Ингибитор диссоциатора гуанозина нуклеотида
| Ингибитор диссоциации ВВП | |||
|---|---|---|---|
 Структура двойного пренилированного YPT1: GDI комплекс | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | GDI | ||
| Pfam | PF00996 | ||
| PFAM клан | CL0063 | ||
| InterPro | IPR018203 | ||
| Краткое содержание | 1gnd / scope / supfam | ||
| |||
В молекулярной биологии ингибиторы диссоциации гуанозина ( GDI S) составляют семейство небольших GTPases , которые выполняют регуляторную роль в пузикулярном трафике мембраны. GDIS связывается с границей GDP-связанной формы Rho и Rab небольших GTPases и не только предотвращают обмен (поддержание небольшой GTPase в вне государства), но также предотвращают локализацию небольшой GTPase на мембране, которая является их местом действия. Это ингибирование может быть удалено за счет действия коэффициента смещения GDI. [ 1 ] GDIS также ингибирует CDC42 , связываясь с его хвостом и предотвращая его вставку в мембраны; Следовательно, он не может инициировать осы и не может привести к зарождению f- актина .
GDIS С-концевое геранилгеранилирование имеет решающее значение для их мембранной ассоциации и функции. [ 2 ] [ 3 ] Эта посттрансляционная модификация катализируется раб-геранилгеранилтрансферазой (Rab-Ggtase), мультисубъединичным ферментом , который содержит каталитический гетеродимер и вспомогательный компонент, называемый белком Rab-эскортом (Rep) -1. [ 2 ] Rep-1 представляет вновь синтезированные белки Rab в каталитический компонент и образует стабильный комплекс с пренилированными белками после реакции переноса. Механизм реп-1-опосредованной мембранной ассоциации Rab5 аналогичен тем, что он опосредован ингибитором диссоциации диссоциации GRAB (GDI). Rep-1 и Rab GDI также имеют другие функциональные свойства, в том числе способность ингибировать высвобождение ВВП и удалять белки Rab из мембран.
Кристаллическая структура бычьей изоформы альфа- Rab GDI была определена в разрешении 1,81 Ангстрем . [ 4 ] Белок состоит из двух основных структурных единиц: большого сложного многостороннего домена I и меньшего альфа-спирального домена II.
Структурная организация домена I тесно связана с увлеченными монооксигеназами и оксидазами . [ 4 ] GDI и гена choroideraemia Консервативные регионы, общие для продукта гена , который обеспечивает Rab в каталитические субъединицы раб геранилгеранилтрансферазы II, кластерируются на одной поверхности домена. [ 3 ] Две наиболее консервативные области образуют компактную структуру на вершине молекулы; Участок, направленный на сайт мутагенез, показал, что эти области играют критическую роль в связывании белков Rab. [ 4 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Dirac-Svejstrup AB, Sumizawa T, Pfeffer SR (февраль 1997 г.). «Идентификация коэффициента смещения GDI, который высвобождает эндосомальные Rab GTPases из Rab-GDI» . Embo Journal . 16 (3): 465–72. doi : 10.1093/emboj/16.3.465 . PMC 1169650 . PMID 9034329 .
- ^ Jump up to: а беременный Александров К., Хориучи Х., Стил-Мортимер О., Сибра М.К., Зериал М (ноябрь 1994 г.). «RAB Escort Protein-1-это многофункциональный белок, который сопровождает вновь пренилированные белки Rab в их целевые мембраны» . Embo j . 13 (22): 5262–73. doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06860.x . PMC 395482 . PMID 7957092 .
- ^ Jump up to: а беременный Nishimura N, Goji J, Nakamura H, Oriata S, Takai Y, Sano K (ноябрь 1995 г.). «Клонирование изоформы типа мозга человеческого Rab GDI и его экспрессия в клеточных линиях нейробластомы человека и образцах опухолей». Рак . 55 (22): 5445–50. PMID 7585614 .
- ^ Jump up to: а беременный в Schalk I, Zeng K, Wu SK, Stura EA, Matteson J, Huang M, Tandon A, Wilson IA, Balch WE (май 1996). «Структура и мутационный анализ ингибитора диссоциации RAB GDP». Природа . 381 (6577): 42–8. Bibcode : 1996natur.381 ... 42S . doi : 10.1038/381042A0 . PMID 8609986 . S2CID 4249512 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Гуаниновые+нуклеотид+диссоциация+ингибиторы в Национальной библиотеке Медицинской библиотеки США медицинские заголовки (Mesh)