CYP4F3

CYP4F3
Идентификаторы
Псевдонимы	CYP4F3 , CPF3, CYP4F, LTB4H, цитохром P450, семейство 4, член 3 подсемейства F, CYPIVF3
Внешние идентификаторы	Опустить : 601270 ; МГИ : 2158641 ; Гомологен : 73902 ; Генные карты : CYP4F3 ; ОМА : CYP4F3 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	15,662,825 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	33,166,376 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; trabecular bone; ; blood; ; bone marrow; ; kidney tubule; ; bone marrow cells; ; metanephric glomerulus; ; jejunal mucosa; ; gallbladder; ; human kidney;
	Top expressed in
	granulocyte; ; neural layer of retina; ; right kidney; ; yolk sac; ; duodenum; ; muscle of thigh; ; jejunum; ; left lobe of liver; ; lip; ; proximal tubule;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	iron ion binding; alpha-tocopherol omega-hydroxylase activity; tocopherol omega-hydroxylase activity; metal ion binding; monooxygenase activity; heme binding; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; oxidoreductase activity; 20-hydroxy-leukotriene B4 omega oxidase activity; leukotriene-B4 20-monooxygenase activity; 20-aldehyde-leukotriene B4 20-monooxygenase activity;
Cellular component	integral component of membrane; organelle membrane; endoplasmic reticulum membrane; membrane; intracellular membrane-bounded organelle; endoplasmic reticulum;
Biological process	leukotriene metabolic process; lipid metabolism; icosanoid metabolic process; leukotriene B4 catabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4051
	170716
	ENSG00000186529
	ENSMUSG00000024055
	Q08477
	н/д
	НМ_000896 ; НМ_001199208 ; НМ_001199209 ; НМ_001369696
	НМ_130882
	НП_000887 ; НП_001186137 ; НП_001186138 ; НП_001356625
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Цитохром P450 4F3 , также лейкотриен-B(4) омега-гидроксилаза 2 , представляет собой фермент , который у человека кодируется CYP4F3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} CYP4F3 кодирует два разных фермента, CYP4F3A и CYP4F3B , которые возникают в результате альтернативного сплайсинга одной молекулы-предшественника пре-мРНК; Выбор любой изоформы тканеспецифичен: CYP3F3A экспрессируется преимущественно в лейкоцитах , а CYP4F3B преимущественно в печени. ^{[ 8 ]}

Функция

Белки цитохрома P450 представляют собой монооксигеназы, которые катализируют многие реакции, участвующие в метаболизме лекарств и синтезе холестерина, стероидов, жирных кислот и других липидов. CYP4F3 фактически кодирует два сплайс-варианта, CYP4F3A и CYP4F3B, суперсемейства ферментов цитохрома P450. Этот ген является частью кластера генов цитохрома P450 на хромосоме 19. Другой член этого семейства, CYP4F8, находится на расстоянии примерно 18 т.п.н. ^{[ 7 ]} Оба варианта локализуются в эндоплазматическом ретикулуме и метаболизируют лейкотриен B4 и, весьма вероятно, 5-гидроксиэйкозатетраеновую кислоту , 5-оксо-эйкозатетраеновую кислоту и 12-гидроксиэйкозатетраеновую кислоту посредством реакции омега-окисления , т.е. путем добавления гидроксильного остатка к их концу (т.е. C- 20) углерод. ^{[ 9 ]} Это дополнение запускает процесс инактивации и разрушения всех этих хорошо известных медиаторов воспаления. ^{[ 10 ]} CYP3FA является основным ферментом, осуществляющим окисление омега-омега в лейкоцитах. ^{[ 10 ]}

CYP4F3A и/или CYP43FB также омега-окисляют арахидоновую кислоту до 20-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты (20-HETE), а также эпоксиэйкозатриеновые кислоты (EET) до 20-гидрокси-EET. ^{[ 10 ]} 20-HETE регулирует кровоток, васкуляризацию, кровяное давление и поглощение ионов почечными канальцами у грызунов и, возможно, у людей; ^{[ 8 ]} Было также предложено участвовать в регуляции роста различных типов рака человека (см. 20-гидроксиэйкозатетраеновая кислота § Рак ). EET имеют аналогичный набор регуляторных функций, но часто действуют противоположно 20-HETE (см. Эпоксиэйкозатриеновая кислота § Рак ); однако, поскольку активность 20-HEET не была четко определена, функция омега-окисления EET неясна. ^{[ 8 ]}

Генетические варианты

Вызванная гидроксилированием инактивация медиаторов воспаления, возможно, особенно лейкотриена B4, может лежать в основе предполагаемой роли этих цитохромов в подавлении воспалительных реакций, а также сообщений о связи некоторых однонуклеотидных вариантов CYP4F3 (SNP) с болезнью Крона у человека (SNP). обозначаются rs1290617 ^{[ 11 ]} и rs1290620 ^{[ 12 ]} и целиакия (rs1290622 и rs1290625). ^{[ 8 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Существует также исследование, которое обнаружило в популяции Гуанчжоу связь между однонуклеотидной вариацией rs3794987 и восприимчивостью к вирусу SARS-CoV-1, обнаруженному в 2003 году. Генотип GG/AG был связан с повышенной восприимчивостью к SARS-CoV-1. 1, по сравнению с генотипом АА. Однако результаты этой связи не были воспроизведены в другом исследовании населения Пекина. Комбинированный анализ двух исследований не показывает какой-либо связи проанализированных SNP CYP4F3 с восприимчивостью к SARS-CoV-1. ^{[ 17 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186529 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024055 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кикута Ю, Кусуносе Э, Эндо К, Ямамото С, Согава К, Фуджи-Курияма Ю, Кусуносе М (май 1993 г.). «Новая форма семейства 4 цитохрома P-450 в полиморфно-ядерных лейкоцитах человека. Клонирование кДНК и экспрессия лейкотриен B4 омега-гидроксилазы» . Журнал биологической химии . 268 (13): 9376–80. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98360-2 . ПМИД 8486631 .
^ Кикута Ю, Като М, Ямашита Ю, Мияучи Ю, Танака К, Камада Н, Кусуносе М (март 1998 г.). «Ген лейкотриеновой B4 омега-гидроксилазы человека (CYP4F3): молекулярное клонирование и хромосомная локализация». ДНК и клеточная биология . 17 (3): 221–30. дои : 10.1089/dna.1998.17.221 . ПМИД 9539102 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: цитохром P450 CYP4F3, семейство 4, подсемейство F, полипептид 3» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Коркос Л., Лукас Д., Ле Жосик-Коркос С., Дреано И., Симон Б., Пле-Готье Е. и др. (апрель 2012 г.). «Цитохром P450 4F3 человека: структура, функции и перспективы». Метаболизм лекарств и взаимодействие лекарств . 27 (2): 63–71. дои : 10.1515/dmdi-2011-0037 . ПМИД 22706230 . S2CID 5258044 .
^ Пауэлл В.С., Рокач Дж. (апрель 2015 г.). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 340–55. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.008 . ПМК 5710736 . ПМИД 25449650 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Джонсон А.Л., Эдсон К.З., Тота Р.А., Ретти А.Е. (2015). «Цитохром P450 ω-гидроксилазы при воспалении и раке». Функция цитохрома P450 и фармакологическая роль при воспалении и раке . Достижения фармакологии. Том. 74. стр. 223–62. дои : 10.1016/bs.apha.2015.05.002 . ISBN 9780128031193 . ПМЦ 4667791 . ПМИД 26233909 .
^ «1290617 рупий» . СНПедия .
^ «Отчет кластера эталонного SNP (refSNP): rs1290620» .
^ Керли CR, Монсуур AJ, Wapenaar MC, Rioux JD, Wijmenga C (ноябрь 2006 г.). «Функциональный кандидатный скрининг генов целиакии» . Европейский журнал генетики человека . 14 (11): 1215–22. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201687 . ПМИД 16835590 . S2CID 10054589 .
^ Костя И., Мак Д.Р., Леметр Р.Н., Исраэль Д., Марсил В., Ахмад А., Амре Д.К. (апрель 2014 г.). «Взаимодействие между соотношением полиненасыщенных жирных кислот в рационе и генетическими факторами определяет предрасположенность к болезни Крона у детей» . Гастроэнтерология . 146 (4): 929–31. дои : 10.1053/j.gastro.2013.12.034 . ПМИД 24406470 .
^ Кикута Ю., Кусуносе Э., Сумимото Х., Мизуками Ю., Такэсигэ К., Сакаки Т. и др. (июль 1998 г.). «Очистка и характеристика рекомбинантной омега-гидроксилазы нейтрофилов человека лейкотриен B4 (цитохром P450 4F3)». Архив биохимии и биофизики . 355 (2): 201–5. дои : 10.1006/abbi.1998.0724 . ПМИД 9675028 .
^ Хардвик JP (июнь 2008 г.). «Функция цитохрома P450 омега-гидроксилазы (CYP4) в метаболизме жирных кислот и метаболических заболеваниях». Биохимическая фармакология . 75 (12): 2263–75. дои : 10.1016/j.bcp.2008.03.004 . ПМИД 18433732 .
^ Чжу X, Ван Ю, Чжан Х, Лю Х, Чен Т, Ян Р и др. (2011). «Генетическая вариация гена человеческого гликопротеина α-2-Heremans-Schmid (AHSG), связанная с риском заражения SARS-CoV» . ПЛОС ОДИН . 6 (8): e23730. Бибкод : 2011PLoSO...623730Z . дои : 10.1371/journal.pone.0023730 . ПМК 3163911 . ПМИД 21904596 .

Дальнейшее чтение

Симпсон А.Е. (март 1997 г.). «Семейство цитохрома P450 4 (CYP4)». Общая фармакология . 28 (3): 351–9. дои : 10.1016/S0306-3623(96)00246-7 . ПМИД 9068972 .
Кикута Ю., Кусуносе Э., Кондо Т., Ямамото С., Киносита Х., Кусуносе М. (июль 1994 г.). «Клонирование и экспрессия новой формы лейкотриен B4 омега-гидроксилазы из печени человека» . Письма ФЭБС . 348 (1): 70–4. Бибкод : 1994FEBSL.348...70K . дои : 10.1016/0014-5793(94)00587-7 . ПМИД 8026587 . S2CID 83948293 .
Кристмас П., Урсино С.Р., Фокс Дж.В., Соберман Р.Дж. (июль 1999 г.). «Экспрессия гена CYP4F3. тканеспецифический сплайсинг и альтернативные промоторы генерируют формы лейкотриен B (4) омега-гидроксилазы с высоким и низким K (m)» . Журнал биологической химии . 274 (30): 21191–9. дои : 10.1074/jbc.274.30.21191 . ПМИД 10409674 . S2CID 307381 .
Кристмас П., Джонс Дж.П., Паттен С.Дж., Рок Д.А., Чжэн Ю., Ченг С.М. и др. (октябрь 2001 г.). «Альтернативный сплайсинг определяет функцию CYP4F3 путем переключения специфичности субстрата» . Журнал биологической химии . 276 (41): 38166–72. дои : 10.1074/jbc.M104818200 . ПМИД 11461919 .
Кристмас П., Карлессо Н., Шан Х., Ченг С.М., Вебер Б.М., Преффер Ф.И. и др. (июль 2003 г.). «Миелоидная экспрессия цитохрома P450 4F3 определяется специфичным для линии альтернативным промотором» . Журнал биологической химии . 278 (27): 25133–42. дои : 10.1074/jbc.M302106200 . ПМИД 12709424 . S2CID 31914930 .
Мизуками Ю, Сумимото Х, Такэсигэ К (январь 2004 г.). «Индукция цитохрома CYP4F3A в клетках HL60, обработанных полностью транс-ретиноевой кислотой». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 314 (1): 104–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.12.062 . ПМИД 14715252 .
Кристмас П., Толентино К., Примо В., Берри К.З., Мерфи Р.К., Чен М. и др. (март 2006 г.). «Цитохром P-450 4F18 представляет собой лейкотриен B4 омега-1/омега-2 гидроксилазу в полиморфно-ядерных лейкоцитах мыши: идентификация в качестве функционального ортолога полиморфно-ядерного лейкоцита человека CYP4F3A при подавлении ответов на LTB4» . Журнал биологической химии . 281 (11): 7189–96. дои : 10.1074/jbc.M513101200 . ПМИД 16380383 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000186529 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024055 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8486631-5] Кикута Ю, Кусуносе Э, Эндо К, Ямамото С, Согава К, Фуджи-Курияма Ю, Кусуносе М (май 1993 г.). «Новая форма семейства 4 цитохрома P-450 в полиморфно-ядерных лейкоцитах человека. Клонирование кДНК и экспрессия лейкотриен B4 омега-гидроксилазы» . Журнал биологической химии . 268 (13): 9376–80. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98360-2 . ПМИД 8486631 .

[pmid9539102-6] Кикута Ю, Като М, Ямашита Ю, Мияучи Ю, Танака К, Камада Н, Кусуносе М (март 1998 г.). «Ген лейкотриеновой B4 омега-гидроксилазы человека (CYP4F3): молекулярное клонирование и хромосомная локализация». ДНК и клеточная биология . 17 (3): 221–30. дои : 10.1089/dna.1998.17.221 . ПМИД 9539102 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: цитохром P450 CYP4F3, семейство 4, подсемейство F, полипептид 3» .

[Corcos_12012-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Коркос Л., Лукас Д., Ле Жосик-Коркос С., Дреано И., Симон Б., Пле-Готье Е. и др. (апрель 2012 г.). «Цитохром P450 4F3 человека: структура, функции и перспективы». Метаболизм лекарств и взаимодействие лекарств . 27 (2): 63–71. дои : 10.1515/dmdi-2011-0037 . ПМИД 22706230 . S2CID 5258044 .

[9] Пауэлл В.С., Рокач Дж. (апрель 2015 г.). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1851 (4): 340–55. дои : 10.1016/j.bbalip.2014.10.008 . ПМК 5710736 . ПМИД 25449650 .

[Johnson_2015-10] Jump up to: ^а ^б ^с Джонсон А.Л., Эдсон К.З., Тота Р.А., Ретти А.Е. (2015). «Цитохром P450 ω-гидроксилазы при воспалении и раке». Функция цитохрома P450 и фармакологическая роль при воспалении и раке . Достижения фармакологии. Том. 74. стр. 223–62. дои : 10.1016/bs.apha.2015.05.002 . ISBN 9780128031193 . ПМЦ 4667791 . ПМИД 26233909 .

[url_Rs1290617_-_SNPedia-11] «1290617 рупий» . СНПедия .

[url_Rs1290620-12] «Отчет кластера эталонного SNP (refSNP): rs1290620» .

[pmid16835590-13] Керли CR, Монсуур AJ, Wapenaar MC, Rioux JD, Wijmenga C (ноябрь 2006 г.). «Функциональный кандидатный скрининг генов целиакии» . Европейский журнал генетики человека . 14 (11): 1215–22. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201687 . ПМИД 16835590 . S2CID 10054589 .

[Costea_2014-14] Костя И., Мак Д.Р., Леметр Р.Н., Исраэль Д., Марсил В., Ахмад А., Амре Д.К. (апрель 2014 г.). «Взаимодействие между соотношением полиненасыщенных жирных кислот в рационе и генетическими факторами определяет предрасположенность к болезни Крона у детей» . Гастроэнтерология . 146 (4): 929–31. дои : 10.1053/j.gastro.2013.12.034 . ПМИД 24406470 .

[15] Кикута Ю., Кусуносе Э., Сумимото Х., Мизуками Ю., Такэсигэ К., Сакаки Т. и др. (июль 1998 г.). «Очистка и характеристика рекомбинантной омега-гидроксилазы нейтрофилов человека лейкотриен B4 (цитохром P450 4F3)». Архив биохимии и биофизики . 355 (2): 201–5. дои : 10.1006/abbi.1998.0724 . ПМИД 9675028 .

[pmid18433732-16] Хардвик JP (июнь 2008 г.). «Функция цитохрома P450 омега-гидроксилазы (CYP4) в метаболизме жирных кислот и метаболических заболеваниях». Биохимическая фармакология . 75 (12): 2263–75. дои : 10.1016/j.bcp.2008.03.004 . ПМИД 18433732 .

[17] Чжу X, Ван Ю, Чжан Х, Лю Х, Чен Т, Ян Р и др. (2011). «Генетическая вариация гена человеческого гликопротеина α-2-Heremans-Schmid (AHSG), связанная с риском заражения SARS-CoV» . ПЛОС ОДИН . 6 (8): e23730. Бибкод : 2011PLoSO...623730Z . дои : 10.1371/journal.pone.0023730 . ПМК 3163911 . ПМИД 21904596 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

v т и Цитохромы , оксигеназы : цитохром P450 (большинство принадлежит EC 1.14)
CYP1	A1 A2 A5 B1
CYP2	A6 A7 A13 B6 C8 C9 C18 C19 D6 E1 F1 J2 R1 S1 U1 W1
CYP3 (CYP3A)	A4 A5 A7 A37 A43
CYP4	A11 A22 B1 F2 F3 F8 F11 F12 F22 V2 X1 Z1
CYP5-20	CYP5 (A1) CYP6 (G1, M2) CYP7 (A1, B1) CYP8 (A1, B1) CYP9 CYP10 CYP11 (A1, A2, B1, B2, B3, C1) CYP12 CYP13 CYP14 CYP15 CYP16 CYP17 (A1) CYP18 CYP19 (A1) CYP20 (A1)
CYP21-49	CYP21 (A2) CYP22 (A1) CYP23 CYP24 (A1) CYP25 CYP26 (A1, B1, C1) CYP27 (A1, B1, C1) CYP28 (A1) CYP29 CYP35 (B1) CYP39 (A1) CYP46 (A1)
CYP51-69	CYP51 (A1, F1) CYP52 CYP53 A1 CYP55 A1 CYP56 A1 CYP61
CYP71-99	CYP71 (C1, C2, C3, C4, Z6, AJ4, AV1, BA1) CYP72A1 CYP73A1 CYP74 (D1) CYP75 (A1, B1) CYP76 (B6, M7) CYP79 (A1, A2, B1, B2, B3, D1, D2, D3, D4) CYP80 (A1, B1, G2) CYP81 (E1, E3, E7, E9) CYP88D6 CYP90C1 CYP93E1 CYP97C1 CYP99A3
CYP101-281	CYP101A1 CYP102A1 CYP105 A1 D7 CYP106A2 CYP107 A1 G1 CYP109 B1 E1 CYP111 CYP113A1 CYP119A1 CYP123 CYP125A1 CYP139 CYP147 CYP152 A1 B1 CYP154C3 CYP158A CYP161C CYP170 A1 B1 CYP176A1 CYP183A CYP197 CYP199A2 CYP255A
CYP301-499	CYP303A1 CYP305 M2 Halloween genes ( CYP302A1, CYP306A1, CYP307A1, CYP307A2, CYP314A1, CYP315A1) CYP318A1
CYP501-699	CYP503 CYP504B1
CYP701-999	CYP704B22 CYP710 CYP720A1