Гаплогруппа О-М268
В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
Гаплогруппа О-М268 | |
---|---|
Возможное время происхождения | 34 100 или 29 200 лет назад [ 1 ] 33 181 [95% ДИ 36 879 <-> 24 461] лет назад [ 2 ] 30 100 [95% ДИ 27 800 <-> 32 400] лет назад [ 3 ] |
Возраст слияния | 31 108 [95% ДИ 34 893 <-> 22 844] лет назад [ 2 ] |
Возможное место происхождения | Юго-Восточная Азия или Восточная Азия [ 3 ] |
Предок | О1 (О-F265) |
Потомки | O1b1 (K18), O1b2 (P49/ https://en.wikipedia.org/wiki/Draft:Haplogroup_O-M176 ) |
Определение мутаций | P31, M268, L690/F167, F256/M1341, Y9038/FGC19644, L463/F330, M1461, F138, Y9317, FGC55566, F292/M1363, CTS4164, CTS6713/M1396, CTS5785/M1377, F435/M1417, F516, M1455 |
Самые высокие частоты | Австроазиатскоязычные народы , тайские народы , хлай , балийцы , яванцы , японцы , рюкюанцы , корейцы , малагасийцы |
В генетике человека гаплогруппа O-M268 , также известная как O1b (ранее гаплогруппа O2), представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Гаплогруппа O-M268 является основным субкладом гаплогруппы O-F265 , которая сама по себе является основной потомковой ветвью гаплогруппы O-M175 .
Источник
[ редактировать ]В статье, опубликованной в 2011 году группой китайских исследователей, связанных с Фуданьским университетом , было высказано предположение, что Китай является источником распространения гаплогруппы O-P31 (там она называется гаплогруппой O2-M268). [ 4 ]
Распределение
[ редактировать ]Гаплогруппа О-Р31 отличается особенностями географического распространения. Как и все клады гаплогруппы O-M175, гаплогруппа O-P31 встречается только среди мужчин современных популяций Восточной Евразии . Однако гаплогруппа O-P31 обычно встречается с высокой частотой только среди определенных популяций, таких как австроазиатские народы Индии, Бангладеш и Юго-Восточной Азии, никобарцы Никобарских островов в Индийском океане, корейцы и японцы .
Помимо широкого и неоднородного распространения, гаплогруппа O1b-P31 также примечательна тем, что ее можно разделить на два основных субклада, которые демонстрируют почти полностью разрозненное распространение: O1b1-M1304/K18 и O1b2-M176/P49. Один из этих субкладов, O1b1-M1304/K18 (также известный как O-F2320), в основном можно разделить на два субклада: O1b1a1-PK4 (ранее O2a) и O1b1a2-CTS4040 (ранее O2*(xM95,M176)). O1b1a1-PK4 встречается главным образом среди популяций Юго-Восточной Азии и некоторых племенных популяций Индии (таких как ремо , жуанг и никобарцы ), но он также распространен среди этнических меньшинств на юге Китая и встречается с низкой частотой по всей территории. Китае, а также в Японии. O1b1a2-CTS4040 относительно редок и в основном распространен в Восточной Азии, особенно в Китае , где он составляет примерно 3,22% мужского населения страны. [ 5 ] Другой первичный субклад гаплогруппы O1b-P31, то есть гаплогруппа O1b2-M176 (ранее O2b), встречается примерно у одной трети современных японских и корейских мужчин и с низкой частотой (примерно 0,70%). [ 6 ] ) у китайских мужчин.
Филогенетика
[ редактировать ]Филогенетическая история
[ редактировать ]До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть прежде всего своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
YCC 2002/2008 (сокращенно) | (а) | (б) | (с) | (г) | (е) | (г) | (или) | YCC 2002 (от руки) | YCC 2005 (от руки) | YCC 2008 (от руки) | YCC 2010r (от руки) | ИСОГГ 2006 г. | ИСОГГ 2007 | ИСОГГ 2008 | ИСОГГ 2009 | ИСОГГ 2010 | ИЗОГГ 2011 | ИЗОГГ 2012 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
О-М175 | 26 | VII | 1U | 28 | ЕС16 | Н9 | я | Т* | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО | ТО |
О-М119 | 26 | VII | 1U | 32 | ЕС16 | Н9 | ЧАС | О1* | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а | О1а |
О-М101 | 26 | VII | 1U | 32 | ЕС16 | Н9 | ЧАС | О1а | О1а1 | О1а1а | О1а1а | О1а1 | О1а1 | О1а1а | О1а1а | О1а1а | О1а1а | О1а1а |
О-М50 | 26 | VII | 1U | 32 | ЕС16 | Н10 | ЧАС | О1б | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 | О1а2 |
О-П31 | 26 | VII | 1U | 33 | ЕС16 | Н5 | я | О2* | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 | О2 |
О-М95 | 26 | VII | 1U | 34 | ЕС16 | H11 | Г | О2а* | О2а | О2а | О2а | О2а | О2а | О2а | О2а | О2а | О2а1 | О2а1 |
О-М88 | 26 | VII | 1U | 34 | ЕС16 | Н12 | Г | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1 | О2а1а | О2а1а |
O-SRY465 | 20 | VII | 1U | 35 | ЕС16 | Н5 | я | O2b* | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б | О2б |
О-47з | 5 | VII | 1U | 26 | ЕС16 | Н5 | я | O2b1 | O2b1a | O2b1 | O2b1 | O2b1a | O2b1a | O2b1 | O2b1 | O2b1 | O2b1 | O2b1 |
О-М122 | 26 | VII | 1U | 29 | ЕС16 | Н6 | л | О3* | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 | О3 |
О-М121 | 26 | VII | 1U | 29 | ЕС16 | Н6 | л | О3а | О3а | О3а1 | О3а1 | О3а1 | О3а1 | О3а1 | О3а1 | О3а1 | О3а1а | О3а1а |
О-М164 | 26 | VII | 1U | 29 | ЕС16 | Н6 | л | О3б | О3б | О3а2 | О3а2 | О3а2 | О3а2 | О3а2 | О3а2 | О3а2 | O3a1b | O3a1b |
О-М159 | 13 | VII | 1U | 31 | ЕС16 | Н6 | л | O3c | O3c | О3а3а | О3а3а | О3а3 | О3а3 | О3а3а | О3а3а | О3а3а | О3а3а | О3а3а |
О-М7 | 26 | VII | 1U | 29 | ЕС16 | H7 | л | O3d* | O3c | О3а3б | О3а3б | О3а4 | О3а4 | О3а3б | О3а3б | О3а3б | O3a2b | O3a2b |
О-М113 | 26 | VII | 1U | 29 | ЕС16 | H7 | л | O3d1 | O3c1 | О3а3б1 | О3а3б1 | - | О3а4а | О3а3б1 | О3а3б1 | О3а3б1 | О3а2б1 | О3а2б1 |
О-М134 | 26 | VII | 1U | 30 | ЕС16 | Н8 | л | O3e* | О3д | O3a3c | O3a3c | О3а5 | О3а5 | O3a3c | O3a3c | O3a3c | O3a2c1 | O3a2c1 |
О-М117 | 26 | VII | 1U | 30 | ЕС16 | Н8 | л | o3e1* | O3d1 | O3a3c1 | O3a3c1 | О3а5а | О3а5а | O3a3c1 | O3a3c1 | O3a3c1 | O3a2c1a | O3a2c1a |
О-М162 | 26 | VII | 1U | 30 | ЕС16 | Н8 | л | O3e1a | O3d1a | O3a3c1a | O3a3c1a | О3а5а1 | О3а5а1 | O3a3c1a | O3a3c1a | O3a3c1a | O3a2c1a1 | O3a2c1a1 |
Оригинальные исследовательские публикации
[ редактировать ]Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.
Филогенетические деревья
[ редактировать ]Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 ( Карафет 2008 ) и последующих опубликованных исследованиях.
- О-П31 (П31, М268)
- О-К18
- O-CTS4040 В основном встречается в ханьском китайском языке и иногда встречается в китайском (дай), маньчжурском, Таиланде ( фуан , тайюань , тайский ), Вьетнаме, на Филиппинах, в Западном Калимантане , Катаре , Хазаре , Японии, Корее.
- О-ПК4
- O-F838 найден в ханьском китайском языке. [ 4 ] [ 7 ] и в экземпляре из средневекового Южного Казахстана, приписываемом тюркам ; [ 8 ] Вероятно, также присутствует в Таиланде ( Калеун , Фуан , Таиланд ), [ 9 ] Ханой , [ 7 ] Амбон , [ 7 ] Регион Иравади , [ 10 ] и уезд Синьлун [ 11 ]
- О-М95 (М95)
- О-CTS350
- O-CTS350* найден в Японии.
- O-CTS10007 Найдено у ханьцев в провинции Хунань.
- О-М1310
- О-F1252
- O-SK1630/F5504 Китай ( Шэньси ), [ 3 ] Russia ( Ryazan Oblast ) [ 3 ]
- О-SK1636
- О-F2924
- O-CTS5854 Встречается в Китае (Хань, Дай ), Лаосе, Таиланде, Японии и на Филиппинах.
- О-М88 (М88, М111) Встречается во Вьетнаме, Лаосе, Таиланде, Камбодже, Мьянме, Китае (Дай, Буи, Чжуан, Ли, Шуй, Ше, Мяо, Яо, Деанг, Булан, Цян, Туцзя, Лису, Ачан, Ну, Лаху, Цзинуо, Хани, Йи, Бай, Хан), Тайвань (Хан, Бунун, Ями), Ява, Борнео, Малайзия, Филиппины
- O-SK1630/F5504 Китай ( Шэньси ), [ 3 ] Russia ( Ryazan Oblast ) [ 3 ]
- O-F789/M1283 Встречается в Китае, Вьетнаме, Камбодже, Сингапуре (Малайский), [ 12 ] Индонезия, Лаос, Таиланд, Мьянма, Бутан, [ 13 ] Бангладеш и Индия
- О-F1252
- О-CTS350
- O-P49 (M176, SRY465, P49, 022454) Япония, [ 14 ] Южная Корея, [ 14 ] Китай, [ 14 ] Монголия, [ 14 ] Вьетнам, [ 14 ] Микронезия [ 14 ]
- O-P49*(xPage92) Япония, Южная Корея
- О-страница92
- O-Page90 Япония ( Хиросима ), Цзилинь [ 3 ]
- О-CTS9259
- O-CTS562 Пекин ( Хань ), [ 3 ] Южная Корея , [ 15 ] Япония (Фукусима) [ 3 ]
- O-K10/F1204
- O-K10* Япония (Токио) [ 3 ] )
- O-CTS10687 Япония, [ 14 ] Монголия [ 14 ]
- O-K7/CTS11723/47z Встречается примерно у 24% японских мужчин и реже в Корее и Китае.
- О-К4
- O-K3/F940 Хунань ( Хань ), Цзянси, Хэнань (Хань)
- O-L682 Встречается примерно у 19% южнокорейских мужчин. [ 16 ] и с меньшей частотой в Японии и Китае
- О-К18
См. также
[ редактировать ]Генетика
[ редактировать ]Субклады Y-ДНК О
[ редактировать ]Основополагающее дерево Y-ДНК
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес и др. , «Периодические всплески демографических показателей мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Нат Жене. 2016 июнь; 48 (6): 593–599. дои: 10.1038/ng.3559.
- ^ Jump up to: а б Моника Кармин, Родриго Флорес, Лаури Сааг, Георгий Худжашов, Николас Брукато, Челзи Кренна-Дарусаллам, Максимилиан Ларена, Филлип Л. Эндикотт, Маттиас Якобссон, Дж. Стивен Лансинг, Херавати Судойо, Мэттью Ливсли, Мейт Метспалу, Франсуа-Ксавье Рико и Мюррей П. Кокс, «Эпизоды диверсификации и изоляции в мужских линиях островной Юго-Восточной Азии и Ближнего Океании», «Молекулярная биология и эволюция» , том 39, выпуск 3, март 2022 г., msac045, https://doi.org/10.1093/molbev/msac045
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб и объявление но из в ах есть также и аль являюсь а к ап ак с как в В из хорошо YПолная гаплогруппа YTree v5.04, 16 мая 2017 г.
- ^ Jump up to: а б Ши Янь, Чуан-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Лин Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновленное дерево гаплогруппы O Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические положения мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; doi:10.1038/ejhg.2011.64
- ^ «Подробности о гаплогруппе O-Cts4040» .
- ^ «Подробности о гаплогруппе O-P49» .
- ^ Jump up to: а б с Жан А. Трежо, Эстелла С. Полони, Джу-Чен Йен и др. (2014), «Вариации ДНК Y-хромосомы Тайваня и ее связь с островами Юго-Восточной Азии». БМК Генетика 2014, 15:77. http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
- ^ Питер де Баррос Дамгаард, Нина Марчи, Саймон Расмуссен и др. (2018), «137 геномов древнего человека со всех концов евразийских степей». Nature , том 557, страницы 369–374 (2018). https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
- ^ Вибху Кутанан, Джатупол Кампуансай, Метави Срикуммул, Андреа Брунелли, Сильвия Гиротто, Леонардо Ариас, Энрико Махольдт, Александр Хюбнер, Роланд Шредер и Марк Стоункинг, «Сравнение отцовских и материнских генетических историй тайского и лаосского населения». Мол. Биол. Эвол. Публикация в предварительном доступе от 12 апреля 2019 г. два : 10.1093/molbev/msz083
- ^ Мин-Шэн Пэн, Цзюнь-Донг Хэ, Лонг Фань и др. (2013), «Извлечение деревьев гаплогрупп Y-хромосомы с использованием данных GWAS». Европейский журнал генетики человека (2013), 1–5. doi:10.1038/ejhg.2013.272
- ^ Ван CC, Ван LX, Шреста Р, Чжан М, Хуан XY и др. (2014), «Генетическая структура цянских популяций, проживающих в Западном Сычуаньском коридоре». PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
- ^ Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте и др. , «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре». Геномные исследования 25:1–8; ISSN 1088-9051/15; www.genome.org
- ^ Пилле Халласт, Кьяра Батини, Даниэль Задик и др. (2015), «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 SNP с высокой степенью достоверности, охватывающие большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция , март 2015 г.;32(3):661-73. doi:10.1093/molbev/msu327
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к Гаплодерево Y-ДНК и генеалогическое древо ДНК
- ^ O Проект Y-гаплогруппы в генеалогическом древе ДНК
- ^ Со Юн Квон, Хван Ён Ли, Ын Ён Ли, У Ик Ян и Кён-Джин Шин, «Подтверждение топологии дерева гаплогрупп Y с недавно предложенными Y-SNP для подгаплогрупп C2, O2b и O3a». Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 42–46. https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003
Сноски
[ редактировать ]Этот раздел пуст. Вы можете помочь, добавив к нему . ( февраль 2013 г. ) |
Цитируемые работы
[ редактировать ]Журналы
- Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; Чжан, Вейлин; Хорошо, Джошуа; Хуан, Вэй; Шен, Ди; и др. (1999). «Свидетельства Y-хромосомы о миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–24. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926 .
Веб-сайты
- «Описания гаплогрупп Y-ДНК» . Архивировано из оригинала 19 марта 2009 г.
Источники таблиц преобразования
[ редактировать ]- Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и др. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891 .
- Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360 .
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
- Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у влакс-рома, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД 11313742 . S2CID 21432405 .
- Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы» . Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299 . ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588 .
- Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, М.Ф. (2008), «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и повышают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека», Genome Research , 18 (5): 830–8, doi : 10.1101/gr.7172008 , PMC 2336805 , PMID 18385274
- Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494. 1155 , ПМИД 11073453
- Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685 . ПМИД 11062480 . S2CID 12893406 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Фирасат, Садаф; Халик, Шагуфта; Мохьюддин, Аиша; Папайоанну, Мирто; Тайлер-Смит, Крис; Андерхилл, Питер А; Аюб, Касим (2006). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана» . Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726 . ПМЦ 2588664 . ПМИД 17047675 .
- Форнарино, Симона; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Маранта, Рамона; Ахилли, Алессандро; Модиано, Гвидо; Торрони, Антонио; Семино, Орнелла; Сантакьяра-Бенерекетти, Сильвана А (2009). «Митохондриальное и Y-хромосомное разнообразие Таруса (Непал): резервуар генетических вариаций» . Эволюционная биология BMC . 9 (1): 154. Бибкод : 2009BMCEE...9..154F . дои : 10.1186/1471-2148-9-154 . ПМК 2720951 . ПМИД 19573232 .
- Херлс, М; Сайкс, Б; Джоблинг, М; Форстер, П. (2005). «Двойное происхождение малагасийцев на островах Юго-Восточной Азии и Восточной Африки: данные по материнской и отцовской линии» . Американский журнал генетики человека . 76 (5): 894–901. дои : 10.1086/430051 . ПМЦ 1199379 . ПМИД 15793703 .
- Карафет Татьяна М.; Лансинг, Дж. С.; Редд, Алан Дж.; Уоткинс, Джозеф К.; Сурата, СПК; Артхавигуна, Вашингтон; Майер, Лаура; Бамшад, Майкл; и др. (2005). «Балийский взгляд на Y-хромосому на заселение Индонезии: генетический вклад донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев». Биология человека . 77 (1): 93–114. дои : 10.1353/hub.2005.0030 . hdl : 1808/13586 . ПМИД 16114819 . S2CID 7953854 .
- Саху, Сангамитра; Кашьяп, В.К. (2006). «Филогеография митохондриальной ДНК и гаплогрупп Y-хромосомы выявляет асимметричный поток генов в популяциях Восточной Индии». Американский журнал физической антропологии . 131 (1): 84–97. дои : 10.1002/ajpa.20399 . ПМИД 16485297 .
- Триведи, Раджни; Ситалакшими, Т.; Банерджи, Джилам; Сингх, Анамика; Сиркар, ПК; Кашьяп, В.К. (2006). «Молекулярное понимание происхождения шомпенов, сокращающегося населения Никобарского архипелага» . Журнал генетики человека . 51 (3): 217–26. дои : 10.1007/s10038-005-0349-2 . ПМИД 16453062 .