Белок 3 распознавания пептидогликана

PGLYRP3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1SK3, 1SK4, 1TWQ, 2APH
Идентификаторы
Псевдонимы	PGLYRP3 , PGRP-Ialpha, PGRPIA, PGLYRPIalpha, белок распознавания пептидогликана 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 608197 ; МГИ : 2685266 ; Гомологен : 71559 ; Генные карты : PGLYRP3 ; ОМА : PGLYRP3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	153,312,952 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	91,938,889 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; skin of leg; ; vagina; ; tonsil; ; ectocervix; ; gonad; ; minor salivary glands; ; right lung; ; upper respiratory tract; ; face;
	Top expressed in
	esophagus; ; lip; ; embryo; ; zone of skin; ; tail of embryo; ; spinal ganglia; ; peripheral nervous system; ; foregut; ; stomach; ; limb;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	zinc ion binding; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity; peptidoglycan immune receptor activity; peptidoglycan binding; protein heterodimerization activity;
Cellular component	intracellular anatomical structure; membrane; extracellular region; protein-containing complex; extracellular space;
Biological process	immune system process; negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response; negative regulation of interferon-gamma production; innate immune response; defense response to bacterium; detection of bacterium; defense response to Gram-positive bacterium; peptidoglycan catabolic process; pattern recognition receptor signaling pathway; antimicrobial humoral response; positive regulation of cytolysis in other organism; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; killing of cells of other organism;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	114771
	242100
	ENSG00000159527
	ENSMUSG00000042244
	Q96LB9
	А1А547
	НМ_052891
	НМ_207247
	НП_443123
	НП_997130
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 3 распознавания пептидогликана ( PGLYRP3 , ранее PGRP-Iα) представляет собой антибактериальный и противовоспалительный врожденного иммунитета белок , который у человека кодируется PGLYRP3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Открытие

PGLYRP3 (ранее PGRP-Iα), член семейства белков распознавания пептидогликана человека (PGRP), был открыт в 2001 году Романом Дзиарским и его коллегами, которые клонировали и идентифицировали гены трех человеческих PGRP: PGRP-L, PGRP-Iα, и PGRP-Iβ (названный в честь транскриптов длинного и среднего размера), ^{[ 5 ]} и установили, что геном человека кодирует семейство из 4 PGRP: PGRP-S (сокращенно PGRP или PGRP-S). ^{[ 9 ]} и PGRP-L, PGRP-Iα и PGRP-Iβ. ^{[ 5 ]} Впоследствии Комитет по генной номенклатуре организации генома человека изменил символы генов PGRP-S, PGRP-L, PGRP-Iα и PGRP-Iβ на PGLYRP1 ( белок распознавания пептидогликана 1 ), PGLYRP2 ( белок распознавания пептидогликана 2 ), PGLYRP3 (белок распознавания пептидогликана 1). белок распознавания 3) и PGLYRP4 ( белок распознавания пептидогликана 4 ) соответственно, и эта номенклатура в настоящее время также используется для других PGRP млекопитающих .

Распределение и секреция в тканях

PGLYRP3 имеет схожую экспрессию с PGLYRP4 ( белком распознавания пептидогликана 4 ), но не идентичную. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} PGLYRP3 конститутивно экспрессируется в коже, глазах и слизистых оболочках языка , а также , горла и пищевода на гораздо более низком уровне в остальных частях кишечного тракта . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Бактерии и их продукты повышают экспрессию PGLYRP3 в кератиноцитах и эпителиальных клетках полости рта . ^{[ 6 ]}^{[ 12 ]} Мышиный PGLYRP3 также дифференциально экспрессируется в развивающемся мозге, и на эту экспрессию влияет кишечный микробиом . ^{[ 13 ]} PGLYRP3 секретируется и образует дисульфидной связью. димеры с ^{[ 6 ]}

Структура

PGLYRP3, подобно PGLYRP4, имеет два пептидогликансвязывающих амидазных домена 2 типа (также известных как домены PGRP), которые не идентичны (имеют 38% аминокислотной идентичности у человека). ^{[ 5 ]}^{[ 14 ]} и не обладают активностью амидазы ферментативной . ^{[ 15 ]} PGLYRP3 секретируется, он гликозилируется , и его гликозилирование необходимо для его бактерицидной активности. ^{[ 6 ]} PGLYRP3 образует гомодимеры с дисульфидной связью, но при экспрессии в тех же клетках, что и PGLYRP4, он образует гетеродимеры с дисульфидной связью PGLYRP3:PGLYRP4. ^{[ 6 ]}

C-концевой пептидогликан -связывающий домен человеческого PGLYRP3 кристаллизован и решена его структура. ^{[ 16 ]} и подобен PGLYRP1 человека. ^{[ 17 ]} С-концевой домен PGRP PGLYRP3 содержит центральный β-лист, состоящий из пяти β-нитей и трех α-спиралей, а также N-концевой сегмент, уникальный для PGRP и не обнаруженный в бактериофагах и прокариотических амидазах. ^{[ 16 ]}

С-концевой PGRP-домен PGLYRP3 человека, аналогичный PGLYRP1, ^{[ 17 ]} имеет три пары цистеинов , которые образуют три дисульфидные связи в положениях 178–300, 194–238 и 214–220. ^{[ 16 ]} Дисульфид Cys214-Cys220 широко консервативен в PRGP беспозвоночных и позвоночных , дисульфид Cys178-Cys300 консервативен во всех PGRP млекопитающих, а дисульфид Cys194-238 уникален для PGLYRP1, PGLYRP3 и PGLYRP4 млекопитающих, но не обнаружен в амидазах. активный PGLYRP2. ^{[ 5 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]} Структуры всей молекулы PGLYRP3 (с двумя доменами PGRP) и димера с дисульфидной связью неизвестны.

С-концевой домен PGRP3 PGLYRP3 содержит сайт связывания пептидогликана, который представляет собой длинную щель, стенки которой образованы α-спиралью и пятью β-петлями, а дно — β-листом. Этот сайт связывает мурамилтрипептид (MurNAc-L-Ala-D-isoGln-L-Lys), но может также размещать более крупные фрагменты пептидогликана, такие как дисахарид-пентапептид. ^{[ 18 ]} Напротив щели, связывающей пептидогликан, расположена большая гидрофобная бороздка, образованная остатками 177–198 (специфичный для PGRP сегмент). ^{[ 18 ]}

Функции

Белок PGLYRP3 играет важную роль во врожденных иммунных реакциях.

Связывание пептидогликана

PGLYRP3 связывает пептидогликан, полимер β(1-4)-связанного N -ацетилглюкозамина (GlcNAc) и N -ацетилмураминовой кислоты (MurNAc), сшитый короткими пептидами , основной компонент бактерий клеточной стенки . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]} Наименьшим фрагментом пептидогликана, который связывается с PGLYRP3 человека, является трипептид MurNAc (MurNAc-L-Ala-D-isoGln-L-Lys), который связывается с низким сродством (Kd = 4,5 x 10 ⁻⁴ M), тогда как более крупный фрагмент, пентапептид MurNAc (MurNAc-L-Ala-γ-D-Gln-L-Lys-D-Ala-D-Ala), связывается с более высоким сродством (Kd = 6 x 10 ^-6 М). ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]} PGLYRP3 человека, в отличие от PGLYRP1, не связывает фрагмент, содержащий мезодиаминопимелиновую кислоту ( m -DAP) (MurNAc-L-Ala-γ-D-Gln-DAP-D-Ala-D-Ala). ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]} m -DAP присутствует в третьем положении пептидогликана у грамотрицательных бактерий и грамположительных бацилл, тогда как L- лизин находится в этом положении у пептидогликана у грамположительных кокков. Таким образом, С-концевой домен PGRP PGLYRP3 предпочитает связывать фрагменты пептидогликана грамположительных кокков. Связывание пентапептида MurNAc вызывает структурные перестройки в сайте связывания, которые необходимы для проникновения лиганда, и блокирует лиганд в щели связывания. ^{[ 22 ]} Точная специфичность N-концевого домена PGRP PGLYRP3 неизвестна.

Бактерицидная активность

PGLYRP3 человека оказывает непосредственно бактерицидное действие как на грамположительные ( Bacillus subtilis , Bacillus licheniformis , Bacillus cereus , Lactobacillus acidophilus , Listeria monocytogenes , Staphylococcus aureus , Streptococcus pyogenes ), так и на грамотрицательные ( Escherichia coli , Proteus vulgaris , Salmonella enterica , sonnei , Псевдомонада aeruginosa ) бактерии. ^{[ 6 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}

Механизм уничтожения бактерий с помощью PGLYRP3 основан на индукции летального стресса оболочки, который в конечном итоге приводит к отключению транскрипции и трансляции . ^{[ 24 ]} Уничтожение, индуцированное PGLYRP3, включает одновременную индукцию трех стрессовых реакций как у грамположительных, так и у грамотрицательных бактерий: окислительный стресс из-за образования активных форм кислорода ( перекиси водорода и гидроксильных радикалов ), тиоловый стресс из-за истощения ( окисления ) клеточных тиолов. и металлический стресс из-за увеличения внутриклеточных свободных (лабильных) ионов металлов. ^{[ 24 ]}^{[ 25 ]} Уничтожение бактерий, индуцированное PGLYRP3, не включает проницаемость клеточной мембраны, которая типична для дефенсинов и других антимикробных пептидов , гидролиз клеточной стенки или осмотический шок . ^{[ 6 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]} Человеческий PGLYRP3 обладает синергической бактерицидной активностью с антибактериальными пептидами. ^{[ 23 ]}

Защита от инфекций

PGLYRP3 играет ограниченную роль в защите хозяина от инфекций . Интраназальное введение PGLYRP3 защищает мышей от инфекции легких S. aureus и E. coli . ^{[ 6 ]}^{[ 26 ]} но мыши с дефицитом PGLYRP3 не имеют измененной чувствительности к Streptococcus pneumoniae вызванной пневмонии, . ^{[ 27 ]}

Поддержание микробиома

Мышиный PGLYRP3 играет роль в поддержании здорового микробиома , поскольку у мышей с дефицитом PGLYRP3 наблюдаются значительные изменения в составе кишечного микробиома, которые влияют на их чувствительность к колиту . ^{[ 11 ]}^{[ 28 ]}^{[ 29 ]}

Влияние на воспаление

Мышиный PGLYRP3 играет роль в поддержании противовоспалительного гомеостаза в кишечнике и коже. Мыши с дефицитом PGLYRP3 более чувствительны, чем мыши дикого типа, к колиту, индуцированному декстрансульфатом натрия (DSS), что указывает на то, что PGLYRP3 защищает мышей от колита, индуцированного DSS. ^{[ 11 ]}^{[ 29 ]} Противовоспалительное действие PGLYRP3 на колит, вызванный DSS, зависит от регулируемого PGLYRP3 кишечного микробиома, поскольку эта более высокая чувствительность мышей с дефицитом PGLYRP3 к колиту, индуцированному DSS, может передаваться мышам дикого типа, свободным от микробов , или мышам, получавшим антибиотики. мышам путем трансплантации микробиома от PGLYRP3 мышей с дефицитом ^{[ 11 ]}^{[ 29 ]} или бактериями, регулируемыми PGLYRP3 . ^{[ 28 ]} PGLYRP3 также оказывает прямое противовоспалительное действие на кишечника эпителиальные клетки . ^{[ 30 ]}^{[ 31 ]}^{[ 32 ]}

Мыши с дефицитом PGLYRP3 более чувствительны, чем мыши дикого типа, к экспериментально индуцированному атопическому дерматиту . ^{[ 33 ]} Эти результаты показывают, что мышиный PGLYRP3 обладает противовоспалительным действием и защищает кожу от воспаления . Этот противовоспалительный эффект обусловлен снижением количества и активности Т-хелперов 17 (Th17) и увеличением количества Т-регуляторных (Treg) клеток. ^{[ 33 ]}

Медицинская значимость

Генетические варианты PGLYRP3 связаны с некоторыми заболеваниями. Пациенты с воспалительным заболеванием кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона и язвенный колит , имеют значительно более частые миссенс-варианты в гене PGLYRP3 (а также в трех других генах PGLYRP ), чем здоровые люди из контрольной группы. ^{[ 14 ]} Варианты PGLYRP3 также связаны с болезнью Паркинсона. ^{[ 34 ]} и псориаз . ^{[ 35 ]}^{[ 36 ]} Эти результаты позволяют предположить, что PGLYRP3 защищает человека от этих заболеваний и что мутации гена PGLYRP3 являются одними из генетических факторов, предрасполагающих к этим заболеваниям. Варианты PGLYRP3 также связаны с составом микробиома дыхательных путей. ^{[ 37 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159527 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042244 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Лю С, Сюй З, Гупта Д, Дзиарски Р (сентябрь 2001 г.). «Белки распознавания пептидогликана: новое семейство из четырех молекул распознавания образов врожденного иммунитета человека» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34686–94. дои : 10.1074/jbc.M105566200 . ПМИД 11461926 . S2CID 44619852 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Лу X, Ван М, Ци Дж, Ван Х, Ли X, Гупта Д, Дзиарски Р (март 2006 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, представляют собой новый класс бактерицидных белков человека» . Журнал биологической химии . 281 (9): 5895–907. дои : 10.1074/jbc.M511631200 . ПМИД 16354652 . S2CID 21943426 .
^ «Белок 3 распознавания пептидогликана PGLYRP3 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 ноября 2020 г.
^ «PGLYRP3 - предшественник белка распознавания пептидогликана 3 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PGLYRP3» . www.uniprot.org . Проверено 2 ноября 2020 г.
^ Канг Д., Лю Г., Лундстрем А., Гелиус Э., Штайнер Х. (август 1998 г.). «Белок, распознающий пептидогликан, во врожденном иммунитете, сохраняющийся от насекомых до человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 10078–82. Бибкод : 1998PNAS...9510078K . дои : 10.1073/pnas.95.17.10078 . ПМК 21464 . ПМИД 9707603 .
^ Матур П., Мюррей Б., Кроуэлл Т., Гарднер Х., Аллер Н., Сюй Ю.М. и др. (июнь 2004 г.). «Мышиные белки распознавания пептидогликана PglyrpIalpha и PglyrpIbeta кодируются в комплексе эпидермальной дифференцировки и экспрессируются в эпидермальных и кроветворных тканях» . Геномика . 83 (6): 1151–63. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.003 . ПМИД 15177568 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Саха С., Цзин Х, Пак С.Ю., Ван С., Ли Х., Гупта Д., Дзиарски Р. (август 2010 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, защищают мышей от экспериментального колита, способствуя нормальной флоре кишечника и предотвращая индукцию гамма-интерферона» . Клетка-хозяин и микроб . 8 (2): 147–62. дои : 10.1016/j.chom.2010.07.005 . ПМЦ 2998413 . ПМИД 20709292 .
^ Уэхара А., Сугавара Ю., Курата С., Фудзимото Ю., Фукасе К., Кусумото С. и др. (май 2005 г.). «Химически синтезированные молекулярные паттерны, связанные с патогенами, увеличивают экспрессию белков распознавания пептидогликана через толл-подобные рецепторы NOD1 и NOD2 в эпителиальных клетках полости рта человека» . Клеточная микробиология . 7 (5): 675–86. дои : 10.1111/j.1462-5822.2004.00500.x . ПМИД 15839897 . S2CID 20544993 .
^ Арентсен Т., Цянь Ю., Гкоцис С., Фемения Т., Ван Т., Удекву К. и др. (февраль 2017 г.). «Бактериальная молекула Pglyrp2, чувствительная к пептидогликанам, модулирует развитие и поведение мозга» . Молекулярная психиатрия . 22 (2): 257–266. дои : 10.1038/mp.2016.182 . ПМЦ 5285465 . ПМИД 27843150 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Зульфикар Ф, Хозо И, Рангараджан С, Мариуцца Р.А., Дзиарски Р., Гупта Д. (2013). «Генетическая ассоциация вариантов белка распознавания пептидогликана с воспалительным заболеванием кишечника» . ПЛОС ОДИН 8 (6): e67393. Бибкод : 2013PLoSO...867393Z . дои : 10.1371/journal.pone.0067393 . ПМЦ 3686734 . ПМИД 23840689 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Ван З.М., Ли Х., Коклин Р.Р., Ван М., Ван М., Фукасе К. и др. (декабрь 2003 г.). «Белок L-распознавания пептидогликана человека представляет собой N-ацетилмурамоил-L-аланинамидазу» . Журнал биологической химии . 278 (49): 49044–52. дои : 10.1074/jbc.M307758200 . ПМИД 14506276 . S2CID 35373818 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Гуан Р., Мальчиоди Э.Л., Ван К., Шук П., Мариуцца Р.А. (июль 2004 г.). «Кристаллическая структура С-концевого пептидогликансвязывающего домена человеческого белка распознавания пептидогликана Iальфа» . Журнал биологической химии . 279 (30): 31873–82. дои : 10.1074/jbc.M404920200 . ПМИД 15140887 . S2CID 29969809 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Гуан Р., Ван К., Сундберг Э.Дж., Мариуцца Р.А. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура белка S распознавания пептидогликана человека (PGRP-S) при разрешении 1,70 А» . Журнал молекулярной биологии . 347 (4): 683–91. дои : 10.1016/j.jmb.2005.01.070 . ПМИД 15769462 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Гуан Р., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Кумар С., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (декабрь 2004 г.). «Структурная основа связывания пептидогликана белками, распознающими пептидогликан» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (49): 17168–73. Бибкод : 2004PNAS..10117168G . дои : 10.1073/pnas.0407856101 . ПМЦ 535381 . ПМИД 15572450 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Кумар С., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Ван К., Гуан Р., Мариуцца Р.А., Бунс Г.Дж. (ноябрь 2005 г.). «Селективное распознавание синтетических фрагментов пептидогликана типа лизина и мезодиаминопимелиновой кислоты белками распознавания пептидогликана человека I {альфа} и S» . Журнал биологической химии . 280 (44): 37005–12. дои : 10.1074/jbc.M506385200 . ПМИД 16129677 . S2CID 44913130 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Сваминатан С.П., Браун П.Х., Ройчоудхури А., Ван К., Гуан Р., Сильверман Н. и др. (январь 2006 г.). «Двойные стратегии распознавания пептидогликана белками распознавания пептидогликана (PGRP)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (3): 684–9. Бибкод : 2006PNAS..103..684S . дои : 10.1073/pnas.0507656103 . ПМЦ 1334652 . ПМИД 16407132 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Чо С., Ван К., Сваминатан К.П., Хесек Д., Ли М., Бунс Г.Дж. и др. (май 2007 г.). «Структурное понимание бактерицидного механизма белков распознавания пептидогликана человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (21): 8761–6. Бибкод : 2007PNAS..104.8761C . дои : 10.1073/pnas.0701453104 . ПМЦ 1885576 . ПМИД 17502600 .
^ Гуан Р., Браун П.Х., Сваминатан С.П., Ройчоудхури А., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (май 2006 г.). «Кристаллическая структура человеческого белка распознавания пептидогликана I альфа, связанного с мурамилпентапептидом грамположительных бактерий» . Белковая наука . 15 (5): 1199–206. дои : 10.1110/ps.062077606 . ПМК 2242522 . ПМИД 16641493 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ван М., Лю Л.Х., Ван С., Ли X, Лу X, Гупта Д., Дзиарски Р. (март 2007 г.). «Белкам, распознающим пептидогликаны человека, требуется цинк для уничтожения как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий, и они синергичны с антибактериальными пептидами» . Журнал иммунологии . 178 (5): 3116–25. дои : 10.4049/jimmunol.178.5.3116 . ПМИД 17312159 . S2CID 22160694 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Кашьяп Д.Р., Ван М., Лю Л.Х., Бунс Г.Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (июнь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, активируя белок-чувствительные двухкомпонентные системы» . Природная медицина . 17 (6): 676–83. дои : 10.1038/нм.2357 . ПМК 3176504 . ПМИД 21602801 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ромпка А., Габалла А., Хельманн Дж.Д., Чан Дж., Чанг С.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, вызывая окислительный, тиоловый и металлический стресс» . ПЛОС Патогены . 10 (7): e1004280. дои : 10.1371/journal.ppat.1004280 . ПМК 4102600 . ПМИД 25032698 .
^ Дзиарский Р., Кашьяп Д.Р., Гупта Д. (июнь 2012 г.). «Белки распознавания пептидогликана млекопитающих убивают бактерии, активируя двухкомпонентные системы и модулируя микробиом и воспаление» . Микробная лекарственная устойчивость . 18 (3): 280–5. дои : 10.1089/mdr.2012.0002 . ПМЦ 3412580 . ПМИД 22432705 .
^ Шривастав А., Дабровский А.Н., Конрад С., Баал Н., Хакштейн Х., Плог С. и др. (2018). «Белок 3, распознающий пептидогликан, не изменяет исход пневмококковой пневмонии у мышей» . Границы микробиологии . 9 : 103. дои : 10.3389/fmicb.2018.00103 . ПМК 5799233 . ПМИД 29449834 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Дзиарски Р., Пак С.Ю., Кашьяп Д.Р., Дауд С.Е., Гупта Д. (2016). «Pglyrp-регулируемая микрофлора кишечника Prevotella falsenii, Parabacteroides distasonis и Bacteroides eggerthii усиливается, а Alistipes Finegoldii ослабляет колит у мышей» . ПЛОС ОДИН 11 (1): e0146162. Бибкод : 2016PLoSO..1146162D . дои : 10.1371/journal.pone.0146162 . ПМК 4699708 . ПМИД 26727498 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Цзин Икс, Зульфикар Ф, Пак С.Ю., Нуньес Дж., Дзиарски Р., Гупта Д. (сентябрь 2014 г.). «Белок 3 распознавания пептидогликана и Nod2 синергически защищают мышей от колита, вызванного декстраном сульфатом натрия» . Журнал иммунологии . 193 (6): 3055–69. doi : 10.4049/jimmunol.1301548 . ПМЦ 4157132 . ПМИД 25114103 .
^ Зенхом М., Хайдер А., Краус-Стоянович И., Ауингер А., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (июнь 2011 г.). «Экспрессия PPARγ-зависимого белка распознавания пептидогликана 3 (PGlyRP3) регулирует провоспалительные цитокины с помощью микробных и пищевых жирных кислот» . Иммунобиология . 216 (6): 715–24. дои : 10.1016/j.imbio.2010.10.008 . ПМИД 21176858 .
^ Зенхом М., Хайдер А., де Врез М., Хеллер К.Дж., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (апрель 2012 г.). «Белок 3 распознавания пептидогликана (PglyRP3) играет противовоспалительную роль в эпителиальных клетках кишечника» . Иммунобиология . 217 (4): 412–9. дои : 10.1016/j.imbio.2011.10.013 . ПМИД 22099350 .
^ Зенхом М., Хайдер А., де Врез М., Хеллер К.Дж., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (май 2011 г.). «Пребиотические олигосахариды уменьшают количество провоспалительных цитокинов в клетках Caco-2 кишечника посредством активации PPARγ и белка распознавания пептидогликана 3» . Журнал питания . 141 (5): 971–7. дои : 10.3945/jn.110.136176 . ПМИД 21451128 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Пак С.Ю., Гупта Д., Ким Ч., Дзиарски Р. (2011). «Дифференциальное влияние белков распознавания пептидогликана на экспериментальный атопический и контактный дерматит, опосредованный клетками Treg и Th17» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24961. Бибкод : 2011PLoSO...624961P . дои : 10.1371/journal.pone.0024961 . ПМК 3174980 . ПМИД 21949809 .
^ Голдман С.М., Камель Ф., Росс Г.В., Джуэлл С.А., Маррас С., Хоппин Дж.А. и др. (август 2014 г.). «Гены белка распознавания пептидогликана и риск болезни Паркинсона» . Двигательные расстройства . 29 (9): 1171–80. дои : 10.1002/mds.25895 . ПМЦ 4777298 . ПМИД 24838182 .
^ Сан С., Матур П., Дюпюи Дж., Тизард Р., Тихо Б., Кроуэлл Т. и др. (март 2006 г.). «Белки распознавания пептидогликана Pglyrp3 и Pglyrp4 кодируются комплексом эпидермальной дифференцировки и являются генами-кандидатами для локуса Psors4 на хромосоме 1q21» . Генетика человека . 119 (1–2): 113–25. дои : 10.1007/s00439-005-0115-8 . ПМИД 16362825 . S2CID 31486449 .
^ Кайну К., Кивинен К., Зуччелли М., Суомела С., Кере Дж., Инерот А. и др. (февраль 2009 г.). «Ассоциация псориаза с генами PGLYRP и SPRR в локусе PSORS4 на 1q показывает гетерогенность между финскими, шведскими и ирландскими семьями» . Экспериментальная дерматология . 18 (2): 109–15. дои : 10.1111/j.1600-0625.2008.00769.x . ПМИД 18643845 . S2CID 5771478 .
^ Игартуа С., Давенпорт Э.Р., Гилад Ю., Николае Д.Л., Пинто Дж., Обер С. (февраль 2017 г.). «Генетические вариации путей иммунитета слизистой оболочки хозяина влияют на микробиом верхних дыхательных путей» . Микробиом . 5 (1): 16. дои : 10.1186/s40168-016-0227-5 . ПМЦ 5286564 . ПМИД 28143570 .

Дальнейшее чтение

Дзиарски Р. , Ройет Дж., Гупта Д. (2016). «Белки, распознающие пептидогликаны, и лизоцим». В Рэтклиффе MJ (ред.). Энциклопедия иммунобиологии . Том. 2. Elsevier Ltd., стр. 389–403. дои : 10.1016/B978-0-12-374279-7.02022-1 . ISBN 978-0123742797 .
Ройет Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (ноябрь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны: модуляторы микробиома и воспаления». Обзоры природы. Иммунология . 11 (12): 837–51. дои : 10.1038/nri3089 . ПМИД 22076558 . S2CID 5266193 .
Ройет Дж., Дзиарски Р. (апрель 2007 г.). «Белки-распознающие пептидогликаны: плейотропные сенсоры и эффекторы антимикробной защиты». Обзоры природы. Микробиология . 5 (4): 264–77. дои : 10.1038/nrmicro1620 . ПМИД 17363965 . S2CID 39569790 .
Дзиарский Р. , Гупта Д. (2006). «Белки, распознающие пептидогликаны (PGRP)» . Геномная биология . 7 (8): 232. doi : 10.1186/gb-2006-7-8-232 . ПМЦ 1779587 . ПМИД 16930467 .
Бастос П.А., Уилер Р., Бонека И.Г. (сентябрь 2020 г.). «Поглощение, распознавание и реакция на пептидогликан у млекопитающего-хозяина» . Обзоры микробиологии FEMS . 45 (1). дои : 10.1093/femsre/fuaa044 . ПМК 7794044 . ПМИД 32897324 .
Вольф Эй Джей, Андерхилл DM (апрель 2018 г.). «Распознавание пептидогликана врожденной иммунной системой». Обзоры природы. Иммунология . 18 (4): 243–254. дои : 10.1038/nri.2017.136 . ПМИД 29292393 . S2CID 3894187 .
Ламан Дж.Д., 'т Харт Б.А., Пауэр С., Дзиарски Р. (июль 2020 г.). «Бактериальный пептидогликан как причина хронического воспаления головного мозга» . Тенденции молекулярной медицины . 26 (7): 670–682. doi : 10.1016/j.molmed.2019.11.006 . ПМИД 32589935 . S2CID 211835568 .
Гонсалес-Сантана А., Диас Хейц Р. (август 2020 г.). «Бактериальные пептидогликаны из микробиоты в развитии нервной системы и поведении» . Тенденции молекулярной медицины . 26 (8): 729–743. doi : 10.1016/j.molmed.2020.05.003 . ПМИД 32507655 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159527 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042244 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Лю С, Сюй З, Гупта Д, Дзиарски Р (сентябрь 2001 г.). «Белки распознавания пептидогликана: новое семейство из четырех молекул распознавания образов врожденного иммунитета человека» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34686–94. дои : 10.1074/jbc.M105566200 . ПМИД 11461926 . S2CID 44619852 .

[:2-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Лу X, Ван М, Ци Дж, Ван Х, Ли X, Гупта Д, Дзиарски Р (март 2006 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, представляют собой новый класс бактерицидных белков человека» . Журнал биологической химии . 281 (9): 5895–907. дои : 10.1074/jbc.M511631200 . ПМИД 16354652 . S2CID 21943426 .

[7] «Белок 3 распознавания пептидогликана PGLYRP3 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 ноября 2020 г.

[:1-8] «PGLYRP3 - предшественник белка распознавания пептидогликана 3 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PGLYRP3» . www.uniprot.org . Проверено 2 ноября 2020 г.

[9] Канг Д., Лю Г., Лундстрем А., Гелиус Э., Штайнер Х. (август 1998 г.). «Белок, распознающий пептидогликан, во врожденном иммунитете, сохраняющийся от насекомых до человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 10078–82. Бибкод : 1998PNAS...9510078K . дои : 10.1073/pnas.95.17.10078 . ПМК 21464 . ПМИД 9707603 .

[10] Матур П., Мюррей Б., Кроуэлл Т., Гарднер Х., Аллер Н., Сюй Ю.М. и др. (июнь 2004 г.). «Мышиные белки распознавания пептидогликана PglyrpIalpha и PglyrpIbeta кодируются в комплексе эпидермальной дифференцировки и экспрессируются в эпидермальных и кроветворных тканях» . Геномика . 83 (6): 1151–63. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.003 . ПМИД 15177568 .

[:3-11] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Саха С., Цзин Х, Пак С.Ю., Ван С., Ли Х., Гупта Д., Дзиарски Р. (август 2010 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, защищают мышей от экспериментального колита, способствуя нормальной флоре кишечника и предотвращая индукцию гамма-интерферона» . Клетка-хозяин и микроб . 8 (2): 147–62. дои : 10.1016/j.chom.2010.07.005 . ПМЦ 2998413 . ПМИД 20709292 .

[12] Уэхара А., Сугавара Ю., Курата С., Фудзимото Ю., Фукасе К., Кусумото С. и др. (май 2005 г.). «Химически синтезированные молекулярные паттерны, связанные с патогенами, увеличивают экспрессию белков распознавания пептидогликана через толл-подобные рецепторы NOD1 и NOD2 в эпителиальных клетках полости рта человека» . Клеточная микробиология . 7 (5): 675–86. дои : 10.1111/j.1462-5822.2004.00500.x . ПМИД 15839897 . S2CID 20544993 .

[13] Арентсен Т., Цянь Ю., Гкоцис С., Фемения Т., Ван Т., Удекву К. и др. (февраль 2017 г.). «Бактериальная молекула Pglyrp2, чувствительная к пептидогликанам, модулирует развитие и поведение мозга» . Молекулярная психиатрия . 22 (2): 257–266. дои : 10.1038/mp.2016.182 . ПМЦ 5285465 . ПМИД 27843150 .

[:4-14] Перейти обратно: ^а ^б Зульфикар Ф, Хозо И, Рангараджан С, Мариуцца Р.А., Дзиарски Р., Гупта Д. (2013). «Генетическая ассоциация вариантов белка распознавания пептидогликана с воспалительным заболеванием кишечника» . ПЛОС ОДИН 8 (6): e67393. Бибкод : 2013PLoSO...867393Z . дои : 10.1371/journal.pone.0067393 . ПМЦ 3686734 . ПМИД 23840689 .

[:5-15] Перейти обратно: ^а ^б Ван З.М., Ли Х., Коклин Р.Р., Ван М., Ван М., Фукасе К. и др. (декабрь 2003 г.). «Белок L-распознавания пептидогликана человека представляет собой N-ацетилмурамоил-L-аланинамидазу» . Журнал биологической химии . 278 (49): 49044–52. дои : 10.1074/jbc.M307758200 . ПМИД 14506276 . S2CID 35373818 .

[:6-16] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Гуан Р., Мальчиоди Э.Л., Ван К., Шук П., Мариуцца Р.А. (июль 2004 г.). «Кристаллическая структура С-концевого пептидогликансвязывающего домена человеческого белка распознавания пептидогликана Iальфа» . Журнал биологической химии . 279 (30): 31873–82. дои : 10.1074/jbc.M404920200 . ПМИД 15140887 . S2CID 29969809 .

[:7-17] Перейти обратно: ^а ^б ^с Гуан Р., Ван К., Сундберг Э.Дж., Мариуцца Р.А. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура белка S распознавания пептидогликана человека (PGRP-S) при разрешении 1,70 А» . Журнал молекулярной биологии . 347 (4): 683–91. дои : 10.1016/j.jmb.2005.01.070 . ПМИД 15769462 .

[:8-18] Перейти обратно: ^а ^б ^с Гуан Р., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Кумар С., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (декабрь 2004 г.). «Структурная основа связывания пептидогликана белками, распознающими пептидогликан» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (49): 17168–73. Бибкод : 2004PNAS..10117168G . дои : 10.1073/pnas.0407856101 . ПМЦ 535381 . ПМИД 15572450 .

[:9-19] Перейти обратно: ^а ^б ^с Кумар С., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Ван К., Гуан Р., Мариуцца Р.А., Бунс Г.Дж. (ноябрь 2005 г.). «Селективное распознавание синтетических фрагментов пептидогликана типа лизина и мезодиаминопимелиновой кислоты белками распознавания пептидогликана человека I {альфа} и S» . Журнал биологической химии . 280 (44): 37005–12. дои : 10.1074/jbc.M506385200 . ПМИД 16129677 . S2CID 44913130 .

[:10-20] Перейти обратно: ^а ^б ^с Сваминатан С.П., Браун П.Х., Ройчоудхури А., Ван К., Гуан Р., Сильверман Н. и др. (январь 2006 г.). «Двойные стратегии распознавания пептидогликана белками распознавания пептидогликана (PGRP)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (3): 684–9. Бибкод : 2006PNAS..103..684S . дои : 10.1073/pnas.0507656103 . ПМЦ 1334652 . ПМИД 16407132 .

[:11-21] Перейти обратно: ^а ^б Чо С., Ван К., Сваминатан К.П., Хесек Д., Ли М., Бунс Г.Дж. и др. (май 2007 г.). «Структурное понимание бактерицидного механизма белков распознавания пептидогликана человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (21): 8761–6. Бибкод : 2007PNAS..104.8761C . дои : 10.1073/pnas.0701453104 . ПМЦ 1885576 . ПМИД 17502600 .

[22] Гуан Р., Браун П.Х., Сваминатан С.П., Ройчоудхури А., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (май 2006 г.). «Кристаллическая структура человеческого белка распознавания пептидогликана I альфа, связанного с мурамилпентапептидом грамположительных бактерий» . Белковая наука . 15 (5): 1199–206. дои : 10.1110/ps.062077606 . ПМК 2242522 . ПМИД 16641493 .

[:12-23] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ван М., Лю Л.Х., Ван С., Ли X, Лу X, Гупта Д., Дзиарски Р. (март 2007 г.). «Белкам, распознающим пептидогликаны человека, требуется цинк для уничтожения как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий, и они синергичны с антибактериальными пептидами» . Журнал иммунологии . 178 (5): 3116–25. дои : 10.4049/jimmunol.178.5.3116 . ПМИД 17312159 . S2CID 22160694 .

[:13-24] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Кашьяп Д.Р., Ван М., Лю Л.Х., Бунс Г.Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (июнь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, активируя белок-чувствительные двухкомпонентные системы» . Природная медицина . 17 (6): 676–83. дои : 10.1038/нм.2357 . ПМК 3176504 . ПМИД 21602801 .

[:14-25] Перейти обратно: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ромпка А., Габалла А., Хельманн Дж.Д., Чан Дж., Чанг С.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, вызывая окислительный, тиоловый и металлический стресс» . ПЛОС Патогены . 10 (7): e1004280. дои : 10.1371/journal.ppat.1004280 . ПМК 4102600 . ПМИД 25032698 .

[26] Дзиарский Р., Кашьяп Д.Р., Гупта Д. (июнь 2012 г.). «Белки распознавания пептидогликана млекопитающих убивают бактерии, активируя двухкомпонентные системы и модулируя микробиом и воспаление» . Микробная лекарственная устойчивость . 18 (3): 280–5. дои : 10.1089/mdr.2012.0002 . ПМЦ 3412580 . ПМИД 22432705 .

[27] Шривастав А., Дабровский А.Н., Конрад С., Баал Н., Хакштейн Х., Плог С. и др. (2018). «Белок 3, распознающий пептидогликан, не изменяет исход пневмококковой пневмонии у мышей» . Границы микробиологии . 9 : 103. дои : 10.3389/fmicb.2018.00103 . ПМК 5799233 . ПМИД 29449834 .

[:15-28] Перейти обратно: ^а ^б Дзиарски Р., Пак С.Ю., Кашьяп Д.Р., Дауд С.Е., Гупта Д. (2016). «Pglyrp-регулируемая микрофлора кишечника Prevotella falsenii, Parabacteroides distasonis и Bacteroides eggerthii усиливается, а Alistipes Finegoldii ослабляет колит у мышей» . ПЛОС ОДИН 11 (1): e0146162. Бибкод : 2016PLoSO..1146162D . дои : 10.1371/journal.pone.0146162 . ПМК 4699708 . ПМИД 26727498 .

[:16-29] Перейти обратно: ^а ^б ^с Цзин Икс, Зульфикар Ф, Пак С.Ю., Нуньес Дж., Дзиарски Р., Гупта Д. (сентябрь 2014 г.). «Белок 3 распознавания пептидогликана и Nod2 синергически защищают мышей от колита, вызванного декстраном сульфатом натрия» . Журнал иммунологии . 193 (6): 3055–69. doi : 10.4049/jimmunol.1301548 . ПМЦ 4157132 . ПМИД 25114103 .

[30] Зенхом М., Хайдер А., Краус-Стоянович И., Ауингер А., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (июнь 2011 г.). «Экспрессия PPARγ-зависимого белка распознавания пептидогликана 3 (PGlyRP3) регулирует провоспалительные цитокины с помощью микробных и пищевых жирных кислот» . Иммунобиология . 216 (6): 715–24. дои : 10.1016/j.imbio.2010.10.008 . ПМИД 21176858 .

[31] Зенхом М., Хайдер А., де Врез М., Хеллер К.Дж., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (апрель 2012 г.). «Белок 3 распознавания пептидогликана (PglyRP3) играет противовоспалительную роль в эпителиальных клетках кишечника» . Иммунобиология . 217 (4): 412–9. дои : 10.1016/j.imbio.2011.10.013 . ПМИД 22099350 .

[32] Зенхом М., Хайдер А., де Врез М., Хеллер К.Дж., Редер Т., Шрезенмейр Дж. (май 2011 г.). «Пребиотические олигосахариды уменьшают количество провоспалительных цитокинов в клетках Caco-2 кишечника посредством активации PPARγ и белка распознавания пептидогликана 3» . Журнал питания . 141 (5): 971–7. дои : 10.3945/jn.110.136176 . ПМИД 21451128 .

[:17-33] Перейти обратно: ^а ^б Пак С.Ю., Гупта Д., Ким Ч., Дзиарски Р. (2011). «Дифференциальное влияние белков распознавания пептидогликана на экспериментальный атопический и контактный дерматит, опосредованный клетками Treg и Th17» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24961. Бибкод : 2011PLoSO...624961P . дои : 10.1371/journal.pone.0024961 . ПМК 3174980 . ПМИД 21949809 .

[34] Голдман С.М., Камель Ф., Росс Г.В., Джуэлл С.А., Маррас С., Хоппин Дж.А. и др. (август 2014 г.). «Гены белка распознавания пептидогликана и риск болезни Паркинсона» . Двигательные расстройства . 29 (9): 1171–80. дои : 10.1002/mds.25895 . ПМЦ 4777298 . ПМИД 24838182 .

[35] Сан С., Матур П., Дюпюи Дж., Тизард Р., Тихо Б., Кроуэлл Т. и др. (март 2006 г.). «Белки распознавания пептидогликана Pglyrp3 и Pglyrp4 кодируются комплексом эпидермальной дифференцировки и являются генами-кандидатами для локуса Psors4 на хромосоме 1q21» . Генетика человека . 119 (1–2): 113–25. дои : 10.1007/s00439-005-0115-8 . ПМИД 16362825 . S2CID 31486449 .

[36] Кайну К., Кивинен К., Зуччелли М., Суомела С., Кере Дж., Инерот А. и др. (февраль 2009 г.). «Ассоциация псориаза с генами PGLYRP и SPRR в локусе PSORS4 на 1q показывает гетерогенность между финскими, шведскими и ирландскими семьями» . Экспериментальная дерматология . 18 (2): 109–15. дои : 10.1111/j.1600-0625.2008.00769.x . ПМИД 18643845 . S2CID 5771478 .

[37] Игартуа С., Давенпорт Э.Р., Гилад Ю., Николае Д.Л., Пинто Дж., Обер С. (февраль 2017 г.). «Генетические вариации путей иммунитета слизистой оболочки хозяина влияют на микробиом верхних дыхательных путей» . Микробиом . 5 (1): 16. дои : 10.1186/s40168-016-0227-5 . ПМЦ 5286564 . ПМИД 28143570 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]