WWP2

WWP2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	4Y07
Идентификаторы
Псевдонимы	WWP2 , AIP2, WWp2-подобный домен WW, содержащий убиквитинпротеинлигазу 2 E3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602308 ; МГИ : 1914144 ; Гомологен : 48490 ; GeneCards : WWP2 ; ОМА : WWP2 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	69,941,741 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	108,285,227 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tibia; ; tendon of biceps brachii; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; sural nerve; ; right coronary artery; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; pancreatic ductal cell; ; endothelial cell;
	Top expressed in
	facial skeleton; ; sphenoid bone; ; basisphenoid; ; splanchnocranium; ; thumb; ; membranous bone; ; index finger; ; phalanx of index finger; ; tunica media of zone of aorta; ; bones of pectoral girdle;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	transcription factor binding; ubiquitin-protein transferase activity; protein binding; transferase activity; ubiquitin protein ligase activity;
Cellular component	membrane; ubiquitin ligase complex; extracellular exosome; nucleus; cytoplasm; cytosol;
Biological process	regulation of membrane potential; regulation of ion transmembrane transport; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; negative regulation of DNA-binding transcription factor activity; negative regulation of gene expression; negative regulation of protein transport; regulation of potassium ion transmembrane transporter activity; viral entry into host cell; viral process; negative regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of transporter activity; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein autoubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; protein K63-linked ubiquitination; extracellular transport; protein ubiquitination; protein polyubiquitination; positive regulation of protein catabolic process; negative regulation of Notch signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	11060
	66894
	ENSG00000198373
	ENSMUSG00000031930
	О00308
	Q9DBH0
	НМ_001270453 ; НМ_001270454 ; НМ_001270455 ; НМ_007014 ; НМ_199424
	НМ_025830
	НП_001257382 ; НП_001257383 ; НП_001257384 ; НП_008945 ; НП_955456
	НП_080106
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

NEDD4-подобная E3 убиквитин-белковая лигаза WWP2, также известная как белок 2, взаимодействующий с атрофином-1 (AIP2) или белок 2, содержащий домен WW (WWP2), представляет собой фермент , который у людей кодируется WWP2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует члена семейства белков, подобных NEDD4. Известно, что семейство белков обладает активностью убиквитин-протеинлигазы . Кодируемый белок содержит 4 тандемных WW-домена . Домен WW представляет собой белковый мотив, состоящий из 35–40 аминокислот и характеризующийся 4 консервативными ароматическими остатками. Домен WW может опосредовать специфические белок-белковые взаимодействия. Для этого гена были обнаружены три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]} В нейронах мышиный ортолог Wwp2 и его гомолог Wwp1 контролируют приобретение полярности, формирование и ветвление аксонов, а также миграцию новорожденных нервных клеток в кортикальную пластинку. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что WWP2 взаимодействует с SCNN1B. ^{[ 6 ]}^{[ 9 ]} и АТН1 . ^{[ 10 ]}

Клиническое значение

Полноразмерный WWP2 (WWP2-FL) вместе с N-концевым (WWP2-N); С-концевые изоформы (WWP2-C) связываются с белками SMAD . WWP2-FL взаимодействует с SMAD2 , SMAD3 и SMAD7 на пути TGF-β . Изоформа WWP2-N взаимодействует с SMAD2 и SMAD3, тогда как WWP2-C взаимодействует только с SMAD7. Нарушение взаимодействий между WWP2 и SMAD7 может стабилизировать уровни белка SMAD7 и предотвратить эпителиально-мезенхимальный переход , индуцированный TGF-β . Следовательно, ингибирование WWP2 может, в свою очередь, привести к отключению ингибитора, который обычно контролирует рост клеток и онкогенез . В тканевых культурах, лишенных ингибитора SMAD7 , раковые клетки быстро распространялись, поэтому подавление WWP2 предотвращало распространение. ^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198373 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031930 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пироцци Дж., МакКоннелл С.Дж., Увегес А.Дж., Картер Дж.М., Спаркс А.Б., Кей Б.К., Фаулкс Д.М. (июнь 1997 г.). «Идентификация новых белков, содержащих домен WW человека, путем клонирования мишеней-лигандов» . J Биол Хим . 272 (23): 14611–6. дои : 10.1074/jbc.272.23.14611 . ПМИД 9169421 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Макдональд Ф.Дж., Вестерн А.Х., МакНил Дж.Д., Томас Б.К., Олсон Д.Р., Снайдер П.М. (август 2002 г.). «Убиквитин-белковая лигаза WWP2 связывается с эпителиальным каналом Na (+) и подавляет его». Am J Physiol Почечная физиол . 283 (3): F431–6. дои : 10.1152/ajprenal.00080.2002 . ПМИД 12167593 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: WWP2 WW-домен, содержащий убиквитинпротеинлигазу 2 E3» .
^ Амброцкевич MC, Шварк М, Кисимото-Суга М, Борисова Е, Хори К, Салазар-Лазаро А, Русанова А, Альтас Б, Пипкорн Л, Бесса П, Шауб Т, Чжан Х, Рабе Т, Рипамонти С, Росарио М, Акияма Х, Ян О, Кобаяши Т, Хосино М, Тарабыкин В, Кавабе Ч (декабрь 2018 г.). «Приобретение полярности в кортикальных нейронах обусловлено синергическим действием Sox9-регулируемых Wwp1 и Wwp2 E3 убиквитин-лигаз и интронной миР-140» . Нейрон . 100 (5): 1097–1115.e15. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.008 . ПМИД 30392800 .
^ Харви К.Ф., Динудом А., Кук Д.И., Кумар С. (март 2001 г.). «Nedd4-подобный белок KIAA0439 является потенциальным регулятором эпителиального натриевого канала» . Ж. Биол. Хим . 276 (11): 8597–601. дои : 10.1074/jbc.C000906200 . ПМИД 11244092 .
^ Вуд Дж., Юань Дж., Марголис Р.Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерляйн Дж.Дж., Шарп А.Х., Росс К.А. (июнь 1998 г.). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW» . Мол. Клетка. Нейроски . 11 (3): 149–60. дои : 10.1006/mcne.1998.0677 . ПМИД 9647693 . S2CID 20003277 .
^
Вскоре С.М., Церковь А (2011). «Избирательное нацеливание на активирующие и ингибирующие Smads с помощью различных изоформ убиквитинлигазы WWP2 дифференциально модулирует передачу сигналов TGFβ и ЕМТ» . Онкоген . 30 (21): 2451–62. дои : 10.1038/onc.2010.617 . ПМЦ 4073228 . ПМИД 21258410 .
- Разместить резюме в: Галлахер Дж. (24 января 2011 г.). «Блокировка гена останавливает распространение раковых клеток» . Новости Би-би-си .

Дальнейшее чтение

Йонссон А.Б. (1998). «Идентификация клона кДНК человека, который опосредует прикрепление патогенных Neisseria к несвязывающим клеткам» . ФЭМС Микробиол. Летт . 162 (1): 25–30. дои : 10.1111/j.1574-6968.1998.tb12974.x . ПМИД 9595660 .
Вуд Дж., Юань Дж., Марголис Р.Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерляйн Дж.Дж., Шарп А.Х., Росс К.А. (1998). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW» . Мол. Клетка. Нейроски . 11 (3): 149–60. дои : 10.1006/mcne.1998.0677 . ПМИД 9647693 . S2CID 20003277 .
Винберг Г., Мацкова Л., Чен Ф., Плант П., Ротин Д., Гиш Г., Ингхэм Р., Эрнберг И., Поусон Т. (2000). «Латентный мембранный белок 2А вируса Эпштейна-Барра связывает белок-убиквитинлигазы домена WW E3, которые убиквитинируют тирозинкиназы B-клеток» . Мол. Клетка. Биол . 20 (22): 8526–35. дои : 10.1128/MCB.20.22.8526-8535.2000 . ПМЦ 102158 . ПМИД 11046148 .
Харви К.Ф., Ширвин-Уятт Л.М., Фотия А., Партон Р.Г., Кумар С. (2002). «N4WBP5, потенциальная мишень для убиквитинирования белков семейства Nedd4, представляет собой новый белок, ассоциированный с аппаратом Гольджи» (PDF) . Ж. Биол. Хим . 277 (11): 9307–17. дои : 10.1074/jbc.M110443200 . ПМИД 11748237 . S2CID 37817970 .
Галинье Р., Гут Э., Лортат-Джейкоб Х., Вуд Дж., Хробочек Дж. (2003). «Белок аденовируса, участвующий в интернализации вируса, рекрутирует убиквитин-белковые лигазы». Биохимия . 41 (48): 14299–305. дои : 10.1021/bi020125b . ПМИД 12450395 .
Колланд Ф., Жак Икс, Труплен В., Мужен С., Гроазело С., Гамбургер А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Ж.М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геном Рез . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .
Ширвин-Уятт Л.М., Браун Д.Л., Уайли Ф.Г., Стоу Дж.Л., Кумар С. (2005). «N4WBP5A (Ndfip2), белок, взаимодействующий с Nedd4, локализуется в мультивезикулярных тельцах и аппарате Гольджи и играет потенциальную роль в транспортировке белков» . Дж. Клеточная наука . 117 (Часть 16): 3679–89. дои : 10.1242/jcs.01212 . hdl : 2440/9578 . ПМИД 15252135 .
Ружье Дж.С., ван Беммелен М.Х., Брюс М.К., Йесперсен Т., Гавилле Б., Апотелоз Ф., Кордонье С., Стауб О., Ротин Д., Абриэль Х. (2005). «Молекулярные детерминанты потенциалзависимой регуляции натриевых каналов с помощью Nedd4/Nedd4-подобных белков». Являюсь. J. Physiol., Cell Physiol . 288 (3): C692–701. doi : 10.1152/ajpcell.00460.2004 . ПМИД 15548568 . S2CID 5342436 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( 2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Нат. Биотехнология . 24 (10): 1285–92. дои : 10.1038/nbt1240 . ПМИД 16964243 . S2CID 14294292 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000198373 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031930 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9169421-5] Пироцци Дж., МакКоннелл С.Дж., Увегес А.Дж., Картер Дж.М., Спаркс А.Б., Кей Б.К., Фаулкс Д.М. (июнь 1997 г.). «Идентификация новых белков, содержащих домен WW человека, путем клонирования мишеней-лигандов» . J Биол Хим . 272 (23): 14611–6. дои : 10.1074/jbc.272.23.14611 . ПМИД 9169421 .

[pmid12167593-6] Перейти обратно: ^а ^б Макдональд Ф.Дж., Вестерн А.Х., МакНил Дж.Д., Томас Б.К., Олсон Д.Р., Снайдер П.М. (август 2002 г.). «Убиквитин-белковая лигаза WWP2 связывается с эпителиальным каналом Na (+) и подавляет его». Am J Physiol Почечная физиол . 283 (3): F431–6. дои : 10.1152/ajprenal.00080.2002 . ПМИД 12167593 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Entrez: WWP2 WW-домен, содержащий убиквитинпротеинлигазу 2 E3» .

[8] Амброцкевич MC, Шварк М, Кисимото-Суга М, Борисова Е, Хори К, Салазар-Лазаро А, Русанова А, Альтас Б, Пипкорн Л, Бесса П, Шауб Т, Чжан Х, Рабе Т, Рипамонти С, Росарио М, Акияма Х, Ян О, Кобаяши Т, Хосино М, Тарабыкин В, Кавабе Ч (декабрь 2018 г.). «Приобретение полярности в кортикальных нейронах обусловлено синергическим действием Sox9-регулируемых Wwp1 и Wwp2 E3 убиквитин-лигаз и интронной миР-140» . Нейрон . 100 (5): 1097–1115.e15. дои : 10.1016/j.neuron.2018.10.008 . ПМИД 30392800 .

[pmid11244092-9] Харви К.Ф., Динудом А., Кук Д.И., Кумар С. (март 2001 г.). «Nedd4-подобный белок KIAA0439 является потенциальным регулятором эпителиального натриевого канала» . Ж. Биол. Хим . 276 (11): 8597–601. дои : 10.1074/jbc.C000906200 . ПМИД 11244092 .

[pmid9647693-10] Вуд Дж., Юань Дж., Марголис Р.Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерляйн Дж.Дж., Шарп А.Х., Росс К.А. (июнь 1998 г.). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW» . Мол. Клетка. Нейроски . 11 (3): 149–60. дои : 10.1006/mcne.1998.0677 . ПМИД 9647693 . S2CID 20003277 .

[Soond_2011-11] Вскоре С.М., Церковь А (2011). «Избирательное нацеливание на активирующие и ингибирующие Smads с помощью различных изоформ убиквитинлигазы WWP2 дифференциально модулирует передачу сигналов TGFβ и ЕМТ» . Онкоген . 30 (21): 2451–62. дои : 10.1038/onc.2010.617 . ПМЦ 4073228 . ПМИД 21258410 .
Разместить резюме в: Галлахер Дж. (24 января 2011 г.). «Блокировка гена останавливает распространение раковых клеток» . Новости Би-би-си .

[12] Разместить резюме в: Галлахер Дж. (24 января 2011 г.). «Блокировка гена останавливает распространение раковых клеток» . Новости Би-би-си .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Ферменты : CO CS и CN лигазы ( EC 6.1-6.3).
6.1: Carbon-Oxygen	Aminoacyl tRNA synthetase Alanine Arginine Asparagine Aspartate Cysteine D-alanine—poly(phosphoribitol) ligase Glutamate Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine
6.2: Carbon-Sulfur	Succinyl coenzyme A synthetase Acetyl—CoA synthetase Long-chain-fatty-acid—CoA ligase
6.3: Carbon-Nitrogen	Glutamine synthetase Ubiquitin ligase Cullin Von Hippel–Lindau tumor suppressor UBE3A Mdm2 Anaphase-promoting complex UBR1 Glutathione synthetase CTP synthetase Adenylosuccinate synthase Argininosuccinate synthase Holocarboxylase synthetase GMP synthase Asparagine synthetase Carbamoyl phosphate synthetase I II Glutamate–cysteine ligase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)