✖


Jump to content

ДНК -лигаза 3

Эта статья была обновлена ​​внешним экспертом по двойной модели публикации. Соответствующая рецензируемая статья была опубликована в журнале Gene. Нажмите, чтобы просмотреть.

Лиг3
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы LIG3 , LIG2, ДНК -лигаза 3, LIG3ALPHA, MTDP20
Внешние идентификаторы Омим : 600940 ; MGI : 109152 ; Гомологен : 32109 ; GeneCards : LIG3 ; OMA LIG3 - Ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить

3980

16882

Набор

ENSG00000005156

Ensmusg00000020697

Uniprot

P49916

P97386

Refseq (мРНК)

NM_002311
NM_013975

NM_001291245
NM_001291246
NM_001291247
NM_010716

Refseq (белок)

NP_002302
NP_039269

n/a

Расположение (UCSC) CHR 17: 34,98 - 35,01 МБ Chr 11: 82,67 - 82,7 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

ДНК -лигаза 3 также ДНК -лигаза III , является ферментом , который у людей кодируется LIG3 геном . [ 5 ] [ 6 ] LIG3 кодирует АТФ -зависимые ДНК -лигазы , которые закрывают прерывания в фосфодиэфирной основе дуплексной ДНК .

Есть три семейства АТФ-зависимых ДНК-лигаз у эукариот . [ 7 ] Эти ферменты используют один и тот же трехэтапный механизм реакции; (i) образование ковалентного фермента-аденилатного промежуточного соединения; (ii) перенос аденилатной группы в 5 'фосфатный концерн ДНК -ника; (iii) Образование фосфодиэфирных связей. В отличие от членов семьи LIG1 и LIG4 , которые встречаются почти во всех эукариотах, члены семьи LIG3 менее распределены. [ 8 ] LIG3 кодирует несколько различных видов ДНК -лигазы путем альтернативного инициации трансляции и альтернативных механизмов сплайсинга , которые описаны ниже.

Структура, связывание ДНК и каталитическая активность

[ редактировать ]

Эукариотические АТФ-зависимые ДНК-лигазы имеют родственную каталитическую область, которая содержит три домена: домен связывания ДНК , домен аденилирования и олигонуклеотида / олигосахарида домен связывания . Когда эти ферменты включают ник в дуплексной ДНК, эти домены окружают дуплекс ДНК с каждым, устанавливая контакт с ДНК. Структура каталитической области ДНК-лигазы III, комплексной с зарегистрированной ДНК, была определена с помощью рентгеновской кристаллографии и удивительно сходна с той, которая образовалась каталитической областью человеческой ДНК-лигазы I, связанной с зарезанной ДНК. [ 9 ] Уникальной особенностью ДНК-лигаз, кодируемых геном LIG3, является N-концевой цинковой пальцем , который напоминает два цинковых пальца на N-конце поли (ADP-рибозы) полимеразы 1 ( PARP1 ). [ 10 ] Как и в случае с цинковыми пальцами PARP1, цинковый палец ДНК лигазы III участвует в связывании с разрывами цепи ДНК. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] В пределах полипептида ДНК лигазы III цинковой пальцем сотрудничает с ДНК-связывающим доменом с образованием ДНК-связывающего модуля. [ 13 ] Кроме того, домен аденилирования и домен связывания олигонуклеотида/олигосахарида образуют второй модуль связывания ДНК. [ 13 ] В модели Джекниф, предложенной лабораторией Элленбергера, [ 13 ] Модуль домена связывания цинкового пальца-датчика служит датчиком разрыва цепи, который связывается с прерыванием отдельных цепи ДНК независимо от природы терминах разрыва цепи. Если эти разрывы являются лигатируемыми, они переносятся в модуль домена домена аденилирования-олигонуклеотид/олигосахарид, который специально связывается с лигатируемыми нитьями. По сравнению с ДНК -лигазами I и IV, ДНК -лигаза III является наиболее активным ферментом в межмолекулярном соединении дуплексов ДНК. [ 14 ] Эта активность преимущественно зависит от цинкового пальца ДНК -лигазы III, что позволяет предположить, что два модуля связывания ДНК ДНК -лигазы III могут одновременно задействовать концы дуплексной ДНК. [ 9 ] [ 13 ]

Альтернативный сплайсинг

[ редактировать ]

Альтернативные механизмы инициирования трансляции и сплайсинга изменяют амино и карбокси -концевые последовательности, которые окружают каталитическую область ДНК -лигазы III. [ 15 ] [ 16 ] В альтернативном механизме сплайсинга экзон , кодирующий С-концевой домен белка 1-терминального ( BRCT ) на C-конце (BRCT) на С-конце ДНК-лигазы III-Альфа, заменяется короткой положительной последовательности, которая действует как локализация ядерной сигнал , генерируя ДНК-лигазу III-бета. Этот альтернативно сплайсированный вариант на сегодняшний день был обнаружен только в клетках зародышевых зародышей. [ 16 ] Основываясь на его паттерне экспрессии во время сперматогенеза, кажется вероятным, что ДНК -лигаза IIIBETA участвует в мейотической рекомбинации и/или репарации ДНК в гаплоидной сперме, но это не было окончательно продемонстрировано. Хотя внутренний ATG является предпочтительным сайтом для инициации трансляции в рамке открытого считывания ДНК-лигазы III , инициации трансляции также возникают при первом ATG в рамке открытого считывания, что приводит к синтезу полипептида с N-терминальной митохондриальной последовательности. Полем [ 15 ] [ 17 ] [ 18 ]

Клеточная функция

[ редактировать ]

Как упомянуто выше, мРНК ДНК лигазы III-альфа кодирует ядерные и митохондриальные версии ДНК-лигазы III-альфа. Ядерная ДНК-лигаза III-альфа существует и функционирует в стабильном комплексе с белком, репаратированным ДНК, XRCC1 . [ 19 ] [ 20 ] Эти белки взаимодействуют посредством их C-концевых доменов BRCT . [ 16 ] [ 21 ] XRCC1 не имеет ферментативной активности, но вместо этого, по-видимому, действует как белок каркаса, взаимодействуя с большим количеством белков, участвующих в основании, и репарации разрыва с одной цепей . Участие XRCC1 в этих путях согласуется с фенотипом клеток XRCC1. [ 19 ] В отличие от ядерной ДНК-лигазы III-альфа, митохондриальная ДНК- лигаза III-Альфа функционирует независимо от XRCC1, которая не обнаружена в митохондриях. [ 22 ] По-видимому, ядерная ДНК-лигаза III-альфа образует комплекс с XRCC1 в цитоплазме , а последующее ядерное нацеливание результирующего комплекса направлено сигналом рентабельной ядерной локализации . [ 23 ] В то время как митохондриальная ДНК-лигаза II-Альфа также взаимодействует с XRCC1, вероятно, что активность митохондриальной нацеленной последовательности ДНК-лигазы II-Альфа больше, чем активность сигнала локализации ядер xrcc1 и что ДНК-лигаза II-альфа/XRCC1 Комплекс нарушается, когда митохондриальная ДНК-лигаза III-альфа проходит через митохондриальную мембрану.

Поскольку ген LIG3 кодирует единственную ДНК -лигазу в митохондриях, инактивация гена LIG3 приводит к потере митохондриальной ДНК, которая, в свою очередь, приводит к потере митохондриальной функции. [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] Фибробласты с инактивированным геном LIG3 могут быть распространены в среде, дополненных уридином и пируватом. Однако в этих клетках не хватает мтДНК. [ 27 ] Физиологические уровни митохондриальной ДНК-лигазы III кажутся чрезмерными, а клетки с 100-кратным сниженным содержанием митохондрий в митохондриальной ДНК-лигазе III-альфа поддерживают нормальное количество копий мтДНК. [ 27 ] Основная роль ДНК-лигазы II-Альфа в метаболизме митохондриальной ДНК может быть выполнена другими ДНК-лигазами, включая NAD-зависимую ДНК-лигазу E. coli , если они нацелены на митохондрии. [ 24 ] [ 26 ] Таким образом, могут быть получены жизнеспособные клетки, в которых отсутствуют ядерная ДНК-лигаза III-альфа. В то время как ДНК-лигаза I является преобладающим ферментом, который соединяет фрагменты Оказаки во время репликации ДНК, теперь очевидно, что комплекс ДНК лигазы III-Альфа/XRCC1 позволяет либо клеткам, которые либо отсутствуют, либо имеют снижение активности ДНК лигазы I для завершения репликации ДНК. [ 24 ] [ 26 ] [ 28 ] [ 29 ] Учитывая биохимические и клеточные биологические исследования, связывающие комплекс ДНК-лигазы III-альфа/XRCC1 с восстановлением удаления и восстановлением разрывов с одной цепью ДНК, [ 30 ] [ 31 ] [ 32 ] Удивительно, что клетки, в которых отсутствуют ядерная ДНК-лигаза III-альфа, не проявляли значительно повышенной чувствительности к нанесению нанесения ДНК агента. [ 24 ] [ 26 ] Эти исследования показывают, что существует значительная функциональная избыточность между ДНК-лигазой I и ДНК-лигазой III-альфа в этих путях репарации ядерной ДНК. В клетках млекопитающих большинство разрывов с двойной цепью ДНК восстанавливаются ДНК-лигазой IV-зависимым не-гомологичным соединением ( NHEJ ). [ 33 ] ДНК-лигаза III-Альфа участвует в незначительном альтернативном пути NHEJ, который генерирует хромосомные транслокации . [ 34 ] [ 35 ] В отличие от других функций репарации ядерной ДНК, кажется, что роль ДНК-лигазы III-альфа в альтернативном NHEJ не зависит от XRCC1. [ 36 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

В отличие от генов LIG1 и LIG4, [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] Унаследованные мутации в гене LIG3 не были идентифицированы в человеческой популяции. Однако ДНК-лигаза III-альфа была косвенно вовлечена в рак и нейродегенеративные заболевания . При раке ДНК-лигаза II-Альфа часто сверхэкспрессируется, и это служит биомаркером для идентификации клеток, которые в большей степени зависят от альтернативного пути NHEJ для восстановления разрывов ДНК двойной цепи. [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] Хотя повышенная активность альтернативного пути NHEJ вызывает геномную нестабильность , которая стимулирует прогрессирование заболевания, он также является новой мишенью для разработки специфических для раковых клеточных терапевтических стратегий. [ 42 ] [ 43 ] Несколько генов, кодирующих белки, которые непосредственно взаимодействуют с ДНК-лигазой III-альфа или косвенно посредством взаимодействий с XRCC1, были идентифицированы как мутированные при наследственных нейродегенеративных заболеваниях. [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ] [ 48 ] [ 49 ] Таким образом, представляется, что транзакции ДНК с участием ДНК-лигазы II-Альфа играют важную роль в поддержании жизнеспособности нейрональных клеток .

LIG3 играет роль в восстановлении микрогомологии, опосредованного конечным соединением (MMEJ) с двойными перерывами. Это один из 6 ферментов, необходимых для этого пути, подвергшегося лечению ДНК. [ 50 ] LIG3 активируется при хронической миелоидной лейкозе, [ 44 ] множественная миелома, [ 51 ] и рак молочной железы. [ 42 ]

Раковые заболевания очень часто недостаточны в экспрессии одного или нескольких генов репарации ДНК, но чрезмерная экспрессия гена репарации ДНК менее обычная при раке. Например, по меньшей мере 36 ферментов репарации ДНК, когда мутационно дефектные в клетках зародышевой линии вызывают повышенный риск рака (наследственные синдромы рака ). [ Цитация необходима ] (Также см. Вращение дефицита дефицита ДНК .) Аналогично, по меньшей мере 12 генов репарации ДНК часто было обнаружено эпигенетически репрессированным при одном или нескольких раковых заболеваниях. [ Цитация необходима ] (См. Также эпигенетически снижает репарацию ДНК и рак .) Обычно дефицитная экспрессия фермента, репаратируемого ДНК, приводит к увеличению повреждений не поврежденных ДНК, которые с помощью ошибок репликации ( синтез трансляции ) приводят к мутациям и раку. Тем не менее, опосредованный LIG3 восстановление MMEJ является очень неточным, поэтому в этом случае чрезмерная экспрессия, а не недостаточно экспрессия, по-видимому, приводит к раку.

Примечания

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000005156 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000020697 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ «Ген Entrez: лигаза III, ДНК, АТФ-зависимая» . Получено 2012-03-12 .
  6. ^ Tomkinson AE, Sallmyr A (декабрь 2013 г.). «Структура и функция ДНК -лигаз, кодируемых геном LIG3 млекопитающих» . Ген . 531 (2): 150–7. doi : 10.1016/j.gene.2013.08.061 . PMC   3881560 . PMID   24013086 .
  7. ^ Элленбергер Т., Томкинсон А.Е. (2008). «Эукариотические ДНК -лигазы: структурные и функциональные идеи» . Анну. Преподобный Биохим . 77 : 313–38. doi : 10.1146/annurev.biochem.77.061306.123941 . PMC   2933818 . PMID   18518823 .
  8. ^ Симсек Д., Джейсин М (ноябрь 2011 г.). «ДНК -лигаза III: точное присутствие у эукариот, но важная функция, в которой протестирована» . Клеточный цикл . 10 (21): 3636–44. doi : 10.4161/cc.10.21.18094 . PMC   3266004 . PMID   22041657 .
  9. ^ Jump up to: а беременный Котнер-Гохара Е., Ким Ик, Хаммел М., Тайнер Дж. А., Томкинсон А.Е., Элленбергер Т. (июль 2010 г.). «Человеческая ДНК-лигаза III распознает концы ДНК путем динамического переключения между двумя связующими ДНК-связанными состояниями» . Биохимия . 49 (29): 6165–76. doi : 10.1021/bi100503w . PMC   2922849 . PMID   20518483 .
  10. ^ Jump up to: а беременный Mackey ZB, Niedergang C, Murcia JM, Leppard J, Au K, Chen J, De Murcia G, Tomkinson AE (июль 1999 г.). «ДНК-лигаза III рекрутируется в разрывы ДНК цепей с помощью цинкового мотива пальца, гомологично по отношению к мотивам поли (ADP-рибозы) полимеразы. Идентификация двух функционально различных областей связывания ДНК в ДНК-лигазе III» . Журнал биологической химии . 274 (31): 21679–87. doi : 10.1074/jbc.274.31.21679 . PMID   10419478 .
  11. ^ Leppard JB, Dong Z, Mackey ZB, Tomkinson AE (август 2003 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между ДНК-лигазой IIIALPHA и поли (ADP-рибозой) полимеразой 1 в репарации разрыва с одним цепью ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (16): 5919–27. doi : 10.1128/mcb.23.16.5919-5927.2003 . PMC   166336 . PMID   12897160 .
  12. ^ Тейлор Р.М., Уайтхаус CJ, Caldecott KW (сентябрь 2000 г.). «Цинк -пальцем ДНК лигазы III стимулирует связывание с вторичной структурой ДНК и способствует соединению конечного соединения» . Нуклеиновые кислоты Res . 28 (18): 3558–63. doi : 10.1093/nar/28.18.3558 . PMC   110727 . PMID   10982876 .
  13. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Котнер-Гохара Е., Ким Ик, Томкинсон А.Е., Элленбергер Т. (апрель 2008 г.). «Два ДНК-связывающие и незвучные модули распознавания в ДНК-лигазе человека III» . Журнал биологической химии . 283 (16): 10764–72. doi : 10.1074/jbc.m708175200 . PMC   2447648 . PMID   18238776 .
  14. ^ Chen L, Trujillo K, Sung P, Tomkinson AE (август 2000 г.). «Взаимодействия комплекса ДНК-лигазы IV-XRCC4 с концами ДНК и ДНК-зависимой протеинкиназы» . Журнал биологической химии . 275 (34): 26196–205. doi : 10.1074/jbc.m000491200 . PMID   10854421 .
  15. ^ Jump up to: а беременный Lakshmipathy U, Campbell C (май 1999). «Ген ДНК -лигазы человека кодирует ядерные и митохондриальные белки» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3869–76. doi : 10.1128/mcb.19.5.3869 . PMC   84244 . PMID   10207110 .
  16. ^ Jump up to: а беременный в Mackey ZB, Ramos W, Levin DS, Walter CA, McCarrey Jr, Tomkinson AE (февраль 1997 г.). «Альтернативное событие сплайсинга, которое происходит в мышиных сперматоцитах, генерирует форму ДНК -лигазы III с различными биохимическими свойствами, которые могут функционировать в мейотической рекомбинации» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (2): 989–98. doi : 10.1128/mcb.17.2.989 . PMC   231824 . PMID   9001252 .
  17. ^ Вей Ю.Ф., Робинс П., Картер К., Кальдекотт К., Паппин Д.Дж., Ю Г.Л., Ван Р.П., Шелл Б.К., Нэш Р.А., Шар П. (июнь 1995 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК человека, кодирующие новую ДНК -лигазу IV и ДНК -лигазу III, фермент, активный в репарации и рекомбинации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (6): 3206–16. doi : 10.1128/mcb.15.6.3206 . PMC   230553 . PMID   7760816 .
  18. ^ Чен Дж., Томкинсон А.Е., Рамос В., Макки З.Б., Данехауэр С., Уолтер К.А., Шульц Р.А., Бестерман Дж. М., Хусейн I (октябрь 1995). «ДНК -лигаза млекопитающих III: молекулярное клонирование, хромосомная локализация и экспрессия в сперматоцитах, подвергающихся мейотической рекомбинации» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5412–22. doi : 10.1128/mcb.15.10.5412 . PMC   230791 . PMID   7565692 .
  19. ^ Jump up to: а беременный Caldecott KW, McKeown CK, Tucker JD, Ljungquist S, Thompson LH (январь 1994 г.). «Взаимодействие между ДНК -белком млекопитающего белка XRCC1 и ДНК -лигазой III» . Молекулярная и клеточная биология . 14 (1): 68–76. doi : 10.1128/mcb.14.1.68 . PMC   358357 . PMID   8264637 .
  20. ^ Caldecott KW, Tucker JD, Stanker LH, Thompson LH (декабрь 1995 г.). «Характеристика комплекса XRCC1-ДНК лигазы III in vitro и его отсутствие в клетках мутантных ходок» . Нуклеиновые кислоты Res . 23 (23): 4836–43. doi : 10.1093/nar/23.23.4836 . PMC   307472 . PMID   8532526 .
  21. ^ Нэш Р.А., Калдекотт К.В., Барнс Д.Е., Линдаль Т (апрель 1997 г.). «Белок XRCC1 взаимодействует с одной из двух различных форм ДНК -лигазы III». Биохимия . 36 (17): 5207–11. doi : 10.1021/bi962281m . PMID   9136882 .
  22. ^ Lakshmipathy U, Campbell C (октябрь 2000 г.). «Митохондриальная ДНК -лигаза III не зависит от XRCC1» . Нуклеиновые кислоты Res . 28 (20): 3880–6. doi : 10.1093/nar/28.20.3880 . PMC   110795 . PMID   11024166 .
  23. ^ Parsons JL, Dianova II, Finch D, Tait PS, Ström CE, Helleday T, Dianov GL (июль 2010 г.). «Фосфорилирование XRCC1 CK2 требуется для его стабильности и эффективного восстановления ДНК» . Репарация ДНК (Amst.) . 9 (7): 835–41. doi : 10.1016/j.dnarep.2010.04.008 . PMID   20471329 .
  24. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Гао Y, Кэйал С., Ли Ю., Чжао Дж., Регг Дж., Рассел Х.Р., МакКиннон П.Дж. (март 2011 г.). «ДНК-лигаза III является критической для целостности мтДНК, но не для xrcc1-опосредованной репарации ядерной ДНК» . Природа . 471 (7337): 240–4. Bibcode : 2011natur.471..240g . doi : 10.1038/nature09773 . PMC   3079429 . PMID   21390131 .
  25. ^ Lakshmipathy U, Campbell C (февраль 2001 г.). «Антисенслой опосредованное снижение экспрессии ДНК лигазы III приводит к снижению целостности митохондриальной ДНК» . Нуклеиновые кислоты Res . 29 (3): 668–76. doi : 10.1093/nar/29.3.668 . PMC   30390 . PMID   11160888 .
  26. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Симсек Д., Толст А., Гао Й, Артус Дж., Брунет Е., Хаджантонакис А.К., Ван Хаутен Б., Шуман С., МакКинон П.Дж., Ясин М (март 2011 г.). «Важнейшая роль ДНК-лигазы III в митохондриях, но не в восстановлении XRCC1-Depenent » Природа 471 (7337): 245–8 Bibcode : 2011Natur.471..245S Doi : 10.1038/ nature09794  3261757PMC  21390132PMID
  27. ^ Jump up to: а беременный Shokolenko In, Fayzulin RZ, Katyal S, McKinnon PJ, Alexeev MF (13 сентября 2013 г.). «Митохондриальная ДНК -лигаза является неопределенной для жизнеспособности культивируемых клеток, но необходима для поддержания мтДНК» . Журнал биологической химии . 288 (37): 26594–605. doi : 10.1074/jbc.m113.472977 . PMC   3772206 . PMID   23884459 .
  28. ^ Аракава Х., Беднар Т., Ван М., Пол К, Младенов Е., Бенксик Тилен А.А., Илиакис Г. (март 2012 г.). «Функциональная избыточность между ДНК -лигазами I и III в репликации ДНК в клетках позвоночных» . Исследование нуклеиновых кислот . 40 (6): 2599–610. doi : 10.1093/nar/gkr1024 . PMC   3315315 . PMID   22127868 .
  29. ^ Le Chalony C, Hoffschir F, Gauthier LR, Gross J, Biard DS, Boussin FD, Pennaneach V (сентябрь 2012 г.). «Частичная комплементация дефицита ДНК -лигазы I с помощью ДНК -лигазы III и ее влияние на выживание клеток и стабильность теломер в клетках млекопитающих» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 69 (17): 2933–49. doi : 10.1007/s00018-012-0975-8 . PMC   3417097 . PMID   22460582 .
  30. ^ Каппелли Е., Тейлор Р., Севаско М., Аббондондоло А., Кальдекотт К., Фросина Г. (сентябрь 1997 г.). «Участие продуктов гена XRCC1 и ДНК лигазы III в репарации удаления основания ДНК» . Журнал биологической химии . 272 (38): 23970–5. doi : 10.1074/jbc.272.38.23970 . PMID   9295348 .
  31. ^ Окано С., Лан Л., Томкинсон А.Е., Ясуи А. (2005). «Транслокация XRCC1 и ДНК лигазы II-альфа из центросомов в хромосомы в ответ на повреждение ДНК в митотических клетках человека» . Нуклеиновые кислоты Res . 33 (1): 422–9. doi : 10.1093/nar/gki190 . PMC   546168 . PMID   15653642 .
  32. ^ Kubota Y, Nash RA, Klungland A, Schär P, Barnes DE, Lindahl T (декабрь 1996 г.). «Восстановление эксцизионной репрессии базы ДНК с очищенными белками человека: взаимодействие между бета-версией ДНК-полимеразы и белком XRCC1» . Embo Journal . 15 (23): 6662–70. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01056.x . PMC   452490 . PMID   8978692 .
  33. ^ Lieber MR (2010). «Механизм двойного репарации разрыва ДНК нехомологичным путем с конечным соединением ДНК» . Анну. Преподобный Биохим . 79 : 181–211. doi : 10.1146/annurev.biochem.052308.093131 . PMC   3079308 . PMID   20192759 .
  34. ^ Ван Х., Розиди Б., Перро Р., Ван М., Чжан Л., Виндхофер Ф., Ильякис Г (май 2005 г.). «ДНК -лигаза III как кандидатский компонент путей резервного копирования нехолологического конца соединения» . Рак . 65 (10): 4020–30. doi : 10.1158/0008-5472.can-04-3055 . PMID   15899791 .
  35. ^ Симсек Д., Брунет Е., Вонг С.А., Катьял С., Гао Й, МакКиннин П.Дж., Лу Дж, Чжан Л., Ли Дж., Репор Э.Дж., Грегори П.Д., Холмс М.К., Джасин М (июнь 2011 г.). Haber Je (ред.). «ДНК-лигаза III способствует альтернативному нехомологичному конечному соединению во время образования хромосомной транслокации» . PLOS GENET . 7 (6): E1002080. doi : 10.1371/journal.pgen.1002080 . PMC   3107202 . PMID   21655080 .
  36. ^ Бобайла С., Оксенич В., Гостисса М., Ван Дж. Х., Чжа С., Чжан Ю., Чай Х, Ли К.С., Янкович М., Саез Л.М., Нуссенцвейг М.К., МакКиннин П.Дж., Альт Ф.В., Швер Б (февраль 2012 г.). «Надежное восстановление хромосомной ДНК посредством альтернативного концов, в отсутствие рентгеновского репарации поперечного комплементарного белка 1 (xrcc1)» . Труды Национальной академии наук, США . 109 (7): 2473–8. BIBCODE : 2012PNAS..109.2473B . doi : 10.1073/pnas.1121470109 . PMC   3289296 . PMID   22308491 .
  37. ^ Жирард П.М., Кайсела Б., Херер С.Дж., Доэрти А.Дж., Джегго Па (октябрь 2004 г.). «Анализ мутаций ДНК лигазы IV, обнаруженных у пациентов с синдромом Лиг4: влияние двух связанных полиморфизмов» . Молекулярная генетика человека . 13 (20): 2369–76. doi : 10.1093/hmg/ddh274 . PMID   15333585 .
  38. ^ O'Driscoll M, Cerosaletti KM, Girard PM, Dai Y, Stumm M, Kysela B, Hirsch B, Gennery A, Palmer SE, Seidel J, Gatti RA, Varon R, Oettinger MA, Neitzel H, Jeggo PA, Ancannon P ( Декабрь 2001 г.). «Мутации ДНК лигазы IV, выявленные у пациентов, демонстрирующих задержку развития и иммунодефицит» . Молекулярная клетка . 8 (6): 1175–85. doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00408-7 . PMID   11779494 .
  39. ^ Рибалло Е., Кричлоу С.Е., Тео Ш., Доэрти А.Дж., Пристли А., Бротон Б., Кайсела Б., Бимиш Х, Плауман Н., Арлетт К.Ф., Леманн А.Р., Джексон С.П., Джегго П.А. (июль 1999 г.). «Идентификация дефекта в ДНК -лигазе IV у пациента с радиочувствительной лейкозом» . Карт Биол . 9 (13): 699–702. Bibcode : 1999cbio .... 9..699r . doi : 10.1016/s0960-9822 (99) 80311-x . PMID   10395545 . S2CID   17103936 .
  40. ^ Barnes DE, Tomkinson AE, Lehmann AR, Webster AD, Lindahl T (май 1992). «Мутации в гене ДНК-лигазы I индивидуума с иммунодефицитом и клеточной гиперчувствительностью к агентам, поражающим ДНК». Клетка . 69 (3): 495–503. doi : 10.1016/0092-8674 (92) 90450-q . PMID   1581963 . S2CID   11736507 .
  41. ^ Чен Х, Чжун С., Чжу Х, Дзегилевская Б., Элленбергер Т., Уилсон Г.М., Макерелл А.Д., Томкинсон А.Е. (май 2008). «Рациональный дизайн ингибиторов ДНК -лигазы человека, которые нацелены на репликацию и восстановление клеточной ДНК» . Рак . 68 (9): 3169–77. doi : 10.1158/0008-5472.can-07-6636 . PMC   2734474 . PMID   18451142 .
  42. ^ Jump up to: а беременный в Тобин Л.А., Роберт С., Нагария П., Чумсри С., Твадделл В., Иоффе ОБ, Греко Г.Е., Броди А.Х., Томкинсон А.Е., Рассул Ф.В. (2012). «Нацеливание на ненормальное восстановление ДНК при устойчивом к терапии рака молочной железы» . Молекулярное исследование рака . 10 (1): 96–107. doi : 10.1158/1541-7786.mcr-11-0255 . PMC   3319138 . PMID   22112941 .
  43. ^ Jump up to: а беременный Тобин Л.А., Роберт С., Рапопорт А.П., Годжо I, Баер М.Р., Томкинсон А.Е., Rassool FV (апрель 2013 г.). «Нацеливание аномального репарации двойного разрыва ДНК в ингибиторе ингибитора тирозинкиназы, устойчивые к хроническим миелоидным лейкозам» . Онкоген . 32 (14): 1784–93. doi : 10.1038/onc.2012.203 . PMC   3752989 . PMID   22641215 .
  44. ^ Jump up to: а беременный Sallmyr A, Tomkinson AE, Rassool FV (август 2008 г.). «Повышенная регуляция WRN и ДНК-лигазы III-альфа при хронической миелоидной лейкозе: последствия для восстановления разрывов с двумя целями ДНК» . Кровь . 112 (4): 1413–23. doi : 10.1182/blood-2007-07-104257 . PMC   2967309 . PMID   18524993 .
  45. ^ Ahel I, Rass U, El-Khamisy SF, Katyal S, Clements PM, McKinnon PJ, Caldecott KW, West SC (октябрь 2006 г.). «Белок нейродегенеративного заболевания апратаксин разрешает абортивные промежуточные соединения лигирования ДНК». Природа . 443 (7112): 713–6. Bibcode : 2006natur.443..713a . doi : 10.1038/nature05164 . PMID   16964241 . S2CID   4431045 .
  46. ^ Дата Х, Онодера О., Танака Х., Ивабучи К., Уэкава К., Игараши С., Коике Р., Хирои Т., Юаса Т., Уакай Т., Сакаи Т., Такахаши Т, Нагатомо Х, Секиджима Ю., Кавачи I, Такияма Y, Nishizawa M, Fukuhara N, Saito K, Sugano S, Tsuji S (октябрь 2001 ) . г. 184–8 DOI : ng1001-184 . 10.1038   / ​ .  ​ ​
  47. ^ Moresira MC, Barbot C, Tachi N, Kozuka N, Uchida E, Gibson T, Mendonça P, Costa M, Barros J, Yanagisawa T, Watanaba M, Ikeda Y, Aoki M, Nagata T, Coutinho P, Sequeis J, Koenig M, (Октябрь 2001 г.). «Ген, оправданный в атаксии-кокулярной апраксии 1, кодирует новый белок хит/Zn-трос апратаксин» Природа генетика 29 (2): 189–9 Doi : 10.1038/ ng1001-1 PMID   11586300 S2CID   23001321
  48. ^ El-Khamisy SF, Saifi GM, Weinfeld M, Johansson F, Helleday T, Lupski JR, Caldecott KW (март 2005 г.). «Дефектное восстановление разрыва с одной цепью ДНК при спиноцеребеллярной атаксии с аксоной невропатией-1». Природа . 434 (7029): 108–13. Bibcode : 2005natur.434..108e . doi : 10.1038/nature03314 . PMID   15744309 . S2CID   4423748 .
  49. ^ Shen J, Gilmore EC, Marshall CA, Haddadin M, Reynolds JJ, Eyaid W, Bodell A, Barry B, Gleson D, Allen K, Ganesh Vs, Chang Bs, Grix A, Hill RS, Topcu M, Caldecott KW, Barkovich AJ , Уолш Калифорния (март 2010 г.). «Мутации в PNKP вызывают микроцефалию, судороги и дефекты в репарации ДНК» . Природа генетика . 42 (3): 245–9. doi : 10.1038/ng.526 . PMC   2835984 . PMID   20118933 .
  50. ^ Шарма С., Джавадекар С.М., Пандей М., Шривастава М., Кумари Р., Рагхаван С.С. (2015). «Гомология и ферментативные требования к микрогомологическому альтернативному окончательному соединению» . Гибель клеток дис . 6 (3): E1697. doi : 10.1038/cddis.2015.58 . PMC   4385936 . PMID   25789972 .
  51. ^ Herrero AB, San Miguel J, Gutierrez NC (2015). «Дерегуляция репарации разрыва с двумя целями ДНК при множественной миеломе: последствия для стабильности генома» . Plos один . 10 (3): E0121581. BIBCODE : 2015PLOSO..1021581H . doi : 10.1371/journal.pone.0121581 . PMC   4366222 . PMID   25790254 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=DNA_ligase_3&oldid=1240678143"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 4ad5f0493c450531da4d1a933ad3145d__1723821960
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/4a/5d/4ad5f0493c450531da4d1a933ad3145d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
DNA ligase 3 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)