Эндогликозидаза H
| Маннозилгликопротеин эндо-β- N -ацетилглюкозаминидаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 3.2.1.96 | ||
| Номер CAS. | 37278-88-9 | ||
| Альт. имена | Эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза H , N,N ′ -диацетилхитобиозил β-N-ацетилглюкозаминидаза , маннозилгликопротеин эндо-β-N-ацетилглюкозамидаза , ди-N-ацетилхитобиозил β-N-ацетилглюкозаминидаза , эндо-β-ацетилглюкозаминидаза , эндо -β-(1→4)-N-ацетилглюкозаминидаза , маннозилгликопротеин 1,4-N-ацетамидодезокси-β-D-гликогидролаза , эндогликозидаза S , эндо-N-ацетил-β-D-глюкозаминидаза , эндо-N-ацетил -β-глюкозаминидаза , эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза D , эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза F , эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза H , эндо-β-N-ацетилглюкозаминидаза L , гликопептид-D-маннозил-4-N -(N-ацетил-D-глюкозаминил)2-аспарагин 1,4-N-ацетил-β-глюкозаминогидролаза , эндогликозидаза H | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| |||
Фермент маннозилгликопротеин эндо-β- N -ацетилглюкозаминидаза (эндогликозидаза Н) ( EC 3.2.1.96 ) имеет систематическое название гликопептид- D -маннозил-N. 4 -(N-ацетил -D -глюкозаминил)2-аспарагин-1,4-N-ацетил-β-глюкозаминогидролаза . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Это высокоспецифичная эндогликозидаза , которая отщепляет аспарагин -связанные маннозо-богатые олигосахариды , но не сильно процессированные сложные олигосахариды от гликопротеинов . Он используется в исследовательских целях для дегликозилирования гликопротеинов и для мониторинга внутриклеточного перемещения белков по секреторному пути .
Структура и деятельность
[ редактировать ]Эндогликозидаза H выделена из Streptomyces plicatus или Streptomyces griseus . Его молекулярная масса составляет 29 кДа. Первичная структура была описана Роббинсом и соавт. в 1984 году. [ 7 ]
Эндогликозидаза Н расщепляет связь в диацетилхитобиозном ядре олигосахарид между двумя субъединицами N -ацетилглюкозамина (GlcNAc), непосредственно проксимальными к остатку аспарагина, образуя усеченную молекулу сахара с одним остатком N -ацетилглюкозамина, оставшимся на аспарагине. [ 8 ]
Он дегликозилирует маннозные гликопротеины, но степень и скорость дегликозилирования в высокой степени зависят от природы гликопротеинов. Скорость дегликозилирования можно увеличить путем денатурации гликопротеинов (например, путем карбоксиметилирования, сульфитолиза или нагревания в присутствии додецилсульфата натрия). Добавление 0,1 М 2-меркаптоэтанола резко повышает активность ферментов в отношении гликопротеинов, содержащих меж- или внутримолекулярные дисульфидные мостики, в отличие от детергентов типа Тритона Х-100, н- Октилглюкозид, или цвиттер-ионные детергенты. [ 9 ]
Биохимические применения
[ редактировать ]Эндогликозидаза H обычно используется клеточными биологами для мониторинга посттрансляционных модификаций в аппарате Гольджи . предназначенных для клеточной поверхности, транслируются рибосомами Большинство белков , в шероховатый эндоплазматический ретикулум (ЭР) и транспортируются в аппарат Гольджи. При попадании в ЭР молекула, содержащая 14 сахарных субъединиц, блоком селективно связывается с аспарагином с помощью фермента олигосахарилтрансферазы . Именно эта молекула олигосахарида модифицируется рядом ферментов по мере продвижения белка через различные отделы аппарата Гольджи . Эндогликозидаза H способна расщеплять каждую структуру этого олигосахарида по мере ее обработки до тех пор, пока фермент Гольджи α-маннозидаза II не удалит две маннозы субъединицы . Поскольку все более поздние олигосахаридные структуры устойчивы к расщеплению эндогликозидазой H, этот фермент широко используется для определения степени процессинга олигосахаридов, которому подвергся интересующий белок. [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чиен С., Вайнбург Р., Ли С., Ли Ю. (1977). «Эндо-β- N -ацетилглюкозаминидаза из инжирного латекса». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 76 : 317–323. дои : 10.1016/0006-291x(77)90727-6 .
- ^ Койде Н., Мурамацу Т. (август 1974 г.). «Эндо-β- N -ацетилглюкозаминидаза, действующая на углеводные фрагменты гликопротеинов. Очистка и свойства фермента из Diplococcus pneumoniae ». Журнал биологической химии . 249 (15): 4897–904. ПМИД 4152561 .
- ^ Пирс Р.Дж., Спик Дж., Монтрей Дж. (июнь 1979 г.). «Цитозольное расположение активности эндо -N -ацетил-β-D-глюкозаминидазы в печени и почках крыс» . Биохимический журнал . 180 (3): 673–76. дои : 10.1042/bj1800673 . ПМК 1161109 . ПМИД 486141 .
- ^ Пирс Р.Дж., Спик Дж., Монтрей Дж. (январь 1980 г.). «Демонстрация и цитозольное расположение активности эндо -N -ацетил-β-D-глюкозаминидазы по отношению к субстрату асиало -N -ацетил-лактозаминового типа в печени крыс» . Биохимический журнал . 185 (1): 261–4. дои : 10.1042/bj1850261 . ПМЦ 1161293 . ПМИД 7378051 .
- ^ Тай Т, Ямасита К, Огата-Аракава М, Койде Н, Мурамацу Т, Ивашита С, Иноуэ Ю, Кобата А (ноябрь 1975 г.). «Структурные исследования двух гликопептидов овальбумина в отношении специфичности эндо-β- N -ацетилглюкозаминидазы». Журнал биологической химии . 250 (21): 8569–75. ПМИД 389 .
- ^ Тарентино А.Л., Пламмер Т.Х., Мэйли Ф. (февраль 1974 г.). «Высвобождение интактных олигосахаридов из специфических гликопротеинов эндо-β- N -ацетилглюкозаминидазой H». Журнал биологической химии . 249 (3): 818–24. ПМИД 4204553 .
- ^ Роббинс П.В., Тримбл Р.Б., Вирт Д.Ф., Геринг С., Мэйли Ф., Мэйли Г.Ф., Дас Р., Гибсон Б.В., Ройал Н., Биманн К. (июнь 1984 г.). «Первичная структура фермента -ацетилглюкозаминидазы H» Streptomyces эндо-β- N . Журнал биологической химии . 259 (12): 7577–83. ПМИД 6429133 .
- ^ Эндогликозидаза H, Полярная звезда
- ^ Тримбл Р.Б., Мэйли Ф. (сентябрь 1984 г.). «Оптимизация гидролиза N -связанных олигосахаридов с высоким содержанием маннозы эндо-β- N -ацетилглюкозаминидазой H». Аналитическая биохимия . 141 (2): 515–22. дои : 10.1016/0003-2697(84)90080-0 . ПМИД 6437277 .
- ^ Альбертс Б (2002). Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Нью-Йорк: Гарленд. ISBN 978-0-8153-4072-0 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Закрытые ферменты
[ редактировать ]Эндогликозидазы F и D расщепляют Glc-Nac.
PNGаза F (пептид-N4-(N-ацетил-бета-глюкозаминил)аспарагин_амидаза)
