Домен GGDEF
| Домен GGDEF | |||
|---|---|---|---|
 регулятор ответа PleD в комплексе с c-diGMP | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ГГДЕФ | ||
| Пфам | PF00990 | ||
| Пфам Клан | CL0276 | ||
| ИнтерПро | IPR000160 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1w25 / СКОПе / СУПФАМ | ||
| CDD | cd01949 | ||
| |||
В молекулярной биологии домен GGDEF представляет собой белковый домен , который, по-видимому, повсеместно встречается у бактерий и часто связан с регуляторным доменом, таким как приемник фосфорилирования или домен, чувствительный к кислороду . Его функция заключается в том, чтобы действовать как дигуанилатциклаза и синтезировать циклический ди-ГМФ , который используется в качестве внутриклеточной сигнальной молекулы у широкого спектра бактерий . [ 1 ] [ 2 ] На ферментативную активность могут сильно влиять соседние домены . Процессы, регулируемые этим доменом, включают синтез экзополисахаридов , образование биопленок , подвижность и дифференцировку клеток .
Структурные исследования PleD Caulobacter crescentus показывают, что этот домен образует пятицепочечный бета-лист, окруженный спиралями , подобный каталитическому ядру аденилатциклазы . [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Пол Р., Вайзер С., Амиот Н.К., Чан С., Ширмер Т., Гизе Б., Дженал У. (март 2004 г.). «Зависимая от клеточного цикла динамическая локализация регулятора бактериального ответа с новым выходным доменом дигуанилатциклазы» . Генс Дев . 18 (6): 715–27. дои : 10.1101/gad.289504 . ПМЦ 387245 . ПМИД 15075296 .
- ^ Рыженков Д.А., Тарутина М., Москвин О.В., Гомельский М. (март 2005 г.). «Циклический дигуанилат — это повсеместная сигнальная молекула у бактерий: понимание биохимии белкового домена GGDEF» . Дж. Бактериол . 187 (5): 1792–8. дои : 10.1128/JB.187.5.1792-1798.2005 . ПМК 1064016 . ПМИД 15716451 .
- ^ Чан С., Пол Р., Саморай Д., Амиот Н.К., Гизе Б., Дженал У., Ширмер Т. (декабрь 2004 г.). «Структурные основы активности и аллостерический контроль дигуанилатциклазы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (49): 17084–9. Бибкод : 2004PNAS..10117084C . дои : 10.1073/pnas.0406134101 . ПМК 535365 . ПМИД 15569936 .