ФКБП4

ФКБП4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1N1A, 1P5Q, 1Q1C, 1QZ2, 4DRJ, 4LAV, 4LAW, 4LAX, 4LAY, 4TW8
Идентификаторы
Псевдонимы	FKBP4 , FKBP51, FKBP52, FKBP59, HBI, Hsp56, PPIase, p52, FK506-связывающий белок 4, FKBP-пролилизомераза 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 600611 ; МГИ : 95543 ; Гомологен : 36085 ; Генные карты : FKBP4 ; ОМА : FKBP4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	2,805,423 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	128,415,640 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; ventricular zone; ; mucosa of transverse colon; ; islet of Langerhans; ; ganglionic eminence; ; right frontal lobe; ; body of pancreas; ; left testis; ; right testis; ; olfactory bulb;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; epiblast; ; otic vesicle; ; primitive streak; ; somite; ; mandibular prominence; ; maxillary prominence; ; embryo; ; spermatocyte; ; yolk sac;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein-macromolecule adaptor activity; heat shock protein binding; copper-dependent protein binding; FK506 binding; GTP binding; isomerase activity; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity; phosphoprotein binding; protein binding; glucocorticoid receptor binding; tau protein binding; ATP binding; RNA binding;
Cellular component	cell projection; axonal growth cone; nucleoplasm; axon; neuronal cell body; mitochondrion; perinuclear region of cytoplasm; neuron projection; microtubule; extracellular exosome; cytoskeleton; nucleus; cytoplasm; cytosol; protein-containing complex;
Biological process	androgen receptor signaling pathway; negative regulation of neuron projection development; negative regulation of microtubule polymerization; prostate gland development; protein peptidyl-prolyl isomerization; reproductive structure development; male sex differentiation; negative regulation of microtubule polymerization or depolymerization; regulation of cellular response to heat; protein-containing complex localization; copper ion transport; steroid hormone receptor complex assembly; embryo implantation; chaperone-mediated protein folding; protein folding;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2288
	14228
	ENSG00000004478
	ENSMUSG00000030357
	Q02790
	P30416
	НМ_002014
	НМ_010219
	НП_002005
	НП_034349
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

FK506-связывающий белок 4 представляет собой белок , который у человека кодируется FKBP4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков иммунофилинов , которые играют роль в иммунорегуляции и основных клеточных процессах, включающих сворачивание и транспортировку белка. Этот кодируемый белок представляет собой цис-транс -пролилизомеразу , которая связывается с иммунодепрессантами FK506 и рапамицином . Он имеет высокое структурное и функциональное сходство с FK506-связывающим белком 1А ( FKBP1A ), но в отличие от FKBP1A этот белок не обладает иммунодепрессивной активностью в комплексе с FK506. Он взаимодействует с регуляторным фактором интерферона-4 и играет важную роль в экспрессии иммунорегуляторных генов в В- и Т-лимфоцитах . Известно, что этот кодируемый белок связывается с альфа-гидроксилазой фитаноил-КоА . Он также может связываться с двумя белками теплового шока ( hsp90 и hsp70 ) и, таким образом, может играть роль во внутриклеточном переносе гетероолигомерных форм рецепторов стероидных гормонов . Этот белок тесно коррелирует с аденоассоциированного вируса типа 2 векторами (AAV), что приводит к значительному увеличению количества AAV-опосредованных вирусов. Экспрессия трансгена в клеточных линиях человека. Таким образом, считается, что этот кодируемый белок имеет важное значение для оптимального использования векторов AAV в генной терапии человека . ^{[ 6 ]}

Структура

Этот белок содержит повторы TPR и имеет домен PPlasa .

Клиническое значение

Недавние исследования показывают, что FKBP4 может играть роль в предотвращении белка Тау превращения в патогенный. Это может оказаться важным для разработки новых лекарств от болезни Альцгеймера и для обнаружения заболевания до появления клинических симптомов. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что FKBP4 взаимодействует с GLMN . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000004478 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000030357 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Питти Д.А., Хардинг М.В., Флеминг М.А., ДеЧензо М.Т., Липпке Дж.А., Ливингстон Д.Д., Бенасутти М. (ноябрь 1992 г.). «Экспрессия и характеристика человеческого FKBP52, иммунофилина, который связывается с белком теплового шока массой 90 кДа и является компонентом комплексов стероидных рецепторов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (22): 10974–8. Бибкод : 1992PNAS...8910974P . дои : 10.1073/pnas.89.22.10974 . ПМК 50465 . ПМИД 1279700 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: FKBP4, связывающий белок FK506 4, 59 кДа» .
^ Блэр Л.Дж., Бейкер Дж.Д., Саббаг Дж.Дж., Дикки Калифорния (апрель 2015 г.). «Новая роль шаперонов пептидил-пролилизомеразы в тау-олигомеризации, процессинге амилоида и болезни Альцгеймера» . Журнал нейрохимии . 133 (1): 1–13. дои : 10.1111/jnc.13033 . ПМЦ 4361273 . ПМИД 25628064 .
^ Шамбро Б., Раданьи С., Камонис Дж.Х., Шазанд К., Райковски К., Болье Э.Э. (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, образующий специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина» . Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. дои : 10.1074/jbc.271.51.32923 . ПМИД 8955134 .
^ Ней Х (март 2001 г.). «Мутация белка 48, связанного с FKBP (FAP48), по пролину 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. дои : 10.1016/S0167-0115(00)00206-8 . ПМИД 11164950 . S2CID 20617551 .
^ Пракаш, Аджит; Шин, Джун; Раджан, Шрикант; Юн, Хо Соп (7 апреля 2016 г.). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .

Дальнейшее чтение

Шине-Фишер С., Ю. С. (апрель 2001 г.). «Вспомогательные ферменты сворачивания рецепторов: функциональная роль пептидилпролил-цис/транс-изомераз» . Письма ФЭБС . 495 (1–2): 1–6. дои : 10.1016/S0014-5793(01)02326-2 . ПМИД 11322937 . S2CID 42263861 .
Йем А.В., Томасселли А.Г., Хейнриксон Р.Л., Цурчер-Нили Х., Рафф В.А., Джонсон Р.А., Дейбель М.Р. (февраль 1992 г.). «Компонент Hsp56 комплексов стероидных рецепторов связывается с иммобилизованным FK506 и проявляет гомологию с FKBP-12 и FKBP-13» . Журнал биологической химии . 267 (5): 2868–71. дои : 10.1016/S0021-9258(19)50664-0 . ПМИД 1371107 .
Тай П.К., Альберс М.В., Чанг Х., Фабер Л.Е., Шрайбер С.Л. (май 1992 г.). «Ассоциация иммунофилина массой 59 килодальтон с глюкокортикоидным рецепторным комплексом». Наука . 256 (5061): 1315–8. Бибкод : 1992Sci...256.1315T . дои : 10.1126/science.1376003 . ПМИД 1376003 .
Видеррехт Г., Хунг С., Чан Х.К., Марси А., Мартин М., Калайкей Дж., Бултон Д., Сигал Н., Кинкейд Р.Л., Сикерка Дж.Дж. (октябрь 1992 г.). «Охарактеризация активности связывания высокомолекулярного FK-506 выявила новый белок, связывающий FK-506, а также белковый комплекс» . Журнал биологической химии . 267 (30): 21753–60. дои : 10.1016/S0021-9258(19)36676-1 . ПМИД 1383226 .
Санчес Э.Р., Фабер Л.Е., Хензель В.Дж., Пратт В.Б. (май 1990 г.). «Белок массой 56–59 килодальтон, идентифицированный в нетрансформированных комплексах стероидных рецепторов, представляет собой уникальный белок, который существует в цитозоле в комплексе как с белками теплового шока массой 70, так и с 90 килодальтон». Биохимия . 29 (21): 5145–52. дои : 10.1021/bi00473a021 . ПМИД 2378870 .
Алнемри Э.С., Фернандес-Алнемри Т., Нелки Д.С., Дадли К., Дюбуа Г.К., Литвак Г. (июль 1993 г.). «Сверхэкспрессия, характеристика и очистка рекомбинантного мышиного иммунофилина FKBP-52 и идентификация связанного с ним фосфопротеина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (14): 6839–43. Бибкод : 1993PNAS...90.6839A . дои : 10.1073/pnas.90.14.6839 . ПМК 47028 . ПМИД 8341706 .
Шамбро Б., Раданьи С., Камонис Дж.Х., Шазанд К., Райковски К., Болье Э.Э. (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, образующий специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина» . Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. дои : 10.1074/jbc.271.51.32923 . ПМИД 8955134 .
Брунер К.Л., Дерфул А., Робертсон Н.М., Геррьеро Г., Фернандес-Альнемри Т., Алнемри Э.С., Литвак Г. (1998). «Несвязанный минералокортикоидный рецептор связан с белками теплового шока 70 и 90 и иммунофилином FKBP-52». Рецепторы и передача сигналов . 7 (2): 85–98. ПМИД 9392437 .
Мията Ю., Шамбро Б., Радани С., Леклерк Дж., Лебо М.С., Ренуар Ж.М., Шираи Р., Кателли М.Г., Яхара И., Болье Э.Э. (декабрь 1997 г.). «Фосфорилирование иммунодепрессантного FK506-связывающего белка FKBP52 казеинкиназой II: регуляция HSP90-связывающей активности FKBP52» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (26): 14500–5. Бибкод : 1997PNAS...9414500M . дои : 10.1073/pnas.94.26.14500 . ПМК 25035 . ПМИД 9405642 .
Бермингем Н.А., Рауф С., Кацанис Н., Мартин Дж.Э., Хантер А.Дж., Фишер Э.М. (март 1998 г.). «Имунофилин FKBP4 (FKBP52/FKBP59) картируется на дистальном коротком плече 12 хромосомы человека». Геном млекопитающих . 9 (3): 268. дои : 10.1007/s003359900746 . ПМИД 9501323 . S2CID 8388657 .
Шамбро Б., Раданьи С., Камонис Дж. Х., Райковски К., Шумахер М., Баули Э. Э. (март 1999 г.). «Иммунофилины, болезнь Рефсума и волчаночный нефрит: пероксисомальный фермент фитаноил-КоА-альфа-гидроксилаза представляет собой новый FKBP-ассоциированный белок» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (5): 2104–9. Бибкод : 1999PNAS...96.2104C . дои : 10.1073/pnas.96.5.2104 . ПМК 26744 . ПМИД 10051602 .
Мамане Ю., Шарма С., Петропулос Л., Лин Р., Хискотт Дж. (февраль 2000 г.). «Посттрансляционная регуляция активности IRF-4 иммунофилином FKBP52» . Иммунитет . 12 (2): 129–40. дои : 10.1016/S1074-7613(00)80166-1 . ПМИД 10714679 .
Ней Х (март 2001 г.). «Мутация белка 48, связанного с FKBP (FAP48), по пролину 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. дои : 10.1016/S0167-0115(00)00206-8 . ПМИД 11164950 . S2CID 20617551 .
Галиньиана, доктор медицинских наук, Радани С., Ренуар Дж. М., Хаусли П. Р., Пратт В. Б. (май 2001 г.). «Доказательства того, что пептидилпролилизомеразный домен hsp90-связывающего иммунофилина FKBP52 участвует как во взаимодействии динеина, так и в движении глюкокортикоидных рецепторов к ядру» . Журнал биологической химии . 276 (18): 14884–9. дои : 10.1074/jbc.M010809200 . ПМИД 11278753 .
Цин К., Хансен Дж., Вайгель-Келли К.А., Тан М., Чжоу С., Шривастава А. (октябрь 2001 г.). «Перенос генов, опосредованный аденоассоциированным вирусом 2 типа: роль клеточного белка FKBP52 в экспрессии трансгена» . Журнал вирусологии . 75 (19): 8968–76. doi : 10.1128/JVI.75.19.8968-8976.2001 . ПМК 114465 . ПМИД 11533160 .
Го Й., Геттуш Т., Фенна М., Бёлльманн Ф., Пратт В.Б., Тофт Д.О., Смит Д.Ф., Воеллми Р. (декабрь 2001 г.). «Доказательства механизма подавления транскрипционной активности фактора теплового шока 1 мультишаперонным комплексом» . Журнал биологической химии . 276 (49): 45791–9. дои : 10.1074/jbc.M105931200 . ПМИД 11583998 .
Дэвис Т.Х., Нин Ю.М., Санчес Э.Р. (февраль 2002 г.). «Новый первый шаг в активации стероидных рецепторов: гормонально-индуцированное переключение иммунофилинов FKBP51 и FKBP52» . Журнал биологической химии . 277 (7): 4597–600. дои : 10.1074/jbc.C100531200 . ПМИД 11751894 .

Внешние ссылки

FKBP52 в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000004478 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000030357 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1279700-5] Питти Д.А., Хардинг М.В., Флеминг М.А., ДеЧензо М.Т., Липпке Дж.А., Ливингстон Д.Д., Бенасутти М. (ноябрь 1992 г.). «Экспрессия и характеристика человеческого FKBP52, иммунофилина, который связывается с белком теплового шока массой 90 кДа и является компонентом комплексов стероидных рецепторов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (22): 10974–8. Бибкод : 1992PNAS...8910974P . дои : 10.1073/pnas.89.22.10974 . ПМК 50465 . ПМИД 1279700 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: FKBP4, связывающий белок FK506 4, 59 кДа» .

[pmid25628064-7] Блэр Л.Дж., Бейкер Дж.Д., Саббаг Дж.Дж., Дикки Калифорния (апрель 2015 г.). «Новая роль шаперонов пептидил-пролилизомеразы в тау-олигомеризации, процессинге амилоида и болезни Альцгеймера» . Журнал нейрохимии . 133 (1): 1–13. дои : 10.1111/jnc.13033 . ПМЦ 4361273 . ПМИД 25628064 .

[pmid8955134-8] Шамбро Б., Раданьи С., Камонис Дж.Х., Шазанд К., Райковски К., Болье Э.Э. (декабрь 1996 г.). «FAP48, новый белок, образующий специфические комплексы как с иммунофилинами FKBP59, так и с FKBP12. Профилактика с помощью иммунодепрессантов FK506 и рапамицина» . Журнал биологической химии . 271 (51): 32923–9. дои : 10.1074/jbc.271.51.32923 . ПМИД 8955134 .

[pmid11164950-9] Ней Х (март 2001 г.). «Мутация белка 48, связанного с FKBP (FAP48), по пролину 219 нарушает взаимодействие с FKBP12 и FKBP52». Регуляторные пептиды . 97 (2–3): 147–52. дои : 10.1016/S0167-0115(00)00206-8 . ПМИД 11164950 . S2CID 20617551 .

[10] Пракаш, Аджит; Шин, Джун; Раджан, Шрикант; Юн, Хо Соп (7 апреля 2016 г.). «Структурные основы распознавания нуклеиновых кислот FK506-связывающим белком 25 (FKBP25), ядерным иммунофилином» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. дои : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 4824100 . ПМИД 26762975 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )