Fyve Domain
| Fyve цинковый палец | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Fyve | ||
| Pfam | PF01363 | ||
| InterPro | IPR000306 | ||
| PROSITE | PDOC50178 | ||
| Краткое содержание | 1vfy / scope / supfam | ||
| OPM Суперсемейство | 59 | ||
| OPM белок | 1vfy | ||
| CDD | CD00065 | ||
| |||
В молекулярной биологии домен цинкового пальца в честь четырех цистеином богатых белков, : f ab 1 (дрожжевой ортолог pikfyve ), y otb, v ac 1 (белок транспорта пузырьков) и E ea1 , в котором он был обнаружен Полем Домены fyve связывают фосфатидилинозитол 3-фосфат , [ 2 ] в некотором смысле зависит от координации ионов металлов и основных аминокислот. Файв домен вводит в клеточные мембраны в зависимости от рН. [ 3 ] Домен Fyve был связан с сортировкой вакуолярного белка и функцией эндосомы . [ 4 ]
Структура
[ редактировать ]Домен FYVE состоит из двух небольших бета -шпильков (или цинковых кулаков), за которыми следует альфа -спираль . [ 5 ] Fyve Finger связывает два иона цинка . Fyve Finger имеет восемь потенциальных координирующих положений цинка цинка и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеинов. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотиве последовательности:
Fyve Finger структурно похож на кольцевой домен и докторскую степень .
Примеры
[ редактировать ]Ниже приведен список человеческих белков, содержащих этот домен:
- ANKFY1 , EEA1 , FGD1 , FGD2 , FGD3 , FGD4 , FGD5 , FGD6 , FYCO1 , HGS , MTMR3 , MTMR4 , Pikfyve , Plekhf1 , Plekhf2
- RUFY1 , RUFY2 , RUFY3 , RUFY4 , WDFY1 , WDFY2 , WDFY3 , ZFYVE1 , ZFYVE9 , ZFYVE16 , ZFYVE20 , ZFYVE21 , ZFYVE26 , ZFYVE27 , Zfyve28 , ZFYVE19
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Dumas JJ, Merithew E, Sudharshan E, et al. (Ноябрь 2001 г.). «Многовалентное окончание гомодимерного EEA1 » Мол Ячейка 8 (5): 947–5 Doi : 10.1016/s1097-2765 (01) 00385-9 11741531PMID
- ^ Gaullier JM, Simonsen A, D'arrigo A, Bremnes B, Stenmark H, Aasland R (июль 1998 г.). «Поиск пальцев связывают птдины (3) p». Природа . 394 (6692): 432–3. doi : 10.1038/28767 . PMID 9697764 . S2CID 4385768 .
- ^ Он J, Vora M, Haney RM, et al. (Сентябрь 2009 г.). «Мембранная вставка домена fyve модулируется pH» . Белки . 76 (4): 852–60. doi : 10.1002/prot.22392 . PMC 2909462 . PMID 19296456 .
- ^ Leevers SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (апрель 1999 г.). «Сигнализация через фосфоинозитид 3-киназ: липиды занимают центральную стадию». Карт Мнение Клеточная биол . 11 (2): 219–25. doi : 10.1016/s0955-0674 (99) 80029-5 . PMID 10209156 .
- ^ Мисра С., Херли Дж. Х. (май 1999). «Кристаллическая структура фосфатидилинозитол 3-фосфатно-специфического мотива мембраны, домен FYVE VPS27P» . Клетка . 97 (5): 657–66. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80776-x . PMID 10367894 . S2CID 15448444 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Stenmark H, Aasland R, Toh Bh, D'arrigo A (сентябрь 1996 г.). «Эндосомная локализация аутоантигена EEA1 опосредована цинком-связывающим пальцем Fyve» . Дж. Биол. Химический 271 (39): 24048–54. doi : 10.1074/jbc.271.39.24048 . PMID 8798641 .
- Stenmark H, Aasland R (декабрь 1999 г.). «Белки Fyve-Finger-Эффекты липида инозитола». J. Cell Sci . 112 (Pt 23): 4175–83. PMID 10564636 .