Темпл Ф. Смит
Темпл Смит | |
|---|---|
 Темпл Смит в Йельском университете в 2008 году. | |
| Рожденный | Темпл Феррис Смит 7 марта 1939 г. ( 85 лет) Оберн, Нью-Йорк |
| Альма-матер |
|
| Известный | Алгоритм Смита-Уотермана [ 3 ] |
| Награды |
|
| Научная карьера | |
| Учреждения | Бостонский университет |
| Диссертация | Амплитуды дейтронов из теории ядерного рассеяния составных частиц (1969) |
| Веб-сайт | www |
Темпл Феррис Смит (родился 7 марта 1939 г.) - почетный профессор биомедицинской инженерии. [ 4 ] [ 5 ] помог разработать алгоритм Смита-Уотермана который вместе с Майклом Уотерманом в 1981 году. [ 3 ] Алгоритм Смита-Уотермана служит основой для сравнений нескольких последовательностей, определяя сегмент с максимальным локальным сходством последовательностей, см. выравнивание последовательностей . Этот алгоритм используется для идентификации схожих сегментов ДНК , РНК и белков . Он был директором [ когда? ] Научно-исследовательского центра биомолекулярной инженерии [ 4 ] в Бостонском университете двадцать лет и сейчас [ когда? ] профессор emeritusпочетный
Образование
[ редактировать ]Смит получил степень бакалавра в 1963 году на физическом факультете Университета Пердью , а затем в 1969 году получил степень доктора философии на физическом факультете Университета Колорадо в Боулдере . [ 6 ]
Исследования и карьера
[ редактировать ]После получения докторской степени Смит с марта 1969 по август 1971 года проводил постдокторские исследования на факультете биофизики и генетики Медицинской школы Университета Колорадо в Боулдере. [ нужна ссылка ]
Его исследования сосредоточены на применении различных компьютерных и математических методов для открытия синтаксических и семантических закономерностей в последовательностях нуклеиновых кислот и аминокислот. В последние годы основное внимание уделяется молекулярной эволюции семейств белков. такие как бета-пропеллеры WD-повторения, ассоциированная с трансляцией ГТФаза и рибосомальные белки. [ 7 ] Он известен созданием алгоритма Смита-Уотермана . [ 3 ]
Смит занимал следующие должности:
- 1965–1966: инструктор ВВС США Лоури, Денвер, Колорадо.
- 1971–1984: профессор кафедры физики Университета Северного Мичигана, Маркетт, Мичиган.
- 1985–1991: директор Ресурса компьютерных исследований молекулярной биологии, Институт рака Дана-Фарбер, Гарвардская медицинская школа и Гарвардская школа общественного здравоохранения.
- 1991–2009: директор Ресурсного центра биомолекулярной инженерии Бостонского университета.
- 1999–: Соорганизатор Дня открытия биотехнологии Института академического развития молодежи 1999 г.
- 2000–: Соучредитель и директор по информационным технологиям Modular Genetics, Inc.
- 2000–: Тренер юношеской хоккейной команды. [ нужна ссылка ]
Избранные публикации
[ редактировать ]- М. Мариотти, Т.Ф. Смит, П.Х. Судмант и Г. Голдбергер, «Псевдогенизация специфичного для семенников Lfg5 предшествует расхождению человека и неандертальца», Journal of Human Genetics 59, 288–291 (2014).
- Хайман Хартман и Темпл Ф. Смит «Эволюция рибосомы и генетического кода», Life, 4 (2), 227–249 (2014).
- Хартман, Х. и Т.Ф. Смит, «ГТФазы и происхождение рибосомы», Biology Direct, 5:36-39, (2010).
- Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. «Эволюция ресничек и эукариотической клетки». Подвижность клеток и цитоскелет. 66: 215-219. (2009)
- Ху, Лан, Смит, Темпл Ф. и Голдбергер, Габриэль. «LFG: семейство генов-кандидатов, регулирующих апоптоз». Апоптоз. 14: 1255–1265. (2009)
- Смит, Темпл Ф., Ли, Юнг К., Гутелл, Робин Р. и Хартман, Хайман. «Происхождение и эволюция рибосомы» Biology Direct 3: 16, 1–13 (2008).
- Смит, Темпл Ф. «Глава 2: Разнообразие белков с WD-повторением» Семейство белков Коронин, 20–30 (2008)
- Бхуткар, Арджун В., Гелбарт, Уильям М. и Смит, Темпл Ф. (2007). Вывод о филогении перестройки масштаба генома и порядке предков генов: исследование случая дрозофилы. Геномная биология 8, R236
- Бхуткар, Арджун, Руссо, Сьюзен М., Смит, Темпл Ф. и Гелбарт, Уильям М. «Геномный анализ позиционно перемещенных генов» Genome Research 17: 1880-1887 (2007)
- Хартман, Хайман, Фаваретто, Паола и Смит, Темпл Ф. «Архейное происхождение эукариотической системы трансляции» Archaea 2: 1-9 (2006)
- Бьенковска, Ядвига, Хартман, Хайман и Смит, Темпл Ф. (2003). Метод поиска гомологов малых белков, убиквитиноподобных белков в прокариотических клетках? Белковая инженерия 16 (12), 897–904.
- Венкатесан, Кавита, Макманус, Хизер Р., Мелло, Крейг К., Смит, Темпл Ф. и Хансен, Улла. (2003). Функциональная консервативность между членами древнего семейства дуплицированных факторов транскрипции, LSF/Grainyhead. Исследования нуклеиновых кислот 31 (15), 4304–4316.
- Чжан YX1, Фокс Дж.Г., Хо Ю, Чжан Л., Стиллз Х.Ф.-младший, Смит Т.Ф. Сравнение гена главного белка внешней мембраны (MOMP) мышиного пневмонита (MoPn) и хомячковых штаммов SFPD Chlamydia trachomatis с другими штаммами Chlamydia. Мол Биол Эвол. Ноябрь 1993 г.; 10 (6): 1327–42.
- Фигге Дж., Смит Т.Ф. Мотив последовательности деления клеток. Nature 334 (6178), 109 (14 июля 1988 г.) |pmid=3290690 |doi=10.1038/334109a0.
Награды и почести
[ редактировать ]Смит был награжден премией старшего ученого ISCB. [ 1 ] и избран членом ISCB в 2009 году Международным обществом вычислительной биологии . [ 2 ]
В 2002 году он был принят в Американский институт медицинской и биологической инженерии (AIMBE) «за выдающийся вклад в определение и развитие области биоинформатики с упором на новые инженерные методы прогнозирования структуры и функции белка». [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Мейзел, М. (2007). «ISCB чтит Темпла Ф. Смита и Эрана Сигала» . PLOS Вычислительная биология . 3 (6): е128. Бибкод : 2007PLSCB...3..128M . дои : 10.1371/journal.pcbi.0030128 . ПМК 1904388 . ПМИД 17604447 .
- ^ Jump up to: а б «Стипендиаты ISCB» . iscb.org . Международное общество вычислительной биологии . 2017. Архивировано из оригинала 20 марта 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с Смит, Т.; Уотерман, М.С. (1981). «Идентификация общих молекулярных подпоследовательностей». Журнал молекулярной биологии . 147 (1): 195–197. CiteSeerX 10.1.1.63.2897 . дои : 10.1016/0022-2836(81)90087-5 . ПМИД 7265238 .
- ^ Jump up to: а б «Исследовательский центр биомолекулярной инженерии | Бостонский университет» . Bmerc-www.bu.edu . Проверено 24 марта 2017 г.
- ^ «Темпл Смит» . Архивировано из оригинала 7 июля 2007 г. Проверено 3 мая 2007 г.
- ^ Смит, Темпл Феррис (1969). Амплитуды дейтронов из теории ядерного рассеяния составных частиц (кандидатская диссертация). Университет Колорадо в Боулдере. OCLC 50252533 . ПроКвест 302393082 .
- ^ «Темпл Ф. Смит, доктор философии »Микробиология »BUMC» . Архивировано из оригинала 4 апреля 2012 г. Проверено 28 октября 2011 г.
