Гаплогруппа C-F3393
| Гаплогруппа C1 F3393 | |
|---|---|
| Возможное время происхождения | около 49 200 лет назад [ 1 ] |
| Возможное место происхождения | Западная Азия [ 2 ] [ 3 ] |
| Предок | Гаплогруппа c |
| Потомки | C1A CTS11043 ( C1A1 M8; C1A2 (ранее C6) V20) C1B1A B66/Z16458; C1B1A1 M356 (ранее C5) C1B2 C-B477 (C1B2A M38 (ранее C2); C1B2A1A P33; C1B2B (ранее C4) M347) |
| Определение мутаций | F3393 |
Гаплогруппа C1, также известная как C-F3393 , является основной Y-хромосомы гаплогруппой . Это одна из двух основных ветвей более широкой гаплогруппы C , а другая -C2 (также известный как C-M217; первая гаплогруппа C3).
Базальный параграп , C1* (C-F3393*), не был найден в образцах от живых или мертвых мужчин.
Из двух основных ветвей C1b распространен в некоторых частях Океании и Азии . Другая основная ветвь, C1A, чрезвычайно редка во всем мире и была обнаружена в основном среди людей, родом из Японии или Европы и среди верхних палеолитических европейцев, с отдельными случаями, известными из Непала [ 4 ] и остров Чеджу [ 5 ] Через академические исследования и из этнического армянского , этнического кабила и этнического хана из Лингхай посредством коммерческих испытаний.
Распределение
[ редактировать ]
Подклады C1 (C-F3393) являются преобладающими гаплогруппами Y-ДНК среди некоторых коренных австралийских народов, некоторых народов островов Тихого океана и некоторых из этнических групп меньших островов Сунда в Индонезии. Другие подклады обнаруживаются на очень низких частотах, в изолированных местах по всей евразийской суши и прилегающих островах.
C1A (CTS11043)
[ редактировать ]Базальный C1A* (CTS11043) был обнаружен у верхних палеолитических европейцев ( Aurignacians ), GoyetQ116-1 и Pestera muerii2. [ 6 ]
Среди наиболее интересных результатов недавних генетических исследований заключается в том, что живые члены C1A также редки и географически распределены по чрезвычайно раздвоенной модели.
C1A1 или C-M8 теперь регулярно обнаруживаются только с низкой частотой (приблизительно от 5% до 6% всех образцов) в Японии . [ 7 ] Это также было обнаружено спорадически среди тысяч мужчин из Кореи и сотен тысяч мужчин из Китая, у которых была проверка Y-ДНК. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 5 ]
C1A2 (известный ранее как C6) или C-V20 , по-видимому, встречаются только среди европейских , алжирских , турок , армянских и непальских мужчин. [ 12 ] [ 4 ]
C1A2 присутствовал в остатках в Европе верхним палеолитом , включая кластер Vestonice (Vestonice16) (то есть остается в современной Чешской Республике). Он также был обнаружен в 7000-летних ( мезолитических ) останках WHG ( западных охотников-собирателей ), известных как «La Braña 1», найденный в La Braña-Arintero, León , Испания. [ 13 ] La Braña 1 был частью так называемого кластера Villabruna , названного в честь места в северо-востоке Италии. Однако ко времени кластера Villabruna доминирующей гаплогруппой Y-ДНК в Западной Европе была I2 . (И баланс снова был изменен в результате массовых миграций в Европу неолитических ближневосточных фермеров и индо-европейцев бронзового века.) [ 14 ] [ 15 ] Кроме того: мужчина из Великой Венгерской равнины , примерно современной до человека Ла -Бранья, также несла его, [ 7 ] [ 16 ] Как и 30 000-летняя останки охотника за кластером Vestonice из района Павлов-Дольни Весстонис ( Чешская Республика ), [ 17 ] а также 34 000 лет российских охотников из Сунгира (Сангир 1/2/3/4). [ 18 ]
C1b (F1370)
[ редактировать ]Базальный C1b* (F1370) был идентифицирован в останках человека, известного как Костенки-14 , который умер около 37 000 лет BP ( верхний палеолит ), который был найден в археологическом месте Костионки в Западной России. Это также было найдено в небольшом количестве мужчин с Ближнего Востока . [ 19 ]
C1B2 (C-B477) является общим предком C-M38 и C-M347.
Вполне вероятно, что более 40% коренных австралийских мужчин, прежде чем контакт с европейскими поселенцами, принадлежали к подкладу C1B2B (C-M347), известным ранее как C4 . [ 20 ] В пределах C-M347 были идентифицированы по меньшей мере два подклада: C1B2B1 (DYS390.1DEL, M210) и еще неразрешенное ответвление парагруппы C1B2B1 (IE M347XDYS390.1DEL, M210).
C1B2A (M38), ранее известный как C2 , практически ограничен островной Юго -Восточной Азией , Новой Гвинее , Меланезией и Полинезии . [ 7 ] Из своих подкладов C1B2A1A (P33) обнаруживается на высокой частоте среди полинезийцев . [ 21 ] [ 22 ]
некоторые члены популяций в частях Азии Было обнаружено, что несут Y-ДНК, которая принадлежит гаплогруппе C1B1-AM00694/K281. C1B1B-B68 был найден в Дусуне в Брунее . [ 23 ] C1B1A-B66/Z16458 имеет три основных подклада: C1B1A1-M356, C1B1A2-B65 и C1B1A3-Z16582. C1B1A3-Z16582 был обнаружен у некоторых людей из Саудовской Аравии и Ирака . C1B1A2-B65 включает в себя два подклада, C1B1A2A-B67 и C1B1A2B-F725. C1B1A2A-B67 был найден у двух жителей Леббо из Борнео , [ 23 ] Люди Hadaway Fresh в книгах , [ 24 ] и четыре человека из Flores (один из Rampasasa и три из Cibal). [ 24 ] По оценкам, TMRCA C-B67 составит 17 007 (95% CI 19 608 <-> 14 627) лет до настоящего времени, а отдельные лица Леббо от Борнео принадлежат к филиалу, которая является базальной для остальных. [ 24 ] C1B1A2B-F725 был найден в Ханьском китайском языке в Китае ( Гуандун , Хунань и Шаньси ), народ Дай в Юньнане , Мурут в Брунее , [ 23 ] Малайцы в Сингапуре , [ 23 ] и люди на Филиппинах AETA [ 23 ] C1B1A1-M356 был обнаружен с общей низкой частотой в Южной Азии , Центральной Азии и Юго-Западной Азии . [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ]
Филогенетическая структура
[ редактировать ]- C1 F3393
- C1A CTS11043
- C1A1 M8 Япония , Китай , Южная Корея , Северная Корея
- C1A1A P121
- C1A1A1 CTS9336
- C1A1A1A CTS6678 Япония, Южная Корея
- C1A1A1B Z1356 Япония
- C1A1A2 Z45460 Китай (Liaoning)
- C1A1A1 CTS9336
- C1A1A P121
- C1A2 (ранее C6) V20
- C1A2A V182
- C1A2A1 V222 Великобритания, Италия (Калабрия), Греция, Венгрия, Украина
- C-Y12152 Шотландия
- C-BY1117 Венгрия, Англия
- C-Y11695 Италия, Греция, Украина
- C-BY67541 Италия, Германия
- C-Y12152 Шотландия
- C1A2A2 Z29329 Испания, Польша
- C1A2A1 V222 Великобритания, Италия (Калабрия), Греция, Венгрия, Украина
- C1A2B Z388888/F16270/PH428 Литва, Ирландия, Англия, Алжир, армяне
- C-Z44576 Алжир
- C-Z44526/F15182 Англия, Армянский
- C1A2A V182
- C1A1 M8 Япония , Китай , Южная Корея , Северная Корея
- C1B F1370
- C1B1 K281
- C1B1A B66 / Z16458
- C-K176
- C1B1A2 B65
- C1B1A3 Z16582 Саудовская Аравия, Ирак
- C1B1B B68 Borneo
- C1B1A B66 / Z16458
- C1B2 B477/Z31885
- C1B2A (ранее C2) M38
- C1B2A1 M208
- C1B2A1A P33 Полинезия
- C1b2a1b P54
- C1B2A1 M208
- C1b2b (previously C4) M347 Australia
- C1b2b1 M210
- C1B2A (ранее C2) M38
- C1B1 K281
- C1A CTS11043
See also
[edit]
Footnotes
[edit]- ^ C-F3393 tree, Yfull
- ^ 崎谷満『DNA・考古・言語の学際研究が示す新・日本列島史』（勉誠出版 2009年）(in Japanese)
- ^ Hallast, Pille; Agdzhoyan, Anastasia; Balanovsky, Oleg; Xue, Yali; Tyler-Smith, Chris (2021). "A Southeast Asian origin for present-day non-African human y chromosomes". Human Genetics. 140 (2): 299–307. doi:10.1007/s00439-020-02204-9. PMC 7864842. PMID 32666166.
- ^ Jump up to: a b Hallast P, Batini C, Zadik D, Maisano Delser P, Wetton JH, Arroyo-Pardo E, et al. (March 2015). "The Y-chromosome tree bursts into leaf: 13,000 high-confidence SNPs covering the majority of known clades". Molecular Biology and Evolution. 32 (3): 661–73. doi:10.1093/molbev/msu327. PMC 4327154. PMID 25468874.
- ^ Jump up to: a b Soon-Hee Kim, Ki-Cheol Kim, Dong-Jik Shin, Han-Jun Jin, Kyoung-Don Kwak, Myun-Soo Han, Joon-Myong Song, Won Kim, and Wook Kim (2011), "High frequencies of Y-chromosome haplogroup O2b-SRY465 lineages in Korea: a genetic perspective on the peopling of Korea." Investigative Genetics 2011, 2:10. http://www.investigativegenetics.com/content/2/1/10
- ^ Fu, Q.; Posth, C.; Hajdinjak, M.; Petr, M.; Mallick, S.; Fernandes, D.; Furtwängler, A.; Haak, W.; Meyer, M.; Mittnik, A.; Nickel, B.; Peltzer, A.; Rohland, N.; Slon, V.; Talamo, S.; Lazaridis, I.; Lipson, M.; Mathieson, I.; Schiffels, S.; Skoglund, P.; Derevianko, A. P.; Drozdov, N.; Slavinsky, V.; Tsybankov, A.; Cremonesi, R. G.; Mallegni, F.; Gély, B.; Vacca, E.; González Morales, M. R.; et al. (2016). "The genetic history of Ice Age Europe". Nature. 534 (7606): 200–205. Bibcode:2016Natur.534..200F. doi:10.1038/nature17993. PMC 4943878. PMID 27135931.
- ^ Jump up to: a b c ISOGG, 2015 "Y-DNA Haplogroup C and its Subclades – 2015" (15 September 2015).
- ^ Phylogenetic tree of haplogroup C-M8/C-M105 according to FamilyTreeDNA
- ^ Phylogenetic tree of haplogroup C-M8 according to YFull
- ^ Jump up to: a b Phylogenetic tree of haplogroup C-F3393 according to 23mofang
- ^ Jump up to: a b Phylogenetic tree of haplogroup C-F3393 according to TheYtree
- ^ Scozzari R, Massaia A, D'Atanasio E, Myres NM, Perego UA, Trombetta B, Cruciani F (202). "Molecular dissection of the basal clades in the human Y chromosome phylogenetic tree". PLOS ONE. 7 (11): e49170. Bibcode:2012PLoSO...749170S. doi:10.1371/journal.pone.0049170. PMC 3492319. PMID 23145109.
- ^ "Dienekes' Anthropology Blog: Brown-skinned, blue-eyed, Y-haplogroup C-bearing European hunter-gatherer from Spain (Olalde et al. 2014)". 26 January 2014.
- ^ Gibbons, Ann (2017). "There's no such thing as a 'pure' European—or anyone else". Science. doi:10.1126/science.aal1186.
- ^ Siska V, Jones ER, Jeon S, Bhak Y, Kim HM, Cho YS, Kim H, Lee K, Veselovskaya E, Balueva T, Gallego-Llorente M, Hofreiter M, Bradley DG, Eriksson A, Pinhasi R, Bhak J, Manica A (February 2017). "Genome-wide data from two early Neolithic East Asian individuals dating to 7700 years ago". Science Advances. 3 (2): e1601877. Bibcode:2017SciA....3E1877S. doi:10.1126/sciadv.1601877. PMC 5287702. PMID 28164156.
- "Ancient DNA reveals 'genetic continuity' between Stone Age and modern populations in East Asia". University of Cambridge Research. February 1, 2017.
- ^ Haak W, Lazaridis I, Patterson N, Rohland N, Mallick S, Llamas B, et al. (June 2015). "Massive migration from the steppe was a source for Indo-European languages in Europe". Nature. 522 (7555): 207–11. arXiv:1502.02783. Bibcode:2015Natur.522..207H. doi:10.1038/nature14317. PMC 5048219. PMID 25731166.
- ^ Fu Q, Posth C, Hajdinjak M, Petr M, Mallick S, Fernandes D, et al. (June 2016). "The genetic history of Ice Age Europe". Nature. 534 (7606): 200–5. Bibcode:2016Natur.534..200F. doi:10.1038/nature17993. PMC 4943878. PMID 27135931.
- ^ Sikora M, Seguin-Orlando A, Sousa VC, Albrechtsen A, Korneliussen T, Ko A, et al. (November 2017). "Ancient genomes show social and reproductive behavior of early Upper Paleolithic foragers". Science. 358 (6363): 659–662. Bibcode:2017Sci...358..659S. doi:10.1126/science.aao1807. PMID 28982795.
- ^ "Haplogroup C Project". Archived from the original on 2022-07-22. Retrieved 2017-07-23.
- ^ Hudjashov G, Kivisild T, Underhill PA, Endicott P, Sanchez JJ, Lin AA, Shen P, Oefner P, Renfrew C, Villems R, Forster P (May 2007). "Revealing the prehistoric settlement of Australia by Y chromosome and mtDNA analysis". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (21): 8726–30. Bibcode:2007PNAS..104.8726H. doi:10.1073/pnas.0702928104. PMC 1885570. PMID 17496137.
- ^ Hammer MF, Karafet TM, Park H, Omoto K, Harihara S, Stoneking M, Horai S (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". Journal of Human Genetics. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
- ^ Cox MP, Redd AJ, Karafet TM, Ponder CA, Lansing S, Sudoyo H, Hammer MF (October 2007). "A Polynesian motif on the Y chromosome: population structure in remote Oceania". Human Biology. 79 (5): 525–35. doi:10.1353/hub.2008.0004. hdl:1808/13585. PMID 18478968. S2CID 4834817.
- ^ Jump up to: a b c d e Karmin M, Saag L, Vicente M, Wilson Sayres MA, Järve M, Talas UG, et al. (April 2015). "A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture". Genome Research. 25 (4): 459–66. doi:10.1101/gr.186684.114. PMC 4381518. PMID 25770088.
- ^ Jump up to: a b c d e f Monika Karmin, Rodrigo Flores, Lauri Saag, Georgi Hudjashov, Nicolas Brucato, Chelzie Crenna-Darusallam, Maximilian Larena, Phillip L Endicott, Mattias Jakobsson, J Stephen Lansing, Herawati Sudoyo, Matthew Leavesley, Mait Metspalu, François-Xavier Ricaut, and Murray P Cox, "Episodes of Diversification and Isolation in Island Southeast Asian and Near Oceanian Male Lineages," Molecular Biology and Evolution, Volume 39, Issue 3, March 2022, https://doi.org/10.1093/molbev/msac045
- ^ Gayden T, Cadenas AM, Regueiro M, Singh NB, Zhivotovsky LA, Underhill PA, Cavalli-Sforza LL, Herrera RJ (May 2007). "The Himalayas as a directional barrier to gene flow". American Journal of Human Genetics. 80 (5): 884–94. doi:10.1086/516757. PMC 1852741. PMID 17436243.
- ^ Fornarino S, Pala M, Battaglia V, Maranta R, Achilli A, Modiano G, Torroni A, Semino O, Santachiara-Benerecetti SA (July 2009). "Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the Tharus (Nepal): a reservoir of genetic variation". BMC Evolutionary Biology. 9 (1): 154. Bibcode:2009BMCEE...9..154F. doi:10.1186/1471-2148-9-154. PMC 2720951. PMID 19573232.
- ^ Cadenas AM, Zhivotovsky LA, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA, Herrera RJ (March 2008). "Y-chromosome diversity characterizes the Gulf of Oman". European Journal of Human Genetics. 16 (3): 374–86. doi:10.1038/sj.ejhg.5201934. PMID 17928816.
- ^ Abu-Amero KK, Hellani A, González AM, Larruga JM, Cabrera VM, Underhill PA (September 2009). "Saudi Arabian Y-Chromosome diversity and its relationship with nearby regions". BMC Genetics. 10: 59. doi:10.1186/1471-2156-10-59. PMC 2759955. PMID 19772609.
- ^ Sengupta S, Zhivotovsky LA, King R, Mehdi SQ, Edmonds CA, Chow CE, Lin AA, Mitra M, Sil SK, Ramesh A, Usha Rani MV, Thakur CM, Cavalli-Sforza LL, Majumder PP, Underhill PA (февраль 2006 г. ) «Полярность и временность распределений Y-хромосом с высоким разрешением в Индии идентифицируют как коренные, так и экзогенные расширения, так и выявляют незначительное генетическое влияние пасторалистов центральной азиатской азиатской азиаты» . Американский журнал человеческой генетики . 78 (2): 202–21. doi : 10.1086/499411 . PMC 1380230 . PMID 16400607 .
- ^ Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Мейлерман М.Б., Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер Мф (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют и увеличивают разрешение человеческого хромосомного дерева гаплогруппы человека» . Исследование генома . 18 (5): 830–8. doi : 10.1101/gr.7172008 . PMC 2336805 . PMID 18385274 .
- ^ Лакау Х, Гейден Т., Регюро М., Ченнакришнайа С., Бухари А., Андерхилл П.А., Гарсия-Бертранд Р.Л., Эррера Р.Дж. (2012). «Афганистан с точки зрения Y-хромосомы» . Европейский журнал человеческой генетики . 20 (10): 1063–1070. doi : 10.1038/ejhg.2012.59 . PMC 3449065 . PMID 22510847 .
- ^ Peng MS, HE JD, Fan L, Liu J, Adeola AC, Wu SF, Murphy RW, Yao YG, Zhang YP (2013). «Получение Y -хромосомных гаплогруппных деревьев с использованием данных GWAS» . Европейский журнал человеческой генетики . 22 (8): 1046–1050. doi : 10.1038/ejhg.2013.272 . PMC 4350590 . PMID 24281365 .
- ^ Brunelli A, Kampuansai J, Seielstad M, Lomthaisong K, Kangwanpong D, Ghirotto S, et al. (2017). «Y -хромосомные данные о происхождении северного тайского народа» . Plos один . 12 (7): E0181935. BIBCODE : 2017PLOSO..1281935B . doi : 10.1371/journal.pone.0181935 . PMC 5524406 . PMID 28742125 .