Белок 4 распознавания пептидогликана

PGLYRP4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EAV, 2EAX
Идентификаторы
Псевдонимы	PGLYRP4 , PGLYRPIbeta, PGRP-Ibeta, PGRPIB, SBBI67, белок распознавания пептидогликана 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 608198 ; МГИ : 2686324 ; Гомологен : 130057 ; Генные карты : PGLYRP4 ; ОМА : PGLYRP4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	153,348,841 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	90,648,824 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; skin of leg; ; skin of thigh; ; cervix epithelium; ; tibialis anterior muscle; ; mucosa of ileum; ; pancreatic ductal cell; ; vagina; ; human penis; ; vulva;
	Top expressed in
	esophagus; ; lip; ; granulocyte; ; zone of skin; ; spermatocyte; ; thymus; ; spermatid; ; testicle; ; spleen; ; stomach;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	zinc ion binding; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity; peptidoglycan immune receptor activity; peptidoglycan binding; protein heterodimerization activity;
Cellular component	extracellular region; intracellular anatomical structure; membrane; protein-containing complex; extracellular space;
Biological process	immune system process; innate immune response; defense response to bacterium; detection of bacterium; defense response to Gram-positive bacterium; peptidoglycan catabolic process; pattern recognition receptor signaling pathway; positive regulation of cytolysis in other organism; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; antimicrobial humoral response; killing of cells of other organism; negative regulation of interferon-gamma production; negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	57115
	384997
	ENSG00000163218
	ENSMUSG00000042250
	Q96LB8
	Q0VB07
	НМ_020393
	НМ_001165968 ; НМ_207263
	НП_065126
	НП_001159440 ; НП_997146
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок распознавания пептидогликана 4 ( PGLYRP4 , ранее PGRP-Iβ) представляет собой антибактериальный и противовоспалительный врожденного иммунитета белок , который у человека кодируется PGLYRP4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Открытие

PGLYRP4 (ранее PGRP-Iβ), член семейства белков распознавания пептидогликана человека (PGRP), был открыт в 2001 году Романом Дзиарским и его коллегами, которые клонировали и идентифицировали гены трех человеческих PGRP: PGRP-L, PGRP-Iα, длинного и среднего размера и PGRP-Iβ (названные в честь транскриптов ), ^{[ 5 ]} и установили, что геном человека кодирует семейство из 4 PGRP: PGRP-S (сокращенно PGRP или PGRP-S ^{[ 9 ]}) и PGRP-L, PGRP-Iα и PGRP-Iβ. ^{[ 5 ]} Впоследствии Комитет по генной номенклатуре организации генома человека изменил символы генов PGRP-S, PGRP-L, PGRP-Iα и PGRP-Iβ на PGLYRP1 ( белок распознавания пептидогликана 1 ), PGLYRP2 ( белок распознавания пептидогликана 2 ), PGLYRP3 ( белок распознавания пептидогликана 2). белок распознавания 3 ) и PGLYRP4 (белок распознавания пептидогликана 4) соответственно, и эта номенклатура в настоящее время также используется для других PGRP млекопитающих .

Распределение и секреция в тканях

PGLYRP4 имеет сходную экспрессию с PGLYRP3 ( белком распознавания пептидогликана 3 ), но не идентичную. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} PGLYRP4 конститутивно экспрессируется в коже , глазах , слизистых оболочках языка . , горла и пищевода , в слюнных железах и клетках, секретирующих слизь , в горле и на гораздо более низком уровне в остальных частях тела кишечный тракт . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Бактерии и их продукты повышают экспрессию PGLYRP4 в кератиноцитах и эпителиальных клетках полости рта. ^{[ 6 ]}^{[ 12 ]} Мышиный PGLYRP4 также дифференциально экспрессируется в развивающемся мозге , и на эту экспрессию влияет кишечный микробиом . ^{[ 13 ]} PGLYRP4 секретируется и образует дисульфидной связью. димеры с ^{[ 6 ]}

Структура

PGLYRP4, подобно PGLYRP3, имеет два пептидогликансвязывающих амидазных домена 2 типа (также известных как домены PGRP), которые не идентичны (имеют 34% аминокислотной идентичности у человека). ^{[ 5 ]}^{[ 14 ]} и не обладают амидазы . ферментативной активностью ^{[ 15 ]} PGLYRP4 секретируется, он гликозилируется , и его гликозилирование необходимо для бактерицидной активности. ^{[ 6 ]} PGLYRP4 образует гомодимеры с дисульфидной связью, но при экспрессии в тех же клетках, что и PGLYRP3, он образует гетеродимеры с дисульфидной связью PGLYRP3:PGLYRP4. ^{[ 6 ]}

Кристаллизован С-концевой пептидогликансвязывающий домен человеческого PGLYRP4 и решена его структура (в свободной форме и в комплексе с пептидогликановым фрагментом дисахарид -пентапептид) ^{[ 16 ]} и похож на человеческий PGLYRP1 ^{[ 17 ]} и PGLYRP3. ^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} С-концевой домен PGRP4 PGLYRP4 содержит центральный β-лист, состоящий из шести β-нитей, окруженных тремя α-спиралями и тремя короткими спиралями, а также N-концевой сегмент, уникальный для PGRP и не обнаруженный в бактериофагах и прокариотических амидазах. ^{[ 16 ]} С-концевой домен PGRP PGLYRP4 содержит три дисульфидные связи: одна широко консервативна в PRGP беспозвоночных и позвоночных , одна консервативна во всех PGRP млекопитающих и одна уникальна для PGLYRP1, PGLYRP3 и PGLYRP4 млекопитающих, но не обнаружена в амидазоактивном PGLYRP2. ^{[ 5 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Структуры всей молекулы PGLYRP4 (с двумя доменами PGRP) и димера с дисульфидной связью неизвестны.

Функции

Белок PGLYRP4 играет важную роль во врожденных иммунных реакциях.

Связывание пептидогликана

PGLYRP4 связывает пептидогликан, полимер β(1-4)-связанного N -ацетилглюкозамина (GlcNAc) и N -ацетилмураминовой кислоты (MurNAc), сшитый короткими пептидами , основной компонент бактерий клеточной стенки . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 16 ]} PGLYRP4 (его C-концевой домен PGRP) связывает фрагмент пептидогликана, пентапептид MurNAc (MurNAc-L-Ala-γ-D-Gln-L-Lys-D-Ala-D-Ala), с Kd = 1,2 x 10 ⁻⁵, но подобно PGLYRP3 (и в отличие от PGLYRP1) не связывает фрагмент, содержащий мезодиаминопимелиновую кислоту ( m -DAP) (MurNAc-L-Ala-γ-D-Gln-DAP-D-Ala-D-Ala). ^{[ 16 ]} m -DAP присутствует в третьем положении пептидогликана у грамотрицательных бактерий и грамположительных бацилл, тогда как L- лизин находится в этом положении у пептидогликана у грамположительных кокков. Таким образом, С-концевой домен PGRP PGLYRP4 предпочитает связывать фрагменты пептидогликана грамположительных кокков. Точная специфичность N-концевого домена PGRP PGLYRP4 неизвестна.

Бактерицидная активность

PGLYRP4 человека оказывает непосредственно бактерицидное действие как на грамположительные ( Bacillus subtilis , Bacillus licheniformis , Bacillus cereus , Lactobacillus acidophilus , Listeria monocytogenes , Staphylococcus aureus ), так и на грамотрицательные ( Escherichia coli , Proteus vulgaris , Salmonella enterica ) бактерии. ^{[ 6 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]} а также активен в отношении Chlamydia trachomatis . ^{[ 25 ]}

В грамположительных бактериях человеческий PGLYRP4 связывается с местами разделения вновь образованных дочерних клеток, созданными бактериальными пептидогликанлитическими эндопептидазами , LytE и LytF в B. subtilis , которые отделяют дочерние клетки после клеточного деления. ^{[ 21 ]} Эти эндопептидазы, разделяющие клетки, вероятно, подвергают воздействию PGLYRP4-связывающие мурамиловые пептиды, о чем свидетельствует совместная локализация PGLYRP4, LytE и LytF в сайтах разделения клеток и отсутствие связывания PGLYRP4 с другими областями клеточной стенки с сильно сшитым пептидогликаном. . ^{[ 21 ]} Эта локализация необходима для уничтожения бактерий, поскольку мутанты , у которых отсутствуют эндопептидазы LytE и LytF и не разделяются после деления клеток, не связывают PGLYRP4, а также с трудом уничтожаются PGLYRP4. ^{[ 21 ]}

Механизм уничтожения бактерий с помощью PGLYRP4 основан на индукции летального стресса оболочки, который в конечном итоге приводит к отключению транскрипции и трансляции . ^{[ 21 ]} Уничтожение, индуцированное PGLYRP4, включает одновременную индукцию трех стрессовых реакций как у грамположительных, так и у грамотрицательных бактерий: окислительный стресс из-за образования активных форм кислорода ( перекиси водорода и гидроксильных радикалов ), тиоловый стресс из-за истощения (окисления) клеточных тиолов. и металлический стресс из-за увеличения внутриклеточных свободных (лабильных) ионов металлов. ^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} PGLYRP4-индуцированный окислительный и тиоловый стресс приводит к нарушению работы дыхательной цепи транспорта электронов у бактерий. ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}^{[ 26 ]} Уничтожение бактерий, индуцированное PGLYRP4, не включает проницаемость клеточной мембраны , которая типична для дефензинов и других антимикробных пептидов , гидролиз клеточной стенки или осмотический шок . ^{[ 6 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]} Человеческий PGLYRP4 обладает синергической бактерицидной активностью с антибактериальными пептидами. ^{[ 20 ]}

Защита от инфекций

PGLYRP4 играет ограниченную роль в защите хозяина от инфекций . Интраназальное введение PGLYRP4 защищает мышей от легких инфекции S. aureus и E. coli. ^{[ 6 ]}^{[ 27 ]} и мыши с дефицитом PGLYRP4 более чувствительны к Streptococcus pneumoniae вызванной пневмонии, . ^{[ 28 ]}

Поддержание микробиома

Мышиный PGLYRP4 играет роль в поддержании здорового микробиома, поскольку у мышей с дефицитом PGLYRP4 наблюдаются значительные изменения в составе кишечного микробиома. ^{[ 11 ]}^{[ 28 ]}^{[ 29 ]} что влияет на их повышенную чувствительность к воспалению легких и тяжесть пневмонии, вызванной S. pneumoniae . ^{[ 28 ]}

Влияние на воспаление

Мышиный PGLYRP4 играет роль в поддержании противовоспалительного гомеостаза в кишечнике, коже и легких. Мыши с дефицитом PGLYRP4 более чувствительны, чем мыши дикого типа, к колиту , индуцированному декстраном сульфатом натрия (DSS) , что указывает на то, что PGLYRP4 защищает мышей от колита, индуцированного DSS. ^{[ 11 ]}

Мыши с дефицитом PGLYRP4 также более чувствительны, чем мыши дикого типа, к экспериментально индуцированному атопическому дерматиту . ^{[ 30 ]} Эти результаты показывают, что мышиный PGLYRP4 обладает противовоспалительным действием и защищает кожу от воспаления. Этот противовоспалительный эффект на кожу обусловлен уменьшением количества и активности Т-хелперов 17 (Th17) и увеличением количества Т-регуляторных (Treg) клеток. ^{[ 30 ]} У мышей с дефицитом PGLYRP4 также наблюдаются повышенные воспалительные реакции в легких во время пневмонии, вызванной S. pneumoniae, связанной с нарушением бактериального клиренса. ^{[ 28 ]} и более тяжелое воспаление легких после заражения Bordetella pertussis , ^{[ 31 ]} что указывает на противовоспалительную роль PGLYRP4 в легких.

Медицинская значимость

Генетические варианты PGLYRP4 связаны с некоторыми заболеваниями. Пациенты с воспалительным заболеванием кишечника (ВЗК), включая болезнь Крона и язвенный колит , имеют значительно более частые миссенс-варианты в гене PGLYRP4 (а также в трех других генах PGLYRP ), чем здоровые люди из контрольной группы. ^{[ 14 ]} Варианты PGLYRP4 также связаны с болезнью Паркинсона . ^{[ 32 ]}^{[ 33 ]} псориаз , ^{[ 34 ]}^{[ 35 ]} и рак яичников . ^{[ 36 ]} Эти результаты позволяют предположить, что PGLYRP4 защищает человека от этих заболеваний и что мутации гена PGLYRP4 являются одними из генетических факторов, предрасполагающих к этим заболеваниям. Варианты PGLYRP4 также связаны с составом микробиома дыхательных путей. ^{[ 37 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163218 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042250 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Лю С, Сюй З, Гупта Д, Дзиарски Р (сентябрь 2001 г.). «Белки распознавания пептидогликана: новое семейство из четырех молекул распознавания образов врожденного иммунитета человека» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34686–34694. дои : 10.1074/jbc.M105566200 . ПМИД 11461926 . S2CID 44619852 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Лу X, Ван М, Ци Дж, Ван Х, Ли X, Гупта Д, Дзиарски Р (март 2006 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, представляют собой новый класс бактерицидных белков человека» . Журнал биологической химии . 281 (9): 5895–5907. дои : 10.1074/jbc.M511631200 . ПМИД 16354652 . S2CID 21943426 .
^ «Белок 4 распознавания пептидогликана PGLYRP4 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 ноября 2020 г.
^ «PGLYRP4 - предшественник белка распознавания пептидогликана 4 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PGLYRP4» . www.uniprot.org . Проверено 4 ноября 2020 г.
^ Канг Д., Лю Г., Лундстрем А., Гелиус Э., Штайнер Х. (август 1998 г.). «Белок, распознающий пептидогликан, во врожденном иммунитете, сохраняющийся от насекомых до человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 10078–10082. Бибкод : 1998PNAS...9510078K . дои : 10.1073/pnas.95.17.10078 . ПМК 21464 . ПМИД 9707603 .
^ Матур П., Мюррей Б., Кроуэлл Т., Гарднер Х., Аллер Н., Сюй Ю.М. и др. (июнь 2004 г.). «Мышиные белки распознавания пептидогликана PglyrpIalpha и PglyrpIbeta кодируются в комплексе эпидермальной дифференцировки и экспрессируются в эпидермальных и кроветворных тканях». Геномика . 83 (6): 1151–1163. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.003 . ПМИД 15177568 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Саха С., Цзин Х, Пак С.Ю., Ван С., Ли Х., Гупта Д., Дзиарски Р. (август 2010 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, защищают мышей от экспериментального колита, способствуя нормальной флоре кишечника и предотвращая индукцию гамма-интерферона» . Клетка-хозяин и микроб . 8 (2): 147–162. дои : 10.1016/j.chom.2010.07.005 . ПМЦ 2998413 . ПМИД 20709292 .
^ Уэхара А., Сугавара Ю., Курата С., Фудзимото Ю., Фукасе К., Кусумото С. и др. (май 2005 г.). «Химически синтезированные молекулярные паттерны, связанные с патогенами, увеличивают экспрессию белков распознавания пептидогликана через толл-подобные рецепторы NOD1 и NOD2 в эпителиальных клетках полости рта человека» . Клеточная микробиология . 7 (5): 675–686. дои : 10.1111/j.1462-5822.2004.00500.x . ПМИД 15839897 . S2CID 20544993 .
^ Арентсен Т., Цянь Ю., Гкоцис С., Фемения Т., Ван Т., Удекву К. и др. (февраль 2017 г.). «Бактериальная молекула Pglyrp2, чувствительная к пептидогликанам, модулирует развитие и поведение мозга» . Молекулярная психиатрия . 22 (2): 257–266. дои : 10.1038/mp.2016.182 . ПМЦ 5285465 . ПМИД 27843150 .
^ Jump up to: ^а ^б Зульфикар Ф, Хозо И, Рангараджан С, Мариуцца Р.А., Дзиарски Р., Гупта Д. (2013). «Генетическая ассоциация вариантов белка распознавания пептидогликана с воспалительным заболеванием кишечника» . ПЛОС ОДИН 8 (6): e67393. Бибкод : 2013PLoSO...867393Z . дои : 10.1371/journal.pone.0067393 . ПМЦ 3686734 . ПМИД 23840689 .
^ Jump up to: ^а ^б Ван З.М., Ли Х., Коклин Р.Р., Ван М., Ван М., Фукасе К. и др. (декабрь 2003 г.). «Белок L-распознавания пептидогликана человека представляет собой N-ацетилмурамоил-L-аланинамидазу» . Журнал биологической химии . 278 (49): 49044–49052. дои : 10.1074/jbc.M307758200 . ПМИД 14506276 . S2CID 35373818 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Чо С., Ван К., Сваминатан К.П., Хесек Д., Ли М., Бунс Г.Дж. и др. (май 2007 г.). «Структурное понимание бактерицидного механизма белков распознавания пептидогликана человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (21): 8761–8766. Бибкод : 2007PNAS..104.8761C . дои : 10.1073/pnas.0701453104 . ПМЦ 1885576 . ПМИД 17502600 .
^ Jump up to: ^а ^б Гуан Р., Ван К., Сундберг Э.Дж., Мариуцца Р.А. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура белка S распознавания пептидогликана человека (PGRP-S) с разрешением 1,70 А». Журнал молекулярной биологии . 347 (4): 683–691. дои : 10.1016/j.jmb.2005.01.070 . ПМИД 15769462 .
^ Jump up to: ^а ^б Гуан Р., Мальчиоди Э.Л., Ван К., Шук П., Мариуцца Р.А. (июль 2004 г.). «Кристаллическая структура С-концевого пептидогликансвязывающего домена человеческого белка распознавания пептидогликана Iальфа» . Журнал биологической химии . 279 (30): 31873–31882. дои : 10.1074/jbc.M404920200 . ПМИД 15140887 . S2CID 29969809 .
^ Гуан Р., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Кумар С., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (декабрь 2004 г.). «Структурная основа связывания пептидогликана белками, распознающими пептидогликан» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (49): 17168–17173. Бибкод : 2004PNAS..10117168G . дои : 10.1073/pnas.0407856101 . ПМЦ 535381 . ПМИД 15572450 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ван М., Лю Л.Х., Ван С., Ли X, Лу X, Гупта Д., Дзиарски Р. (март 2007 г.). «Белкам, распознающим пептидогликаны человека, требуется цинк для уничтожения как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий, и они синергичны с антибактериальными пептидами» . Журнал иммунологии . 178 (5): 3116–3125. дои : 10.4049/jimmunol.178.5.3116 . ПМИД 17312159 . S2CID 22160694 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Кашьяп Д.Р., Ван М., Лю Л.Х., Бунс Г.Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (июнь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, активируя белок-чувствительные двухкомпонентные системы» . Природная медицина . 17 (6): 676–683. дои : 10.1038/нм.2357 . ПМК 3176504 . ПМИД 21602801 .
^ Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ромпка А., Габалла А., Хельманн Дж.Д., Чан Дж., Чанг С.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, вызывая окислительный, тиоловый и металлический стресс» . ПЛОС Патогены . 10 (7): e1004280. дои : 10.1371/journal.ppat.1004280 . ПМК 4102600 . ПМИД 25032698 .
^ Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Кузьма М., Ковальчик Д.А., Гупта Д., Дзерски Р. (сентябрь 2017 г.). «Бактерицидный белок, распознающий пептидогликан, вызывает окислительный стресс у Escherichia coli посредством блокады дыхательной цепи и увеличения катаболизма центрального углерода» . Молекулярная микробиология . 105 (5): 755–776. дои : 10.1111/mmi.13733 . ПМК 5570643 . ПМИД 28621879 .
^ Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ковальчик Д.А., Шан Ю, Ян С.К., Гупта Д., Дзиарски Р. (февраль 2020 г.). «Формиат дегидрогеназа, убихинон и цитохром bd-I необходимы для индуцированного белком распознавания пептидогликана окислительного стресса и уничтожения Escherichia coli» . Научные отчеты . 10 (1): 1993. Бибкод : 2020НацСР..10.1993К . дои : 10.1038/s41598-020-58302-1 . ПМК 7005000 . ПМИД 32029761 .
^ Бобровский П., Манувера В., Полина Н., Подгорный О., Прусаков К., Говорун В., Лазарев В. (июль 2016 г.). «Рекомбинантные белки распознавания пептидогликана человека проявляют антихламидийную активность» . Инфекция и иммунитет . 84 (7): 2124–2130. дои : 10.1128/IAI.01495-15 . ПМЦ 4936355 . ПМИД 27160295 .
^ Ян К.К., Кашьяп Д.Р., Ковальчик Д.А., Руднер Д.З., Ван Х, Гупта Д., Дзиарски Р. (январь 2021 г.). «Компоненты дыхательной цепи необходимы для индуцированного белком распознавания пептидогликана истощения и уничтожения тиолов в Bacillus subtilis и Escherichia coli» . Научные отчеты . 11 (1): 64. doi : 10.1038/s41598-020-79811-z . ПМЦ 7794252 . ПМИД 33420211 .
^ Дзиарский Р., Кашьяп Д.Р., Гупта Д. (июнь 2012 г.). «Белки распознавания пептидогликана млекопитающих убивают бактерии, активируя двухкомпонентные системы и модулируя микробиом и воспаление» . Микробная лекарственная устойчивость . 18 (3): 280–285. дои : 10.1089/mdr.2012.0002 . ПМЦ 3412580 . ПМИД 22432705 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Дабровский А.Н., Шривастав А., Конрад С., Комма К., Вайгель М., Дитерт К. и др. (2019). «Белок 4, распознающий пептидогликан, ограничивает бактериальный клиренс и воспаление в легких путем контроля микробиоты кишечника» . Границы в иммунологии . 10 : 2106. дои : 10.3389/fimmu.2019.02106 . ПМК 6763742 . ПМИД 31616404 .
^ Дзиарски Р., Пак С.Ю., Кашьяп Д.Р., Дауд С.Е., Гупта Д. (2016). «Pglyrp-регулируемая микрофлора кишечника Prevotella falsenii, Parabacteroides distasonis и Bacteroides eggerthii усиливается, а Alistipes Finegoldii ослабляет колит у мышей» . ПЛОС ОДИН 11 (1): e0146162. Бибкод : 2016PLoSO..1146162D . дои : 10.1371/journal.pone.0146162 . ПМК 4699708 . ПМИД 26727498 .
^ Jump up to: ^а ^б Пак С.Ю., Гупта Д., Ким Ч., Дзиарски Р. (2011). «Дифференциальное влияние белков распознавания пептидогликана на экспериментальный атопический и контактный дерматит, опосредованный клетками Treg и Th17» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24961. Бибкод : 2011PLoSO...624961P . дои : 10.1371/journal.pone.0024961 . ПМК 3174980 . ПМИД 21949809 .
^ Скерри С., Голдман В.Е., Карбонетти Н.Х. (февраль 2019 г.). «Белок 4, распознающий пептидогликан, подавляет ранние воспалительные реакции на Bordetella pertussis и способствует ослаблению заболевания, опосредованного агонистом рецептора сфингозин-1-фосфата» . Инфекция и иммунитет . 87 (2). дои : 10.1128/IAI.00601-18 . ПМК 6346131 . ПМИД 30510103 .
^ Голдман С.М., Камель Ф., Росс Г.В., Джуэлл С.А., Маррас С., Хоппин Дж.А. и др. (август 2014 г.). «Гены белка распознавания пептидогликана и риск болезни Паркинсона» . Двигательные расстройства . 29 (9): 1171–1180. дои : 10.1002/mds.25895 . ПМЦ 4777298 . ПМИД 24838182 .
^ Горецкий А.М., Бакеберг М.К., Теуниссен Ф., Кенна Дж.Э., Хоес М.Э., Пфафф А.Л. и др. (17.11.2020). «Однонуклеотидные полиморфизмы, связанные с гомеостазом кишечника, влияют на риск и возраст начала болезни Паркинсона» . Границы стареющей неврологии . 12 : 603849. дои : 10.3389/fnagi.2020.603849 . ПМЦ 7718032 . ПМИД 33328979 .
^ Сан С., Матур П., Дюпюи Дж., Тизард Р., Тихо Б., Кроуэлл Т. и др. (март 2006 г.). «Белки распознавания пептидогликана Pglyrp3 и Pglyrp4 кодируются комплексом эпидермальной дифференцировки и являются генами-кандидатами для локуса Psors4 на хромосоме 1q21». Генетика человека . 119 (1–2): 113–125. дои : 10.1007/s00439-005-0115-8 . ПМИД 16362825 . S2CID 31486449 .
^ Кайну К., Кивинен К., Зуччелли М., Суомела С., Кере Дж., Инерот А. и др. (февраль 2009 г.). «Ассоциация псориаза с генами PGLYRP и SPRR в локусе PSORS4 на 1q показывает гетерогенность между финскими, шведскими и ирландскими семьями». Экспериментальная дерматология . 18 (2): 109–115. дои : 10.1111/j.1600-0625.2008.00769.x . ПМИД 18643845 . S2CID 5771478 .
^ Чжан Л., Ло М., Ян Х., Чжу С., Ченг Х., Цин С. (февраль 2019 г.). «Анализ геномного профилирования нового поколения на основе секвенирования выявляет новые мутации для клинической диагностики у китайских пациентов с первичным эпителиальным раком яичников» . Журнал исследований яичников . 12 (1): 19. дои : 10.1186/s13048-019-0494-4 . ПМК 6381667 . ПМИД 30786925 .
^ Игартуа С., Давенпорт Э.Р., Гилад Ю., Николае Д.Л., Пинто Дж., Обер С. (февраль 2017 г.). «Генетические вариации путей иммунитета слизистой оболочки хозяина влияют на микробиом верхних дыхательных путей» . Микробиом . 5 (1): 16. дои : 10.1186/s40168-016-0227-5 . ПМЦ 5286564 . ПМИД 28143570 .

Дальнейшее чтение

Дзиарски Р., Ройет Дж., Гупта Д. (2016). «Белки, распознающие пептидогликаны, и лизоцим». В Рэтклиффе MJ (ред.). Энциклопедия иммунобиологии . Том. 2. Elsevier Ltd., стр. 389–403. дои : 10.1016/B978-0-12-374279-7.02022-1 . ISBN 978-0123742797 .
Ройет Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (ноябрь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны: модуляторы микробиома и воспаления». Обзоры природы. Иммунология . 11 (12): 837–851. дои : 10.1038/nri3089 . ПМИД 22076558 . S2CID 5266193 .
Ройет Дж., Дзиарски Р. (апрель 2007 г.). «Белки-распознающие пептидогликаны: плейотропные сенсоры и эффекторы антимикробной защиты». Обзоры природы. Микробиология . 5 (4): 264–277. дои : 10.1038/nrmicro1620 . ПМИД 17363965 . S2CID 39569790 .
Дзиарский Р., Гупта Д. (2006). «Белки, распознающие пептидогликаны (PGRP)» . Геномная биология . 7 (8): 232. doi : 10.1186/gb-2006-7-8-232 . ПМЦ 1779587 . ПМИД 16930467 .
Бастос П.А., Уиллер Р., Бонека И.Г. (январь 2021 г.). «Поглощение, распознавание и реакция на пептидогликан у млекопитающего-хозяина» . Обзоры микробиологии FEMS . 45 (1). дои : 10.1093/femsre/fuaa044 . ПМК 7794044 . ПМИД 32897324 .
Вольф Эй Джей, Андерхилл DM (апрель 2018 г.). «Распознавание пептидогликана врожденной иммунной системой». Обзоры природы. Иммунология . 18 (4): 243–254. дои : 10.1038/nri.2017.136 . ПМИД 29292393 . S2CID 3894187 .
Ламан Дж.Д., 'т Харт Б.А., Пауэр С., Дзиарски Р. (июль 2020 г.). «Бактериальный пептидогликан как причина хронического воспаления головного мозга» (PDF) . Тенденции молекулярной медицины . 26 (7): 670–682. doi : 10.1016/j.molmed.2019.11.006 . ПМИД 32589935 . S2CID 211835568 .
Гонсалес-Сантана А., Диас Хейц Р. (август 2020 г.). «Бактериальные пептидогликаны из микробиоты в развитии нервной системы и поведении» . Тенденции молекулярной медицины . 26 (8): 729–743. doi : 10.1016/j.molmed.2020.05.003 . ПМИД 32507655 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163218 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042250 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Лю С, Сюй З, Гупта Д, Дзиарски Р (сентябрь 2001 г.). «Белки распознавания пептидогликана: новое семейство из четырех молекул распознавания образов врожденного иммунитета человека» . Журнал биологической химии . 276 (37): 34686–34694. дои : 10.1074/jbc.M105566200 . ПМИД 11461926 . S2CID 44619852 .

[:1-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Лу X, Ван М, Ци Дж, Ван Х, Ли X, Гупта Д, Дзиарски Р (март 2006 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, представляют собой новый класс бактерицидных белков человека» . Журнал биологической химии . 281 (9): 5895–5907. дои : 10.1074/jbc.M511631200 . ПМИД 16354652 . S2CID 21943426 .

[7] «Белок 4 распознавания пептидогликана PGLYRP4 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 4 ноября 2020 г.

[8] «PGLYRP4 - предшественник белка распознавания пептидогликана 4 - Homo sapiens (человек) - ген и белок PGLYRP4» . www.uniprot.org . Проверено 4 ноября 2020 г.

[9] Канг Д., Лю Г., Лундстрем А., Гелиус Э., Штайнер Х. (август 1998 г.). «Белок, распознающий пептидогликан, во врожденном иммунитете, сохраняющийся от насекомых до человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (17): 10078–10082. Бибкод : 1998PNAS...9510078K . дои : 10.1073/pnas.95.17.10078 . ПМК 21464 . ПМИД 9707603 .

[10] Матур П., Мюррей Б., Кроуэлл Т., Гарднер Х., Аллер Н., Сюй Ю.М. и др. (июнь 2004 г.). «Мышиные белки распознавания пептидогликана PglyrpIalpha и PglyrpIbeta кодируются в комплексе эпидермальной дифференцировки и экспрессируются в эпидермальных и кроветворных тканях». Геномика . 83 (6): 1151–1163. дои : 10.1016/j.ygeno.2004.01.003 . ПМИД 15177568 .

[:2-11] Jump up to: ^а ^б ^с Саха С., Цзин Х, Пак С.Ю., Ван С., Ли Х., Гупта Д., Дзиарски Р. (август 2010 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, защищают мышей от экспериментального колита, способствуя нормальной флоре кишечника и предотвращая индукцию гамма-интерферона» . Клетка-хозяин и микроб . 8 (2): 147–162. дои : 10.1016/j.chom.2010.07.005 . ПМЦ 2998413 . ПМИД 20709292 .

[12] Уэхара А., Сугавара Ю., Курата С., Фудзимото Ю., Фукасе К., Кусумото С. и др. (май 2005 г.). «Химически синтезированные молекулярные паттерны, связанные с патогенами, увеличивают экспрессию белков распознавания пептидогликана через толл-подобные рецепторы NOD1 и NOD2 в эпителиальных клетках полости рта человека» . Клеточная микробиология . 7 (5): 675–686. дои : 10.1111/j.1462-5822.2004.00500.x . ПМИД 15839897 . S2CID 20544993 .

[13] Арентсен Т., Цянь Ю., Гкоцис С., Фемения Т., Ван Т., Удекву К. и др. (февраль 2017 г.). «Бактериальная молекула Pglyrp2, чувствительная к пептидогликанам, модулирует развитие и поведение мозга» . Молекулярная психиатрия . 22 (2): 257–266. дои : 10.1038/mp.2016.182 . ПМЦ 5285465 . ПМИД 27843150 .

[:3-14] Jump up to: ^а ^б Зульфикар Ф, Хозо И, Рангараджан С, Мариуцца Р.А., Дзиарски Р., Гупта Д. (2013). «Генетическая ассоциация вариантов белка распознавания пептидогликана с воспалительным заболеванием кишечника» . ПЛОС ОДИН 8 (6): e67393. Бибкод : 2013PLoSO...867393Z . дои : 10.1371/journal.pone.0067393 . ПМЦ 3686734 . ПМИД 23840689 .

[:4-15] Jump up to: ^а ^б Ван З.М., Ли Х., Коклин Р.Р., Ван М., Ван М., Фукасе К. и др. (декабрь 2003 г.). «Белок L-распознавания пептидогликана человека представляет собой N-ацетилмурамоил-L-аланинамидазу» . Журнал биологической химии . 278 (49): 49044–49052. дои : 10.1074/jbc.M307758200 . ПМИД 14506276 . S2CID 35373818 .

[:5-16] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Чо С., Ван К., Сваминатан К.П., Хесек Д., Ли М., Бунс Г.Дж. и др. (май 2007 г.). «Структурное понимание бактерицидного механизма белков распознавания пептидогликана человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (21): 8761–8766. Бибкод : 2007PNAS..104.8761C . дои : 10.1073/pnas.0701453104 . ПМЦ 1885576 . ПМИД 17502600 .

[:6-17] Jump up to: ^а ^б Гуан Р., Ван К., Сундберг Э.Дж., Мариуцца Р.А. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура белка S распознавания пептидогликана человека (PGRP-S) с разрешением 1,70 А». Журнал молекулярной биологии . 347 (4): 683–691. дои : 10.1016/j.jmb.2005.01.070 . ПМИД 15769462 .

[:7-18] Jump up to: ^а ^б Гуан Р., Мальчиоди Э.Л., Ван К., Шук П., Мариуцца Р.А. (июль 2004 г.). «Кристаллическая структура С-концевого пептидогликансвязывающего домена человеческого белка распознавания пептидогликана Iальфа» . Журнал биологической химии . 279 (30): 31873–31882. дои : 10.1074/jbc.M404920200 . ПМИД 15140887 . S2CID 29969809 .

[19] Гуан Р., Ройчоудхури А., Эмбер Б., Кумар С., Бунс Г.Дж., Мариуцца Р.А. (декабрь 2004 г.). «Структурная основа связывания пептидогликана белками, распознающими пептидогликан» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (49): 17168–17173. Бибкод : 2004PNAS..10117168G . дои : 10.1073/pnas.0407856101 . ПМЦ 535381 . ПМИД 15572450 .

[:8-20] Jump up to: ^а ^б ^с Ван М., Лю Л.Х., Ван С., Ли X, Лу X, Гупта Д., Дзиарски Р. (март 2007 г.). «Белкам, распознающим пептидогликаны человека, требуется цинк для уничтожения как грамположительных, так и грамотрицательных бактерий, и они синергичны с антибактериальными пептидами» . Журнал иммунологии . 178 (5): 3116–3125. дои : 10.4049/jimmunol.178.5.3116 . ПМИД 17312159 . S2CID 22160694 .

[:9-21] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Кашьяп Д.Р., Ван М., Лю Л.Х., Бунс Г.Дж., Гупта Д., Дзиарски Р. (июнь 2011 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, активируя белок-чувствительные двухкомпонентные системы» . Природная медицина . 17 (6): 676–683. дои : 10.1038/нм.2357 . ПМК 3176504 . ПМИД 21602801 .

[:10-22] Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ромпка А., Габалла А., Хельманн Дж.Д., Чан Дж., Чанг С.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Белки, распознающие пептидогликаны, убивают бактерии, вызывая окислительный, тиоловый и металлический стресс» . ПЛОС Патогены . 10 (7): e1004280. дои : 10.1371/journal.ppat.1004280 . ПМК 4102600 . ПМИД 25032698 .

[:11-23] Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Кузьма М., Ковальчик Д.А., Гупта Д., Дзерски Р. (сентябрь 2017 г.). «Бактерицидный белок, распознающий пептидогликан, вызывает окислительный стресс у Escherichia coli посредством блокады дыхательной цепи и увеличения катаболизма центрального углерода» . Молекулярная микробиология . 105 (5): 755–776. дои : 10.1111/mmi.13733 . ПМК 5570643 . ПМИД 28621879 .

[:12-24] Jump up to: ^а ^б Кашьяп Д.Р., Ковальчик Д.А., Шан Ю, Ян С.К., Гупта Д., Дзиарски Р. (февраль 2020 г.). «Формиат дегидрогеназа, убихинон и цитохром bd-I необходимы для индуцированного белком распознавания пептидогликана окислительного стресса и уничтожения Escherichia coli» . Научные отчеты . 10 (1): 1993. Бибкод : 2020НацСР..10.1993К . дои : 10.1038/s41598-020-58302-1 . ПМК 7005000 . ПМИД 32029761 .

[25] Бобровский П., Манувера В., Полина Н., Подгорный О., Прусаков К., Говорун В., Лазарев В. (июль 2016 г.). «Рекомбинантные белки распознавания пептидогликана человека проявляют антихламидийную активность» . Инфекция и иммунитет . 84 (7): 2124–2130. дои : 10.1128/IAI.01495-15 . ПМЦ 4936355 . ПМИД 27160295 .

[26] Ян К.К., Кашьяп Д.Р., Ковальчик Д.А., Руднер Д.З., Ван Х, Гупта Д., Дзиарски Р. (январь 2021 г.). «Компоненты дыхательной цепи необходимы для индуцированного белком распознавания пептидогликана истощения и уничтожения тиолов в Bacillus subtilis и Escherichia coli» . Научные отчеты . 11 (1): 64. doi : 10.1038/s41598-020-79811-z . ПМЦ 7794252 . ПМИД 33420211 .

[27] Дзиарский Р., Кашьяп Д.Р., Гупта Д. (июнь 2012 г.). «Белки распознавания пептидогликана млекопитающих убивают бактерии, активируя двухкомпонентные системы и модулируя микробиом и воспаление» . Микробная лекарственная устойчивость . 18 (3): 280–285. дои : 10.1089/mdr.2012.0002 . ПМЦ 3412580 . ПМИД 22432705 .

[:13-28] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Дабровский А.Н., Шривастав А., Конрад С., Комма К., Вайгель М., Дитерт К. и др. (2019). «Белок 4, распознающий пептидогликан, ограничивает бактериальный клиренс и воспаление в легких путем контроля микробиоты кишечника» . Границы в иммунологии . 10 : 2106. дои : 10.3389/fimmu.2019.02106 . ПМК 6763742 . ПМИД 31616404 .

[29] Дзиарски Р., Пак С.Ю., Кашьяп Д.Р., Дауд С.Е., Гупта Д. (2016). «Pglyrp-регулируемая микрофлора кишечника Prevotella falsenii, Parabacteroides distasonis и Bacteroides eggerthii усиливается, а Alistipes Finegoldii ослабляет колит у мышей» . ПЛОС ОДИН 11 (1): e0146162. Бибкод : 2016PLoSO..1146162D . дои : 10.1371/journal.pone.0146162 . ПМК 4699708 . ПМИД 26727498 .

[:14-30] Jump up to: ^а ^б Пак С.Ю., Гупта Д., Ким Ч., Дзиарски Р. (2011). «Дифференциальное влияние белков распознавания пептидогликана на экспериментальный атопический и контактный дерматит, опосредованный клетками Treg и Th17» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24961. Бибкод : 2011PLoSO...624961P . дои : 10.1371/journal.pone.0024961 . ПМК 3174980 . ПМИД 21949809 .

[31] Скерри С., Голдман В.Е., Карбонетти Н.Х. (февраль 2019 г.). «Белок 4, распознающий пептидогликан, подавляет ранние воспалительные реакции на Bordetella pertussis и способствует ослаблению заболевания, опосредованного агонистом рецептора сфингозин-1-фосфата» . Инфекция и иммунитет . 87 (2). дои : 10.1128/IAI.00601-18 . ПМК 6346131 . ПМИД 30510103 .

[32] Голдман С.М., Камель Ф., Росс Г.В., Джуэлл С.А., Маррас С., Хоппин Дж.А. и др. (август 2014 г.). «Гены белка распознавания пептидогликана и риск болезни Паркинсона» . Двигательные расстройства . 29 (9): 1171–1180. дои : 10.1002/mds.25895 . ПМЦ 4777298 . ПМИД 24838182 .

[33] Горецкий А.М., Бакеберг М.К., Теуниссен Ф., Кенна Дж.Э., Хоес М.Э., Пфафф А.Л. и др. (17.11.2020). «Однонуклеотидные полиморфизмы, связанные с гомеостазом кишечника, влияют на риск и возраст начала болезни Паркинсона» . Границы стареющей неврологии . 12 : 603849. дои : 10.3389/fnagi.2020.603849 . ПМЦ 7718032 . ПМИД 33328979 .

[34] Сан С., Матур П., Дюпюи Дж., Тизард Р., Тихо Б., Кроуэлл Т. и др. (март 2006 г.). «Белки распознавания пептидогликана Pglyrp3 и Pglyrp4 кодируются комплексом эпидермальной дифференцировки и являются генами-кандидатами для локуса Psors4 на хромосоме 1q21». Генетика человека . 119 (1–2): 113–125. дои : 10.1007/s00439-005-0115-8 . ПМИД 16362825 . S2CID 31486449 .

[35] Кайну К., Кивинен К., Зуччелли М., Суомела С., Кере Дж., Инерот А. и др. (февраль 2009 г.). «Ассоциация псориаза с генами PGLYRP и SPRR в локусе PSORS4 на 1q показывает гетерогенность между финскими, шведскими и ирландскими семьями». Экспериментальная дерматология . 18 (2): 109–115. дои : 10.1111/j.1600-0625.2008.00769.x . ПМИД 18643845 . S2CID 5771478 .

[36] Чжан Л., Ло М., Ян Х., Чжу С., Ченг Х., Цин С. (февраль 2019 г.). «Анализ геномного профилирования нового поколения на основе секвенирования выявляет новые мутации для клинической диагностики у китайских пациентов с первичным эпителиальным раком яичников» . Журнал исследований яичников . 12 (1): 19. дои : 10.1186/s13048-019-0494-4 . ПМК 6381667 . ПМИД 30786925 .

[37] Игартуа С., Давенпорт Э.Р., Гилад Ю., Николае Д.Л., Пинто Дж., Обер С. (февраль 2017 г.). «Генетические вариации путей иммунитета слизистой оболочки хозяина влияют на микробиом верхних дыхательных путей» . Микробиом . 5 (1): 16. дои : 10.1186/s40168-016-0227-5 . ПМЦ 5286564 . ПМИД 28143570 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]