Цитохром б

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Цитохром B, C-концевой домен
Цитохром B, C-концевой домен
	Митохондриальный цитохромный комплекс BC1
Идентификаторы
Символ	Cytochrom_b_c
Pfam	PF00032
InterPro	IPR005798
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Цитохром В является белком, обнаруженным в мембранах аэробных клеток. В эукариотических митохондриях (внутренней мембране) и в аэробных прокариотах цитохром B является компонентом комплекса дыхательной цепи III ( EC 1.10.2.2 ), также известного как комплекс BC1 или убиквинол-цитохрома Creductase. В хлоропластах растений и цианобактериях есть гомологичный белок, цитохром B6, компонент пластохинон -пластоцианиновой редуктазы ( EC 1.10.99.1 ), также известный как комплекс B6F. Эти комплексы участвуют в электронном переносе , накачивании протонов для создания протонной силы ( PMF ). Этот протонный градиент используется для генерации АТФ . Эти комплексы играют жизненно важную роль в клетках. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Структура и функция

Цитохром B/B6 является интегральным мембранным белком из приблизительно 400 аминокислотных остатков , которые, вероятно, имеют 8 трансмембранных сегментов . У растений и цианобактерий цитохром B6 состоит из двух белковых субъединиц, кодируемых генами PetB и PETD. Цитохром B/B6 нековалентно связывает две группы гема , известные как B562 и B566. Постуливаются четыре консервативные остатки гистидина как лиганды атомов железа этих двух гем -групп. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Гемы гема являются ключевыми частями внутреннего пути переноса электрона и необходимы для функционирования двух окислительных комплексов хинола. Два единицы B/B6 также образуют путь входа в хинол. ^{[ 4 ]}

Использование в филогенетике

Цитохром B обычно используется в качестве области митохондриальной ДНК для определения филогенетических взаимосвязей между организмами из -за изменчивости ее последовательности. Это считается наиболее полезным при определении отношений в семьях и родах . Сравнительные исследования с участием цитохрома B привели к новым схемам классификации и использовались для назначения вновь описанных видов на род, а также для углубления понимания эволюционных отношений. ^{[ 5 ]}

Клиническое значение

Мутации в цитохроме В в первую очередь приводят к непереносимости физических упражнений у пациентов с людьми; Несмотря на более редкие, также сообщалось о тяжелых мультисистемных патологиях. ^{[ 6 ]}

Одноточечные мутации в цитохроме В плазмодия Falciparum и P. berghei связаны с устойчивостью к антималярийному препарату атовакону . ^{[ 7 ]}

Человеческие гены

Человеческие гены, кодирующие белки цитохрома В, включают:

Cyb5a - цитохром B5 Тип A (микросомаль)
Cyb5b - цитохром B5 Тип B (внешняя митохондриальная мембрана)
Cybasc3 - Cytochrome B, Ascorbate -зависимость 3
MT-CYB -Митохондриально кодированный цитохром B

Фунгицид -цель

Цит B нацелен на Q _O I класс фунгицидов комитета по борьбе с устойчивостью к фунгицидам . , Группа G143A и F129L обеспечивает устойчивость к основному органу группы 11, хотя G143A не работает против Metyltetraprole (11a). ^{[ 8 ]} G143A является значительным в Botrytis Cinerea в Калифорнии . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Бланкеншип, Роберт (2009). Молекулярные механизмы фотосинтеза . Blackwell Publishing. С. 124–132.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Хауэлл Н (август 1989 г.). «Эволюционное сохранение белковых областей в мотиве протонного цитохрома B и их возможная роль в окислительно -восстановительном катализе». J. Mol. Эвол . 29 (2): 157–69. Bibcode : 1989JMOLE..29..157H . doi : 10.1007/bf02100114 . PMID 2509716 . S2CID 7298013 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Esposti MD, De Vries S, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A (июль 1993 г.). «Митохондриальный цитохром B: эволюция и структура белка» (PDF) . Биохим. Биофиз. Акт . 1143 (3): 243–71. doi : 10.1016/0005-2728 (93) 90197-N . PMID 8329437 .
^ Саревич, м; Pintscher, S; Pietras, R; Борек, а; Bujnowicz,; Ханке, G; Cramer, WA; Finazzi, g; Osyczka, A (24 февраля 2021 года). «Каталитические реакции и энергосбережение в комплексах цитохрома BC (1) и B (6) F мембран, передающих энергетики» . Химические обзоры . 121 (4): 2020–2108. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00712 . PMC 7908018 . PMID 33464892 .
^ Кастризана, Дж. (2001). «Филогения цитохрома B и таксономия великих обезьян и млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (4): 465–471. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003825 . PMID 11264397 .
^ Blakely EL, Mitchell AL, Fisher N, Meunier B, Nijtmans LG, Schaefer AM, Jackson MJ, Turnbull DM, Taylor RW (июль 2005 г.). «Мутация митохондриального цитохрома B, вызывающая тяжелый дефицит ферментов дыхательной цепи у людей и дрожжей» . Февраль J. 272 (14): 3583–92. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04779.x . PMID 16008558 . S2CID 13938075 .
^ Siregar Je, Syafruddin D, Matsuoka H, Kita K, Marzuki S (июнь 2008 г.). «Мутация, лежащая в основе устойчивости плазмодия Berghei к атовакону в домене связывания хинона 2 (QO (2)) гена цитохрома B». Паразитология International . 57 (2): 229–32. doi : 10.1016/j.parint.2007.12.002 . PMID 18248769 .
^ FRAC ( комитет по борьбе с устойчивостью к фунгицидам ) (март 2021 г.). «Список кодов FRAC ©*2021: Агенты управления грибком, отсортированные по шаблону резистентности и режима действия (включая кодирование групп FRAC на метках продукта)» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2021-11-05 . Получено 2021-06-16 .
^
- Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; Ван Кан, Ян Ал; Blanco-ult, Barbara (2019-04-04). «Серая плесень клубники, разрушительное заболевание, вызванное повсеместным некротрофическим грибковым патогеном Botrytis cinerea » . Патология молекулярного растения . 20 (6). Британское общество патологии растений ( WB ): 877–892. doi : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . PMC 6637890 . PMID 30945788 . S2CID 93002697 .
- Cosseboom, Scott D.; Ivors, Kelly L.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патриция К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «В течение сезона сдвиг в профилях устойчивости к фунгицидам Botrytis cinerea на калифорнийских клубничных полях» . Болезнь растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . PMID 30422743 . S2CID 205345358 .

Внешние ссылки

Cytochromes+B в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)

[1] Бланкеншип, Роберт (2009). Молекулярные механизмы фотосинтеза . Blackwell Publishing. С. 124–132.

[pmid2509716-2] Jump up to: ^а ^{беременный} Хауэлл Н (август 1989 г.). «Эволюционное сохранение белковых областей в мотиве протонного цитохрома B и их возможная роль в окислительно -восстановительном катализе». J. Mol. Эвол . 29 (2): 157–69. Bibcode : 1989JMOLE..29..157H . doi : 10.1007/bf02100114 . PMID 2509716 . S2CID 7298013 .

[pmid8329437-3] Jump up to: ^а ^{беременный} Esposti MD, De Vries S, Crimi M, Ghelli A, Patarnello T, Meyer A (июль 1993 г.). «Митохондриальный цитохром B: эволюция и структура белка» (PDF) . Биохим. Биофиз. Акт . 1143 (3): 243–71. doi : 10.1016/0005-2728 (93) 90197-N . PMID 8329437 .

[4] Саревич, м; Pintscher, S; Pietras, R; Борек, а; Bujnowicz,; Ханке, G; Cramer, WA; Finazzi, g; Osyczka, A (24 февраля 2021 года). «Каталитические реакции и энергосбережение в комплексах цитохрома BC (1) и B (6) F мембран, передающих энергетики» . Химические обзоры . 121 (4): 2020–2108. doi : 10.1021/acs.chemrev.0c00712 . PMC 7908018 . PMID 33464892 .

[2001Castresana-5] Кастризана, Дж. (2001). «Филогения цитохрома B и таксономия великих обезьян и млекопитающих» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (4): 465–471. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003825 . PMID 11264397 .

[pmid16008558-6] Blakely EL, Mitchell AL, Fisher N, Meunier B, Nijtmans LG, Schaefer AM, Jackson MJ, Turnbull DM, Taylor RW (июль 2005 г.). «Мутация митохондриального цитохрома B, вызывающая тяжелый дефицит ферментов дыхательной цепи у людей и дрожжей» . Февраль J. 272 (14): 3583–92. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.04779.x . PMID 16008558 . S2CID 13938075 .

[pmid18248769-7] Siregar Je, Syafruddin D, Matsuoka H, Kita K, Marzuki S (июнь 2008 г.). «Мутация, лежащая в основе устойчивости плазмодия Berghei к атовакону в домене связывания хинона 2 (QO (2)) гена цитохрома B». Паразитология International . 57 (2): 229–32. doi : 10.1016/j.parint.2007.12.002 . PMID 18248769 .

[FRAC-MoAs-8] FRAC ( комитет по борьбе с устойчивостью к фунгицидам ) (март 2021 г.). «Список кодов FRAC ©*2021: Агенты управления грибком, отсортированные по шаблону резистентности и режима действия (включая кодирование групп FRAC на метках продукта)» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2021-11-05 . Получено 2021-06-16 .

[Cosseboom-et-al-2019-bundle-9] 
Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; Ван Кан, Ян Ал; Blanco-ult, Barbara (2019-04-04). «Серая плесень клубники, разрушительное заболевание, вызванное повсеместным некротрофическим грибковым патогеном Botrytis cinerea » . Патология молекулярного растения . 20 (6). Британское общество патологии растений ( WB ): 877–892. doi : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . PMC 6637890 . PMID 30945788 . S2CID 93002697 .
Cosseboom, Scott D.; Ivors, Kelly L.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патриция К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «В течение сезона сдвиг в профилях устойчивости к фунгицидам Botrytis cinerea на калифорнийских клубничных полях» . Болезнь растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . PMID 30422743 . S2CID 205345358 .

[10] Петраш, Стефан; Кнапп, Стивен Дж.; Ван Кан, Ян Ал; Blanco-ult, Barbara (2019-04-04). «Серая плесень клубники, разрушительное заболевание, вызванное повсеместным некротрофическим грибковым патогеном Botrytis cinerea » . Патология молекулярного растения . 20 (6). Британское общество патологии растений ( WB ): 877–892. doi : 10.1111/mpp.12794 . ISSN 1464-6722 . PMC 6637890 . PMID 30945788 . S2CID 93002697 .

[11] Cosseboom, Scott D.; Ivors, Kelly L.; Шнабель, Гвидо; Брайсон, Патриция К.; Холмс, Джеральд Дж. (2019). «В течение сезона сдвиг в профилях устойчивости к фунгицидам Botrytis cinerea на калифорнийских клубничных полях» . Болезнь растений . 103 (1). Американское фитопатологическое общество : 59–64. doi : 10.1094/pdis-03-18-0406-re . ISSN 0191-2917 . PMID 30422743 . S2CID 205345358 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]