Макрогаплогруппа L

Гаплогруппа L1-6
Гаплогруппа L1-6
Возможное время происхождения	от 200 до 130 тысяч лет назад
Предок	L ( Митохондриальная Ева )
Потомки	Л1, Л2-Л6
Определение мутаций	146, 182, 4312, 10664, 10915, 11914, 13276, 16230

*Гаплогруппа L*
Гаплогруппа L
Время происхождения	от 230 до 150 тысяч лет назад
Место происхождения	Восточная Африка
Потомки	Л0 , Л1-6

В митохондриальной генетике человека L — это макрогаплогруппа митохондриальной ДНК , лежащая в основе филогенетического дерева мтДНК анатомически современного человека ( Homo sapiens ). Таким образом, он представляет собой наиболее древнюю митохондриальную линию всех ныне живущих современных людей, также называемую « Митохондриальной Евой ».

Два его субклада — L1-6 и L0 . Раскол произошел во время предпоследнего ледникового периода ; По оценкам, L1-6 образовался ок. 170 тысяч лет назад, а L0 ок. 150 тысяч лет назад. Образование L0 связано с заселением Южной Африки популяциями, предками койсанов , ок. 140 тыс. лет назад, в начале эемского межледниковья . L далее подразделяется на L1-6 и L1 , датированные ок. 150 тыс. лет назад и 130 тыс. лет назад соответственно. Гаплогруппы L5 (120 тысяч лет назад), L2 и L6 (90 тысяч лет назад), L4 (80 тысяч лет назад) и L3 (70 тысяч лет назад).

Источник

Внешней группой для филогении мтДНК современных людей является мтДНК архаичных людей , особенно неандертальцев и денисовцев . Раскол современной человеческой линии от неандертальской и денисовской линии датируется ок. 760–550 тысяч лет назад на основе полного анализа генома. Это согласуется с оценкой, основанной на ДНК Y-хромосомы , согласно которой разрыв между ок. 806–447 тысяч лет назад. ^{[ 4 ]} Однако с точки зрения мтДНК кажется, что современные люди и неандертальцы образуют сестринскую кладу, а денисовцы являются базовой внешней группой. Раскол мтДНК неандертальца и современного человека датируется примерно 498–295 тыс. лет назад, то есть значительно моложе даты, оцененной на основе ядерной ДНК. Это было объяснено как отражение раннего потока генов из Африки в геном неандертальца, около 270 тысяч лет назад или раньше, то есть примерно во время первого появления анатомически современных людей ( Джебель Ирхуд ). Пост и др. (2017) предполагают возможность того, что ранняя мтДНК Homo sapiens из Африки могла полностью заменить исходную мтДНК неандертальцев, даже если предположить минимальную примесь. Линии неандертальцев и денисовцев разошлись примерно до 430 тыс. лет назад, и мтДНК денисовцев не пострадала от интрогрессии. ^{[ 4 ]}

Самый недавний общий предок мтДНК современного человека (получивший название « Митохондриальная Ева ») датируется ок. 230–150 тысяч лет назад. Появление гаплогруппы L1-6 по определению датируется более поздним временем, примерно 200–130 тысяч лет назад. ^{[ 1 ]} возможно, в популяции Восточной Африки . ^{[ 3 ]} Гаплогруппа L0 возникает из базальной гаплогруппы L1-6* несколько позже, примерно 190–110 тыс. лет назад.

Глубокая временная глубина этих линий приводит к тому, что субструктура этой гаплогруппы в Африке сложна и плохо изучена. ^{[ 5 ]} Оценки дат обязательно неточны. Приведенные выше интервалы представляют собой высокие и низкие оценки 95% доверительного интервала по данным Soares et al. (2009), наиболее вероятный возраст следует принимать вблизи центра этих интервалов. ^{[ 1 ]}

Филогения

Л1-6

Филогения гаплогруппы L

л

L1─6

Л1

	Л1

	Л2

Л3

Л4

Л5

	Л6

	Л7

Л0

Л0д

Л0к

L0f

	L0a

	Л0б

Гаплогруппа L1-6 (также L1'2'3'4'5'6) отделилась от недифференцированной гаплогруппы L примерно 20 000 лет после Митохондриальной Евы, или примерно 170 000 лет назад. ( 167 ± 36 тыс. лет назад по оценке Соареса и др., 2009). Он, в свою очередь, разделился на L1 (150 тыс. лет назад), L5 (120 тыс. лет назад) и L2 (90 тыс. лет назад) перед недавним событием за пределами Африки ок. 70 тысяч лет назад. L3 возникает около 70 тысяч лет назад и тесно связан с событием за пределами Африки; оно могло возникнуть либо в Восточной Африке, либо в Азии. L6 и L4 — сестринские клады L3, они чаще всего встречаются в Восточной Африке и Западной Азии. Новое открытие предполагает, что L4 зародился в Евразии около 74 000 тысяч лет назад и мигрировал в Африку. А L6 возник в Йемене около 60 000 тысяч лет назад и мигрировал через Баб-Эль-Мендеб в Эфиопию.

Недифференцированный L1'2'3'4'5'6 был обнаружен в окаменелостях неандертальцев с Кавказа ( Мезмайская пещера ) и Алтая ( Денисова пещера ), датированных до 50 тыс. лет назад. Это предполагает, что более ранняя волна экспансии Homo sapiens покинула Африку примерно между 200–130 тыс. лет назад (во время предпоследнего ледникового периода , ср. гоминины Схула и Кафзе ) и оставила генетические следы путем скрещивания с неандертальцами, прежде чем исчезнуть. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Гаплогруппа L1 отделилась от L около 140 000 лет назад. Его появление связано с ранним заселением Африки анатомически современными людьми во время Эемского периода , и сейчас он в основном встречается у банту и семибанту, говорящих в западноафриканских популяциях.

Гаплогруппа L5 ранее классифицировалась как L1e, но теперь считается, что она отошла от L1 примерно на 120 тыс. лет назад. Это также в основном связано с пигмеями, с наибольшей частотой среди пигмеев мбути из восточной части Центральной Африки - 15%. ^{[ 10 ]}

Гаплогруппа L2 отделилась от L(1'4'6)'2 примерно 90 тыс. лет назад, что связано с заселением Восточной Западной Африки. В результате миграции банту на юго-восток он теперь распространился по всей Центральной Африке к югу от Сахары за счет ранее более распространенных L0, L1 и L5. ^{[ 11 ]}

Гаплогруппа L6 отделилась от L3'4'6 примерно в то же время, ок. 90 тысяч лет назад. Сейчас это второстепенная гаплогруппа, распространение которой в основном ограничено Африканским Рогом и югом Восточной Африки.

Гаплогруппа L3 отделилась от L3'4 примерно 70 тысяч лет назад, вероятно, незадолго до события южного расселения (миграция за пределы Африки), возможно, в Восточной Африке. МтДНК всех неафриканцев происходит от L3, разделенного на две основные линии M и N. :

Гаплогруппа L4 — это необычная гаплогруппа Восточной Африки и Западной Азии, которая возникла около 70 тысяч лет назад и, возможно, мигрировала в Африку из Западной Азии. Гаплогруппа, ранее называвшаяся L7, была реклассифицирована как субклад L4, названный L4a .

Л0

Гаплогруппа L0 возникла примерно между 200 и 130 тыс. лет назад, ^{[ 12 ]} то есть примерно в то же время, что и L1 , до начала эмиана . Это связано с заселением Южной Африки примерно 140 000 лет назад.

Его субклады — L0d и L0k. Оба почти исключительно ограничены койсанами южной Африки, но L0d также был обнаружен среди народа сандаве в Танзании, что предполагает древнюю связь между койсанами и восточноафриканскими носителями клик-языков . ^{[ 13 ]}

Гаплогруппа L0f относительно небольшая частота присутствует в Танзании среди народа сандаве , который, как известно, старше койсанов . L0a наиболее распространен в популяциях Юго-Восточной Африки (25% в Мозамбике ), а L0b встречается в Эфиопии .

Распределение

Если оставить в стороне его ответвления, гаплогруппы M и N, гаплогруппы L преобладают во всей Африке к югу от Сахары ; L находится на уровне 96–100%, врозь. Встречается в Северной Африке , на Аравийском полуострове , на Ближнем Востоке , в Америке , Европе , в диапазоне от низких до высоких частот в зависимости от страны.

Африка

Мутации, которые используются для идентификации базальных линий гаплогруппы L, древние, и им может быть 150 000 лет. Глубокая временная глубина этих линий приводит к тому, что субструктура этой гаплогруппы в Африке сложна и в настоящее время плохо изучена. ^{[ 5 ]} Первое раскол внутри гаплогруппы L произошел 140–200 тыс. лет назад, с мутациями, определяющими макрогаплогруппы L0 и L1-6. Эти две гаплогруппы встречаются по всей Африке с разной частотой и, таким образом, демонстрируют запутанную структуру вариаций мтДНК. Однако распространение некоторых субкладов гаплогруппы L структурировано вокруг географических или этнических единиц. Например, самые глубокие клады гаплогруппы L0, L0d и L0k почти исключительно ограничены койсанами на юге Африки. L0d также был обнаружен среди сандаве в Танзании, что предполагает древнюю связь между койсанским и восточноафриканским населением. ^{[ 13 ]}

ЮАР

Гаплогруппа L достигает 100% у многих коренных жителей Южной Африки . Различные этнические меньшинства Южной Африки имеют разную частоту линий гаплогруппы L. Он обнаружен у 47% жителей Кейп-Цветного , 44% — у Кейп-Малай , 14% — у индийских мусульман, 20% — у другого мусульманского населения Южной Африки. ^{[ 21 ]}

Северная Африка

Гаплогруппа L также встречается с умеренной частотой в Северной Африке . Например, в различных популяциях берберов частота линий гаплогруппы L колеблется от 3% до 45%. ^{[ 22 ]}^{[ 23 ]} Гаплогруппа L также была обнаружена с небольшой частотой - 2,2% у североафриканских евреев из Марокко, Туниса и Ливии. Частота была самой высокой у ливийских евреев 3,6%. ^{[ 24 ]} У марокканских арабов более повышена материнская примесь SSA - примерно от 21% до 36%. Судя по последовательностям L-мтДНК, самые высокие частоты L-мтДНК наблюдаются у марокканских арабов в окрестностях Эль-Джадиды - 33%. ^{[ 25 ]}

Западная Азия

Гаплогруппа L также встречается в Западной Азии с низкой и умеренной частотой, особенно в Йемене , где частота достигает 60%. ^{[ 26 ]} Он также встречается на уровне 15,50% у бедуинов из Израиля , 13,68% у палестинцев , 12,55% у иорданцев , 9,48% у иракцев , 9,15% у сирийцев , 7,5% у хазарейцев Афганистана , 2,84 , 6,66% у саудовцев % у ливанцев. , 2,60% у друзов из Израиля, 2,44% у курдов и 1,76% у турков . ^{[ 27 ]}^{[ 28 ]} В целом арабская работорговля и расширение иностранных империй, охватывающих Саудовскую Аравию, были связаны с присутствием гаплогруппы L в генофонде Саудовской Аравии. ^{[ 29 ]}

Европа

В Европе гаплогруппа L встречается с низкой частотой, обычно менее 1%, за исключением Иберии (Испания и Португалия), где региональная частота достигает 18,2%, и некоторых регионов Италии , где частота составляет от 2 до 3%. был найден. Общая частота в Иберии выше в Португалии, чем в Испании , где частота высока только на юге и западе страны. Увеличение частоты наблюдается в Галисии (3,26%) и северной Португалии (3,21%), через центр (5,02%) и на юг Португалии (11,38%). ^{[ 30 ]} Относительно высокие частоты 7,40% и 8,30% были также зарегистрированы соответственно в Южной Испании, в нынешней популяции Уэльвы и Приего-де-Кордоба, согласно Casas et al. 2006. ^{[ 31 ]} Значительные частоты были также обнаружены в автономных регионах Португалии : гаплогруппы L составляют около 13% линий на Мадейре и 3,4% на Азорских островах . На испанском архипелаге Канарских островов частота зарегистрирована на уровне 6,6%. ^{[ 32 ]} По мнению некоторых исследователей, линии L в Иберии связаны с исламскими вторжениями, в то время как для других это может быть связано с более древними процессами, а также с более поздними процессами, возникшими в результате внедрения этих линий посредством современной работорговли. Самая высокая частота (18,2%) линий к югу от Сахары, обнаруженных на данный момент в Европе, наблюдалась Альваресом и соавт. 2010 г. в комарке Саяго в Испании и в Алькасер - ду-Сал в Португалии. ^{[ 33 ]}^{[ 34 ]} В Италии линии гаплогруппы L присутствуют в некоторых регионах с частотой от 2 до 3% в Лациуме (2,90%), некоторых частях Тосканы , ^{[ 28 ]} Базиликата и Сицилия . ^{[ 35 ]} В 2015 году исследование показало, что доисторический эпизод будет основным фактором присутствия стран к югу от Сахары в Средиземноморской Европе и Иберии. ^{[ 36 ]} Исследование 2018 года связывает высокий уровень африканской примеси в Испании и Португалии с двумя отдельными эпизодами: один во время североафриканской исламской экспансии в Иберию, а другой - более поздний, возможно, связанный с работорговлей. ^{[ 37 ]}

Америка

Линии гаплогруппы L встречаются в африканской диаспоре Америки, а также у коренных американцев. Линии гаплогруппы L преобладают среди афроамериканцев , афрокарибцев и афролатиноамериканцев . В Бразилии Pena et al. сообщают, что 85% самоидентифицированных афро-бразильцев имеют последовательности мтДНК гаплогруппы L. ^{[ 38 ]} Линии гаплогруппы L также встречаются с умеренной частотой у самоидентифицированных белых бразильцев . Алвес Силва сообщает, что 28% выборки белых бразильцев принадлежат к гаплогруппе L. ^{[ 39 ]} В Аргентине по всей стране наблюдался незначительный вклад африканских линий. ^{[ 40 ]} также сообщалось, что линии гаплогруппы L составляют 8% В Колумбии . ^{[ 41 ]} и на уровне 4,50% в Северо-Центральной Мексике . ^{[ 42 ]} В Северной Америке линии гаплогруппы L встречались с частотой 0,90% у белых американцев европейского происхождения. ^{[ 43 ]}

Гаплогруппа L обнаруживается в различных группах индейцев в разных частотах. Он был обнаружен в 8% в Науа -Койолильо. ^{[ 44 ]} и 7,1% в НАСА , говорящей на языке чибча. этнической группе ^{[ 44 ]}

Частоты гаплогруппы L (> 1%)

Область	Население или страна	Количество протестированных	Ссылка	%
Северная Африка	Ливия (евреи)	83	Бехар и др. (2008)	3.60%
Северная Африка	Тунис (евреи)	37	Бехар и др. (2008)	2.20%
Северная Африка	Марокко (евреи)	149	Бехар и др. (2008)	1.34%
Северная Африка	Тунис	64	Турчи и др. (2009)	48.40%
Северная Африка	Тунис (Такруна)	33	Фриги и др. (2006)	3.03%
Северная Африка	Тунис (Зриба)	50	Турчи и др. (2009)	8.00%
Северная Африка	Марокко	56	Турчи и др. (2009)	26.80%
Северная Африка	Марокко (берберы)	64	Турчи и др. (2009)	3.20%
Северная Африка	Алжир (мозабитцы)	85	Турчи и др. (2009)	12.90%
Северная Африка	Алжир	47	Турчи и др. (2009)	20.70%
Европа	Италия (Лацио)	138	Ахиллес и др. (2007)	2.90%
Европа	Италия (Вольтерра)	114	Ахиллес и др. (2007)	2.60%
Европа	Италия (Базиликата)	92	Оттони и др. (2009)	2.20%
Европа	Италия (Сицилия)	154	Оттони и др. (2009)	2.00%
Европа	Мальта	132	Каруана и др. (2016)	15.90% ^{[ 45 ]}^{[ самостоятельно опубликованный источник? ]}
Европа	Испания	312	Альварес и др. (2007)	2.90%
Европа	Испания (Галисия)	92	Перейра и др. (2005)	3.30%
Европа	Испания (Северо-Восток)	118	Перейра и др. (2005)	2.54%
Европа	Испания (Приего-де-Кордоба)	108	Касас и др. (2006)	8.30%
Европа	Испания (Самора)	214	Альварес и др. (2010)	4.70%
Европа	Испания (Саяго)	33	Альварес и др. (2010)	18.18%
Европа	Испания (Каталония)	101	Альварес-Иглесиас и др. (2009)	2.97%
Европа	Южная Иберия	310	Касас и др. (2006)	7.40%
Европа	Испания (Канарские острова)	300	Брем и др. (2003)	6.60%
Европа	Испания (Балеарские острова)	231	Пикорнелл и др. (2005)	2.20%
Европа	Испания (Андалусия)	1004	Барраль-Арка и др. (2016)	2.6%
Европа	Испания (Кастилия и Леон)	428	Барраль-Арка и др. (2016)	2.1%
Европа	Испания (Арагон)	70	Барраль-Арка и др. (2016)	4.3%
Европа	Испания (Астурия)	99	Барраль-Арка и др. (2016)	4.0%
Европа	Испания (Галисия)	98	Барраль-Арка и др. (2016)	2.0%
Европа	Испания (Мадрид)	178	Барраль-Арка и др. (2016)	1.70%
Европа	Испания (Кастилия-Ла-Манча)	207	Барраль-Арка и др. (2016)	1.40%
Европа	Испания (Эстремадура)	87	Барраль-Арка и др. (2016)	1.10%
Европа	Испания (Уэльва)	280	Эрнандес и др. (2015)	3.93%
Европа	Испания (Гранада)	470	Эрнандес и др. (2015)	1.49%
Европа	Португалия	594	Ахиллес и др. (2007)	6.90%
Европа	Португалия (Север)	188	Ахиллес и др. (2007)	3.19%
Европа	Португалия (Центральный)	203	Ахиллес и др. (2007)	6.40%
Европа	Португалия (Юг)	203	Ахиллес и др. (2007)	10.84%
Европа	Португалия	549	Перейра и др. (2005)	5.83%
Европа	Португалия (Север)	187	Перейра и др. (2005)	3.21%
Европа	Португалия (Центральный)	239	Перейра и др. (2005)	5.02%
Европа	Португалия (Юг)	123	Перейра и др. (2005)	11.38%
Европа	Португалия (Мадейра)	155	Брем и др. (2003)	12.90%
Европа	Португалия (Азорские острова)	179	Брем и др. (2003)	3.40%
Европа	Португалия (Алкасер-ду-Сал)	50	Перейра и др. (2010)	22.00%
Европа	Португалия (Коруше)	160	Перейра и др. (2010)	8.70%
Европа	Португалия (Пиас)	75	Перейра и др. (2010)	3.90%
Европа	Португалия	1429	Барраль-Арка и др. (2016)	6.16%
Западная Азия	Йемен	115	Кивисилд и др. (2004)	45.70%
Западная Азия	Йемен (евреи)	119	Бехар и др. (2008)	16.81%
Западная Азия	Бедуины (Израиль)	58	Бехар и др. (2008)	15.50%
Западная Азия	Палестинцы (Израиль)	117	Ахиллес и др. (2007)	13.68%
Западная Азия	Иордания	494	Ахиллес и др. (2007)	12.50%
Западная Азия	Ирак	116	Ахиллес и др. (2007)	9.48%
Западная Азия	Сирия	328	Ахиллес и др. (2007)	9.15%
Западная Азия	Саудовская Аравия	120	Абу-Амеро и др. (2007)	6.66%
Западная Азия	Ливан	176	Ахиллес и др. (2007)	2.84%
Западная Азия	Друзы (Израиль)	77	Бехар и др. (2008)	2.60%
Западная Азия	Курды	82	Ахиллес и др. (2007)	2.44%
Западная Азия	Турция	340	Ахиллес и др. (2007)	1.76%
Южная Америка	Колумбия (Антиокия)	113	Бедоя и др. (2006)	8.00%
Северная Америка	Мексика (Северо-Центральная)	223	Грин и др. (2000)	4.50%
Южная Америка	Аргентина	246	Корах и др. (2009)	2.03%

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с 151,6–233,6 ка 95% ДИ по данным: Соареш, Педро; Эрмини, Лука; Томсон, Ноэль; Мормина, Мару; Рито, Тереза; Рёль, Арне; Салас, Антонио; Оппенгеймер, Стивен; Маколей, Винсент; Ричардс, Мартин Б. (июнь 2009 г.). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–759. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . ПМК 2694979 . ПМИД 19500773 .
^ Оценка возраста (ка, 95% ДИ в угловых скобках): Оценка возраста цельной мтДНК ML: 178,8 [155,6; 202.2], ρ оценка возраста цельной мтДНК: 185,2 [153,8; 216,9], ρ синонимическая оценка возраста (ка): 174,8 [153,8; 216,9]: РИТО, Тереза; Ричардс, Мартин Б.; ФЕРНАНДЕС, Вероника; Альшамали, Фарида; ЦЕРНИ, Виктор; Перейра, Луиза; Соарес, Педро (13 ноября 2013 г.). «Первое расселение современного человека по Африке» . ПЛОС ОДИН . 8 (11): е80031. Бибкод : 2013PLoSO...880031R . дои : 10.1371/journal.pone.0080031 . ПМЦ 3827445 . ПМИД 24236171 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Гондер М.К., Мортенсен Х.М., Рид Ф.А., де Соуза А., Тишкофф С.А. (март 2007 г.). «Анализ последовательности всего генома мтДНК древних африканских линий» . Мол. Биол. Эвол . 24 (3): 757–68. дои : 10.1093/molbev/msl209 . ПМИД 17194802 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Пост, Козимо; Виссинг, Кристоф; Китагава, Кейко; Пагани, Лука; ван Гольштейн, Лаура; Расимо, Фернандо; Вербергер, Курт; Конард, Николас Дж.; Добрый, Клаус Иоахим; Бочеренс, Эрве; Краузе, Йоханнес (декабрь 2017 г.). «Глубоко расходящийся архаичный митохондриальный геном обеспечивает нижнюю временную границу для потока африканских генов в неандертальцев» . Природные коммуникации . 8 (1): 16046. Бибкод : 2017NatCo...816046P . дои : 10.1038/ncomms16046 . ПМК 5500885 . ПМИД 28675384 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Бехар, Дорон М.; Виллемс, Ричард; Судьял, Химла; Блю-Смит, Джейсон; Перейра, Луиза; Мецпалу, Он; Скоццари, Розарий; Маккан, Конституция; Цур, Шей; Комас, Дэвид; Бертранпети, Жауме; Кинтана-Мурси, Луис; Тайлер-Смит, Крис; Уэллс, Р. Спенсер; Россе, Сахарон; Генографический, Консорциум. (май 2008 г.). «Рассвет человеческого матрилинейного разнообразия» . Американский журнал генетики человека . 82 (5): 1130–1140. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.04.002 . ПМК 2427203 . ПМИД 18439549 .
^ 166.8 +36.7
−36,1 тысяч лет назад (Соарес и др., 2009).
^ ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Человеческая мутация . 30 (2): E386–E394. дои : 10.1002/humu.20921 . ПМИД 18853457 . S2CID 27566749 .
^ Бриггс, AW; Хорошо, Дж. М.; Зеленый, РЕ; Краузе, Дж.; Маричич, Т.; и др. (16 июля 2009 г.). «Целевое извлечение и анализ пяти геномов мтДНК неандертальцев». Наука . 325 (5938). Американская ассоциация содействия развитию науки (AAAS): 318–321. Бибкод : 2009Sci...325..318B . дои : 10.1126/science.1174462 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 19608918 . S2CID 7117454 .
^ ФЕРРЕЙРА, Рената С; РОДРИГЕС, Камила Р.; Броуч, Джеймс Р.; Брионес, Марсело РС (18 сентября 2017 г.). «Неандертальские подписи в гаплогруппах митохондриального генома современного человека?». bioRxiv 10.1101/190363 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Тишкофф, С.А.; Гондер, МК; Хенн, Б.М.; Мортенсен, Х.; Найт, А.; Жиньу, К.; Фернандопулле, Н.; Лема, Г.; Ньямбо, ТБ; Рамакришнан, У.; Рид, ФА; Маунтин, JL (21 июля 2007 г.). «История говорящих по щелчку популяций Африки, выведенная на основе генетических вариаций мтДНК и Y-хромосомы» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (10): 2180–2195. дои : 10.1093/molbev/msm155 . ПМИД 17656633 .
^ Марина Сильва, Фарида Альшамали, Паула Сильва, Карла Каррильо, Флавио Мандлате, Мария Хесус Тровоада, Виктор Черны, Луиза Перейра, Педро Соареш, «60 000 лет взаимодействий между Центральной и Восточной Африкой, задокументированных основной африканской митохондриальной гаплогруппой L2», научный представитель . 2015 г.; 5:12526, дои : 10.1038/srep12526
^ точечная оценка 168,5 тыс. лет назад (136,3–201,1 тыс. лет, 95% ДИ ) по данным Хайнц, Таня; Пала, Мэри; Гомес-Карбалья, Альберто; Ричардс, Мартин Б.; Салас, Антонио (март 2017 г.). «Обновление дерева митохондриальной ДНК человека в Африке: актуальность для судебно-медицинской экспертизы и популяционной генетики». Международная судебно-медицинская экспертиза: Генетика . 27 : 156–159. дои : 10.1016/j.fsigen.2016.12.016 . ПМИД 28086175 . (таблица 2). 150 предложено в: Соареш, Педро; Эрмини, Лука; Томсон, Ноэль; Мормина, Мару; Рито, Тереза; Рёль, Арне; Салас, Антонио; Оппенгеймер, Стивен; Маколей, Винсент (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . ПМЦ 2694979 . ПМИД 19500773 . .
^ Перейти обратно: ^а ^б Гондер М.К., Мортенсен Х.М., Рид Ф.А., де Соуза А., Тишкофф С.А. (март 2007 г.). «Анализ последовательности всего генома мтДНК древних африканских линий» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (3): 757–68. дои : 10.1093/molbev/msl209 . ПМИД 17194802 . присутствие гаплогрупп N1 и J в Танзании предполагает «обратную» миграцию с Ближнего Востока или Евразии в Восточную Африку, что было сделано на основе предыдущих исследований других популяций Восточной Африки.
^ Перейти обратно: ^а ^б Роза, Александра; Брем, Антонио; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Эне; Виллемс, Ричард (июль 2004 г.). «Профиль мтДНК жителей Западной Африки: на пути к лучшему пониманию региона Сенегамбии». Анналы генетики человека . 68 (4): 340–352. дои : 10.1046/j.1529-8817.2004.00100.x . hdl : 10400.13/3044 . ПМИД 15225159 . S2CID 15391342 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Абу-Амеро К.К., Ларруга Х.М., Кабрера В.М., Гонсалес А.М. (2008). «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове» . БМК Эвол. Биол . 8 (1): 45. Бибкод : 2008BMCEE...8...45A . дои : 10.1186/1471-2148-8-45 . ПМК 2268671 . ПМИД 18269758 .
^ Кивисилд, Томас; Рейдла, Маере; Мецпалу, Он; Роуз, Александра; Брем, Энтони; Пеннарун, Эрван; Парик, Юрий; Геберхивот, Тарекегн; Усанга, Эсьен; Виллемс, Ричард (ноябрь 2004 г.). «Наследие митохондриальной ДНК Эфиопии: отслеживание потока генов через и вокруг Врат Слез» . Американский журнал генетики человека . 75 (5): 752–770. дои : 10.1086/425161 . ПМК 1182106 . ПМИД 15457403 .
^ Солмс, Лизель Эсме (2013). Филогенетика и видообразование африканского Bradypterus и комплекса Apalis thoracica (PDF) (Диссертация). OCLC 956378078 . Архивировано из оригинала (PDF) 10 сентября 2011 г.
^ Салас, Антонио; Ричардс, Мартин; О вере, Томас; Лареу, Мария-Виктория; Племянник Беатрис; Санчес-Дис, Паула; Маколей, Винсент; Карраседо, Анхель (ноябрь 2002 г.). «Создание африканского ландшафта мтДНК» . Американский журнал генетики человека . 71 (5): 1082–1111. дои : 10.1086/344348 . ПМК 385086 . ПМИД 12395296 .
^ Чен, Юй-Шэн; Олкерс, Антонель; Шурр, Теодор Г.; Когельник, Андрей М.; Хуопонен, Кирси; Уоллес, Дуглас К. (апрель 2000 г.). «Вариации мтДНК южноафриканских кунгов и хве — и их генетические связи с другими африканскими популяциями» . Американский журнал генетики человека . 66 (4): 1362–1383. дои : 10.1086/302848 . ПМК 1288201 . ПМИД 10739760 .
^ Кинтана, Луис и др. 2003, Разнообразие мтДНК в Центральной Африке: от охотников-собирателей до земледелия. ^{[ нужна полная цитата ]}
^ Айзекс, Шафика; Гедульд-Улла, Тасним; Бенджедду, Монги (июль 2013 г.). «Реконструкция основных материнских и отцовских линий мусульманского населения Кейптауна» . Генетика и молекулярная биология . 36 (2): 167–176. дои : 10.1590/S1415-47572013005000019 . ПМЦ 3715281 . ПМИД 23885197 .
^ Черни Л., Луэслати Б.И., Перейра Л., Эннафаа Х., Аморим А., Эль Гаайед А.Б. (февраль 2005 г.). «Женские генофонды соседних берберских и арабских общин в центральном Тунисе: микроструктура вариаций мтДНК в Северной Африке». человека Биология 77 (1): 61–70. дои : 10.1353/hub.2005.0028 . hdl : 10216/109267 . ПМИД 16114817 . S2CID 7022459 .
^ Турки, Кьяра; Бушеми, Лоредана; Джаккино, Эрика; Онофри, Валерио; Фендт, Лиана; Парсон, Вальтер; Тальябраччи, Адриано (июнь 2009 г.). «Полиморфизмы контрольной области мтДНК в тунисском и марокканском населении: обогащение баз данных судебно-медицинской экспертизы мтДНК данными Северной Африки». Международная судебно-медицинская экспертиза: Генетика . 3 (3): 166–172. дои : 10.1016/j.fsigen.2009.01.014 . ПМИД 19414164 .
^ Бехар, Дорон М.; Мецпалу, Эне; Кивисилд, Тоомас; Россе, Сахарон; Цур, Шей; Хадид, Ярин; Юдковский, Геннадий; Розенгартен, Дрор; Перейра, Луиза; Аморим, Антонио; Кутуев, Ильдус; Гурвиц, Дэвид; Бонне-Тамир, Батшева; Виллемс, Ричард; Скорецкий, Карл (30 апреля 2008 г.). «Подсчет основателей: матрилинейное генетическое происхождение еврейской диаспоры» . ПЛОС ОДИН . 3 (4): е2062. Бибкод : 2008PLoSO...3.2062B . дои : 10.1371/journal.pone.0002062 . ПМЦ 2323359 . ПМИД 18446216 .
^ Харич, Нурдин; КОСТА, Марта Д; ФЕРНАНДЕС, Вероника; Кандил, Мостафа; Перейра, Хоана Б; СИЛЬВА, Нуно М; Перейра, Луиза (2010). «Транссахарская работорговля - разделы интерполяционного анализа и характеристики линий митохондриальной ДНК с высоким разрешением» . Эволюционная биология BMC . 10 (1): 138. Бибкод : 2010BMCEE..10..138H . дои : 10.1186/1471-2148-10-138 . ПМЦ 2875235 . ПМИД 20459715 .
^ Черный, Виктор; Маллиган, Конни Дж.; Ридл, Якуб; Жалоудкова, Мартина; Иденс, Кристофер М.; Гаек, Мартин; Перейра, Луиза (июнь 2008 г.). «Региональные различия в распространении линий мтДНК к югу от Сахары, Западной Евразии и Южной Азии в Йемене». Американский журнал физической антропологии . 136 (2): 128–137. дои : 10.1002/ajpa.20784 . ПМИД 18257024 .
^ Кит, Джон Уильям (2012). Анализ митохондриальной ДНК четырех этнических групп Афганистана (PDF) (Диссертация). OCLC 883630158 . Архивировано из оригинала (PDF) 2 августа 2017 года.
^ Перейти обратно: ^а ^б Ахилли, Алессандро; Оливьери, Анна; Пала, Мария; Мецпалу, Эне; Форнарино, Симона; Батталья, Винченца; Акчеттуро, Маттео; Кутуев, Ильдус; Хуснутдинова, Эльза; Пеннарун, Эрван; Черутти, Николетта; Ди Гаэтано, Корнелия; Кробу, Франческа; Палли, Доменико; Матулло, Джузеппе; Сантакьяра-Бенерекетти, А. Сильвана; Кавалли-Сфорца, Л. Лука; Семино, Орнелла; Виллемс, Ричард; Бандельт, Ханс-Юрген; Пьяцца, Альберто; Торрони, Антонио (апрель 2007 г.). «Вариации митохондриальной ДНК современных тосканцев подтверждают ближневосточное происхождение этрусков» . Американский журнал генетики человека . 80 (4): 759–768. дои : 10.1086/512822 . ПМЦ 1852723 . ПМИД 17357081 .
^ Абу-Амеро, Халед К.; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Босли, Томас М; Кабрера, Висенте М (2007). «Влияние евразийской и африканской митохондриальной ДНК на население Саудовской Аравии» . Эволюционная биология BMC . 7 (1): 32. дои : 10.1186/1471-2148-7-32 . ПМК 1810519 . ПМИД 17331239 .
^ Перейра Л., Кунья К., Алвес К., Аморим А. (апрель 2005 г.). «Африканское женское наследие в Иберии: переоценка распределения линий мтДНК в настоящее время». Биология человека . 77 (2): 213–29. дои : 10.1353/hub.2005.0041 . hdl : 10216/109268 . ПМИД 16201138 . S2CID 20901589 .
^ Касас М.Дж., Хагельберг Э., Фрегель Р., Ларруга Х.М., Гонсалес А.М. (декабрь 2006 г.). «Разнообразие митохондриальной ДНК человека на археологических раскопках в Аль-Андалусе: генетическое влияние миграций из Северной Африки в средневековую Испанию». Являюсь. Дж. Физ. Антрополь . 131 (4): 539–51. дои : 10.1002/ajpa.20463 . ПМИД 16685727 .
^ Брем А., Перейра Л., Кивисилд Т., Аморим А. (декабрь 2003 г.). «Митохондриальные портреты архипелагов Мадейра и Асорские острова свидетельствуют о разных генетических пулах их поселенцев». Генетика человека . 114 (1): 77–86. дои : 10.1007/s00439-003-1024-3 . hdl : 10400.13/3046 . ПМИД 14513360 . S2CID 8870699 .
^ Альварес Л., Сантос К., Рамос А., Пратдесаба Р., Франкалаччи П., Алуха М.П. (август 2010 г.). «Образцы митохондриальной ДНК на северном иберийском плато: динамика населения и субструктура провинции Самора». Являюсь. Дж. Физ. Антрополь . 142 (4): 531–39. дои : 10.1002/ajpa.21252 . ПМИД 20127843 .
^ Альварес Л., Сантос К., Рамос А., Пратдесаба Р., Франкалаччи П., Алуха М.П. (август 2010 г.). «Образцы митохондриальной ДНК на северном иберийском плато: динамика населения и субструктура провинции Самора». Являюсь. Дж. Физ. Антрополь . 142 (4): 531–39. дои : 10.1002/ajpa.21252 . ПМИД 20127843 . Что касается ртути к югу от Сахары (L1b, L2b и L3b), то высокая частота встречаемости, обнаруженная в южных регионах Саморы, 18,2% в Саяго и 8,1% в Бахо-Дуэро, сравнима с описанной для юга Португалии.
^ Оттони, Клаудио; Мартинес-Лабарга, Кристина; Вителли, Лусиана; Скано, Джузеппина; Фабрини, Энрико; Контини, Ирен; Бионди, Джанфранко; Рикардс, Ольга (декабрь 2009 г.). «Вариации митохондриальной ДНК человека в Южной Италии». Анналы биологии человека . 36 (6): 785–811. дои : 10.3109/03014460903198509 . ПМИД 19852679 . S2CID 1788055 .
^ Эрнандес, Кандела Л.; Соареш, Питер; Дюгужон, Жан М.; Новеллетто, Андреа; Родригес, Джон Н.; Рито, Тереза; Оливейра, Марисса; Мелхауи, Мохаммед; Крылья, Абделлатиф; Перейра, Луиза; Кальдерон, Розарий (28 октября 2015 г.). «Ранние голоценовые и исторические африканские признаки мтДНК на Пиренейском полуострове: Андалузский регион как парадигма » ПЛОС ОДИН 10 (10): e0139784. Бибкод : 2015PLoSO..1039784H . дои : 10.1371/journal.pone.0139784 . ПМЦ 4624789 . ПМИД 26509580 .
^ Байкрофт, Клэр; Фернандес-Розадилья, Церера; Руис-Понте, Клара; Кинтела, Инес; Карраседо, Анхель; Доннелли, Питер; Майерс, Саймон (01 февраля 2019 г.). «Модели генетической дифференциации и следы исторических миграций на Пиренейском полуострове» . Природные коммуникации . 10 (1): 551. Бибкод : 2019NatCo..10..551B . дои : 10.1038/s41467-018-08272-w . ПМК 6358624 . ПМИД 30710075 .
^ Пена, SDJ; Бастос-Родригес, Л.; Пимента, младший; Быдловский, СП (11 сентября 2009 г.). «Тесты ДНК исследуют геномное происхождение бразильцев» . Бразильский журнал медицинских и биологических исследований . 42 (10): 870–876. дои : 10.1590/s0100-879x2009005000026 . ПМИД 19738982 .
^ Бобильо, Мария Сесилия; Циммерманн, Беттина; Сала, Андреа; Хубер, Габриэла; Рёк, Александр; Бандельт, Ханс-Юрген; Корах, Дэниел; Парсон, Вальтер (июль 2010 г.). «Гаплогруппы митохондриальной ДНК индейцев преобладают в населении Аргентины: на пути к созданию первой общенациональной базы данных последовательностей митохондриальной ДНК для судебно-медицинской экспертизы» . Международный журнал юридической медицины . 124 (4): 263–268. дои : 10.1007/s00414-009-0366-3 . ПМЦ 1287189 . ПМИД 19680675 .
^ Бобильо, Мария Сесилия; Циммерманн, Беттина; Сала, Андреа; Хубер, Габриэла; Рёк, Александр; Бандельт, Ханс-Юрген; Корах, Дэниел; Парсон, Вальтер (июль 2010 г.). «Гаплогруппы митохондриальной ДНК индейцев преобладают в населении Аргентины: на пути к созданию первой общенациональной базы данных последовательностей митохондриальной ДНК для судебно-медицинской экспертизы». Международный журнал юридической медицины . 124 (4): 263–268. дои : 10.1007/s00414-009-0366-3 . ПМИД 19680675 . S2CID 13260716 .
^ Бедойя, Габриэль; Монтойя, Патрисия; Гарсиа, Дженни; Сото, Иван; Буржуа, Стефан; Карвахаль, Луис; Лабуда, Дамиан; Альварес, Виктор; Оспина, Хорхе; Хедрик, Филип В.; Руис-Линарес, Андрес (9 мая 2006 г.). «Динамика примеси у выходцев из Латинской Америки: сдвиг в ядерном генетическом происхождении изолята южноамериканской популяции» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (19): 7234–7239. Бибкод : 2006PNAS..103.7234B . дои : 10.1073/pnas.0508716103 . JSTOR 30049673 . ПМЦ 1464326 . ПМИД 16648268 .
^ Грин Л.Д., Дерр Дж.Н., Найт А. (март 2000 г.). «Сродство мтДНК народов Северо-Центральной Мексики» . Американский журнал генетики человека . 66 (3): 989–98. дои : 10.1086/302801 . ПМЦ 1288179 . ПМИД 10712213 .
^ Гонсалвес В.Ф., Просдочими Ф., Сантос Л.С., Ортега Х.М., Пенья С.Д. (2007). «Потоковый поток генов у афроамериканцев, но не у американских европеоидов» . Генетика и молекулярные исследования . 6 (2): 256–61. ПМИД 17573655 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Пеньялоса-Эспиноза, Розенда И.; Аренас-Аранда, Диего.; Серда-Флорес, Рикардо М.; Буэнтелло-Мало, Леонор; Гонсалес-Валенсия, Херардо.; Торрес, Хавьер; Альварес, Беренис.; Мендоса, Ирма; Флорес, Марио; Сандовал, Люсила.; Лоэса, Франциско.; Рамос, Ирма; Муньос, Леопольдо; Саламанка, Фабио. (2007). «Характеристика гаплогрупп мтДНК у 14 коренных народов Мексики». Биология человека . 79 (3): 313–320. дои : 10.1353/hub.2007.0042 . ПМИД 18078204 . S2CID 35654242 .
^ Каруана, Йозеф (2016). Генетическое наследие Мальтийских островов: матрилинейная перспектива .