АДАМЦ1

АДАМЦ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2JIH, 2V4B, 3Q2G, 3Q2H
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAMTS1 , C3-C5, METH1, металлопептидаза ADAM с мотивом тромбоспондина 1 типа 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 605174 ; МГИ : 109249 ; Гомологен : 21381 ; GeneCards : ADAMTS1 ; ОМА : ADAMTS1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 21 (human)
End	26,845,409 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	85,600,001 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right ovary; ; left uterine tube; ; vena cava; ; left ovary; ; pericardium; ; gastric mucosa; ; decidua; ; tibial arteries; ; mucosa of urinary bladder; ; ascending aorta;
	Top expressed in
	iris; ; left lung lobe; ; efferent ductule; ; stroma of bone marrow; ; ciliary body; ; gastrula; ; ascending aorta; ; aortic valve; ; vas deferens; ; decidua;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	heparin binding; zinc ion binding; metal ion binding; peptidase activity; metalloendopeptidase activity; hydrolase activity; metallopeptidase activity;
Cellular component	extracellular region; basement membrane; cytoplasmic vesicle; extracellular matrix; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	ovulation from ovarian follicle; heart trabecula formation; kidney development; proteolysis; integrin-mediated signaling pathway; negative regulation of cell population proliferation; positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; positive regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9510
	11504
	ENSG00000154734
	ENSMUSG00000022893
	Q9UHI8
	P97857
	НМ_006988
	НМ_009621
	НП_008919
	НП_033751
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Дезинтегрин и металлопротеиназа с мотивами тромбоспондина 1 представляют собой фермент , который у человека кодируется ADAMTS1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков ADAMTS ( дезинтегрин и металлопротеиназа с мотивом тромбоспондина ). Члены семейства имеют несколько различных белковых модулей, включая пропептидную область, металлопротеиназный домен, дезинтегриноподобный домен и мотив тромбоспондина типа 1 (TS). Отдельные члены этого семейства различаются количеством С-концевых TS-мотивов, а некоторые имеют уникальные С-концевые домены. Белок, кодируемый этим геном, содержит две петли дезинтегрина и три С-концевых TS-мотива и обладает антиангиогенной активностью. Экспрессия этого гена может быть связана с различными воспалительными процессами, а также с развитием раковой кахексии . Этот ген, вероятно, необходим для нормального роста, фертильности, морфологии и функционирования органов. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ADAMTS1 взаимодействует с фактором роста эндотелия сосудов А. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154734 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022893 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Васкес Ф., Гастингс Г., Ортега М.А., Лейн Т.Ф., Ойкемус С., Ломбардо М., Ируэла-Ариспе М.Л. (сентябрь 1999 г.). «METH-1, человеческий ортолог ADAMTS-1, и METH-2 являются членами нового семейства белков с ангиоингибирующей активностью» . J Биол Хим . 274 (33): 23349–57. дои : 10.1074/jbc.274.33.23349 . ПМИД 10438512 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: металлопептидаза ADAMTS1 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 1» .
^ Люке А., Карписо Д.Р., Ируэла-Ариспе М.Л. (июнь 2003 г.). «ADAMTS1/METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165» . Ж. Биол. Хим . 278 (26): 23656–65. дои : 10.1074/jbc.M212964200 . ПМИД 12716911 .

Дальнейшее чтение

Тан Б.Л., Хонг В. (1999). «ADAMTS: новое семейство протеаз с протеазным доменом ADAM и повторами тромбоспондина 1» . ФЭБС Летт . 445 (2–3): 223–5. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00119-2 . ПМИД 10094461 . S2CID 37955930 .
Хирохата С (2002). «[Семейство ADAMTS — новый фермент, разрушающий внеклеточный матрикс]». Сэйкагаку . 73 (11): 1333–7. ПМИД 11831030 .
Куно К., Канада Н., Накашима Э. и др. (1997). «Молекулярное клонирование гена, кодирующего новый тип белка семейства металлопротеиназ-дезинтегрин с мотивами тромбоспондина в качестве гена, связанного с воспалением» . Ж. Биол. Хим . 272 (1): 556–62. дои : 10.1074/jbc.272.1.556 . ПМИД 8995297 .
Куно К., Мацусима К. (1998). «Белок ADAMTS-1 закрепляется во внеклеточном матриксе посредством мотивов тромбоспондина типа I и его пространственной области» . Ж. Биол. Хим . 273 (22): 13912–7. дои : 10.1074/jbc.273.22.13912 . ПМИД 9593739 .
Куно К., Терашима Ю., Мацусима К. (1999). «ADAMTS-1 представляет собой активную металлопротеиназу, связанную с внеклеточным матриксом» . Ж. Биол. Хим . 274 (26): 18821–6. дои : 10.1074/jbc.274.26.18821 . ПМИД 10373500 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И. и др. (2000). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 7 (1): 65–73. дои : 10.1093/dnares/7.1.65 . ПМИД 10718198 .
Глиенке Дж., Шмитт А.О., Пиларски С. и др. (2000). «Дифференциальная экспрессия генов эндотелиальными клетками в различных ангиогенных состояниях» . Евро. Дж. Биохим . 267 (9): 2820–30. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01325.x . ПМИД 10785405 .
Шиндо Т., Курихара Х., Куно К. и др. (2000). «ADAMTS-1: металлопротеиназа-дезинтегрин, необходимая для нормального роста, фертильности, морфологии и функции органов» . Дж. Клин. Инвестируйте . 105 (10): 1345–52. дои : 10.1172/JCI8635 . ПМК 315464 . ПМИД 10811842 .
Хаттори М., Фудзияма А., Тейлор Т.Д. и др. (2000). «Последовательность ДНК 21 хромосомы человека» . Природа . 405 (6784): 311–9. Бибкод : 2000Natur.405..311H . дои : 10.1038/35012518 . ПМИД 10830953 .
Куно К., Окада Ю., Кавасима Х. и др. (2000). «ADAMTS-1 расщепляет протеогликан хряща, аггрекан» . ФЭБС Летт . 478 (3): 241–5. дои : 10.1016/S0014-5793(00) 01854-8 ПМИД 10930576 . S2CID 32699689 .
Сэнди Дж.Д., Вестлинг Дж., Кенаги Р.Д. и др. (2001). «Протеолиз Versican V1 в аорте человека in vivo происходит по связи Glu441-Ala442, сайту, который расщепляется рекомбинантными ADAMTS-1 и ADAMTS-4» . Ж. Биол. Хим . 276 (16): 13372–8. дои : 10.1074/jbc.M009737200 . ПМИД 11278559 .
Вэй П., Чжао Ю.Г., Чжуан Л. и др. (2002). «Белковая инженерия и свойства металлопротеиназы человека и тромбоспондина 1». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 478–88. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00255-3 . ПМИД 12054626 .
Родригес-Мансанеке Х.К., Вестлинг Дж., Тай С.Н. и др. (2002). «ADAMTS1 расщепляет агрекан в нескольких местах и дифференциально ингибируется ингибиторами металлопротеиназ». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (1): 501–8. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00254-1 . ПМИД 12054629 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Люке А., Карписо Д.Р., Ируэла-Ариспе М.Л. (2003). «ADAMTS1/METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165» . Ж. Биол. Хим . 278 (26): 23656–65. дои : 10.1074/jbc.M212964200 . ПМИД 12716911 .
Рассел Д.Л., Дойл К.М., Окснер С.А. и др. (2004). «Обработка и локализация ADAMTS-1 и протеолитическое расщепление версикана во время расширения кумулюсного матрикса и овуляции» . Ж. Биол. Хим . 278 (43): 42330–9. дои : 10.1074/jbc.M300519200 . ПМИД 12907688 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: M12.222
ADAMTS1 в Атласе генетики и онкологии
человека Местоположение генома ADAMTS1 и страница сведений о гене ADAMTS1 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9UHI8 (дезинтегрин и металлопротеиназа с мотивами тромбоспондина 1) в PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 21 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000154734 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022893 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10438512-5] Васкес Ф., Гастингс Г., Ортега М.А., Лейн Т.Ф., Ойкемус С., Ломбардо М., Ируэла-Ариспе М.Л. (сентябрь 1999 г.). «METH-1, человеческий ортолог ADAMTS-1, и METH-2 являются членами нового семейства белков с ангиоингибирующей активностью» . J Биол Хим . 274 (33): 23349–57. дои : 10.1074/jbc.274.33.23349 . ПМИД 10438512 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: металлопептидаза ADAMTS1 ADAM с мотивом тромбоспондина типа 1, 1» .

[pmid12716911-7] Люке А., Карписо Д.Р., Ируэла-Ариспе М.Л. (июнь 2003 г.). «ADAMTS1/METH1 ингибирует пролиферацию эндотелиальных клеток путем прямого связывания и секвестрации VEGF165» . Ж. Биол. Хим . 278 (26): 23656–65. дои : 10.1074/jbc.M212964200 . ПМИД 12716911 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

v т и Протеазы : металлоэндопептидазы ( EC 3.4.24 )
ADAM proteins	Alpha secretases ADAM9 ADAM10 ADAM17 ADAM19 ADAM2 ADAM7 ADAM8 ADAM11 ADAM12 ADAM15 ADAM18 ADAM22 ADAM23 ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 ADAMTS8 ADAMTS9 ADAMTS10 ADAMTS12 ADAMTS13
Matrix metalloproteinases	Collagenases MMP1 MMP8 Gelatinases MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28
Other	Neprilysin Procollagen peptidase Thermolysin Pregnancy-associated plasma protein A Bone morphogenetic protein 1 Lysostaphin Insulin-degrading enzyme ZMPSTE24