Белок 2, связанный с драгоценными камнями

БЛИЗНЕЦ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2LEH, 3S6N
Идентификаторы
Псевдонимы	GEMIN2 , SIP1, SIP1-дельта, выживание белка 1, взаимодействующего с белком мотонейрона, белок 2, связанный с ядерной органеллой драгоценного камня
Внешние идентификаторы	Опустить : 602595 ; МГИ : 1913853 ; Гомологен : 37827 ; Генные карты : GEMIN2 ; ОМА : GEMIN2 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	39,136,973 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	59,075,256 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; secondary oocyte; ; sperm; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; gonad; ; right testis; ; left testis; ; testicle; ; gastrocnemius muscle;
	Top expressed in
	morula; ; otic placode; ; epiblast; ; embryo; ; embryo; ; endocardial cushion; ; primitive streak; ; otic vesicle; ; abdominal wall; ; ureter;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	SMN complex; SMN-Sm protein complex; cytosol; spliceosomal complex; nucleolus; intracellular anatomical structure; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; nuclear body; gemini of coiled bodies;
Biological process	RNA splicing, via transesterification reactions; mRNA processing; spliceosomal complex assembly; RNA splicing; spliceosomal snRNP assembly; import into nucleus;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8487
	66603
	ENSG00000092208
	ENSMUSG00000060121
	О14893
	Q9CQQ4
	НМ_001009182 ; НМ_001009183 ; НМ_003616
	НМ_025656
	НП_001009182 ; НП_001009183 ; НП_003607
	НП_079932
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2, связанный с драгоценными камнями ( GEMIN2 ), также называемый белком 1, взаимодействующим с белками двигательных нейронов ( SIP1 ), представляет собой белок , который у людей кодируется GEMIN2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ассоциированный с драгоценными камнями белок 2 взаимодействует с DDX20. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} и СМН1 . ^{[ 6 ]}^{[ 10 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000092208 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060121 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фишер Ю, Лю Ц, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Комплекс SMN-SIP1 играет важную роль в биогенезе сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 90 (6): 1023–1029. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80368-2 . ПМИД 9323130 .
^ Jump up to: ^а ^б Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–1021. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 .
^ «Ген Энтрез: выживание SIP1 белка 1 мотонейрона, взаимодействующего с белком 1» .
^ Мурелатос З., Дости Дж., Паушкин С., Шарма А., Шарру Б., Абель Л. и др. (март 2002 г.). «МиРНП: новый класс рибонуклеопротеинов, содержащий многочисленные микроРНК» . Гены и развитие . 16 (6): 720–728. дои : 10.1101/gad.974702 . ПМК 155365 . ПМИД 11914277 .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–1194. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–1986. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .

Дальнейшее чтение

Ван З, Ву X, Фридберг EC (сентябрь 1997 г.). «Молекулярный механизм эксцизионной репарации оснований урацилсодержащей ДНК в бесклеточных экстрактах дрожжей» . Журнал биологической химии . 272 (38): 24064–24071. дои : 10.1074/jbc.272.38.24064 . ПМИД 9295360 .
Чжан WJ, Ву JY (февраль 1998 г.). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (2): 676–684. дои : 10.1128/mcb.18.2.676 . ПМЦ 108778 . ПМИД 9447963 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–1194. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Журнал клеточной биологии . 148 (6): 1177–1186. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Хельмкен С., Веттер А., Рудник-Шёнеборн С., Лиер Т., Зеррес К., Вирт Б. (июль 2000 г.). «Основной белок, взаимодействующий с SMN (SIP1), не участвует в фенотипической изменчивости спинальной мышечной атрофии (СМА)» . Европейский журнал генетики человека . 8 (7): 493–499. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200479 . ПМИД 10909848 .
Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–1986. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .
Янг П.Дж., Мэн Н.Т., Лорсон К.Л., Ле Т.Т., Андрофи Э.Дж., Бергес А.Х., Моррис Дж.Е. (ноябрь 2000 г.). «Область экзона 2b белка спинальной мышечной атрофии, SMN, участвует в самоассоциации и связывании SIP1» . Молекулярная генетика человека . 9 (19): 2869–2877. дои : 10.1093/hmg/9.19.2869 . ПМИД 11092763 .
Селенко П., Спрангерс Р., Стир Г., Бюлер Д., Фишер У., Саттлер М. (январь 2001 г.). «Структура домена SMN Tudor и ее взаимодействие с белками Sm». Структурная биология природы . 8 (1): 27–31. дои : 10.1038/83014 . ПМИД 11135666 . S2CID 27071310 .
Пеллиццони Л., Шарру Б., Раппсильбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (январь 2001 г.). «Функциональное взаимодействие между комплексом выживающих мотонейронов и РНК-полимеразой II» . Журнал клеточной биологии . 152 (1): 75–85. дои : 10.1083/jcb.152.1.75 . ПМЦ 2193649 . ПМИД 11149922 .
Яблонка С., Бандилья М., Визе С., Бюлер Д., Вирт Б., Сендтнер М., Фишер У. (март 2001 г.). «Совместная регуляция выживания белка двигательного нейрона (SMN) и его взаимодействия SIP1 во время развития и при спинальной мышечной атрофии» . Молекулярная генетика человека . 10 (5): 497–505. дои : 10.1093/hmg/10.5.497 . ПМИД 11181573 .
Фризен В.Дж., Массне С., Паушкин С., Вайс А., Дрейфус Г. (май 2001 г.). «SMN, продукт гена спинальной мышечной атрофии, преимущественно связывается с белками-мишенями, содержащими диметиларгинин» . Молекулярная клетка . 7 (5): 1111–1117. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00244-1 . ПМИД 11389857 .
Пак Дж.В., Восс П.Г., Грабски С., Ван Дж.Л., Паттерсон Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (17): 3595–3602. дои : 10.1093/нар/29.17.3595 . ПМК 55878 . ПМИД 11522829 .
Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А., Массне С., Песиридис Г.С., Ван Дуйн Г. и др. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (24): 8289–8300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .
Губитц А.К., Мурелатос З., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (февраль 2002 г.). «Gemin5, новый белковый компонент повторов WD комплекса SMN, который связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (7): 5631–5636. дои : 10.1074/jbc.M109448200 . ПМИД 11714716 .
Пеллиццони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (март 2002 г.). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–7545. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Аэрбажинай В., Исихара Т., Арахата К., Цукахара Т. (июнь 2002 г.). «Повышенный уровень экспрессии сплайсингового варианта SIP1 при заболеваниях двигательных нейронов». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 34 (6): 699–707. дои : 10.1016/S1357-2725(01)00150-9 . ПМИД 11943600 .
Бэккон Дж., Пеллиццони Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (август 2002 г.). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов» . Журнал биологической химии . 277 (35): 31957–31962. дои : 10.1074/jbc.M203478200 . ПМИД 12065586 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 14 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000092208 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060121 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9323130-5] Фишер Ю, Лю Ц, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Комплекс SMN-SIP1 играет важную роль в биогенезе сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 90 (6): 1023–1029. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80368-2 . ПМИД 9323130 .

[pmid9323129-6] Jump up to: ^а ^б Лю Ц, Фишер Ю, Ван Ф, Дрейфусс Г (сентябрь 1997 г.). «Продукт гена заболевания спинальной мышечной атрофией, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP» . Клетка . 90 (6): 1013–1021. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80367-0 . ПМИД 9323129 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: выживание SIP1 белка 1 мотонейрона, взаимодействующего с белком 1» .

[pmid11914277-8] Мурелатос З., Дости Дж., Паушкин С., Шарма А., Шарру Б., Абель Л. и др. (март 2002 г.). «МиРНП: новый класс рибонуклеопротеинов, содержащий многочисленные микроРНК» . Гены и развитие . 16 (6): 720–728. дои : 10.1101/gad.974702 . ПМК 155365 . ПМИД 11914277 .

[pmid10601333-9] Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–1194. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .

[pmid10942426-10] Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Молекулярная генетика человека . 9 (13): 1977–1986. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]