Терм
Терм | |
---|---|
Термус водный | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Дейнококкота |
Сорт: | дейнококки |
Заказ: | Термальный |
Семья: | Термовые |
Род: | Терм Брок и Фриз 1969 |
Типовой вид | |
Термус водный Брок и Фриз 1969
| |
Разновидность | |
Посмотреть текст |
Термус — род термофильных бактерий . Это одна из нескольких бактерий, принадлежащих к типу Deinococta . По данным сравнительного анализа 16S рРНК , это одна из древнейших групп бактерий. [ 1 ] Виды Thermus можно отличить от других родов семейства Thermaceae, а также от всех других бактерий по наличию восьми консервативных сигнатурных инделей, обнаруженных в таких белках, как аденилаткиназа и репликативная ДНК-хеликаза , а также 14 консервативных сигнатурных белков, которые являются общими исключительно для членов. этого рода. [ 2 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 3 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Среди всех своих видов T. thermophilus имеет особое значение как модельный организм для фундаментальных и прикладных исследований.
на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Неопределенные типы сидений: [ 26 ]
- « T. anatoliensis » Kacagan et al. 2016 год
- « T.caldophilus » Taguchi et al. 1983 год
- « Т. eggertssonii » Петерс 2008 г.
- « Т. murrieta » Benner et al. 2006 г.
- " Т. нонпротеолитикус " 1992 г.
- « Т. rehai » Lin et al. 2002 г.
- « T. yunnanensis » Gong et al. 2005 г.
Места обитания
[ редактировать ]Штаммы рода Thermus обычно выделяют из гидротермальных районов, где температура воды составляет 55–70 °C, а pH – 5,0–10,5. [ 27 ]
Первый изолят рода Thermus был выделен из гидротермальных районов Йеллоустонского национального парка. [ 5 ] Позже было получено еще больше изолятов из нескольких гидротермальных зон по всему миру. [ 27 ] например, в Японии, [ 28 ] [ 29 ] Исландия, [ 30 ] Новая Зеландия, Нью-Мексико или Австралийский Артезианский бассейн.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Вёзе, ЧР (июнь 1987 г.). «Бактериальная эволюция» . Микробиологические обзоры . 51 (2): 221–271. дои : 10.1128/мр.51.2.221-271.1987 . ISSN 0146-0749 . ПМК 373105 . ПМИД 2439888 .
- ^ Эй, Джонатан; Адеолу, Моболаджи; Хадка, Биджендра; Гупта, Рэдхи С. (октябрь 2016 г.). «Выявление отличительных молекулярных признаков, характерных для типа « Deinococcus–Thermus » и отличающих его основные составляющие группы» . Систематическая и прикладная микробиология . 39 (7): 453–463. Бибкод : 2016СиАпМ..39..453H . дои : 10.1016/j.syapm.2016.07.003 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 27506333 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Термус» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2022 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Дейнококк–Термус» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2022 г.
- ^ Jump up to: а б Брок Т.Д. и Фриз Х (1969). « Thermus aquaticus , экстремальный термофил, не образующий спор» . Журнал бактериологии . 98 (1): 289–97. дои : 10.1128/jb.98.1.289-297.1969 . ПМК 249935 . ПМИД 5781580 .
- ^ Чанг, AP; Рейни, ФА; Валенте, М.; Нобре, МФ; да Коста, MS (2000). « Thermus igniterrae sp. nov. и Thermus antranikianii sp. nov., два новых вида из Исландии» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (1): 209–217. дои : 10.1099/00207713-50-1-209 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 10826806 .
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ УИЛЬЯМС, РАЛЬФ А.Д.; СМИТ, КЕЛЬВИН Э.; УЭЛЧ, САЙМОН Г.; МИКАЛЛЕФ, ДЖЕНИС (1 января 1996 г.). «Thermus oshimai sp. nov., изолированный от горячих источников в Португалии, Исландии и Азорских островах, и комментарий к концепции ограниченного географического распространения видов Thermus» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 46 (2): 403–408. дои : 10.1099/00207713-46-2-403 . ПМИД 8934898 .
- ^ Хадсон, Дж.А.; Морган, HW; Дэниел, РМ (1 января 1987 г.). «Thermus filiformis sp. nov., нитчатая кальдоактивная бактерия» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 37 (4): 431–436. дои : 10.1099/00207713-37-4-431 .
- ^ Манайя, Селия М.; Хост, Барт; Кармен Гутьеррес, М.; Гиллис, Моник; Вентоза, Антонио; Керстерс, Карел; Да Коста, Милтон С. (1 февраля 1995 г.). «Галотолерантные штаммы Thermus из морских и наземных горячих источников принадлежат Thermus thermophilus (бывший Осима и Имахори, 1974), номинальная версия, исправленная». Систематическая и прикладная микробиология . 17 (4): 526–532. Бибкод : 1995СиАпМ..17..526М . дои : 10.1016/S0723-2020(11)80072-X .
- ^ Вайна, Б.; Канижай, С.; Кеки, З.; Мариалигети, К.; Шуман, П.; Тот, Э.М. (1 июля 2012 г.). «Thermus composti sp. nov., выделенный из компоста вешенок». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 62 (Часть 7): 1486–1490. дои : 10.1099/ijs.0.030866-0 . ПМИД 21856987 .
- ^ Брок, Томас Д.; Фриз, Хадсон (1 апреля 1969 г.). «Thermus aquaticus gen. n. и sp. n., экстремальный термофил, не образующий спор» . Журнал бактериологии . 98 (1): 289–297. дои : 10.1128/jb.98.1.289-297.1969 . ISSN 0021-9193 . ПМК 249935 . ПМИД 5781580 .
- ^ Чжан, XQ; Ин, Ю.; Йе, Й.; Сюй, XW; Чжу, XF; Ву, М. (01 апреля 2010 г.). «Thermus arciformis sp. nov., термофильный вид из геотермальной зоны». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (4): 834–839. дои : 10.1099/ijs.0.007690-0 . ПМИД 19661520 .
- ^ Бьёрнсдоттир, Снедис Х.; Петурсдоттир, Сольвейг К.; Хреггвидссон, Гудмундур О.; Скирнисдоттир, Сигурлауг; Хьорлейфсдоттир, Сигридур; Арнфиннссон, Иоганн; Кристьянссон, Якоб К. (1 января 2009 г.). «Thermus Islandicus sp. nov., миксотрофная сероокисляющая бактерия, выделенная из геотермальной зоны Торфайокудль» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (12): 2962–2966. дои : 10.1099/ijs.0.007013-0 . ПМИД 19628590 .
- ^ УИЛЬЯМС, РАД; СМИТ, К.Э.; УЭЛЧ, СГ; МИКАЛЛЕФ, Дж.; ШАРП, Р.Дж. (1 июля 1995 г.). «ДНК-родство штаммов Thermus, описание Thermus brockianus sp. nov. и предложение восстановить Thermus thermophilus (Ошима и Имахори)» . Международный журнал систематической бактериологии . 45 (3): 495–499. дои : 10.1099/00207713-45-3-495 . ПМИД 8590676 .
- ^ Jump up to: а б Чанг, AP; Рейни, ФА; Валенте, М.; Нобре, МФ; Коста, MS да (1 января 2000 г.). «Thermus igniterrae sp. nov. и Thermus antranikianii sp. nov., два новых вида из Исландии» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 50 (1): 209–217. дои : 10.1099/00207713-50-1-209 . ПМИД 10826806 .
- ^ Ю, Тянь-Тянь; Яо, Цзи-Чэн; Инь, И-Жуй, Лю, Мин-Цзяо; Ли, Вэнь-Цзюнь; Thermus tengchongensis sp. nov., выделенный из геотермически нагретого образца почвы в Тэнчонге, Юньнань, юго-запад Китая». Antonie van Leeuwenhoek . 103 (3): 513–518. doi : 10.1007/s10482-012-9833-9 . ПМИД 23104072 .
- ^ Мин, Х.; Инь, Ю.-Р.; Ли, С.; Не, Г.-Х.; Ю, Т.-Т.; Чжоу, Э.-М.; Лю, Л.; Донг, Л.; Ли, В.-Дж. (01.02.2014). «Thermus caliditerrae sp. nov., новый термофильный вид, выделенный из геотермальной зоны». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 64 (Часть 2): 650–656. дои : 10.1099/ijs.0.056838-0 . ПМИД 24158953 . S2CID 6476087 .
- ^ Ю, Тянь-Тянь; Пак, Дон-Джин; Хоззейн, Ваэль Н.; Ким, Чан-Джин; Вадаан, Мохаммед AM; Мин, Хун; Ли, Вэнь-Цзюнь; Яо, Цзи-Чэн; Чжоу, Энь-Мин (01 августа 2015 г.). «Thermus amyloliquefaciens sp. nov., выделенный из образца отложений горячего источника» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (8): 2491–2495. дои : 10.1099/ijs.0.000289 . ПМИД 25920724 .
- ^ Кристьянссон, Джейкоб; Хьёрлейфсдоттир, Сигридюр; Мартейнссон, Вигго; Альфредссон, Хорошо (1994). « Thermus scotoductus , sp. nov., термофильная бактерия, продуцирующая пигмент, из горячей водопроводной воды в Исландии, включая Thermus sp. X-1» Систематическая и прикладная микробиология . 17 (1): 44–50. Бибкод : 1994СиАпМ..17... 44K дои : 10.1016/S0723-2020(11) 80030-5
- ^ ТЕНРЕЙРО, С.; НОБРЕ, МФ; КОСТА, MS DA (1 октября 1995 г.). «Thermus silvanus sp. nov. и Thermus chliarophilus sp. nov., два новых вида, родственных Thermus Ruber, но с более низкой температурой роста» . Международный журнал систематической бактериологии . 45 (4): 633–639. дои : 10.1099/00207713-45-4-633 . ПМИД 7547281 .
- ^ Jump up to: а б Да Коста, Милтон С.; Рейни, Фред А.; Нобре, М. Фернанда (2006), Дворкин, Мартин; Фалькоу, Стэнли; Розенберг, Юджин; Шлейфер, Карл-Хайнц (ред.), «Род Thermus и его родственники» , Прокариоты , Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer New York, стр. 797–812, doi : 10.1007/0-387-30747-8_32 , ISBN 978-0-387-25497-5 , получено 5 июня 2024 г.
- ^ Осима, Т.; Имахори, К. (1 января 1974 г.). «Описание Thermus thermophilus (Yoshida и Oshima) comb. nov., неспорообразующей термофильной бактерии из японского термального курорта» . Международный журнал систематической бактериологии . 24 (1): 102–112. дои : 10.1099/00207713-24-1-102 . ISSN 0020-7713 .
- ^ Сайки, Такаши; Кимура, Рёхей; Арима, Кей (январь 1972 г.). «Выделение и характеристика чрезвычайно термофильных бактерий из горячих источников» . Сельскохозяйственная и биологическая химия . 36 (13): 2357–2366. дои : 10.1080/00021369.1972.10860589 . ISSN 0002-1369 .
- ^ Паск-Хьюз, РА; Уильямс, рад (1 октября 1977 г.). «Желтопигментированные штаммы Thermus spp. из исландских горячих источников» . Журнал общей микробиологии . 102 (2): 375–383. дои : 10.1099/00221287-102-2-375 . ISSN 0022-1287 .