Семейство гликозид гидролаз 97
| Гликозидная гидролаза 97 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | GLYCO_HYDRO_97 | ||
| Pfam | PF10566 | ||
| PFAM клан | CL0058 | ||
| InterPro | IPR019563 | ||
| |||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 97 представляет собой семейство гликозид -гидролаз .
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. это широко распространенная группа ферментов, которые гидролизируют гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неглеворным фрагментом. Система классификации для гликозидных гидролаз, основанных на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Эта классификация доступна на веб -сайте CAZY , [ 4 ] [ 5 ] а также обсуждается в Cazypedia, онлайн -энциклопедии активных ферментов углеводов. [ 6 ] [ 7 ]
Семейство гликозид гидролаз 97 (GH97) является бактериальным семейством. Центральная часть белковых последовательностей семейства GH97 представляет собой типичный и полный (бета/альфа) Barrel Tim домен типа Tim- -Barrel . N- и C-концевые части последовательностей, в основном состоящие из бета-цепи , скорее всего, образуют два дополнительных некаталитических домена с пока еще неизвестными функциями. Некаталитические домены гликозидаз из суперсемейств альфа-галактозидазы и альфа-глюкозидазы также в основном состоят из бета-цепи, и, по крайней мере, некоторые из этих доменов участвуют в олигомеризации и связывании углеводов. Во всех известных гликозидазах с (бета-альфа) складыванием 8-болота аминокислотные остатки на активном участке расположены на С-концах бета-цепи. [ 8 ]
Внешние ссылки
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Энриссат Б., Каллебаут I, Морн Дж.П., Фабрега С., Лен П., Дэвис Г. (1995). «Консервативный каталитический механизм и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (15): 7090–7094. Bibcode : 1995pnas ... 92.7090h . doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375 .
- ^ Энриссат Б., Дэвис Г. (1995). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз» . Структура 3 (9): 853–859. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00220-9 . PMID 8535779 .
- ^ «Bairoch, A.» Классификация семейств гликозилгидролаз и индекса вводов гликозилгидролазы в швейцарском протоке ». 1999» . Архивировано из оригинала 2011-05-25 . Получено 2011-10-04 .
- ^ "Дом" . Cazy.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Ломбард, Винсент; Голаконда Рамулу, Хемалата; Друла, Элоди; Coutinho, Pedro M.; Энриссат, Бернард (2014-01-01). «База данных по углеводам-активным ферментам (CAZY) в 2013 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 42 (D1): D490 - D495. doi : 10.1093/nar/gkt1178 . ISSN 0305-1048 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 97» . Cazypedia.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Cazypedia Consortium (2018-12-01). «Десять лет Казипедии: живая энциклопедия углеводов-активных ферментов» . Гликобиология . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . HDL : 21.11116/0000-0003-B7EB-6 . ISSN 1460-2423 . PMID 29040563 .
- ^ Наумофф Д.Г. (2005). «GH97-это новое семейство гликозидных гидролаз, которое связано с суперсемейством альфа-галактозидазы» . BMC Genomics . 6 : 112. DOI : 10.1186/1471-2164-6-112 . PMC 1249566 . PMID 16131397 .
