CYP26B1

CYP26B1
Идентификаторы
Псевдонимы	CYP26B1 , CYP26A2, P450RAI-2, P450RAI2, RHFCA, цитохром P450, член 1 подсемейства B семейства 26
Внешние идентификаторы	Опустить : 605207 ; МГИ : 2176159 ; Гомологен : 23179 ; Генные карты : CYP26B1 ; ОМА : CYP26B1 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	72,147,862 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	84,570,890 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	pons; ; skin of arm; ; cerebellar vermis; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; skin of leg; ; adipose tissue; ; subcutaneous adipose tissue; ; decidua; ; skin of abdomen;
	Top expressed in
	hand; ; skin of external ear; ; otolith organ; ; utricle; ; endocardial cushion; ; lip; ; decidua; ; neuromere; ; rhombomere; ; foot;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	iron ion binding; retinoic acid binding; metal ion binding; monooxygenase activity; heme binding; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; oxidoreductase activity; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, NAD(P)H as one donor, and incorporation of one atom of oxygen; retinoic acid 4-hydroxylase activity;
Cellular component	cytoplasm; organelle membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; endoplasmic reticulum;
Biological process	cellular response to retinoic acid; proximal/distal pattern formation; retinoic acid catabolic process; tongue morphogenesis; establishment of skin barrier; positive regulation of tongue muscle cell differentiation; regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; male meiotic nuclear division; bone morphogenesis; positive regulation of gene expression; retinoic acid receptor signaling pathway; embryonic limb morphogenesis; vitamin metabolic process; spermatogenesis; establishment of T cell polarity; cornification; cell fate determination; inflammatory response; regulation of T cell differentiation; xenobiotic metabolic process; sterol metabolic process; response to retinoic acid; response to vitamin A; kidney development;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	56603
	232174
	ENSG00000003137
	ENSMUSG00000063415
	Q9NR63
	Q811W2
	НМ_001277742 ; НМ_019885
	НМ_001177713 ; НМ_175475
	НП_001264671 ; НП_063938
	НП_001171184 ; НП_780684
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цитохром P450 26B1 — белок , который у человека кодируется CYP26B1 геном . ^[5]^[6]

кодирует член цитохрома P450 суперсемейства ферментов Этот ген . Белки цитохрома P450 представляют собой монооксигеназы , которые катализируют многие реакции, участвующие в метаболизме лекарств и синтезе холестерина , стероидов и других липидов . Фермент, кодируемый этим геном, участвует в специфической инактивации полностью транс-ретиноевой кислоты до гидроксилированных форм, таких как 4-оксо-, 4-ОН- и 18-ОН-все-транс-ретиноевая кислота. ^[6]

У развивающегося эмбриона мыши CYP26B1 экспрессируется в дистальном кончике формирующегося зачатка конечности с обилием в апикальном эктодермальном гребне . В нокаутной мышиной модели мыши проявляются тяжелыми пороками развития конечностей и умирают после рождения из-за респираторного дистресс-синдрома. ^[7] Однако если экспрессию CYP26B1 условно удалить только до E9.5, конечности не будут столь сильно усечены и будет видно больше пальцев. Исследования показывают, что эта разница связана со временем дифференцировки хондробластов. ^[8]

Было показано, что CYP26B1 сверхэкспрессируется в клетках колоректального рака по сравнению с нормальным толстой кишки эпителием . Экспрессия CYP26B1 также имела независимое прогностическое значение у пациентов с колоректальным раком, а сильная экспрессия была связана с худшим исходом. ^[9]

На мышах было показано, что фермент, расщепляющий ретиноиды, кодируемый геном CYP26B1, также играет важную роль в развитии мужских гонад и сперматогенезе. ^[10] Действие ретиноевой кислоты (РА) подавляется CYP26B1, который останавливает дифференцировку мужских зародышевых клеток. ^[11] RA отвечает за активацию Stra8, который сигнализирует XX зародышевым клеткам о переходе к мейотической профазе I. Действия Stra8 ингибируются CYP26B1 до тех пор, пока мужчина не достигнет пубертатного возраста. Механизм подавления активности CYP26B1 в семенниках еще не открыт.

В полногеномном исследовании CCHCR1, TCN2, TNXB, LTA, FASN и CYP26B1 были идентифицированы как локусы, связанные с риском развития плоскоклеточного рака пищевода. Из этих локусов CYP26B1 продемонстрировал наибольшую величину эффекта. Более того, было обнаружено, что локус CYP26B1 имеет два аллеля с разной способностью катаболизировать полностью транс-ретиноевую кислоту, химиотерапевтический агент. Когда аллель с более высокой катаболической способностью, rs138478634-GA, сверхэкспрессировался, пролиферация клеток значительно усиливалась по сравнению с другим аллелем, rs138478634-GG. Кроме того, исследования позволяют предположить взаимодействие образа жизни, когда у людей с аллелем риска, которые курят или употребляют алкоголь, коэффициент нечетности более чем в 2 раза выше, чем у курильщиков или пьющих без этого варианта или у людей, которые воздерживаются от курения. ^[12]

См. также

Дефицит оксидоредуктазы цитохрома P450

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000003137 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063415 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нельсон Д.Р. (декабрь 1999 г.). «Второй CYP26 P450 у людей и рыбок данио: CYP26B1». Арх Биохим Биофиз . 371 (2): 345–7. дои : 10.1006/abbi.1999.1438 . ПМИД 10545224 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: цитохром P450 CYP26B1, семейство 26, подсемейство B, полипептид 1» .
^ Яширо К., Чжао Х., Уэхара М., Ямшита К., Нисидзима М., Нишино Дж., Сайджо Ю., Сакаи Ю., Хамада Х. (2004). «Регуляция распределения ретиноевой кислоты необходима для формирования проксимодистального паттерна и роста развивающейся конечности мыши» . Дев. Клетка . 6 (3): 411–22. дои : 10.1016/s1534-5807(04)00062-0 . ПМИД 15030763 .
^ Дрансе Х.Дж., Сампайо А.В., Петкович М., Андерхилл Т.М. (2011). «Генетическая делеция Cyp26b1 отрицательно влияет на скелетогенез конечностей, подавляя хондрогенез». Дж. Клеточная наука . 124 (16): 2723–34. дои : 10.1242/jcs.084699 . ПМИД 21807937 . S2CID 33340957 .
^ Браун, Гордон; Беатрис Кэш; Даниэла Блихоге; Петронелла Йоханссон; Айхам Алнабулси; Грэм Мюррей (07 марта 2014 г.). «Экспрессия и прогностическое значение ферментов, метаболизирующих ретиноевую кислоту, при колоректальном раке» . ПЛОС ОДИН . 9 (3): е90776. Бибкод : 2014PLoSO...990776B . дои : 10.1371/journal.pone.0090776 . ПМЦ 3946526 . ПМИД 24608339 .
^ Саба Р., Ву Ц, Сага Ю (2014). «CYP26B1 способствует дифференцировке мужских зародышевых клеток путем подавления STRA8-зависимых мейотических и STRA8-независимых митотических путей». Дев. Биол . 389 (2): 173–181. дои : 10.1016/j.ydbio.2014.02.013 . ПМИД 24576537 .
^ Боулз Дж., Найт Д., Смит С., Вильгельм Д., Ричман Дж., Мамия С., Яширо К., Чавенгсаксофак К., Уилсон М.Дж., Россант Дж., Хамада Х., Купман П. (2006). «Передача сигналов ретиноидов определяет судьбу зародышевых клеток у мышей». Наука . 312 (5773): 596–600. Бибкод : 2006Sci...312..596B . дои : 10.1126/science.1125691 . ПМИД 16574820 . S2CID 2514848 .
^ Чанг Дж, Чжун Р, Тянь Дж, Ли Дж, Чжай К, Кэ Дж, Лу Дж, Чан В, Чжу Б, Шэнь Н, Чжан Ю, Гун Ю, Ян Ю, Цзоу Д, Пэн Икс, Чжан Цз, Чжан Икс , Хуан К., Ву Т, Ву С, Мяо X, Линь Д (2018). «Общий экзомный анализ выявляет низкочастотный вариант CYP26B1 и дополнительные варианты кодирования, связанные с плоскоклеточным раком пищевода». Нат. Жене . 50 (3): 338–43. дои : 10.1038/s41588-018-0045-8 . ПМИД 29379198 . S2CID 205571738 .

Внешние ссылки

человека CYP26B1 Расположение генома и страница сведений о гене CYP26B1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Крыса Е, Бийо-Ладен I, Аллорг Д и др. (2006). «Доказательства функционального генетического полиморфизма человеческого фермента CYP26A1, метаболизирующего ретиноевую кислоту, фермента, который может участвовать в расщелине позвоночника». Врожденные дефекты Рез. А. 76 (6): 491–8. дои : 10.1002/bdra.20275 . ПМИД 16933217 .
Боулз Дж., Найт Д., Смит С. и др. (2006). «Передача сигналов ретиноидов определяет судьбу зародышевых клеток у мышей». Наука . 312 (5773): 596–600. Бибкод : 2006Sci...312..596B . дои : 10.1126/science.1125691 . ПМИД 16574820 . S2CID 2514848 .
Хиллиер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Трофимова-Гриффин М.Е., Джухау М.Р. (2002). «Эволюционная экспрессия цитохрома CYP26B1 (P450RAI-2) в тканях головного мозга человека». Мозговой Рес. Дев. Мозговой Рес . 136 (2): 175–8. дои : 10.1016/S0165-3806(02)00305-X . ПМИД 12101034 .
Абу-Абед С., Маклин Г., Фраулоб В. и др. (2002). «Дифференциальная экспрессия ферментов CYP26A1 и CYP26B1, метаболизирующих ретиноевую кислоту, во время органогенеза у мышей». Мех. Дев . 110 (1–2): 173–7. дои : 10.1016/S0925-4773(01)00572-X . ПМИД 11744378 . S2CID 9286863 .
Уайт Дж.А., Рамшоу Х., Тайми М. и др. (2000). «Идентификация человеческого цитохрома P450, P450RAI-2, который преимущественно экспрессируется во взрослом мозжечке и отвечает за метаболизм полностью транс-ретиноевой кислоты» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (12): 6403–8. Бибкод : 2000PNAS...97.6403W . дои : 10.1073/pnas.120161397 . ЧВК 18615 . ПМИД 10823918 .
Саба Р., Ву Ц, Сага Ю (2014). «CYP26B1 способствует дифференцировке мужских зародышевых клеток путем подавления STRA8-зависимых мейотических и STRA8-независимых митотических путей». Дев. Биол . 389 (2): 173–181. дои : 10.1016/j.ydbio.2014.02.013 . ПМИД 24576537 .
Боулз Дж., Найт Д., Смит С., Вильгельм Д., Ричман Дж., Мамия С., Яширо К., Чавенгсаксофак К., Уилсон М.Дж., Россант Дж., Хамада Х., Купман П. (2006). «Передача сигналов ретиноидов определяет судьбу зародышевых клеток у мышей». Наука . 312 (5773): 596–600. Бибкод : 2006Sci...312..596B . дои : 10.1126/science.1125691 . ПМИД 16574820 . S2CID 2514848 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000003137 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063415 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10545224-5] Нельсон Д.Р. (декабрь 1999 г.). «Второй CYP26 P450 у людей и рыбок данио: CYP26B1». Арх Биохим Биофиз . 371 (2): 345–7. дои : 10.1006/abbi.1999.1438 . ПМИД 10545224 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: цитохром P450 CYP26B1, семейство 26, подсемейство B, полипептид 1» .

[7] Яширо К., Чжао Х., Уэхара М., Ямшита К., Нисидзима М., Нишино Дж., Сайджо Ю., Сакаи Ю., Хамада Х. (2004). «Регуляция распределения ретиноевой кислоты необходима для формирования проксимодистального паттерна и роста развивающейся конечности мыши» . Дев. Клетка . 6 (3): 411–22. дои : 10.1016/s1534-5807(04)00062-0 . ПМИД 15030763 .

[8] Дрансе Х.Дж., Сампайо А.В., Петкович М., Андерхилл Т.М. (2011). «Генетическая делеция Cyp26b1 отрицательно влияет на скелетогенез конечностей, подавляя хондрогенез». Дж. Клеточная наука . 124 (16): 2723–34. дои : 10.1242/jcs.084699 . ПМИД 21807937 . S2CID 33340957 .

[9] Браун, Гордон; Беатрис Кэш; Даниэла Блихоге; Петронелла Йоханссон; Айхам Алнабулси; Грэм Мюррей (07 марта 2014 г.). «Экспрессия и прогностическое значение ферментов, метаболизирующих ретиноевую кислоту, при колоректальном раке» . ПЛОС ОДИН . 9 (3): е90776. Бибкод : 2014PLoSO...990776B . дои : 10.1371/journal.pone.0090776 . ПМЦ 3946526 . ПМИД 24608339 .

[10] Саба Р., Ву Ц, Сага Ю (2014). «CYP26B1 способствует дифференцировке мужских зародышевых клеток путем подавления STRA8-зависимых мейотических и STRA8-независимых митотических путей». Дев. Биол . 389 (2): 173–181. дои : 10.1016/j.ydbio.2014.02.013 . ПМИД 24576537 .

[11] Боулз Дж., Найт Д., Смит С., Вильгельм Д., Ричман Дж., Мамия С., Яширо К., Чавенгсаксофак К., Уилсон М.Дж., Россант Дж., Хамада Х., Купман П. (2006). «Передача сигналов ретиноидов определяет судьбу зародышевых клеток у мышей». Наука . 312 (5773): 596–600. Бибкод : 2006Sci...312..596B . дои : 10.1126/science.1125691 . ПМИД 16574820 . S2CID 2514848 .

[12] Чанг Дж, Чжун Р, Тянь Дж, Ли Дж, Чжай К, Кэ Дж, Лу Дж, Чан В, Чжу Б, Шэнь Н, Чжан Ю, Гун Ю, Ян Ю, Цзоу Д, Пэн Икс, Чжан Цз, Чжан Икс , Хуан К., Ву Т, Ву С, Мяо X, Линь Д (2018). «Общий экзомный анализ выявляет низкочастотный вариант CYP26B1 и дополнительные варианты кодирования, связанные с плоскоклеточным раком пищевода». Нат. Жене . 50 (3): 338–43. дои : 10.1038/s41588-018-0045-8 . ПМИД 29379198 . S2CID 205571738 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

v т и Цитохромы , оксигеназы : цитохром P450 (большинство принадлежит EC 1.14)
CYP1	A1 A2 A5 B1
CYP2	A6 A7 A13 B6 C8 C9 C18 C19 D6 E1 F1 J2 R1 S1 U1 W1
CYP3 (CYP3A)	A4 A5 A7 A37 A43
CYP4	A11 A22 B1 F2 F3 F8 F11 F12 F22 V2 X1 Z1
CYP5-20	CYP5 (A1) CYP6 (G1, M2) CYP7 (A1, B1) CYP8 (A1, B1) CYP9 CYP10 CYP11 (A1, A2, B1, B2, B3, C1) CYP12 CYP13 CYP14 CYP15 CYP16 CYP17 (A1) CYP18 CYP19 (A1) CYP20 (A1)
CYP21-49	CYP21 (A2) CYP22 (A1) CYP23 CYP24 (A1) CYP25 CYP26 (A1, B1, C1) CYP27 (A1, B1, C1) CYP28 (A1) CYP29 CYP35 (B1) CYP39 (A1) CYP46 (A1)
CYP51-69	CYP51 (A1, F1) CYP52 CYP53 A1 CYP55 A1 CYP56 A1 CYP61
CYP71-99	CYP71 (C1, C2, C3, C4, Z6, AJ4, AV1, BA1) CYP72A1 CYP73A1 CYP74 (D1) CYP75 (A1, B1) CYP76 (B6, M7) CYP79 (A1, A2, B1, B2, B3, D1, D2, D3, D4) CYP80 (A1, B1, G2) CYP81 (E1, E3, E7, E9) CYP88D6 CYP90C1 CYP93E1 CYP97C1 CYP99A3
CYP101-281	CYP101A1 CYP102A1 CYP105 A1 D7 CYP106A2 CYP107 A1 G1 CYP109 B1 E1 CYP111 CYP113A1 CYP119A1 CYP123 CYP125A1 CYP139 CYP147 CYP152 A1 B1 CYP154C3 CYP158A CYP161C CYP170 A1 B1 CYP176A1 CYP183A CYP197 CYP199A2 CYP255A
CYP301-499	CYP303A1 CYP305 M2 Halloween genes ( CYP302A1, CYP306A1, CYP307A1, CYP307A2, CYP314A1, CYP315A1) CYP318A1
CYP501-699	CYP503 CYP504B1
CYP701-999	CYP704B22 CYP710 CYP720A1