Энсифер Нумидикус

Энсифер Нумидикус
	Клубеньки ризобий, прикрепленные к корням Vigna unguiculata.
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Псевдомонадота
Сорт:	Альфапротеобактерии
Заказ:	Гифомикробиалы
Семья:	Ризобиевые
Род:	Энсифер
Разновидность:	Э. нумидикус
Биномиальное имя
	Энсифер Нумидикус ; Мерабет и др. 2010 год
Тип штамма
	ОРС 1444, ОРС1410, ОРС 1407, LMG 24690, CIP 109850, PN14, LBi2

Ensifer numidicus — азотфиксирующий симбионт семейства Fabaceae . ^{[ 1 ]} грамотрицательная, аэробная, неспорообразующая палочковидная бактерия семейства Rhizobiaceae . ^{[ 2 ]} Впервые описан в 2010 г.; ^{[ 1 ]} с тех пор было выделено и описано больше биоваров ^{[ 3 ]} с ORS 1407 считается репрезентативным организмом. ^{[ 4 ]} Большинство примеров было обнаружено в засушливых и инфразасушливых регионах Туниса . ^{[ 5 ]}

Растения-хозяева

Было показано, что биовары вызывают образование клубеньков у самых разных видов растений, способных к симбиозу, включая Medicago Sativa ( культивируемая люцерна). ^{[ 6 ]}, критский лотос ^{[ 3 ]}, сирийский мескит ( чучело Просописа ) , ^{[ 7 ]} Lens culinaris Medikus ssp( чечевица ) ^{[ 3 ]}^{[ 8 ]} а также Cicer arietinum (нут) ^{[ 3 ]} и Argyrolobium uniflorum . ^{[ 1 ]}

Связанные биовары

Argyrolobium uniflorum : ORS 1407. ^{[ 1 ]}

культурная люцерна ( Medicago sativa ) : ORS 1407 ^{[ 1 ]}

Критский лотос : PT26 ^{[ 7 ]}, ОРС 1410 ^{[ 3 ]}

Культивированная чечевица (Lens culinaris): ORS 1444. ^{[ 3 ]}

Нут : LBi ₂^{[ 3 ]}

Сирийский мескит ( Prosopis Farca ): PN14. ^{[ 7 ]}

Известные взаимоотношения между сортами

нумидийский

ОРС 1407

ОРС 1444

	ОРС 1410

Эта филогения основана на ограниченном анализе 16S рибосомальной РНК. ^{[ 1 ]}

Геном

Анализ 16s РНК показал, что Ensifer numidicus тесно связан с Ensifer medicae и Ensifer garamanticus . ^{[ 3 ]} Аналогичные гены между близкородственными видами предполагают высокий уровень горизонтального переноса генов между близкородственными видами. ^{[ 3 ]} Лабораторная инокуляция показала, что Ensifer numidicus по крайней мере при некоторых обстоятельствах образует неопределенные клубеньки на растениях-хозяевах. ^{[ 9 ]}

Условия роста

E. numidicus растет на дрожжево-маннитовой среде при температуре 28°С с верхним пределом 40°С. Было обнаружено, что ^{[ 1 ]} У штаммов, культивируемых в лаборатории, обнаружен метаболизм по меньшей мере 13 субстратов, включая дульцит, D-ликсозу, 1-O-метил-AD-глюкопиранозид, 3-O-метил-D-глюкопиранозу, D-глюконат , L-гистидин , сукцинат , фумарат , этаноламин. , DL-b-гидроксибутират, L-аспартат, L-аланин и пропионат. ^{[ 1 ]} Обнаружена чувствительность к концентрации соли более 4%. ^{[ 3 ]} Из-за сходства с другими видами Ensifer его нельзя описать только по условиям роста, и его необходимо дифференцировать по генетическим компонентам. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Мерабет, К.; Мартенс, М.; Махдхи, М.; Захия, Ф.; Си, А.; Ле Ру, К.; Домерг, О.; Купман, Р.; Бекки, А.; Марс, М.; Виллемс, А. (март 2010 г.). «Анализ мультилокусной последовательности изолятов корневых клубеньков Lotus arabicus (Сенегал), Lotus creticus, Argyrolobium uniflorum и Medicago sativa (Тунис) и описание Ensifer numidicus sp. nov. и Ensifer garamanticus sp. nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (Часть 3): 664–674. дои : 10.1099/ ijs.0.012088-0 hdl : 1854/LU-936490 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 19656922 .
^ Подставка, Адам. « Ensifer numidicus | Типовой штамм | LMG 24690, CIP 109850, ORS 1407 | BacDiveID:133535» . bacdive.dsmz.de . Проверено 02 сентября 2021 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Небеса, Дхауи; Мохтар, Режим; Питер, Мергерт; Мохаммед, март (2016 г.). « Rhizobium leguminosarum symbiovar trifolii , Ensifer numidicus и Mesorhizobium amorphae symbiovar ciceri (или Mesorhizobium loti ) являются новыми эндосимбиотическими бактериями Lens culinaris Medik» . ФЭМС Микробиология Экология . 92 (8): не определено. дои : 10.1093/femsec/fiw118 . ПМИД 27267929 .
^ Паркер, Чарльз Томас; Тейлор, Доротея; Гаррити, Джордж М. (2010). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Штамм ORS 1407 (=LMG 24690 =CIP 109850): микробные характеристики и геномная информация» . doi : 10.1601/ex.17831 (неактивен 17 апреля 2024 г.). {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь ) CS1 maint: DOI неактивен с апреля 2024 г. ( ссылка )
^ Бессадок, Хулуд; Наварро-Торре, Сальвадора; Фтерих, Амира; Кавьедес, Мигель Анхель; Пахуэло, Элоиза; Родригес-Льоренте, Игнасио Давид; Марс, Мохамед (01 мая 2021 г.). «Разнообразие ризобий, выделенных из засушливых почв Туниса, способных образовывать азотфиксирующий симбиоз с Anthyllis henoniana» . Журнал засушливой среды . 188 : 104467. Бибкод : 2021JArEn.188j4467B . дои : 10.1016/j.jaridenv.2021.104467 . ISSN 0140-1963 . S2CID 233567533 .
^ Мерабет, Шахинес; Мартенс, Миет; Махди, М.; Закхей, Фредерик; Си, А.; Ле Ру, К.; Домерг, О.; Купман, Ренана; Бекки, А.; Марс, М.; Виллемс, Энн (2010). «Анализ мультилокусной последовательности изолятов корневых клубеньков Lotus arabicus (Сенегал), Lotus creticus , Argyrolobium uniflorum и Medicago sativa (Тунис) и описание Ensifer numidicus sp nov и Ensifer garamanticus sp nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (3): 664–674. дои : 10.1099/ ijs.0.012088-0 hdl : 1854/LU-936490 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 19656922 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Фтерих, А.; Махдхи, М.; Кавьедес, Массачусетс; Пахуэло, Э.; Ривас, Р.; Родригес-Льоренте, ID; Марс, М. (01 июня 2011 г.). «Характеристика клубеньковых бактерий, связанных с Prosopis Farcta, растущих в засушливых регионах Туниса» . Архив микробиологии . 193 (6): 385–397. дои : 10.1007/s00203-011-0683-z . ISSN 1432-072X . ПМИД 21359955 . S2CID 24398589 .
^ «Таксономическое и симбиотическое разнообразие бактерий, выделенных из клубеньков Acacia tortilis subsp. raddiana в засушливых почвах Туниса» . Исследовательские ворота . Проверено 02 сентября 2021 г.
^ Лэмб, Ирен; Руис-Диес, Беатрис; Коба Скалы, Теодор; Балагер, Луи; Лукас, М. Мерседес; Корнер, Ханна; Пуэйо, Джозеф Дж. (01 мая 2016 г.). «Ризобиальное разнообразие, симбиотическая эффективность и структура клубеньков Vachellia macracantha » . Биология и биохимия почвы . 96 : 39–54. doi : 10.1016/soilbio.2016.01.011 . ISSN 0038-0717 .

[:1-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Мерабет, К.; Мартенс, М.; Махдхи, М.; Захия, Ф.; Си, А.; Ле Ру, К.; Домерг, О.; Купман, Р.; Бекки, А.; Марс, М.; Виллемс, А. (март 2010 г.). «Анализ мультилокусной последовательности изолятов корневых клубеньков Lotus arabicus (Сенегал), Lotus creticus, Argyrolobium uniflorum и Medicago sativa (Тунис) и описание Ensifer numidicus sp. nov. и Ensifer garamanticus sp. nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (Часть 3): 664–674. дои : 10.1099/ ijs.0.012088-0 hdl : 1854/LU-936490 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 19656922 .

[2] Подставка, Адам. « Ensifer numidicus | Типовой штамм | LMG 24690, CIP 109850, ORS 1407 | BacDiveID:133535» . bacdive.dsmz.de . Проверено 02 сентября 2021 г.

[:0-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Небеса, Дхауи; Мохтар, Режим; Питер, Мергерт; Мохаммед, март (2016 г.). « Rhizobium leguminosarum symbiovar trifolii , Ensifer numidicus и Mesorhizobium amorphae symbiovar ciceri (или Mesorhizobium loti ) являются новыми эндосимбиотическими бактериями Lens culinaris Medik» . ФЭМС Микробиология Экология . 92 (8): не определено. дои : 10.1093/femsec/fiw118 . ПМИД 27267929 .

[4] Паркер, Чарльз Томас; Тейлор, Доротея; Гаррити, Джордж М. (2010). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Штамм ORS 1407 (=LMG 24690 =CIP 109850): микробные характеристики и геномная информация» . doi : 10.1601/ex.17831 (неактивен 17 апреля 2024 г.). {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь ) CS1 maint: DOI неактивен с апреля 2024 г. ( ссылка )

[5] Бессадок, Хулуд; Наварро-Торре, Сальвадора; Фтерих, Амира; Кавьедес, Мигель Анхель; Пахуэло, Элоиза; Родригес-Льоренте, Игнасио Давид; Марс, Мохамед (01 мая 2021 г.). «Разнообразие ризобий, выделенных из засушливых почв Туниса, способных образовывать азотфиксирующий симбиоз с Anthyllis henoniana» . Журнал засушливой среды . 188 : 104467. Бибкод : 2021JArEn.188j4467B . дои : 10.1016/j.jaridenv.2021.104467 . ISSN 0140-1963 . S2CID 233567533 .

[6] Мерабет, Шахинес; Мартенс, Миет; Махди, М.; Закхей, Фредерик; Си, А.; Ле Ру, К.; Домерг, О.; Купман, Ренана; Бекки, А.; Марс, М.; Виллемс, Энн (2010). «Анализ мультилокусной последовательности изолятов корневых клубеньков Lotus arabicus (Сенегал), Lotus creticus , Argyrolobium uniflorum и Medicago sativa (Тунис) и описание Ensifer numidicus sp nov и Ensifer garamanticus sp nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (3): 664–674. дои : 10.1099/ ijs.0.012088-0 hdl : 1854/LU-936490 . ISSN 1466-5026 . ПМИД 19656922 .

[:2-7] Jump up to: ^а ^б ^с Фтерих, А.; Махдхи, М.; Кавьедес, Массачусетс; Пахуэло, Э.; Ривас, Р.; Родригес-Льоренте, ID; Марс, М. (01 июня 2011 г.). «Характеристика клубеньковых бактерий, связанных с Prosopis Farcta, растущих в засушливых регионах Туниса» . Архив микробиологии . 193 (6): 385–397. дои : 10.1007/s00203-011-0683-z . ISSN 1432-072X . ПМИД 21359955 . S2CID 24398589 .

[8] «Таксономическое и симбиотическое разнообразие бактерий, выделенных из клубеньков Acacia tortilis subsp. raddiana в засушливых почвах Туниса» . Исследовательские ворота . Проверено 02 сентября 2021 г.

[9] Лэмб, Ирен; Руис-Диес, Беатрис; Коба Скалы, Теодор; Балагер, Луи; Лукас, М. Мерседес; Корнер, Ханна; Пуэйо, Джозеф Дж. (01 мая 2016 г.). «Ризобиальное разнообразие, симбиотическая эффективность и структура клубеньков Vachellia macracantha » . Биология и биохимия почвы . 96 : 39–54. doi : 10.1016/soilbio.2016.01.011 . ISSN 0038-0717 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]