Семейство гликозид гидролаз 15
| Гликозилгидролазы Семейство 15 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | GLYCO_HYDRO_15 | ||
| Pfam | PF00723 | ||
| PFAM клан | CL0059 | ||
| Краткое содержание | 1glm / scope / supfam | ||
| Кэзи | G15 | ||
| |||
В молекулярной биологии семейство гликозидгидролаз 15 представляет собой семейство гликозид -гидролаз .
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. это широко распространенная группа ферментов, которые гидролизируют гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неглеворным фрагментом. Система классификации для гликозидных гидролаз, основанных на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Эта классификация доступна на веб -сайте CAZY , [ 4 ] [ 5 ] а также обсуждается в Cazypedia, онлайн -энциклопедии активных ферментов углеводов. [ 6 ] [ 7 ] и [_] 9
Семейство гликозид гидролаз 15 Cazy GH_15 включает ферменты с несколькими известными видами деятельности; глюкоамилаза ( EC 3.2.1.3 ); альфа-глюкозидаза ( EC 3.2.1.20 ); глюкодекстраназа ( EC 3.2.1.70 ).
Глюкоамилаза (GA) катализирует высвобождение D-глюкозы из необращающих концов крахмала и других олиго- или полисахаридов. Исследования грибкового GA показали, что 3 тесно кластеризованные кислотные остатки, которые играют роль в каталитическом механизме. [ 8 ] Этот регион также сохраняется в недавно секвенированном бактериальном GA. [ 9 ]
3D-структура псевдотетрасахаридного акарбозы , комплексная с глюкоамилазой II (471) из Aspergillus awamori var. X100 был определен до 2,4 разрешения . [ 10 ] Белок принадлежит в основном альфа -класс и содержит 19 спиралей и 9 нитей .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервативный каталитический механизм и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (15): 7090–4. Bibcode : 1995pnas ... 92.7090h . doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375 .
- ^ Дэвис Г., Энриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз» . Структура 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00220-9 . PMID 8535779 .
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации на основе последовательности гликозилгидролаз» . Биохимический журнал . 316 (Pt 2) (Pt 2): 695–6. doi : 10.1042/bj3160695 . PMC 1217404 . PMID 8687420 .
- ^ "Дом" . Cazy.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (январь 2014 г.). «База данных по углеводам-активным ферментам (CAZY) в 2013 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 42 (проблема базы данных): D490-5. doi : 10.1093/nar/gkt1178 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 15» . Cazypedia.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Консорциум Cazypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет Казипедии: живая энциклопедия углеводов-активных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . HDL : 21.11116/0000-0003-B7EB-6 . PMID 29040563 .
- ^ Sierks MR, Ford C, Reilly PJ, Svensson B (январь 1990 г.). «Каталитический механизм грибной глюкоамилазы, определяемый мутагенезу ASP176, Glu179 и Glu180 в ферменте от Aspergillus awamori». Протеиновая инженерия . 3 (3): 193–8. doi : 10.1093/белок/3.3.193 . PMID 1970434 .
- ^ Ohnishi H, Kitamura H, Minowa T, Sakai H, Ohta T (июль 1992 г.). «Молекулярное клонирование гена глюкоамилазы из термофильного клостридий и кинетики клонированного фермента». Европейский журнал биохимии . 207 (2): 413–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb17064.x . PMID 1633799 .
- ^ Алешин А.Е., Фирсов Л.М., Хонзатко Р.Б. (июнь 1994 г.). «Уточненная структура для комплекса акарбозы с глюкоамилазой из Aspergillus awamori var. X100 до 2,4-A разрешает разрешение» . Журнал биологической химии . 269 (22): 15631–9. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 40728-9 . PMID 8195212 .
