Белковая дисульфид-изомераза

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Белковая дисульфид-изомераза
Белковая дисульфид-изомераза
Идентификаторы
Номер ЕС.	5.3.4.1
Номер CAS.	37318-49-3
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Белковая дисульфид-изомераза
Белковая дисульфид-изомераза
	Структурная картина протеиндисульфидизомеразы человека (PDB 1BJX)
Идентификаторы
Символ	?
ИнтерПро	ИПР005792

семейство протеиндисульфидизомераз А, член 2

Идентификаторы

Символ

ПДИА2

Альт. символы

ПДИП

Другие данные

Хр. 16 п13.3

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

семейство протеиндисульфидизомераз А, член 3

Идентификаторы

Символ

PDIA3

Альт. символы

ГРП58

Другие данные

Хр. 15 q15

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

семейство протеиндисульфидизомераз А, член 4

Идентификаторы

Символ

Другие данные

7 q35

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

семейство протеиндисульфидизомераз А, член 5

Идентификаторы

Символ

Другие данные

Хр. 3 q21.1

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

семейство протеиндисульфидизомераз А, член 6

Идентификаторы

Символ

PDIA6

Альт. символы

TXNDC7

Другие данные

Хр. 2 п25.1

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Протеиндисульфидизомераза ( EC 5.3.4.1 ), или PDI, представляет собой фермент эндоплазматической сети (ER) эукариот и периплазмы бактерий, который катализирует образование и разрыв дисульфидных связей между остатками цистеина внутри белков при их сворачивании. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Это позволяет белкам быстро находить правильное расположение дисульфидных связей в полностью свернутом состоянии, и поэтому фермент катализирует сворачивание белка .

Структура

Белково-дисульфид-изомераза имеет два каталитических тиоредоксин- подобных домена (активные центры), каждый из которых содержит канонический мотив CGHC, и два некаталитических домена. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Эта структура аналогична структуре ферментов, ответственных за окислительную сворачивание в межмембранном пространстве митохондрий; примером этого является импорт и сборка митохондриального IMS (Mia40), который имеет 2 каталитических домена, содержащих CX ₉ C, который подобен домену CGHC PDI. ^{[ 7 ]} Бактериальный DsbA , ответственный за окислительное сворачивание, также имеет тиоредоксиновый домен CXXC. ^{[ 8 ]}

Функция

Складывание белка

PDI проявляет оксидоредуктазные и изомеразные свойства, оба из которых зависят от типа субстрата, который связывается с протеиндисульфидизомеразой, и изменений в окислительно-восстановительном состоянии протеиндисульфидизомеразы. ^{[ 4 ]} Эти виды активности позволяют осуществлять окислительное сворачивание белков. Окислительное сворачивание включает окисление восстановленных остатков цистеина возникающих белков; при окислении этих остатков цистеина образуются дисульфидные мостики, которые стабилизируют белки и позволяют создавать нативные структуры (а именно третичные и четвертичные структуры). ^{[ 4 ]}

Механизм и путь регулярного окислительного сворачивания

PDI конкретно отвечает за сворачивание белков в ЭР. ^{[ 6 ]} В развернутом белке остаток цистеина образует смешанный дисульфид с остатком цистеина в активном центре (мотив CGHC) протеиндисульфид-изомеразы. Второй остаток цистеина затем образует стабильный дисульфидный мостик внутри субстрата , оставляя два цистеиновых остатка в активном центре протеиндисульфид-изомеразы в восстановленном состоянии. ^{[ 4 ]}

После этого PDI может быть регенерирован в свою окисленную форму в эндоплазматическом ретикулуме путем переноса электронов на реокисляющиеся белки, такие как ER оксидоредуктин 1 (Ero 1), VKOR (эпоксидредуктаза витамина К), глутатионпероксидаза (Gpx7/8) и PrxIV (пероксиредоксин IV). ). ^{[ 4 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 6 ]} Считается, что Ero1 является основным реокисляющим белком PDI, и путь повторного окисления PDI для Ero1 более изучен, чем у других белков. ^{[ 10 ]} Ero1 принимает электроны от PDI и отдает эти электроны молекулам кислорода в ЭР, что приводит к образованию перекиси водорода. ^{[ 10 ]}

Механизм неправильной свертки белка

Восстановленная (дитиоловая) форма протеиндисульфидизомеразы способна катализировать восстановление неправильно сформированного дисульфидного мостика субстрата либо за счет редуктазной активности, либо за счет активности изомеразы. ^{[ 11 ]} В редуктазном методе неправильно свернутая дисульфидная связь субстрата преобразуется в пару восстановленных остатков цистеина путем переноса электронов от глутатиона и НАДФН. После этого происходит нормальное сворачивание с образованием окислительной дисульфидной связи между правильными парами остатков цистеина субстрата, что приводит к правильно свернутому белку. Для изомеразного метода внутримолекулярная перегруппировка функциональных групп субстрата катализируется вблизи N-конца каждого активного центра. ^{[ 4 ]} Следовательно, протеиндисульфидизомераза способна катализировать посттрансляционную модификацию дисульфидного обмена .

Редокс-сигнализация

В хлоропластах одноклеточных водорослей Chlamydomonas Reinhardtii протеиндисульфид-изомераза RB60 служит окислительно-восстановительным сенсорным компонентом м- РНК-связывающего белкового комплекса, участвующего в фоторегуляции трансляции psbA, РНК, кодирующей коровый белок D1 фотосистемы II . Было также высказано предположение, что протеиндисульфидизомераза играет роль в образовании регуляторных дисульфидных связей в хлоропластах. ^{[ 12 ]}

Другие функции

Иммунная система

Протеиндисульфидизомераза помогает загружать антигенные пептиды в MHC класса I. молекулы Эти молекулы (MHC I) связаны с презентацией пептидов антигенпрезентирующими клетками при иммунном ответе .

Было обнаружено, что протеиндисульфид-изомераза участвует в разрыве связей белка ВИЧ gp120 во время ВИЧ-инфицирования CD4- положительных клеток и необходима для ВИЧ-инфицирования лимфоцитов и моноцитов. ^{[ 13 ]} Некоторые исследования показали, что он доступен при ВИЧ-инфекции на поверхности клетки, сгруппированной вокруг белка CD4. Однако противоречивые исследования показали, что он недоступен на поверхности клеток, а вместо этого обнаруживается в значительных количествах в плазме крови.

Деятельность сопровождающего

Другая важная функция протеиндисульфид-изомеразы связана с ее активностью в качестве шаперона ; его домен b' способствует связыванию неправильно свернутого белка для последующей деградации . ^{[ 4 ]} Это регулируется тремя мембранными белками ЭР: протеинкиназой РНК-подобной киназой эндоплазматического ретикулума (PERK), инозитол-требующей киназой 1 (IRE1) и активирующим фактором транскрипции 6 (ATF6). ^{[ 4 ]}^{[ 14 ]} Они реагируют на высокие уровни неправильно свернутых белков в ЭР через внутриклеточные сигнальные каскады, которые могут активировать шаперонную активность PDI. ^{[ 4 ]} Эти сигналы также могут инактивировать трансляцию этих неправильно свернутых белков, поскольку каскад движется от ЭР к ядру. ^{[ 4 ]}

Анализы активности

Анализ мутности инсулина : протеиндисульфид-изомераза разрывает две дисульфидные связи между двумя цепями инсулина (a и b), что приводит к осаждению b-цепи. Это осаждение можно отслеживать при длине волны 650 нм, что косвенно используется для мониторинга активности протеиндисульфидизомеразы. ^{[ 15 ]} Чувствительность этого анализа находится в микромолярном диапазоне.

Анализ ScРНКазы : протеиндисульфид-изомераза преобразует скремблированную (неактивную) РНКазу в нативную (активную) РНКазу, которая в дальнейшем действует на свой субстрат. ^{[ 16 ]} Чувствительность находится в микромолярном диапазоне.

Анализ Di-E-GSSG : это флуорометрический анализ , который может обнаружить пикомолярные количества протеиндисульфидизомеразы и, следовательно, является наиболее чувствительным на сегодняшний день анализом для определения активности протеиндисульфидизомеразы. ^{[ 17 ]} Di-E-GSSG имеет две эозина молекулы , присоединенные к окисленному глутатиону (GSSG). Близость молекул эозина приводит к тушению его флуоресценции. Однако при разрыве дисульфидной связи протеиндисульфидизомеразой флуоресценция увеличивается в 70 раз.

Стресс и торможение

Эффекты нитрозативного стресса

Нарушение окислительно-восстановительной регуляции приводит к усилению нитрозативного стресса в эндоплазматическом ретикулуме. Такие неблагоприятные изменения в нормальной клеточной среде восприимчивых клеток, например нейронов, приводят к нефункционированию тиолсодержащих ферментов. ^{[ 14 ]} Более конкретно, протеиндисульфидизомераза больше не может фиксировать неправильно свернутые белки, если к ее тиоловой группе в активном центре присоединена группа монооксида азота; в результате в нейронах происходит накопление неправильно свернутых белков, что связано с развитием нейродегенеративных заболеваний, таких как болезнь Альцгеймера и болезнь Паркинсона. ^{[ 4 ]}^{[ 14 ]}

Торможение

В связи с ролью протеиндисульфидизомеразы в ряде болезненных состояний были разработаны низкомолекулярные ингибиторы протеиндисульфидизомеразы. Эти молекулы могут необратимо воздействовать на активный центр протеиндисульфид-изомеразы. ^{[ 18 ]} или обратимо. ^{[ 19 ]}

Было показано, что активность протеиндисульфид-изомеразы ингибируется красным вином и виноградным соком, что может служить объяснением французского парадокса . ^{[ 20 ]}

Члены

Гены человека, кодирующие белково-дисульфид-изомеразы, включают: ^{[ 3 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}

Ссылки

^ Уилкинсон Б., Гилберт Х.Ф. (июнь 2004 г.). «Протеиндисульфидизомераза». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1699 (1–2): 35–44. дои : 10.1016/j.bbapap.2004.02.017 . ПМИД 15158710 .
^ Грубер CW, Семазар М., Херас Б., Мартин Дж.Л., Крейк DJ (август 2006 г.). «Протеиндисульфидизомераза: структура окислительного сворачивания». Тенденции биохимических наук . 31 (8): 455–64. дои : 10.1016/j.tibs.2006.06.001 . ПМИД 16815710 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Галлиган Дж. Дж., Петерсен Д. Р. (июль 2012 г.). «Семейство генов белковой дисульфид-изомеразы человека» . Геномика человека . 6 (1): 6. дои : 10.1186/1479-7364-6-6 . ПМК 3500226 . ПМИД 23245351 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Перри Э.Р., Томас С.Дж., Парах С., Спенсер Д.М., Аткин Дж.Д. (2016). «Развернутый белковый ответ и роль протеиндисульфидизомеразы в нейродегенерации» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 3 : 80. дои : 10.3389/fcell.2015.00080 . ПМК 4705227 . ПМИД 26779479 .
^ Bechtel TJ, Weerapana E (март 2017 г.). «От структуры к окислительно-восстановительному потенциалу: разнообразные функциональные роли дисульфидов и последствия при заболеваниях» . Протеомика . 17 (6): 10.1002/pmic.201600391. дои : 10.1002/pmic.201600391 . ПМК 5367942 . ПМИД 28044432 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Соареш Моретти AI, Мартинс Лауриндо FR (март 2017 г.). «Белковые дисульфид-изомеразы: окислительно-восстановительные связи внутри и снаружи эндоплазматического ретикулума». Архив биохимии и биофизики . Химия окислительно-восстановительной сигнализации. 617 : 106–119. дои : 10.1016/j.abb.2016.11.007 . ПМИД 27889386 .
^ Эрдоган А.Дж., Ример Дж. (январь 2017 г.). «Митохондриальная дисульфидная реле и его субстраты: механизмы здоровья и болезней». Исследования клеток и тканей . 367 (1): 59–72. дои : 10.1007/s00441-016-2481-z . ПМИД 27543052 . S2CID 35346837 .
^ Ху Ш., Пик Дж.А., Раттиган Э., Тейлор Р.К., Мартин Дж.Л. (апрель 1997 г.). «Структура TcpG, катализатора сворачивания белка DsbA холерного вибриона» . Журнал молекулярной биологии . 268 (1): 137–46. дои : 10.1006/jmbi.1997.0940 . ПМИД 9149147 .
^ Манганас П., Макферсон Л., Токатлидис К. (январь 2017 г.). «Окислительный биогенез белков и окислительно-восстановительная регуляция в митохондриальном межмембранном пространстве» . Исследования клеток и тканей . 367 (1): 43–57. дои : 10.1007/s00441-016-2488-5 . ПМК 5203823 . ПМИД 27632163 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Ока О.Б., Йео ХАЙ, Буллейд, Нью-Джерси (июль 2015 г.). «Тиол-дисульфидный обмен между оксидоредуктазами семейства PDI сводит на нет потребность в оксидазе или редуктазе для каждого фермента» . Биохимический журнал . 469 (2): 279–88. дои : 10.1042/bj20141423 . ПМЦ 4613490 . ПМИД 25989104 .
^ Хатахет Ф., Раддок Л.В. (октябрь 2007 г.). «Распознавание субстрата протеиндисульфидизомеразами». Журнал ФЭБС . 274 (20): 5223–34. дои : 10.1111/j.1742-4658.2007.06058.x . ПМИД 17892489 . S2CID 9455925 .
^ Виттенберг Г., Данон А. (2008). «Образование дисульфидной связи в хлоропластах». Наука о растениях . 175 (4): 459–466. doi : 10.1016/j.plantsci.2008.05.011 .
^ Райзер Х.Дж., Флюкигер Р. (август 2005 г.). «Прогресс в борьбе с проникновением ВИЧ-1». Открытие наркотиков сегодня . 10 (16): 1085–94. дои : 10.1016/S1359-6446(05)03550-6 . ПМИД 16182193 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с МакБин Дж.Дж., Лопес М.Г., Валлнер ФК (июнь 2017 г.). «Окислительно-восстановительная терапия при нейродегенеративных заболеваниях» . Британский журнал фармакологии . 174 (12): 1750–1770. дои : 10.1111/bph.13551 . ПМЦ 5446580 . ПМИД 27477685 .
^ Лундстрем Дж., Холмгрен А. (июнь 1990 г.). «Протеиндисульфид-изомераза является субстратом тиоредоксинредуктазы и обладает тиоредоксинподобной активностью» . Журнал биологической химии . 265 (16): 9114–20. дои : 10.1016/S0021-9258(19)38819-2 . ПМИД 2188973 .
^ Лайлс М.М., Гилберт Х.Ф. (январь 1991 г.). «Катализ окислительного сворачивания рибонуклеазы А протеиндисульфидизомеразой: зависимость скорости от состава окислительно-восстановительного буфера». Биохимия . 30 (3): 613–9. дои : 10.1021/bi00217a004 . ПМИД 1988050 .
^ Ратури А., Мутус Б. (июль 2007 г.). «Характеристика окислительно-восстановительного состояния и редуктазной активности протеиндисульфидизомеразы в различных окислительно-восстановительных средах с использованием чувствительного флуоресцентного анализа». Свободно-радикальная биология и медицина . 43 (1): 62–70. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2007.03.025 . ПМИД 17561094 .
^ Хоффстром Б.Г., Каплан А., Летсо Р., Шмид Р.С., Термел Г.Дж., Ло Д.С., Стоквелл Б.Р. (декабрь 2010 г.). «Ингибиторы протеиндисульфидизомеразы подавляют апоптоз, индуцированный неправильно свернутыми белками» . Химическая биология природы . 6 (12): 900–6. дои : 10.1038/nchembio.467 . ПМК 3018711 . ПМИД 21079601 .
^ Каплан А., Гашлер М.М., Данн Д.Е., Коллиган Р., Браун Л.М., Палмер А.Г., Ло Д.С., Стоквелл Б.Р. (апрель 2015 г.). «Вызванное малыми молекулами окисление протеиндисульфидизомеразы оказывает нейропротекторное действие» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (17): Е2245-52. Бибкод : 2015PNAS..112E2245K . дои : 10.1073/pnas.1500439112 . ПМЦ 4418888 . ПМИД 25848045 .
^ Галински К.Н., Цвикер Дж.И., Кеннеди Д.Р. (январь 2016 г.). «Возвращаясь к механистической основе французского парадокса: красное вино ингибирует активность протеиндисульфидизомеразы in vitro» . Исследование тромбоза . 137 : 169–173. дои : 10.1016/j.thromres.2015.11.003 . ПМЦ 4706467 . ПМИД 26585763 .
^ Эллгаард Л., Раддок Л.В. (январь 2005 г.). «Семейство белков-дисульфид-изомераз человека: взаимодействия субстратов и функциональные свойства» . Отчеты ЭМБО . 6 (1): 28–32. дои : 10.1038/sj.embor.7400311 . ПМЦ 1299221 . ПМИД 15643448 .
^ Аппенцеллер-Герцог К., Эллгаард Л. (апрель 2008 г.). «Семейство PDI человека: универсальность в одном устройстве» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1783 (4): 535–48. дои : 10.1016/j.bbamcr.2007.11.010 . ПМИД 18093543 .

Внешние ссылки

Белковая дисульфид-изомераза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[pmid15158710-1] Уилкинсон Б., Гилберт Х.Ф. (июнь 2004 г.). «Протеиндисульфидизомераза». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1699 (1–2): 35–44. дои : 10.1016/j.bbapap.2004.02.017 . ПМИД 15158710 .

[pmid16815710-2] Грубер CW, Семазар М., Херас Б., Мартин Дж.Л., Крейк DJ (август 2006 г.). «Протеиндисульфидизомераза: структура окислительного сворачивания». Тенденции биохимических наук . 31 (8): 455–64. дои : 10.1016/j.tibs.2006.06.001 . ПМИД 16815710 .

[humgenomics.com-3] Перейти обратно: ^а ^б Галлиган Дж. Дж., Петерсен Д. Р. (июль 2012 г.). «Семейство генов белковой дисульфид-изомеразы человека» . Геномика человека . 6 (1): 6. дои : 10.1186/1479-7364-6-6 . ПМК 3500226 . ПМИД 23245351 .

[Perri_2016-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Перри Э.Р., Томас С.Дж., Парах С., Спенсер Д.М., Аткин Дж.Д. (2016). «Развернутый белковый ответ и роль протеиндисульфидизомеразы в нейродегенерации» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 3 : 80. дои : 10.3389/fcell.2015.00080 . ПМК 4705227 . ПМИД 26779479 .

[Bechtel_2017-5] Bechtel TJ, Weerapana E (март 2017 г.). «От структуры к окислительно-восстановительному потенциалу: разнообразные функциональные роли дисульфидов и последствия при заболеваниях» . Протеомика . 17 (6): 10.1002/pmic.201600391. дои : 10.1002/pmic.201600391 . ПМК 5367942 . ПМИД 28044432 .

[Soares_2017-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с Соареш Моретти AI, Мартинс Лауриндо FR (март 2017 г.). «Белковые дисульфид-изомеразы: окислительно-восстановительные связи внутри и снаружи эндоплазматического ретикулума». Архив биохимии и биофизики . Химия окислительно-восстановительной сигнализации. 617 : 106–119. дои : 10.1016/j.abb.2016.11.007 . ПМИД 27889386 .

[7] Эрдоган А.Дж., Ример Дж. (январь 2017 г.). «Митохондриальная дисульфидная реле и его субстраты: механизмы здоровья и болезней». Исследования клеток и тканей . 367 (1): 59–72. дои : 10.1007/s00441-016-2481-z . ПМИД 27543052 . S2CID 35346837 .

[8] Ху Ш., Пик Дж.А., Раттиган Э., Тейлор Р.К., Мартин Дж.Л. (апрель 1997 г.). «Структура TcpG, катализатора сворачивания белка DsbA холерного вибриона» . Журнал молекулярной биологии . 268 (1): 137–46. дои : 10.1006/jmbi.1997.0940 . ПМИД 9149147 .

[9] Манганас П., Макферсон Л., Токатлидис К. (январь 2017 г.). «Окислительный биогенез белков и окислительно-восстановительная регуляция в митохондриальном межмембранном пространстве» . Исследования клеток и тканей . 367 (1): 43–57. дои : 10.1007/s00441-016-2488-5 . ПМК 5203823 . ПМИД 27632163 .

[Oka_2015-10] Перейти обратно: ^а ^б ^с Ока О.Б., Йео ХАЙ, Буллейд, Нью-Джерси (июль 2015 г.). «Тиол-дисульфидный обмен между оксидоредуктазами семейства PDI сводит на нет потребность в оксидазе или редуктазе для каждого фермента» . Биохимический журнал . 469 (2): 279–88. дои : 10.1042/bj20141423 . ПМЦ 4613490 . ПМИД 25989104 .

[pmid17892489-11] Хатахет Ф., Раддок Л.В. (октябрь 2007 г.). «Распознавание субстрата протеиндисульфидизомеразами». Журнал ФЭБС . 274 (20): 5223–34. дои : 10.1111/j.1742-4658.2007.06058.x . ПМИД 17892489 . S2CID 9455925 .

[pmid100-12] Виттенберг Г., Данон А. (2008). «Образование дисульфидной связи в хлоропластах». Наука о растениях . 175 (4): 459–466. doi : 10.1016/j.plantsci.2008.05.011 .

[Ryser2005-13] Райзер Х.Дж., Флюкигер Р. (август 2005 г.). «Прогресс в борьбе с проникновением ВИЧ-1». Открытие наркотиков сегодня . 10 (16): 1085–94. дои : 10.1016/S1359-6446(05)03550-6 . ПМИД 16182193 .

[McBean_2017-14] Перейти обратно: ^а ^б ^с МакБин Дж.Дж., Лопес М.Г., Валлнер ФК (июнь 2017 г.). «Окислительно-восстановительная терапия при нейродегенеративных заболеваниях» . Британский журнал фармакологии . 174 (12): 1750–1770. дои : 10.1111/bph.13551 . ПМЦ 5446580 . ПМИД 27477685 .

[15] Лундстрем Дж., Холмгрен А. (июнь 1990 г.). «Протеиндисульфид-изомераза является субстратом тиоредоксинредуктазы и обладает тиоредоксинподобной активностью» . Журнал биологической химии . 265 (16): 9114–20. дои : 10.1016/S0021-9258(19)38819-2 . ПМИД 2188973 .

[16] Лайлс М.М., Гилберт Х.Ф. (январь 1991 г.). «Катализ окислительного сворачивания рибонуклеазы А протеиндисульфидизомеразой: зависимость скорости от состава окислительно-восстановительного буфера». Биохимия . 30 (3): 613–9. дои : 10.1021/bi00217a004 . ПМИД 1988050 .

[17] Ратури А., Мутус Б. (июль 2007 г.). «Характеристика окислительно-восстановительного состояния и редуктазной активности протеиндисульфидизомеразы в различных окислительно-восстановительных средах с использованием чувствительного флуоресцентного анализа». Свободно-радикальная биология и медицина . 43 (1): 62–70. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2007.03.025 . ПМИД 17561094 .

[18] Хоффстром Б.Г., Каплан А., Летсо Р., Шмид Р.С., Термел Г.Дж., Ло Д.С., Стоквелл Б.Р. (декабрь 2010 г.). «Ингибиторы протеиндисульфидизомеразы подавляют апоптоз, индуцированный неправильно свернутыми белками» . Химическая биология природы . 6 (12): 900–6. дои : 10.1038/nchembio.467 . ПМК 3018711 . ПМИД 21079601 .

[19] Каплан А., Гашлер М.М., Данн Д.Е., Коллиган Р., Браун Л.М., Палмер А.Г., Ло Д.С., Стоквелл Б.Р. (апрель 2015 г.). «Вызванное малыми молекулами окисление протеиндисульфидизомеразы оказывает нейропротекторное действие» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (17): Е2245-52. Бибкод : 2015PNAS..112E2245K . дои : 10.1073/pnas.1500439112 . ПМЦ 4418888 . ПМИД 25848045 .

[20] Галински К.Н., Цвикер Дж.И., Кеннеди Д.Р. (январь 2016 г.). «Возвращаясь к механистической основе французского парадокса: красное вино ингибирует активность протеиндисульфидизомеразы in vitro» . Исследование тромбоза . 137 : 169–173. дои : 10.1016/j.thromres.2015.11.003 . ПМЦ 4706467 . ПМИД 26585763 .

[pmid15643448-21] Эллгаард Л., Раддок Л.В. (январь 2005 г.). «Семейство белков-дисульфид-изомераз человека: взаимодействия субстратов и функциональные свойства» . Отчеты ЭМБО . 6 (1): 28–32. дои : 10.1038/sj.embor.7400311 . ПМЦ 1299221 . ПМИД 15643448 .

[pmid18093543-22] Аппенцеллер-Герцог К., Эллгаард Л. (апрель 2008 г.). «Семейство PDI человека: универсальность в одном устройстве» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1783 (4): 535–48. дои : 10.1016/j.bbamcr.2007.11.010 . ПМИД 18093543 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

v т и Изомеразы : внутримолекулярные оксидоредуктазы ( EC 5.3)
5.3.1: Aldoses/Ketoses	Triosephosphate isomerase Ribose-5-phosphate isomerase Mannose phosphate isomerase Glucose isomerase
5.3.2: Keto/Enol	Phenylpyruvate tautomerase Oxaloacetate tautomerase 4-Oxalocrotonate tautomerase
5.3.3: C = C	Steroid D-isomerase Isopentenyl-diphosphate delta isomerase Vinylacetyl-CoA D-isomerase Muconolactone D-isomerase Cholestenol Delta-isomerase (EBP) Methylitaconate D-isomerase Aconitate Delta-isomerase Enoyl CoA isomerase Prostaglandin-A1 Delta-isomerase 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate D-isomerase Isopiperitenone D-isomerase L-dopachrome isomerase Polyenoic fatty acid isomerase
5.3.4: S-S	Protein disulfide-isomerase (PDIA3)
5.3.99: other	Prostaglandin D2 synthase/Prostaglandin-D synthase Prostaglandin E synthase Prostacyclin synthase Thromboxane-A synthase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)