Простагландин D 2 синтаза

ПТГДС
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 4OS8, 2WWP, 3O19, 3O22, 3O2Y, 4IMN, 4IMO, 4ORR, 4ORS, 4ORU, 4ORW, 4ORX, 4ORY, 4OS0, 4OS3
Идентификаторы
Псевдонимы	PTGDS , L-PGDS, LPGDS, PDS, PGD2, PGDS, PGDS2, синтаза простагландина D2
Внешние идентификаторы	Опустить : 176803 ; МГИ : 99261 ; Гомологен : 737 ; GeneCards : PTGDS ; ОМА : PTGDS — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 9 (human) Band 9q34.3 Start 136,975,092 bp End 136,981,742 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 A3|2 17.28 cM Start 25,356,721 bp End 25,360,058 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis C1 segment substantia nigra putamen apex of heart right auricle temporal lobe amygdala caudate nucleus Top expressed in vestibular membrane of cochlear duct olfactory tubercle median eminence arcuate nucleus mammillary body iris optic nerve pontine nuclei retinal pigment epithelium stria vascularis More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function transporter activity isomerase activity fatty acid binding prostaglandin-D synthase activity protein binding small molecule binding retinoid binding Cellular component cytoplasm Golgi apparatus rough endoplasmic reticulum nuclear membrane endoplasmic reticulum membrane membrane extracellular region endoplasmic reticulum perinuclear region of cytoplasm extracellular exosome nucleus extracellular space Biological process prostaglandin metabolic process lipid metabolism cyclooxygenase pathway fatty acid metabolic process fatty acid biosynthetic process prostaglandin biosynthetic process regulation of circadian sleep/wake cycle, sleep transport Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 5730 19215 Вместе ENSG00000107317 ENSMUSG00000015090 ЮниПрот P41222 Q5SQ11 O09114 RefSeq (мРНК) НМ_000954 НМ_008963 RefSeq (белок) НП_000945 НП_032989 Местоположение (UCSC) Chr 9: 136,98 – 136,98 Мб Chr 2: 25,36 – 25,36 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Простагландин-H2 D-изомераза ( PTGDS ) — это фермент , который у человека кодируется PTGDS геном .

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой глутатион-независимую синтазу простагландина D, которая катализирует превращение простагландина H ₂ (PGH ₂ ) в простагландин D ₂ (PGD ₂ ). PGD _​​2 действует как нейромодулятор, а также трофический фактор в центральной нервной системе. PGD _​​2 также участвует в сокращении/расслаблении гладких мышц и является мощным ингибитором агрегации тромбоцитов. Этот ген преимущественно экспрессируется в мозге. Исследования на трансгенных мышах со сверхэкспрессией этого гена позволяют предположить, что этот ген также может участвовать в регуляции сна с медленными движениями глаз. Кроме того, PTGDS и его продукт PGD ₂ повышены в участках лысины у мужчин с облысением по мужскому типу ( андрогенная алопеция ).

Клиническое использование

Простагландин-D2 _- синтаза используется в клинике как диагностический маркер ликвореи , то есть для проверки того, содержит ли жидкость, вытекающая из носа или уха, спинномозговую жидкость . Это важно для оценки тяжести травмы головы . В медицинском контексте для обозначения PTGDS часто используется старый термин «бета-следовой белок».

См. также

• Гематопоэтическая простагландин D-синтаза

Дальнейшее чтение

• Уайт ДМ, Микол Д.Д., Эспиноза Р., Веймер Б., Ле Бо М.М., Стефанссон К. (ноябрь 1992 г.). «Структура и хромосомная локализация человеческого гена мозговой формы простагландин-D2-синтазы» . Журнал биологической химии . 267 (32): 23202–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)50077-6 . ПМИД   1385416 .
• Курувилла А.П., Хохвальд ГМ, Гисо Дж., Кастаньо Э.М., Пиццолато М., Франджионе Б. (ноябрь 1991 г.). «Выделение и аминоконцевая последовательность бета-следа, нового белка из спинномозговой жидкости человека» . Исследования мозга . 565 (2): 337–40. дои : 10.1016/0006-8993(91)91666-О . ПМИД   1726844 . S2CID   54405256 .
• Зан М., Мэдер М., Шмидт Б., Болленсен Э., Фельгенхауэр К. (май 1993 г.). «Очистка и N-концевая последовательность бета-следа, белка, которого много в спинномозговой жидкости человека». Письма по неврологии . 154 (1–2): 93–5. дои : 10.1016/0304-3940(93)90179-О . ПМИД   7689714 . S2CID   42018337 .
• Харрингтон М.Г., Эберсолд Р., Мартин Б.М., Меррил Ч.Р., Худ Л. (1993). «Идентификация специфичного для мозга гликопротеина спинномозговой жидкости человека, бета-следового белка». Прикладной и теоретический электрофорез . 3 (5): 229–34. ПМИД   7692978 .
• Бастьен Л., Сойер Н., Григорчик Р., Меттерс К.М., Адам М. (апрель 1994 г.). «Клонирование, функциональная экспрессия и характеристика подтипа EP2 рецептора простагландина E2 человека» . Журнал биологической химии . 269 ​​(16): 11873–7. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32654-6 . ПМИД   8163486 .
• Funk CD, Фурчи Л., Фитцджеральд Г.А., Григорчик Р., Рошетт С., Бейн М.А., Абрамовиц М., Адам М., Меттерс К.М. (декабрь 1993 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК подтипа EP1 рецептора простагландина Е человека» . Журнал биологической химии . 268 (35): 26767–72. дои : 10.1016/S0021-9258(19)74379-8 . ПМИД   8253813 .
• Абрамовиц М., Бой Й., Нгуен Т., Рашмор Т.Х., Бейн М.А., Меттерс К.М., Слипец Д.М., Григорчик Р. (январь 1994 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК простаноидного FP-рецептора человека» . Журнал биологической химии . 269 ​​(4): 2632–6. дои : 10.1016/S0021-9258(17)41991-0 . ПМИД   8300593 .
• Хоффманн А., Конрад Х.С., Гросс Г., Нимц М., Лотспайх Ф., Вурстер Ю. (август 1993 г.). «Очистка и химическая характеристика бета-следового белка из спинномозговой жидкости человека: его идентификация как простагландин-D-синтазы». Журнал нейрохимии . 61 (2): 451–6. дои : 10.1111/j.1471-4159.1993.tb02145.x . ПМИД   8336134 . S2CID   34300607 .
• Леоне М.Г., Сасо Л., Дель Веккьо А., Мо М.Ю., Сильвестрини Б., Ченг С.И. (август 1993 г.). «Микроочистка двух белков спинномозговой жидкости человека методом высокоэффективной электрофорезной хроматографии». Журнал нейрохимии . 61 (2): 533–40. дои : 10.1111/j.1471-4159.1993.tb02156.x . ПМИД   8336140 . S2CID   29843974 .
• Джакомелли С., Леоне М.Г., Грима Дж., Сильвестрини Б., Ченг С.И. (февраль 1996 г.). «Астроциты синтезируют и секретируют синтетазу простагландина D in vitro» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1310 (3): 269–76. дои : 10.1016/0167-4889(95)00182-4 . ПМИД   8599604 .
• Блёдорн Б., Мэдер М., Ураде Ю., Хаяиши О., Фельгенхауэр К., Брюк В. (май 1996 г.). «Сосудистое сплетение: основной участок экспрессии мРНК бета-следового белка (синтазы простагландина D) в мозге человека». Письма по неврологии . 209 (2): 117–20. дои : 10.1016/0304-3940(96)12614-8 . ПМИД   8761996 . S2CID   34159760 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• Ямасима Т., Сакуда К., Тома Ю., Ямашита Дж., Ода Х., Ирикура Д., Эгути Н., Бекманн К.Т., Канаока Ю., Ураде Ю., Хаяиси О. (апрель 1997 г.). «Простагландин D-синтаза (бета-след) в клетках паутинной оболочки и менингиомы человека: роль клеточного маркера или в абсорбции спинномозговой жидкости, онкогенезе и процессе кальцификации» . Журнал неврологии . 17 (7): 2376–82. doi : 10.1523/JNEUROSCI.17-07-02376.1997 . ПМК   6573504 . ПМИД   9065498 .
• Уайт Д.М., Такеда Т., ДеГрут Л.Дж., Стефанссон К., Арнасон Б.Г. (май 1997 г.). «Экспрессия гена бета-следа регулируется основным промотором и дистальным элементом ответа на гормон щитовидной железы» . Журнал биологической химии . 272 (22): 14387–93. дои : 10.1074/jbc.272.22.14387 . ПМИД   9162076 .
• Эгучи Ю, Эгучи Н, Ода Х, Сэйки К, Кидзима Ю, Мацу-ура Ю, Урадэ Ю, Хаяиси О (декабрь 1997 г.). «Экспрессия простагландин D-синтазы липокалинового типа (бета-след) в сердце человека и ее накопление в коронарном кровообращении больных стенокардией» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (26): 14689–94. Бибкод : 1997PNAS...9414689E . дои : 10.1073/pnas.94.26.14689 . ПМК   25094 . ПМИД   9405674 .
• Токугава Ю, Кунисигэ И, Кубота Ю, Симоя К, Нобунага Т, Кимура Т, Саджи Ф, Мурата Ю, Эгути Н, Ода Х, Урадэ Ю, Хаяиси О (февраль 1998 г.). «Синтаза простагландина D липокалинового типа в мужских репродуктивных органах и семенной плазме человека» . Биология размножения . 58 (2): 600–7. дои : 10.1095/biolreprod58.2.600 . ПМИД   9475419 .
• Сасо Л., Леоне М.Г., Соррентино С., Джакомелли С., Сильвестрини Б., Грима Дж., Ли Дж.К., Сами Э., Мрук Д., Ченг С.И. (ноябрь 1998 г.). «Количественное определение синтетазы простагландина D в спинномозговой жидкости: потенциальный маркер опухоли головного мозга» . Международная биохимия и молекулярная биология . 46 (4): 643–56. дои : 10.1080/15216549800204172 . ПМИД   9844724 . S2CID   29770550 .
• Блёдорн Б., Брюк В., Тумани Х., Мишель У., Рикманн П., Альтанс Н., Мэдер М. (сентябрь 1999 г.). «Экспрессия бета-следового белка в пахименинксе человека, выявленная с помощью гибридизации in situ и иммуноцитохимии». Журнал нейробиологических исследований . 57 (5): 730–4. doi : 10.1002/(SICI)1097-4547(19990901)57:5<730::AID-JNR14>3.0.CO;2-7 . ПМИД   10462696 . S2CID   23555031 .
• Пинзар Э., Канаока Ю., Инуи Т., Эгучи Н., Ураде Ю., Хаяиши О. (апрель 2000 г.). «Ген простагландин-D-синтазы участвует в регуляции сна с медленными движениями глаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (9): 4903–7. Бибкод : 2000PNAS...97.4903P . дои : 10.1073/pnas.090093997 . ЧВК   18330 . ПМИД   10781097 .

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P41222 (D-изомераза простагландина-H2 человека) в PDBe-KB .
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O09114 (D-изомераза простагландина-H2 мыши) на PDBe-KB .