Jump to content

Семейство гликозидгидролаз 19

Семейство гликозилгидролаз 19
уточненная кристаллическая структура эндохитиназы из hordeum vulgare l. семена с разрешением 1,8 ангстрем
Идентификаторы
Символ Глико_гидро_19
Пфам PF00182
Пфам Клан CL0037
ИнтерПро IPR000726
PROSITE PDOC00620
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 2баа / СКОПе / СУПФАМ
CAZy GH19
CDD cd00325
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

В молекулярной биологии гликозидгидролаз 19 представляет собой семейство гликозидгидролаз EC семейство 3.2.1. , которые представляют собой широко распространенную группу ферментов, гидролизующих гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неуглеводной частью. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению более 100 различных семейств. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Эта классификация доступна на веб-сайте CAZy . [ 4 ] [ 5 ] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии ферментов, активных в отношении углеводов. [ 6 ] [ 7 ] и[ _]9

Семейство гликозидгидролаз 19 CAZY GH_19 включает ферменты только с одной известной активностью; хитиназа ( EC 3.2.1.14 ).

Хитиназы [ 8 ] представляют собой ферменты, катализирующие гидролиз бета-1,4-N-ацетил-D-глюкозамина в полимерах хитина. Хитиназы принадлежат к семействам гликозидгидролаз 18 или 19. [ 9 ] Хитиназы семейства 19 (также известные как классы IA или I и IB или II) представляют собой ферменты растений, которые действуют в защиту от грибков и насекомых патогенов , разрушая их хитинсодержащие клеточные стенки . Ферменты классов IA/I и IB/II различаются наличием (IA/I) или отсутствием (IB/II) N-концевого хитинсвязывающего домена. Каталитический домен этих ферментов состоит примерно из 220–230 аминокислотных остатков.

Активный сайт

[ редактировать ]
Активный сайт хитиназы папайи семейства гликозидгидролаз 19 ( PDB : 3cql ) . [ 10 ] Консервативные остатки показаны вокруг каталитической кислоты Glu67. Связывание единицы GlcNAc2 в субсайтах -1 и +1 показано в виде узкой палочки, а стрелка указывает положение гликозидного кислорода.

Ферменты GH19 имеют мотив консервативной последовательности ([FHY]-GRG-[AP]-ζ-Q-[IL]-[ST]-[FHYW]-[HN]-[FY]-[NY], ζ = гидрофильная аминогруппа. кислота) в его активном центре. [ 11 ]

  1. ^ Хенриссат Б., Каллебо И., Фабрега С., Лен П., Морнон Дж. П., Дэвис Дж. (июль 1995 г.). «Консервативный каталитический механизм и предсказание общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (15): 7090–4. Бибкод : 1995PNAS...92.7090H . дои : 10.1073/pnas.92.15.7090 . ПМК   41477 . ПМИД   7624375 .
  2. ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы действия гликозилгидролаз» . Структура . 3 (9): 853–9. дои : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . ПМИД   8535779 .
  3. ^ Хенриссат Б, Байрох А (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей» . Биохимический журнал . 316 (Часть 2) (Часть 2): 695–6. дои : 10.1042/bj3160695 . ПМК   1217404 . ПМИД   8687420 .
  4. ^ "Дом" . CAZy.org . Проверено 06 марта 2018 г.
  5. ^ Ломбард В., Голаконда Рамулу Х., Друла Э., Коутиньо П.М., Хенриссат Б. (январь 2014 г.). «База данных углеводно-активных ферментов (CAZy) в 2013 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных): D490-5. дои : 10.1093/nar/gkt1178 . ПМЦ   3965031 . ПМИД   24270786 .
  6. ^ «Семейство гликозидгидролаз 19» . CAZypedia.org . Проверено 06 марта 2018 г.
  7. ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводоактивных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. дои : 10.1093/гликоб/cwx089 . ПМИД   29040563 .
  8. ^ Флах Дж., Пиле П.Е., Жоллес П. (август 1992 г.). «Что нового в исследованиях хитиназы?». Эксперименты . 48 (8): 701–16. дои : 10.1007/BF02124285 . ПМИД   1516675 . S2CID   37362071 .
  9. ^ Хенриссат Б (декабрь 1991 г.). «Классификация гликозилгидролаз, основанная на сходстве аминокислотных последовательностей» . Биохимический журнал . 280 (Часть 2) (2): 309–16. дои : 10.1042/bj2800309 . ПМЦ   1130547 . ПМИД   1747104 .
  10. ^ Эййсинк В., Хоэлл И., Ваае-Колстада Г. (1 января 2010 г.). «Строение и функции ферментов, действующих на хитин и хитозан» . Обзоры биотехнологий и генной инженерии . 27 (1): 331–66. дои : 10.1080/02648725.2010.10648156 . ПМИД   21415904 .
  11. ^ Удая Пракаш Н.А., Джаянти М., Сабаринатан Р., Кангеан П., Мэтью Л., Секар К. (май 2010 г.). «Эволюция, сохранение гомологии и идентификация уникальных сигнатур последовательностей хитиназ семейства GH19». Журнал молекулярной эволюции . 70 (5): 466–78. Бибкод : 2010JMolE..70..466U . дои : 10.1007/s00239-010-9345-z . ПМИД   20480157 . S2CID   2202745 .
В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000726.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: d7e3c38a3cd31436fa19d6de3b4d9c9c__1698741960
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/d7/9c/d7e3c38a3cd31436fa19d6de3b4d9c9c.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Glycoside hydrolase family 19 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)