Synechocystis sp. PCC 6803
Synechocystis sp. PCC6803 | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Филум: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | S. sp. PCC6803
|
Биномиальное название | |
Synechocystis sp. PCC6803 | |
Синонимы | |
Synechocystis sp. PCC6803 является штаммом одноклеточных пресноводных цианобактерий . Synechocystis sp. PCC6803 способен к фототрофическому росту с помощью кислородного фотосинтеза во время световых периодов и гетеротрофного роста с помощью гликолиза и окислительного фосфорилирования в темные периоды. [ 2 ] Экспрессия генов регулируется циркадными часами , и организм может эффективно предвидеть переходы между световыми и темными фазами. [ 3 ]
Эволюционная история
[ редактировать ]Цианобактерии - это фотосинтетические прокариоты , которые существовали на Земле около 2,7 миллиарда лет. Способность цианобактерий продуцировать кислород, инициировавшая переход от планеты, состоящей из высоких уровней углекислого газа и небольшого кислорода, к тому, что называлось большим событием оксигенации, где было получено большое количество газа кислорода. [ 4 ] Цианобактерии колонизировали широкое разнообразие мест обитания, в том числе экосистемы свежей и соленой воды, и большинство земельных сред. [ 5 ] Филогенетически, Synechocystis отключается позже в цианобактериальном эволюционном дереве , в дальнейшем от наследственного корня ( Gloeobacter violaceus ). [ 6 ] Synechocystis , который является неазотрофическим, тесно связан с другим модельным организмом, Cyanothece ATCC 51442, который является диазотрофом . [ 7 ] Таким образом, было предложено, что Synechocystis изначально обладала способностью фиксировать газ азота, но потерял гены, необходимые для полностью функционирующего гена генов азота ( NIF ). [ 8 ]
Рост и использование в качестве модельного организма
[ редактировать ]Цианобактерии являются модельными микроорганизмами для изучения фотосинтеза , ассимиляции углерода и азота , эволюции растительных пластидов и адаптивности к стрессам окружающей среды . Synechocystis sp. PCC6803 является одним из наиболее изученных типов цианобактерий , поскольку он может выращивать как автотрофически, так и гетеротрофически в отсутствие света. Он был изолирован из пресноводного озера в 1968 году и лучше всего растет между 32 и 38 градусами по Цельсию . [ 9 ] Synechocystis sp. PCC6803 может легко занимать экзогенную ДНК , в дополнение к тому, чтобы взять ДНК посредством электропорации , ультразвукового трансформации и конъюгации . [ 10 ] Фотосинтетический . аппарат очень похож на то, что встречается на наземных растениях Организм также демонстрирует фототаксическое движение .
Synechocystis sp. PCC6803 можно выращивать либо на пластинах агара , либо в жидкой культуре . Наиболее широко используемой культуральной средой является соляный раствор BG-11. [ 11 ] Идеальный pH составляет от 7 до 8,5. [ 2 ] Интенсивность света 50 мкмоль фотонов m −2 с −1 приводит к лучшему росту. [ 2 ] Пузырька с обогащенным воздухом углекислого газа (1–2% CO 2 ) может увеличить скорость роста, но может потребовать дополнительного буфера для поддержания pH [ 2 ]
Отбор обычно выполняется генами устойчивости к антибиотикам . Heidorn et al. 2011 экспериментально определен в Synechocystis sp. PCC6803 Идеальные концентрации канамицина , спектиномицина , стрептомицина , хлорамфеникола , эритромицина и гентамицина . [ 2 ] Культуры можно хранить на пластинах агара в течение приблизительно 2 недель и повторно настраиваться на неопределенный срок. [ 11 ] Для долгосрочного хранения культуры жидких клеток должны храниться в 15% растворе глицерина при -80 градусов по Цельсию . [ 11 ]
Геном
[ редактировать ]Геном Synechocystis sp . PCC6803 is contained within approximately 12 copies of a single chromosome (3.57 megabases), three small plasmids : pCC5.2 (5.2 kb) pCA2.4 (2.4 kb), and pCB2.4 (2.4 kb) and four large plasmids: pSYSM ( 120 КБ), PSYSX (106 КБ), PSYSA (103KB) и PSYSG (44 КБ). [ 12 ] [ 13 ] Геном Synechocystis sp. PCC6803 является четвертым геномом, который будет полностью секвенирован, и первый фототрофный организм, имеющий его геном полностью секвенировать. [ 14 ]
Дополнительные штаммы
[ редактировать ]Первичный штамм Synechocystis sp. это PCC6803. Были созданы дальнейшие модификации родительского штамма PCC6803, таких как подразделение, в которой отсутствует фотосистема 1 (PSI). [ 15 ] Другой широко используемый подразделение Synechocystis sp. является толерантным штаммом глюкозы , ATCC 27184. Родительский штамм PCC 6803 не может использовать внешнюю глюкозу. [ 16 ]
Активированная светом гетеротрофия
[ редактировать ]Synechocystis sp. PCC6803, подразделение ATCC 27184 может жить гетеротрофически в темноте на глюкозе источника углерода , но по еще неизвестным причинам требуется минимум от 5 до 15 минут (синий) свет в день. Эта регуляторная роль света не повреждена как в штаммах с дефицитом PSI , так и в PSII . [ 17 ]
Некоторые гликолитические гены регулируются геном SLL1330 в условиях света и с учетом глюкозы. Одним из наиболее важных гликолитических генов является фруктоза-1,6-бисфосфат-альдолаза ( FBAA ). Уровень мРНК FBAA увеличивается в условиях света и с учетом глюкозы. [ 18 ]
Нативная система CRISPR-CAS
[ редактировать ]Система CRISPR -CAS (регулярно межпрессовые короткие палиндромные повтора -белки CRISPR) обеспечивает адаптивный иммунитет в археи и бактериях . Synechocystis sp. PCC6803 содержит три различных система CRISPR-CAS: идентификатор типа и две версии типа III. Все три системы CRISPR-CAS локализуются на плазмиде PSYSA. У всех цианобактерий отсутствуют система типа II, которая была широко адаптирована для целей генетической инженерии для многих видов. [ 19 ]
РНК -полимераза и сигма -факторы
[ редактировать ]РНК -полимераза (RNAP) и сигма -факторы являются необходимыми белками для транскрипции ДНК в Мессенджер РНК (мРНК). Ебактериальные голофермента RNAP состоят из ядра с четырьмя основными субъединицами α2 ββ '. В цианобактериях β 'образуется из двух меньших субъединиц (U и β'), что соответствует RNAP в хлоропластах растений . [ 20 ] Бета -субъединицы ответственны за связывание RNAP с ДНК, предотвращая преждевременную диссоциацию. В Escherichia coli бета -зажим «зажимать» сначала связывается свободно и подтягивается, когда RNAP приближается к начальному кодону (август) . В цианобактериях бета -зажим тесно связывается при начальном связывании. Влияние этого различия заключается в том, что синтетические репрессируемые промоторы не функционируют, как ожидалось в Synechocystis sp. PCC6803. В E. coli репрессор связывает ДНК -оперон и смещает RNAP из -за слабо связанного бета -зажима, тогда как в Synechocystis RNAP тесно связан, ведущий обратный явление, где репрессор сбивают с ДНК. Таким образом, ген не эффективно подавлен. [ 21 ] Synechocystis обладает фактором Sigma 70 -х годов (σ70), который можно разделить на три группы. группы 1 Сигма -факторы имеют решающее значение для жизнеспособности клеток. Группа 2, сходная по структуре с группой 1, не является важной для жизнеспособности клеток. Группа 3 структурно отличается и связана с выживанием в условиях стресса. Synechocystis sp. PCC6803 не имеет σN -фактора, обнаруженного в других организмах, таких как Escherichia coli , которая связана с транскрибирующими генами, связанными с азотом, но, тем не менее, способен метаболизировать азот. [ 20 ]
Естественная генетическая трансформация
[ редактировать ]Synechocystis sp. PCC6803 способен к естественной генетической трансформации . [ 22 ] Чтобы трансформация имела место, бактерии -получатели должны быть в компетентном состоянии . Было показано, что ген, COMF , участвует в развитии компетенции в Synechocystis sp. PCC6803. [ 23 ]
Синтетическая биология/генетическая инженерия
[ редактировать ]Synechocystis sp. PCC6803 считается образцовым организмом , но существует мало синтетических частей, которые можно использовать для генной инженерии . Поскольку цианобактерии в целом имеют медленное время удвоения (от 4,5 до 5 ч в Synechocystis sp. PCC6301 [ 24 ] ), более эффективно выполнять как можно больше клонирования ДНК у быстро растущего хозяина, таких как Escherichia coli . Чтобы создать плазмиды -стабильные, воспроизводить круговые кусочки ДНК-которые будут успешно функционировать у нескольких видов, необходимы трансфер с широким хост-диапазоном (см. Репликативные плазмиды ниже). Генные промоторы, которые контролируют экспрессию генов, также должны также предсказуемо работать у нескольких хостов (см. Промоторы ниже).
Репликативные плазмиды
[ редактировать ]В настоящее время существует только один трансфер с широким хост-диапазоном , RSF1010, который успешно повторяет в Synechocystis sp. PCC6803. [ 2 ] RSF1010 - это мобилизационная плазмида, которая облегчает конъюгацию между клетками, позволяя горизонтальному переносу гена ДНК. [ 25 ] Кроме того, RSF1010 кодирует свой собственный механизм репликации, так что он не зависит от своего хозяина, чтобы обладать необходимыми белками и различными факторами. [ 2 ]
Промоутеры
[ редактировать ]Генные промоторы отвечают за набор RNAP и содействие транскрипции ДНК. Промоутеры типа I состоит из консенсуса -35 и -10 ( Pribnow Box ) [ 20 ] вверх по течению от сайта Gene Start. Heidorn et al. 2011 составил список Native Synechocystis sp. Промоторы PCC6803, которые использовались в синтетических конструкциях , хотя это приводит к перекрестному разговору и неоршогональной или неспецифической экспрессии генов. [ 2 ] Горстка промоутеров Андерсона [ 26 ] (Группа конститутивных промоторов, собранных из комбинаторной библиотеки, основанной на области консенсуса -35 ( 5'-ttgaca-3 ' ) и -10 ( 5'-татаат-3' ), представленные лучше всего BBA_J23101, были продемонстрированы Функция в Synechocystis sp. PCC6803. [ 27 ] Реестр IGEM проводит эти промоторные последовательности в рамках инициативы Biobrick для создания взаимозаменяемых генетических частей. Для синтетической биологии очень важно иметь индуцируемые промоторы или гены, которые можно включить/выключить по требованию. Несколько популярных индуцибельных промоторов в E. coli - это PBAD , PTET и промоторы PLAC , которые репрессируют экспрессию генов молекулой репрессора , которая связывает оператор гена и блокирует прогрессирование RNAP.
Прогресс в инженерии Synechocystis sp. PCC6803 в настоящее время мешает промоутеру. Как отмечено выше в РНК -полимеразе и сигма -факторах, белки -бета -зажимы в комплексе RNAP имеют более высокую начальную аффинность связывания в Synechocystis sp. по сравнению с другими эубактериальными моделями. [ 21 ] Таким образом, промоторы, которые включаются/выключены в ответ на малые молекулы связывания, менее эффективны в Synechocystis, поскольку RNAP может сбить их с цепи ДНК. [ 21 ] Camsund, Heidorn and Lindblad 2014 попытались улучшить репрессию на месте в Synechocystis sp. PCC6803, разработав промоутер с несколькими оперонами, что облегчает петлю ДНК. [ 21 ] Их попытка была слишком эффективной, так как теперь было слишком сложно вызвать транскрипцию в сильно подавленных вариантах. [ 21 ] Huang and Lindblad 2013 создали библиотеку модифицированных промоторов PTET с различными уровнями репрессии и динамического диапазона в глюкозе толерантном Synechocystis sp. ATCC 27184. [ 16 ] Другим вариантом являются промоторы, которые индуцируются тяжелыми металлами, такими как: цинк , кадмий , кобальт , мышьяк , никель и хром . [ 28 ] Несколько таких промоторов были оценены в Synechocystis sp. PCC6803 от PECA 2007. Эти промоторы не идеальны, так как ионы металлов имеют решающее значение по метаболическим путям Synechocystis , и изменение концентрации может привести к составлению нежелательных побочных эффектов. [ 28 ] Кроме того, работа с этими промоутерами производит отходы, загрязненные тяжелыми металлами , увеличивая затраты на утилизацию
Сайт связывания рибосом (RBS)
[ редактировать ]Сайт связывания рибосомы (RBS) - это место, где рибосома связывает прядь мРНК и начинает трансляцию . В прокариотах RBS включает в себя последовательность Shine-Dalgarno . [ 2 ] Мало что известно о эффективности перевода RBSS в Synechocystis sp. PCC6803. [ 2 ] Heidorn et al. 2011 Сканирован Synechocystis sp. Genome PCC6803 и создал консенсусную последовательность RBS ( Tagtggaggt ), которая имела в 5 раз выше, чем консенсусная последовательность E. coli . [ 2 ]
Терминаторы
[ редактировать ]Терминаторы - это сигнал ДНК, который останавливает транскрипцию . Native Synechocystis sp. Были охарактеризованы сайты завершения PCC6803. [ 29 ]
Транскрипционная единица (TU)
[ редактировать ]Транскрипционные единицы (TUS) Synechocystis sp. PCC6803 были назначены с использованием начальных сайтов транскрипции (TSS) и транскрипта 3'-конца (TEPS). [ 29 ]
Производство биотоплива
[ редактировать ]Цианобактерии использовались несколькими способами для производства возобновляемого биотоплива. Первоначальный метод состоял в том, чтобы выращивать цианобактерии для биомассы , которая может быть преобразована через разжижение в жидкое топливо. Современные оценки показывают, что производство биотоплива из цианобактерий невозможна, поскольку возврат энергии по инвестированной (EROEI) (EROEI) является неблагоприятным. [ 30 ] EROEI не является выгодным , поскольку многочисленные крупные, закрытые биореакторы с идеальными условиями роста (солнечный свет, удобрения, концентрированный углекислый газ, кислород) должны быть построены и эксплуатированы, что потребляет ископаемое топливо . [ 30 ] Кроме того, необходима дальнейшая обработка цианобактериальных продуктов, что требует дополнительного ископаемого топлива. [ 30 ]
Synechocystis sp. PCC6803 использовался в качестве модели для увеличения выхода цианобактериальной энергии через ген -инженерию следующими манипуляциями: расширение диапазона поглощения фотосинтетического света , [ 31 ] изменение размера антенны в фотосистеме II , [ 32 ] Увеличение бикарбоната , поглощения [ 33 ] модификация Rubisco фермента для увеличения углеродной фиксации , [ 34 ] и введение метаболических путей, продуцирующих биотопливо . [ 30 ] [ 35 ] Пока не ясно, будет ли цианобактериальная биотоплива быть жизнеспособной будущей альтернативой невозобновляемому ископаемому топливу.
Базы данных
[ редактировать ]- Synechonet : интегрированная база данных взаимодействия белка-белок модели Cyanobacterium synechocystis sp. PCC 6803. Synechonet-это специализированная база данных взаимодействия белкового белка. Он показывает возможные взаимодействия с цианобактериальным доменом доменом, а также их взаимодействия на уровне белка с использованием модели Cyanobacterium, Synechocystis sp. PCC 6803. Кроме того, Synechonet предоставляет трансмембранную топологию и информацию о домене, а также сети взаимодействия в графических веб -интерфейсах.
- Цианобаза : цианобактерии несут полный набор генов для оксигенного фотосинтеза, который является наиболее фундаментальным жизненным процессом на Земле. Этот организм также интересен с эволюционной точки зрения, поскольку он возник в очень древней эпохе и выжил в различных условиях. Хлоропласт водорослей и земельного растения развивался из цианобактериальных предков, у которых развилась эндосимбиотическая связь с эукариотической клеткой -хозяева. Cyanobase обеспечивает простой способ получить доступ к последовательностям и данных аннотации в целях включения в структуры цианобактериальных геномов. Эта база данных была первоначально разработана Макото Хиросава, Такаказу Канеко и Сатоши Табата, а в текущей версии цианобазы была разработана и поддерживается Yasukazu Nakamura, Takakazu Kaneko и Satoshi Tabata в Научно -исследовательском институте Kazusa DNA.
- Строка : Строка-это база данных известных и прогнозируемых белковых взаимодействий. Взаимодействия включают прямые (физические) и косвенные (функциональные) ассоциации; Они получены из четырех источников: геномный контекст, высокопроизводительные эксперименты, (консервативная) коэкспрессия и предыдущие знания. В настоящее время база данных содержит 1513 782 белка у 373 видов. В частности, база данных обеспечивает взаимодействия для Synechocystis sp. PCC 6803.
- CTFBASE : CTFBASE содержит 1288 предполагаемых факторов транскрипции (TFS), идентифицированных из 21 полностью секвенированных цианобактериальных геномов. Благодаря своему удобному интерактивному интерфейсу пользователи могут использовать различные критерии для извлечения всех последовательностей TF и их подробной информации о аннотации, включая функции последовательности, архитектуру доменов и сходство последовательности против связанных баз данных. Кроме того, CTFBASE также обеспечивает филогенетические деревья отдельных семейств TF, множественные выравнивания последовательности ДНК-связывающего домена и идентификацию ортолога из любых выбранных геномов .
Смотрите также
[ редактировать ]- Архея Эон из предыстории Земли
- Бактериальная фила , другие основные линии доменных бактерий
- Биозернил
- Биотопливо
- Цианобактерии
- Цианобактериальный термометр РНК
- Цианобионт
- Cyanothece
- Геологическая история кислорода
- Великое событие оксигенации
- Зеленые водоросли
- Микроводоросли
- Микробные коврики
- Фослок
- Фитопланктон
- Протерозойский эон из предыстории Земли
- Строматолит
Ссылки
[ редактировать ]- ^ "GTDB - Genome GCF_000284455.1" . База данных таксономии генома .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k Heidorn T, Camsund D, Huang HH, Lindberg P, Oliveira P, Stensjö K, Lindblad P (2011). «Синтетическая биология в цианобактериях». Синтетическая биология, часть а . Методы в фермере. Тол. 497. С. 539–79. doi : 10.1016/b978-0-12-385075-1.00024-x . ISBN 9780123850751 Полем PMID 21601103 .
- ^ Dong G, Golden SS (декабрь 2008 г.). «Как цианобактериум рассказывает время» . Текущее мнение о микробиологии . 11 (6): 541–6. doi : 10.1016/j.mib.2008.10.003 . PMC 2692899 . PMID 18983934 .
- ^ Wang M, Jiang YY, Kim KM, Qu G, Ji HF, Mittenthal JE, et al. (Январь 2011). «Универсальные молекулярные часы белков и его сила в отслеживании ранней истории аэробного метаболизма и оксигенации планеты» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (1): 567–82. doi : 10.1093/molbev/msq232 . PMID 20805191 .
- ^ Уиттон Б.А., Поттс М. (2012). «Введение в цианобактерии». Экология цианобактерий II . С. 1–13. doi : 10.1007/978-94-007-3855-3_1 . ISBN 978-94-007-3854-6 Полем S2CID 18622903 .
- ^ Shih PM, Wu D, Latifi A, Axen SD, Leseer DP, Talla E, et al. (Январь 2013). «Улучшение охвата цианобактериального филома с использованием секвенирования генома, управляемого разнообразием» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (3): 1053–8. BIBCODE : 2013PNAS..110.1053S . doi : 10.1073/pnas.1217107110 . PMC 3549136 . PMID 23277585 .
- ^ Bandyopadhyay A, Elvitigala T, Welsh E, Stöckel J, Liberton M, Min H, et al. (4 октября 2011 г.). «Новые метаболические атрибуты рода Cyanothece, включающие группу одноклеточного азота-фиксирующего цианотеки» . Мбио . 2 (5): E00214–11 - E00214–11. doi : 10.1128/mbio.00214-11 . PMC 3187577 . PMID 21972240 .
- ^ Turner S, Huang TC, Chaw SM (2001). «Молекулярная филогения азотных фиксирующих одноклеточных цианобактерий». Ботанический бюллетень из академии синика . 42 : 181–186.
- ^ Червени Дж., Синетова М.А., Завел Т., Лос -да (март 2015 г.). «Механизмы высокой температурной устойчивости Synechocystis sp. PCC 6803: влияние гистидинкиназы 34» . Жизнь . 5 (1): 676–99. Bibcode : 2015life .... 5..676c . doi : 10.3390/life5010676 . PMC 4390874 . PMID 25738257 .
- ^ Marraccini P, Bulteau S, Cassier-Chauvat C, Mermet-Bouvier P, Chauvat F (ноябрь 1993). «Конъюгативный плазмидный вектор для промоторного анализа в нескольких цианобактериях родов Synechococcus и Synechocystis». Растительная молекулярная биология . 23 (4): 905–9. doi : 10.1007/bf00021546 . PMID 8251644 . S2CID 29521179 .
- ^ Jump up to: а беременный в Уильямс JG (1988). «Строительство конкретных мутаций в фотосинтетической реакционной центре Photogystem II методами генетической инженерии в Synechocystis 6803». Цианобактерии . Методы в фермере. Тол. 167. С. 766–778. doi : 10.1016/0076-6879 (88) 67088-1 . ISBN 9780121820688 .
- ^ Labarre J, Chauvat F, Thuriaux P (июнь 1989 г.). «Вставка мутагенеза путем случайного клонирования генов устойчивости к антибиотикам в геном штамма Cyanobacterium synechocystis PCC 6803» . Журнал бактериологии . 171 (6): 3449–57. doi : 10.1128/jb.171.6.3449-3457.1989 . PMC 210070 . PMID 2498291 .
- ^ Maineko T, Namura Y, Sasamoto S, Watanaba A, Kohara M, Matsumoto M, et al. (Октябрь 2003 г.). «Структурный анализ четырех больших плазмид, несущих одноцелушки Cyanbacterium, Synechocystis sp. PCC 6803 » ДНК -исследования 10 (5): 221–8 Doi : 10.1093/ dnares/ 10.5.2 PMID 14686584 .
- ^ Ikeuchi M, Tabata S (2001). «Synechocystis sp. PCC 6803 - полезный инструмент в изучении генетики цианобактерий». Фотосинтез исследования . 70 (1): 73–83. doi : 10.1023/a: 1013887908680 . PMID 16228363 . S2CID 32114202 .
- ^ Shen G, Boussiba S, Vermaas WF (декабрь 1993 г.). «Synechocystis SP PCC 6803 штаммы, в которых отсутствуют фотосистема I и функция Phycobilisome» . Растительная ячейка . 5 (12): 1853–63. doi : 10.1105/tpc.5.12.1853 . PMC 160410 . PMID 8305875 .
- ^ Jump up to: а беременный Huang HH, Lindblad P (апрель 2013 г.). «Широкодинамические промоторы, спроектированные для цианобактерий» . Журнал биологической инженерии . 7 (1): 10. doi : 10.1186/1754-1611-7-10 . PMC 3724501 . PMID 23607865 .
- ^ Андерсон С.Л., Макинтош Л (май 1991). «Световой активированный гетеротрофный рост цианобактерии Synechocystis sp. Штамм PCC 6803: процесс реквизиции синего света» . Журнал бактериологии . 173 (9): 2761–7. doi : 10.1128/jb.173.9.2761-2767.1991 . PMC 207855 . PMID 1902208 .
- ^ Табей Y, Окада К, Цузуки М (апрель 2007 г.). «SLL1330 контролирует экспрессию гликолитических генов в Synechocystis sp. PCC 6803». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 355 (4): 1045–50. doi : 10.1016/j.bbrc.2007.02.065 . PMID 17331473 .
- ^ Scholz I, Lange SJ, Hein S, Hess WR, Backofen R (18 февраля 2013 г.). «Системы CRISPR-CAS в Cyanobacterium synechocystis sp. PCC6803 демонстрируют различные пути обработки, включающие по меньшей мере два CAS6 и белок CMR2» . Plos один . 8 (2): E56470. BIBCODE : 2013PLOSO ... 856470S . doi : 10.1371/journal.pone.0056470 . PMC 3575380 . PMID 23441196 .
- ^ Jump up to: а беременный в Имамура С., Асаяма М (апрель 2009 г.). «Сигма -факторы для цианобактериальной транскрипции» . Регуляция генов и системная биология . 3 : 65–87. doi : 10.4137/grsb.s2090 . PMC 2758279 . PMID 19838335 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и Камсунд Д., Хайдорн Т., Линдблад П (январь 2014 г.). «Проектирование и анализ промоторов и сжигания ДНК в цианобактерии» . Журнал биологической инженерии . 8 (1): 4. doi : 10.1186/1754-1611-8-4 . PMC 3922697 . PMID 24467947 .
- ^ Grigorieva G, Shestakov S. Трансформация в Cyanobacterium synechocystis sp. 6803 FEMS Microbiology Letters 13 (1982) 367-370 Опубликовано Elsevier Biomedical Press https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/j.1574-6968.1982.tb08289.x
- ^ Накасуги К., Свенсон С.Дж., Нилан Б.А. (декабрь 2006 г.). «Ген компетентности, COMF, от Synechocystis sp. Штамм PCC 6803 участвует в естественной трансформации, фототаксической подвижности и пилиации» . Микробиология . 152 (Pt 12): 3623–3631. doi : 10.1099/mic.0.29189-0 . PMID 17159215 .
- ^ Сакамото Т., Брайант Д.А. (февраль 1999 г.). «Транспорт нитратов, а не фотоингибирование ограничивает рост пресной воды Cyanobacterium synechococcus pcc 6301 при низкой температуре» . Физиология растений . 119 (2): 785–94. doi : 10.1104/pp.119.2.785 . PMC 32156 . PMID 9952475 .
- ^ Scholz P, Haring V, Wittmann-Liebold B, Ashman K, Bagdasarian M, Scherzinger E (февраль 1989 г.). «Полная нуклеотидная последовательность и генная организация плазмиды RSF1010 широко-хост-диапазона». Ген . 75 (2): 271–88. doi : 10.1016/0378-1119 (89) 90273-4 . PMID 2653965 .
- ^ «Промоутеры/каталог/Андерсон» . Реестр стандартных биологических частей .
- ^ Camsund D, Lindblad P (1 октября 2014 г.). «Инженерные транскрипционные системы для цианобактериальной биотехнологии» . Границы в биоинженерии и биотехнологии . 2 : 40. doi : 10.3389/fbioe.2014.00040 . PMC 4181335 . PMID 25325057 .
- ^ Jump up to: а беременный Peca L (2007). «Характеристика активности промоторов, чувствительных к тяжелым металлам, в цианобактерии Synechocystis PCC 6803». Acta Biologica Hungarica . 58 : 11–22. doi : 10.1556/abiol.58.2007.suppl.2 . PMID 18297791 . S2CID 27474839 .
- ^ Jump up to: а беременный Чо Ш.Х., Чжон Ю., Хонг С.Дж., Ли Х, Чой Х.К., Ким Д.М. и др. (Декабрь 2021 г.). «Различные регуляторные способы Synechocystis sp. PCC 6803 в ответ на условия ингибирования фотосинтеза» . Msystems . 6 (6): E0094321. doi : 10.1128/msystems.00943-21 . PMC 8651088 . PMID 34874777 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Cotton CA, Douglass JS, De Coasemecker S, Brinkert K, Cardona T, Fantuzzi A, et al. (18 марта 2015 г.). «Фотосинтетические ограничения на топливе из микробов» . Границы в биоинженерии и биотехнологии . 3 : 36. doi : 10.3389/fbioe.2015.00036 . PMC 4364286 . PMID 25853129 .
- ^ Blankenship RE , Tiede DM, Barber J, Brudvig GW, Fleming G, Ghirardi M, et al. (Май 2011). «Сравнение фотосинтетической и фотоэлектрической эффективности и признание потенциала для улучшения» . Наука . 332 (6031): 805–9. Bibcode : 2011sci ... 332..805b . doi : 10.1126/science.1200165 . PMID 21566184 . S2CID 22798697 .
- ^ Накаджима Y, Ueda R (1997). «Улучшение фотосинтеза в плотной микроводоростной подвеске путем восстановления пигментов сбора света». Гидробиология . 9 (6): 503–510. doi : 10.1023/a: 1007920025419 . S2CID 6884865 .
- ^ Kamennaya NA, Ahn S, Park H, Bartal R, Sasaki Ka, Holman HY, Jansson C (май 2015). «Установка дополнительных бикарбонатных транспортеров в Cyanobacterium synechocystis sp. PCC6803 усиливает выработку биомассы» . Метаболическая инженерия . 29 : 76–85. doi : 10.1016/j.ymben.2015.03.002 . PMID 25769289 .
- ^ Дурао П., Агенер Х., Надь П., Мюллер-Каджар О., Хартл Фу, Хейер-Хартл М (февраль 2015 г.). «Противоположные последствия складывания и ассамблеи шаперонов на эволюционируемость Рубиско». Природная химическая биология . 11 (2): 148–55. doi : 10.1038/nchembio.1715 . PMID 25558973 .
- ^ Оливер Дж.В., Мачадо И.М., Йонда Х, Атсуми С (январь 2013 г.). «Цианобактериальное преобразование углекислого газа в 2,3-бутандиол» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (4): 1249–54. Bibcode : 2013pnas..110.1249o . doi : 10.1073/pnas.1213024110 . PMC 3557092 . PMID 23297225 .