Семейство гликозидгидролаз 19
| Семейство гликозилгидролаз 19 | |||
|---|---|---|---|
 уточненная кристаллическая структура эндохитиназы из hordeum vulgare l. семена с разрешением 1,8 ангстрем | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Глико_гидро_19 | ||
| Пфам | PF00182 | ||
| Пфам Клан | CL0037 | ||
| ИнтерПро | IPR000726 | ||
| PROSITE | PDOC00620 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 2баа / СКОПе / СУПФАМ | ||
| CAZy | GH19 | ||
| CDD | cd00325 | ||
| |||
В молекулярной биологии гликозидгидролаз 19 представляет собой семейство гликозидгидролаз EC семейство 3.2.1. , которые представляют собой широко распространенную группу ферментов, гидролизующих гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неуглеводной частью. Система классификации гликозидгидролаз, основанная на сходстве последовательностей, привела к определению более 100 различных семейств. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Эта классификация доступна на веб-сайте CAZy . [ 4 ] [ 5 ] а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии ферментов, активных в отношении углеводов. [ 6 ] [ 7 ] и[ _]9
Семейство гликозидгидролаз 19 CAZY GH_19 включает ферменты только с одной известной активностью; хитиназа ( EC 3.2.1.14 ).
Хитиназы [ 8 ] представляют собой ферменты, катализирующие гидролиз бета-1,4-N-ацетил-D-глюкозамина в полимерах хитина. Хитиназы принадлежат к семействам гликозидгидролаз 18 или 19. [ 9 ] Хитиназы семейства 19 (также известные как классы IA или I и IB или II) представляют собой ферменты растений, которые действуют в защиту от грибков и насекомых патогенов , разрушая их хитинсодержащие клеточные стенки . Ферменты классов IA/I и IB/II различаются наличием (IA/I) или отсутствием (IB/II) N-концевого хитинсвязывающего домена. Каталитический домен этих ферментов состоит примерно из 220–230 аминокислотных остатков.
Активный сайт
[ редактировать ]
Ферменты GH19 имеют мотив консервативной последовательности ([FHY]-GRG-[AP]-ζ-Q-[IL]-[ST]-[FHYW]-[HN]-[FY]-[NY], ζ = гидрофильная аминогруппа. кислота) в его активном центре. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Хенриссат Б., Каллебо И., Фабрега С., Лен П., Морнон Дж. П., Дэвис Дж. (июль 1995 г.). «Консервативный каталитический механизм и предсказание общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (15): 7090–4. Бибкод : 1995PNAS...92.7090H . дои : 10.1073/pnas.92.15.7090 . ПМК 41477 . ПМИД 7624375 .
- ^ Дэвис Дж., Хенриссат Б (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы действия гликозилгидролаз» . Структура . 3 (9): 853–9. дои : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . ПМИД 8535779 .
- ^ Хенриссат Б, Байрох А (июнь 1996 г.). «Обновление классификации гликозилгидролаз на основе последовательностей» . Биохимический журнал . 316 (Часть 2) (Часть 2): 695–6. дои : 10.1042/bj3160695 . ПМК 1217404 . ПМИД 8687420 .
- ^ "Дом" . CAZy.org . Проверено 06 марта 2018 г.
- ^ Ломбард В., Голаконда Рамулу Х., Друла Э., Коутиньо П.М., Хенриссат Б. (январь 2014 г.). «База данных углеводно-активных ферментов (CAZy) в 2013 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Проблема с базой данных): D490-5. дои : 10.1093/nar/gkt1178 . ПМЦ 3965031 . ПМИД 24270786 .
- ^ «Семейство гликозидгидролаз 19» . CAZypedia.org . Проверено 06 марта 2018 г.
- ^ Консорциум CAZypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводоактивных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. дои : 10.1093/гликоб/cwx089 . ПМИД 29040563 .
- ^ Флах Дж., Пиле П.Е., Жоллес П. (август 1992 г.). «Что нового в исследованиях хитиназы?». Эксперименты . 48 (8): 701–16. дои : 10.1007/BF02124285 . ПМИД 1516675 . S2CID 37362071 .
- ^ Хенриссат Б (декабрь 1991 г.). «Классификация гликозилгидролаз, основанная на сходстве аминокислотных последовательностей» . Биохимический журнал . 280 (Часть 2) (2): 309–16. дои : 10.1042/bj2800309 . ПМЦ 1130547 . ПМИД 1747104 .
- ^ Эййсинк В., Хоэлл И., Ваае-Колстада Г. (1 января 2010 г.). «Строение и функции ферментов, действующих на хитин и хитозан» . Обзоры биотехнологий и генной инженерии . 27 (1): 331–66. дои : 10.1080/02648725.2010.10648156 . ПМИД 21415904 .
- ^ Удая Пракаш Н.А., Джаянти М., Сабаринатан Р., Кангеан П., Мэтью Л., Секар К. (май 2010 г.). «Эволюция, сохранение гомологии и идентификация уникальных сигнатур последовательностей хитиназ семейства GH19». Журнал молекулярной эволюции . 70 (5): 466–78. Бибкод : 2010JMolE..70..466U . дои : 10.1007/s00239-010-9345-z . ПМИД 20480157 . S2CID 2202745 .
