Андрей Шали
Андрей Шали | |
---|---|
![]() Шали выступает на ISMB 2012. | |
Рожденный | 1963 (60–61 год) |
Альма-матер | Биркбек-колледж Лондонского университета |
Научная карьера | |
Учреждения | Калифорнийский университет, Сан-Франциско Гарвардский университет Рокфеллеровский университет Биркбек-колледж Лондонского университета Университет Любляны |
Диссертация | Моделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности (1991). |
Докторантура | Том Бланделл |
Веб-сайт | www |
Андрей Шали (род. 1963, Крань, Словения ) — вычислительный структурный биолог . С 2003 года он является профессором кафедры биоинженерии и терапевтических наук Калифорнийского университета в Сан-Франциско. [ 1 ] Он также является редактором журнала Structure .
Образование
[ редактировать ]Шали получил степень бакалавра наук по химии в Люблянском университете в 1987 году; его доктор философии. степень бакалавра молекулярной биофизики Биркбек -колледжа , [ 2 ] Лондонский университет , 1991 г. (работает с Томом Бланделлом ); и работал над докторской диссертацией в Гарвардском университете (работая с Мартином Карплюсом ).
Исследовать
[ редактировать ]Сали поступил на факультет Рокфеллеровского университета в 1995 году после окончания постдокторской диссертации в Гарвардском университете . Он использует вычисления, основанные на законах физики и эволюции, для изучения структуры и функций белков. Например, он разработал сравнительное моделирование структуры белков по удовлетворению пространственных ограничений, реализованное в программе MODELLER. [ 3 ] и интегративное определение структуры макромолекулярных ансамблей, реализованное в программе IMP. [ 4 ]
Влияние исследования
[ редактировать ]Сали внес большой вклад в структурную биологию, разрабатывая и применяя вычислительные методы структурного моделирования и анализа белков. Две наиболее часто используемые программы, разработанные его исследовательской группой, включают «MODELLER» для сравнительного моделирования структуры белков и «IMP» для определения интегративной структуры.
По состоянию на январь 2022 года Шали опубликовал около 400 статей. [ 5 ] которые были процитированы примерно 89 000 раз в Google Scholar. Его индекс Хирша равен 132 (т.е. 132 публикации процитированы не менее 132 раз).
В 2018 году Шали был избран членом Национальной академии наук в знак признания его вклада в биофизику и вычислительную биологию . [ 6 ]
Известные выпускники Shali Lab
[ редактировать ]Имя | Должность в лаборатории | Продолжительность | Текущее местоположение | Текущая позиция |
---|---|---|---|---|
Фрэнк Альбер | Постдокторант | Калифорнийский университет, Лос-Анджелес, Калифорния, США | Профессор | |
Физер Андры | Постдокторант | Сентябрь 1997 г. - декабрь 2002 г. | Медицинский колледж Альберта Эйнштейна, Бронкс, Нью-Йорк | Профессор |
Рэйчел Карчин | Постдокторант | с августа 2003 г. по август 2006 г. | Университет Джонса Хопкинса | Доцент |
Дмитрий Коркин | Постдокторант | Сентябрь 2002 г. - июль 2007 г. | Вустерский политехнический институт | Профессор |
Марк А. Марти-Реном | Постдокторант
Адъюнкт-доцент |
февраль 1999 г. - июнь 2006 г. | Национальный центр геномного анализа (CNAG), Барселона, Испания | Руководитель группы |
MS Мадхусудхан | Постдокторант | Февраль 2000 г. - март 2008 г. | IISER, Пуна, Индия | Доцент |
горшок майя | Постдокторант | 2003-2006 гг. | Центр структурной системной биологии, Гамбург, Германия | Профессор |
Дэвид Баркан | доктор философии Студент | Сентябрь 2006 г. - октябрь 2011 г. | Терапия главного героя | Штатный научный сотрудник |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Публикации Андрея Шали , индексируемые Microsoft Academic.
- ^ Сали, Андрей (1984). Моделирование трехмерной структуры белка по его аминокислотной последовательности (кандидатская диссертация). Лондон, Биркбек-колледж.
- ^ Шали, А.; Бланделл, ТЛ (1993). «Сравнительное моделирование белков путем удовлетворения пространственных ограничений». Журнал молекулярной биологии . 234 (3): 779–815. дои : 10.1006/jmbi.1993.1626 . ПМИД 8254673 .
- ^ Рассел, Д.; Ласкер, К.; Уэбб, Б.; Веласкес-Мюриэль, Дж.; Тиоэ, Э.; Шнейдман-Духовны, Д.; Петерсон, Б.; Сали, А. (2012). «Соединяем детали: программное обеспечение платформы интегративного моделирования для определения структуры макромолекулярных ансамблей» . ПЛОС Биология . 10 (1): e1001244. дои : 10.1371/journal.pbio.1001244 . ПМК 3260315 . ПМИД 22272186 .
- ^ Публикации Андрея Шали
- ^ «Андрей Сали» . Национальная академия наук . Проверено 23 июля 2018 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- 1963 года рождения
- Живые люди
- Словенские биологи
- Выпускники Биркбека Лондонского университета
- Выпускники Гарвардского университета
- Калифорнийский университет, факультет Сан-Франциско
- Выпускники Люблянского университета
- Люди из Краня
- Члены Международного общества вычислительной биологии
- Американские биологи XXI века
- Члены Национальной академии наук США
- Обладатели медали полыни