторяющийся домен, His ²⁹²-Его ²⁹⁹, как ожидается, облегчит локализацию. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Область неизвестной функции , DUF4587 (Arg ²³⁴- Его ²⁹¹⁾, является членом pfam15248, встречающегося исключительно у эукариот . ^{[ 11 ]}

C21orf58 содержит сигнал ядерной локализации . ¹³⁵- Леу ¹⁴⁴. ^{[ 12 ]}

Структура

Предполагается, что вторичная структура C21orf58 будет состоять в основном из случайных спиральных доменов с четырьмя областями альфа-спиралей по всему белку. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Прогнозы вторичной структуры ортологов C21orf58 показали аналогичные результаты; случайная катушка и четыре области альфа-спиралей с добавлением бета-листов повсюду. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Посттрансляционные модификации

Предполагается, что C21orf58 претерпит множество посттрансляционных модификаций , включая фосфорилирование , O-GlcNAc и SUMOylation . ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}

Субклеточная локализация

Иммуноцитохимия выявила локализацию C21orf58 в нуклеоплазме и ядерных тельцах. ^{[ 21 ]} Наличие последовательности ядерной локализации является дополнительным доказательством импорта белка в ядро клетки. ^{[ 14 ]}

Прогнозы субклеточной локализации C21orf58 на основе аминокислотной последовательности ( PSORTII ) предполагают ядерную локализацию. ^{[ 22 ]} Прогнозы ортологов согласовались с ядерной локализацией. ^{[ 22 ]}

Выражение

Паттерн экспрессии тканей

C21orf58 конститутивно экспрессируется на низких уровнях в различных нормальных тканях ( GDS3113 ), включая, помимо прочего, ткани головного мозга , эндокринной системы , костного мозга , легких и репродуктивной системы . ^{[ 23 ]}

Конститутивный низкий уровень экспрессии C21orf58 во всех проанализированных тканях (GDS3113) ^{[ 24 ]}

Экспериментальные данные ДНК-микрочипа

Анализ микрочипов ДНК из различных экспериментов показал вариабельную экспрессию C21orf58 в уникальных физиологических условиях.

Повышенный уровень экспрессии C21orf58 наблюдался в астроцитах, обработанных гарманом , химическим соединением, связанным с эссенциальным тремором (ЭТ), по сравнению с контролем ( GDS2919 ). ^{[ 25 ]}
Экспрессия C21orf58 повышалась, а затем снижалась в Т-лимфоцитах с течением времени после воздействия азаспирацида-1 (AZ-10), морского фикотоксина ( GDS3429 ). ^{[ 26 ]}
Было обнаружено, что экспрессия C21orf58 повышена у лиц с тератозооспермией по сравнению с экспрессией у лиц с нормоспермией ( GDS2697 ). ^{[ 27 ]} Тератозооспермия — это состояние, при котором сперматозоиды имеют аномальную морфологию, что влияет на мужскую фертильность . ^{[ 28 ]}

Было обнаружено, что C21orf58 экспрессируется на всех стадиях развития на одинаковых уровнях. ^{[ 29 ]}

Гибридизация in situ

Было обнаружено, что ортолог C21orf58 мыши 2610028H24Rik повсеместно экспрессируется на высоких уровнях по всему мозгу мыши. ^{[ 30 ]}

Регуляция экспрессии

Транскрипционный

Первичный промотор самого длинного варианта C21orf58 совпадает с началом 5'UTR и имеет длину 1143 п.н. ^{[ 31 ]} Предсказанная последовательность промотора перекрывается с 5'UTR и кодирующей последовательностью перицентрина ( PCNT ) на плюс-цепи хромосомы 21. Предсказанные факторы транскрипции связаны с регуляцией клеточного цикла , нейрогенезом , ранним развитием и определением пола .


Транскрипционный фактор ^{[ 31 ]}	Функция ^{[ 31 ]}
PLAG1	Связано с ядерным импортом Транскрипционный активатор
WT1	Роль в развитии мочеполовой системы
ZFX	Участвует в определении пола млекопитающих.
АП-2	Активация генов на раннем этапе развития Экспрессия в клеток нервного гребня линиях
Е2F4	клеточного цикла Контроль Подавление опухоли
c-Myb	Регуляция кроветворения
Лось-1	Транскрипционный активатор
КЛФ7	клеток Пролиферация , дифференциация и выживание Регулирует нейрогенез
ЗБТБ33	Способствует деацетилированию гистонов и образованию репрессивных хроматических структур.
бродить	Участвует в обонятельных дифференцировке нейронов.

Взаимодействующие белки

Скрининг дрожжево-двойного гибрида подтвердил белок-белковые взаимодействия с PNMA1 , MTUS2 , GRB2 . ^{[ 32 ]} Affinity Capture -MS показал взаимодействие с MTA2 , ASH2L и FAM199X. ^{[ 32 ]} Объединение двух гибридных жертв с последующим подходом с использованием двух гибридных массивов выявило взаимодействие с Ccdc136, Ccdc125, , KRT37 , KRT27 KRT35 , SPTA1 , MKRN3 , USHBP1 и KLHL20 . ^{[ 33 ]}

Предсказанные взаимодействия включали белки, связанные с цитоскелетом , миграцией клеток , модификацией гистонов и передачей сигналов .

Интерактор	Функция
ПНМА1	Белок, специфичный для нейронов и семенников ^{[ 34 ]} Связано с паранеопластическими неврологическими расстройствами. ^{[ 34 ]}
МТУС2	Каркасный белок, связанный с микротрубочками ^{[ 35 ]} Роль в миграции клеток и связывании микротрубочек с плазматической мембраной ^{[ 35 ]}
ГРБ2	Преобразование сигнала ^{[ 36 ]}
МТА2	Компонент NuRD, деацетилазного комплекса, ремоделирующего нуклеосомы. ^{[ 37 ]}
АШ2Л	Компонент комплекса гистона метилтрансферазы (HTM) HMT Set1/Ash2 ^{[ 38 ]}
Ккдк136	Образование акросом в сперматогенезе ^{[ 39 ]}
Ккдк125	Регуляция миграции клеток ^{[ 40 ]}
КРТ37	Кератин типа 1, который гетеродимеризуется с кератином типа II, образуя волосы и ногти. ^{[ 41 ]}
КРТ27	Член семейства кератинов I типа. Участвует в формировании промежуточных нитей. ^{[ 42 ]}
КРТ35	Кератин типа 1, который гетеродимеризуется с кератином типа II, образуя волосы и ногти. ^{[ 43 ]}
ЗИП1	Молекулярный каркасный белок, который связывает плазматическую мембрану с актиновым цитоскелетом. ^{[ 44 ]}
МКРН3	Играет роль в наступлении полового созревания Часть убиквитин-протеасомной системы. ^{[ 45 ]}
УШБП1	Белок, связывающий гармонин ^{[ 46 ]} Связывание актиновых нитей ^{[ 46 ]}
КЛХЛ20	Связывание актиновых нитей ^{[ 47 ]} Адаптер BCR, негативного регулятора апоптоза ^{[ 47 ]}

Гомология

Паралоги

Человеческих паралогов C21orf58 обнаружено не было. ^{[ 49 ]}

Ортологи

Ортологи C21orf58 были идентифицированы у костных рыб , но не у хрящевых рыб . ^{[ 50 ]} Первые 35 оснований DUF4587, Arg ²³⁴- Про ²⁶⁵, были сохранены во всех ортологичных последовательностях. ^{[ 51 ]} Самым отдаленным из выявленных ортологов была рыбка данио. ^{[ 50 ]}

Молекулярная эволюция

Скорость эволюции C21orf58 была определена с помощью гипотезы молекулярных часов . Путем сравнения с альфа-фибриногеном и цитохромом C было установлено, что C21orf58 развивается с промежуточной скоростью.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160298 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «неохарактеризованный белок C21orf58, изоформа 1 [Homo sapiens] - Белок - NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 февраля 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л «Открытая рамка считывания 58 хромосомы 21orf58 [Homo sapiens (человек)] — Ген — NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 февраля 2018 г.
^ «Ген: C21orf58 (ENSG00000160298) - Варианты сплайсинга - Homo sapiens - Браузер генома Ensembl 88» . mar2017.archive.ensembl.org . Проверено 18 февраля 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «ExPASy — инструмент вычисления pi/Mw» . web.expasy.org . Проверено 27 апреля 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ЭМБЛ-ЭБИ. «Результаты SAPS» . ebi.ac.uk. Проверено 27 апреля 2018 г.
^ Левицки М., Кардинал С., Геринг Н.Х., Шмидт Е.К., Конкол Б., Эйлитц М., Бирхмайер В., Шепер У., Феллер С.М. (март 2001 г.). «С-концевой SH3-домен адаптерного белка Grb2 с высокой аффинностью связывается с последовательностями в Gab1 и SLP-76, в которых отсутствует типичный для SH3 коровый мотив PxxP» . Онкоген . 20 (9): 1052–62. дои : 10.1038/sj.onc.1204202 . ПМИД 11314042 .
^ Эрнандес-Санчес И.Е., Марури-Лопес И., Феррандо А., Карбонелл Дж., Гретер С.П., Хименес-Бремонт Х.Ф. (07.09.2015). «Ядерная локализация дегидрина OpsDHN1 определяется богатым гистидином мотивом» . Границы в науке о растениях . 6 :702.дои : 10.3389 / fpls.2015.00702 . ПМЦ 4561349 . ПМИД 26442018 .
^ Со Я.А., Лопес В., Келлехер С.Л. (июнь 2011 г.). «Богатый гистидином мотив опосредует митохондриальную локализацию ZnT2 для модуляции митохондриальной функции» . Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 300 (6): C1479–89. doi : 10.1152/ajpcell.00420.2010 . ПМЦ 3118624 . ПМИД 21289295 .
^ группа, NIH/NLM/NCBI/IEB/CDD. «NCBI CDD Консервативный белковый домен DUF4587» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 апреля 2018 г. {{cite web}}: |last= имеет общее имя ( справка )
^ Косуги С., Хасебе М., Томита М., Янагава Х. (июнь 2009 г.). «Систематическая идентификация зависимых от клеточного цикла белков дрожжевого нуклеоцитоплазматического челнока путем предсказания сложных мотивов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (25): 10171–6. Бибкод : 2009PNAS..10610171K . дои : 10.1073/pnas.0900604106 . ПМК 2695404 . ПМИД 19520826 .
^ Келли, Лоуренс. «Сервер распознавания складок белка PHYRE2» . sbg.bio.ic.ac.uk. Проверено 7 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Комбе С, Бланше С, Журжон С, Делеаж Ж (март 2000 г.). «NPS @: анализ последовательностей сетевых белков». Тенденции биохимических наук . 25 (3): 147–50. дои : 10.1016/s0968-0004(99)01540-6 . ПМИД 10694887 .
^ Jump up to: ^а ^б Гарнье Дж., Диджей Осгуторп, Робсон Б. (март 1978 г.). «Анализ точности и применения простых методов предсказания вторичной структуры глобулярных белков». Журнал молекулярной биологии . 120 (1): 97–120. дои : 10.1016/0022-2836(78)90297-8 . ПМИД 642007 .
^ Jump up to: ^а ^б Чоу, Питер Ю.; Фасман, Джеральд Д. (15 января 1974 г.). «Прогнозирование конформации белка». Биохимия . 13 (2): 222–245. дои : 10.1021/bi00699a002 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 4358940 .
^ «Сканирование мотивов» . myhits.isb-sib.ch . Проверено 27 апреля 2018 г.
^ Басу С., Плевчинский Д. (апрель 2010 г.). «AMS 3.0: предсказание посттрансляционных модификаций» . БМК Биоинформатика . 11 : 210. дои : 10.1186/1471-2105-11-210 . ПМЦ 2874555 . ПМИД 20423529 .
^ Гупта Р., Брунак С. (2002). «Прогнозирование гликозилирования в протеоме человека и корреляция с функцией белка». Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу. Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 310–22. дои : 10.1142/9789812799623_0029 . ISBN 978-981-02-4777-5 . ПМИД 11928486 .
^ Хилгарт Р.С., Мерфи Л.А., Скэггс Х.С., Вилкерсон, округ Колумбия, Син Х., Сардж К.Д. (декабрь 2004 г.). «Регулирование и функции модификации СУМО» . Журнал биологической химии . 279 (52): 53899–902. дои : 10.1074/jbc.R400021200 . ПМИД 15448161 .
^ «C21orf58 - Антитела - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 1 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «ПСОРТ II Прогноз» . psort.hgc.jp . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «49003066 — Профили GEO — NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 мая 2018 г.
^ «ГДС3113/152620» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 мая 2018 г.
^ «ГДС2919/238541_ат» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «ГДС3429/19723» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «ГДС2697/238541_ат» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «Что такое тератозооспермия?» . Тератозооспермия . 06.04.2018 . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Группа Шулер. «Профиль EST — Hs.236572» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 7 мая 2018 г. {{cite web}}: |last= имеет общее имя ( справка )
^ «Детали эксперимента :: Атлас мозга Аллена: Мозг мыши» . mouse.brain-map.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Геноматикс: Результат Эльдорадо» . genomatix.de . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б Лаборатория, Майк Тайерс. «Сводка результатов C21orf58 | BioGRID» . thebiogrid.org . Проверено 5 мая 2018 г.
^ «По поисковому запросу C21orf58 найдено 31 двоичное взаимодействие» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген PNMA1 - GeneCards | Белок PNMA1 | Антитело PNMA1» . Genecards.org . Проверено 4 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген MTUS2 — GeneCards | Белок MTUS2 | Антитело MTUS2» . Genecards.org . Проверено 4 мая 2018 г.
^ «ГРБ2» . colab.its.virginia.edu . Проверено 5 мая 2018 г.
^ База данных GeneCards Human Gene. «Ген MTA2 - GeneCards | Белок MTA2 | Антитело MTA2» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «Ash2l — субъединица ASH2 комплекса гистонов метилтрансферазы Set1/Ash2 — Mus musculus (Мышь) — ген и белок Ash2l» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «CCDC136 - Белок 136, содержащий спирально-спиральный домен - Homo sapiens (человек) - ген и белок CCDC136» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ База данных GeneCards Human Gene. «Ген CCDC125 — GeneCards | Белок CC125 | Антитело CC125» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ База данных GeneCards Human Gene. «Ген KRT37 - GeneCards | Белок KRT37 | Антитело KRT37» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ База данных GeneCards Human Gene. «Ген KRT27 - GeneCards | Белок K1C27 | Антитело K1C27» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «KRT35 кератин 35 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.
^ База данных GeneCards Human Gene. «Ген SPTA1 - GeneCards | Белок SPTA1 | Антитело SPTA1» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Справочник, Дом генетики. «Ген MKRN3» . Домашний справочник по генетике . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген USHBP1 — GeneCards | Белок USBP1 | Антитело USBP1» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «KLHL20 - Кельх-подобный белок 20 - Homo sapiens (человек) - ген и белок KLHL20» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.
^ «Дерево Времени:: Временная шкала жизни» . timetree.org . Проверено 4 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «BLAST: базовый инструмент поиска локального выравнивания» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 мая 2018 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Protein BLAST: поиск по базам данных белков с помощью запроса белков» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 мая 2018 г.
^ ЭМБЛ-ЭБИ. «Инструменты биоинформатики для множественного выравнивания последовательностей <EMBL-EBI» . ebi.ac.uk. Проверено 4 мая 2018 г.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000160298 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:2-3] Jump up to: ^а ^б ^с «неохарактеризованный белок C21orf58, изоформа 1 [Homo sapiens] - Белок - NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 февраля 2018 г.

[:0-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л «Открытая рамка считывания 58 хромосомы 21orf58 [Homo sapiens (человек)] — Ген — NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 февраля 2018 г.

[:1-5] «Ген: C21orf58 (ENSG00000160298) - Варианты сплайсинга - Homo sapiens - Браузер генома Ensembl 88» . mar2017.archive.ensembl.org . Проверено 18 февраля 2018 г.

[:3-6] Jump up to: ^а ^б «ExPASy — инструмент вычисления pi/Mw» . web.expasy.org . Проверено 27 апреля 2018 г.

[:4-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ЭМБЛ-ЭБИ. «Результаты SAPS» . ebi.ac.uk. Проверено 27 апреля 2018 г.

[8] Левицки М., Кардинал С., Геринг Н.Х., Шмидт Е.К., Конкол Б., Эйлитц М., Бирхмайер В., Шепер У., Феллер С.М. (март 2001 г.). «С-концевой SH3-домен адаптерного белка Grb2 с высокой аффинностью связывается с последовательностями в Gab1 и SLP-76, в которых отсутствует типичный для SH3 коровый мотив PxxP» . Онкоген . 20 (9): 1052–62. дои : 10.1038/sj.onc.1204202 . ПМИД 11314042 .

[9] Эрнандес-Санчес И.Е., Марури-Лопес И., Феррандо А., Карбонелл Дж., Гретер С.П., Хименес-Бремонт Х.Ф. (07.09.2015). «Ядерная локализация дегидрина OpsDHN1 определяется богатым гистидином мотивом» . Границы в науке о растениях . 6 :702.дои : 10.3389 / fpls.2015.00702 . ПМЦ 4561349 . ПМИД 26442018 .

[10] Со Я.А., Лопес В., Келлехер С.Л. (июнь 2011 г.). «Богатый гистидином мотив опосредует митохондриальную локализацию ZnT2 для модуляции митохондриальной функции» . Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 300 (6): C1479–89. doi : 10.1152/ajpcell.00420.2010 . ПМЦ 3118624 . ПМИД 21289295 .

[11] группа, NIH/NLM/NCBI/IEB/CDD. «NCBI CDD Консервативный белковый домен DUF4587» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 апреля 2018 г. {{cite web}}: |last= имеет общее имя ( справка )

[12] Косуги С., Хасебе М., Томита М., Янагава Х. (июнь 2009 г.). «Систематическая идентификация зависимых от клеточного цикла белков дрожжевого нуклеоцитоплазматического челнока путем предсказания сложных мотивов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (25): 10171–6. Бибкод : 2009PNAS..10610171K . дои : 10.1073/pnas.0900604106 . ПМК 2695404 . ПМИД 19520826 .

[13] Келли, Лоуренс. «Сервер распознавания складок белка PHYRE2» . sbg.bio.ic.ac.uk. Проверено 7 мая 2018 г.

[:8-14] Jump up to: ^а ^б ^с Комбе С, Бланше С, Журжон С, Делеаж Ж (март 2000 г.). «NPS @: анализ последовательностей сетевых белков». Тенденции биохимических наук . 25 (3): 147–50. дои : 10.1016/s0968-0004(99)01540-6 . ПМИД 10694887 .

[:9-15] Jump up to: ^а ^б Гарнье Дж., Диджей Осгуторп, Робсон Б. (март 1978 г.). «Анализ точности и применения простых методов предсказания вторичной структуры глобулярных белков». Журнал молекулярной биологии . 120 (1): 97–120. дои : 10.1016/0022-2836(78)90297-8 . ПМИД 642007 .

[:10-16] Jump up to: ^а ^б Чоу, Питер Ю.; Фасман, Джеральд Д. (15 января 1974 г.). «Прогнозирование конформации белка». Биохимия . 13 (2): 222–245. дои : 10.1021/bi00699a002 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 4358940 .

[17] «Сканирование мотивов» . myhits.isb-sib.ch . Проверено 27 апреля 2018 г.

[18] Басу С., Плевчинский Д. (апрель 2010 г.). «AMS 3.0: предсказание посттрансляционных модификаций» . БМК Биоинформатика . 11 : 210. дои : 10.1186/1471-2105-11-210 . ПМЦ 2874555 . ПМИД 20423529 .

[19] Гупта Р., Брунак С. (2002). «Прогнозирование гликозилирования в протеоме человека и корреляция с функцией белка». Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу. Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 310–22. дои : 10.1142/9789812799623_0029 . ISBN 978-981-02-4777-5 . ПМИД 11928486 .

[20] Хилгарт Р.С., Мерфи Л.А., Скэггс Х.С., Вилкерсон, округ Колумбия, Син Х., Сардж К.Д. (декабрь 2004 г.). «Регулирование и функции модификации СУМО» . Журнал биологической химии . 279 (52): 53899–902. дои : 10.1074/jbc.R400021200 . ПМИД 15448161 .

[21] «C21orf58 - Антитела - Атлас белков человека» . www.proteinatlas.org . Проверено 1 мая 2018 г.

[:12-22] Jump up to: ^а ^б «ПСОРТ II Прогноз» . psort.hgc.jp . Проверено 06 мая 2018 г.

[23] «49003066 — Профили GEO — NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 мая 2018 г.

[24] «ГДС3113/152620» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 1 мая 2018 г.

[25] «ГДС2919/238541_ат» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.

[GDS3429_/_19723-26] Jump up to: ^а ^б «ГДС3429/19723» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.

[27] «ГДС2697/238541_ат» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.

[28] «Что такое тератозооспермия?» . Тератозооспермия . 06.04.2018 . Проверено 06 мая 2018 г.

[29] Группа Шулер. «Профиль EST — Hs.236572» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 7 мая 2018 г. {{cite web}}: |last= имеет общее имя ( справка )

[30] «Детали эксперимента :: Атлас мозга Аллена: Мозг мыши» . mouse.brain-map.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[:13-31] Jump up to: ^а ^б ^с «Геноматикс: Результат Эльдорадо» . genomatix.de . Проверено 06 мая 2018 г.

[:11-32] Jump up to: ^а ^б Лаборатория, Майк Тайерс. «Сводка результатов C21orf58 | BioGRID» . thebiogrid.org . Проверено 5 мая 2018 г.

[33] «По поисковому запросу C21orf58 найдено 31 двоичное взаимодействие» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

[:6-34] Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген PNMA1 - GeneCards | Белок PNMA1 | Антитело PNMA1» . Genecards.org . Проверено 4 мая 2018 г.

[:7-35] Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген MTUS2 — GeneCards | Белок MTUS2 | Антитело MTUS2» . Genecards.org . Проверено 4 мая 2018 г.

[36] «ГРБ2» . colab.its.virginia.edu . Проверено 5 мая 2018 г.

[37] База данных GeneCards Human Gene. «Ген MTA2 - GeneCards | Белок MTA2 | Антитело MTA2» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[38] «Ash2l — субъединица ASH2 комплекса гистонов метилтрансферазы Set1/Ash2 — Mus musculus (Мышь) — ген и белок Ash2l» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[39] «CCDC136 - Белок 136, содержащий спирально-спиральный домен - Homo sapiens (человек) - ген и белок CCDC136» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[40] База данных GeneCards Human Gene. «Ген CCDC125 — GeneCards | Белок CC125 | Антитело CC125» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[41] База данных GeneCards Human Gene. «Ген KRT37 - GeneCards | Белок KRT37 | Антитело KRT37» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[42] База данных GeneCards Human Gene. «Ген KRT27 - GeneCards | Белок K1C27 | Антитело K1C27» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[43] «KRT35 кератин 35 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 06 мая 2018 г.

[44] База данных GeneCards Human Gene. «Ген SPTA1 - GeneCards | Белок SPTA1 | Антитело SPTA1» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[45] Справочник, Дом генетики. «Ген MKRN3» . Домашний справочник по генетике . Проверено 06 мая 2018 г.

[:15-46] Jump up to: ^а ^б База данных GeneCards Human Gene. «Ген USHBP1 — GeneCards | Белок USBP1 | Антитело USBP1» . Genecards.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[:16-47] Jump up to: ^а ^б «KLHL20 - Кельх-подобный белок 20 - Homo sapiens (человек) - ген и белок KLHL20» . uniprot.org . Проверено 06 мая 2018 г.

[48] «Дерево Времени:: Временная шкала жизни» . timetree.org . Проверено 4 мая 2018 г.

[:14-49] Jump up to: ^а ^б «BLAST: базовый инструмент поиска локального выравнивания» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 мая 2018 г.

[:5-50] Jump up to: ^а ^б «Protein BLAST: поиск по базам данных белков с помощью запроса белков» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 мая 2018 г.

[51] ЭМБЛ-ЭБИ. «Инструменты биоинформатики для множественного выравнивания последовательностей <EMBL-EBI» . ebi.ac.uk. Проверено 4 мая 2018 г.

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]