Jump to content

SMC6

SMC6
Идентификаторы
Псевдонимы SMC6 , SMC-6, SMC6L1, структурное сохранение хромосом 6
Внешние идентификаторы Опустить : 609387 ; МГИ : 1914491 ; Гомологен : 41575 ; Генные карты : SMC6 ; ОМА : SMC6 – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001142286
НМ_024624

НМ_025695
НМ_001324476
НМ_001361252

RefSeq (белок)

НП_001135758
НП_078900

НП_001311405
НП_079971
НП_001348181

Местоположение (UCSC) Chr 2: 17,66 – 17,8 Мб Чр 12: 11.32 – 11.37 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок 6 структурного поддержания хромосом — это белок , который у человека кодируется SMC6 геном . [ 5 ] [ 6 ]

Структура

[ редактировать ]

SMC6 был впервые обнаружен у делящихся дрожжей как RAD18 (SMC6). Он образует гетеродимерный комплекс с белком Spr18 (SMC5). [ 7 ] [ 8 ] У дрожжей комплекс SMC5/6 имеет субъединицы, состоящие из SMC5, SMC6 и шести белков неструктурного поддержания хромосом (NSE). Субъединицы Nse1-Nse3-Nse4 соединяют головку Smc6 Smc5 и позволяют связываться с ДНК. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

Он потенциально участвует в механизме альтернативного удлинения теломер рака. [ 12 ]

Это отражает расположение белков Nse вдоль комплекса SMC5/6 у почкующихся и делящихся дрожжей. Это изображение не включает Nse2, поскольку его положение в комплексе на данный момент неизвестно.

Nse-субъединицы

[ редактировать ]

Субъединицы Nse1-Nse3-Nse4 соединяют головки белков Smc5 и Smc6 и позволяют комплексу связываться с ДНК. Nse5 и Nse6 образуют подкомплекс, который локализуется в головке комплекса SMC5/6 у почкующихся дрожжей Saccharomyces cerevisiae и в шарнирах комплекса SMC5/6 у делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe . Субкомплекс Nse5/6 необходим для репликации S. cerevisiae , но не охарактеризован как необходимый для S. pombe . Белки, ортологичные Nse5-Nse6, существуют и у других эукариот, а именно ASAP1-SNI1 у Arabidopsis thaliana и SLF1-SLF2 у людей, которые, как полагают, имеют аналогичную функцию со своими аналогами Nse. Локализация SLF1 и SLF2 в комплексе SMC5/6 человека неизвестна. [ 13 ] [ 14 ]

Локализация

[ редактировать ]

Комплекс Smc5/6 имеет не очень консервативные методы локализации. У людей комплекс локализуется в последовательностях вирусной ДНК с использованием факторов локализации SMC5/6 1 и 2 (SLF1 и SLF2), что способствует устойчивости к вирусам. [ 15 ] У растения A. thaliana этот гетеродимер может быть локализован в двухцепочечных разрывах для гомологичной рекомбинации с использованием комплекса SWI3B пути SWI/SNF . [ 16 ] После локализации в ДНК комплекс SCM5/6 неспецифически связывается с ~20 парами оснований ДНК. [ 17 ]

Роль в рекомбинации и мейозе

[ редактировать ]

Белки Smc6 и Smc5 образуют гетеродимерную кольцевую структуру и вместе с другими не-SMC-элементами образуют комплекс SMC-5/6. У червя Caenorhabditis elegans этот комплекс взаимодействует с геликазой HIM-6 (BLM), способствуя промежуточному процессингу мейотической рекомбинации и созреванию хромосом . [ 18 ] Комплекс SMC-5/6 в ооцитах мыши необходим для образования компетентных к сегрегации бивалентов во время мейоза . [ 19 ] В дрожжах Saccharomyces cerevisiae SMC6 необходим для устойчивости к повреждению ДНК, а также для вызванной повреждением межхромосомной и сестринской рекомбинации хроматид . [ 20 ] У человека синдром разрыва хромосом, характеризующийся тяжелым заболеванием легких в раннем детстве, связан с мутацией компонента комплекса SMC-5/6. [ 21 ] В клетках пациента наблюдаются перестройки хромосом , микроядер , чувствительность к повреждению ДНК и дефектная гомологичная рекомбинация .

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163029 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020608 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Дж, Глассль С, Ансорж В, Бохер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Дж, Дастерхофт А, Бейер А, Корер К, Штрак Н, Мьюз Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК   311072 . ПМИД   11230166 .
  6. ^ «Ген Энтрез: структурное поддержание SMC6 хромосом 6» .
  7. ^ Фустери М.И., Леманн А.Р. (апрель 2000 г.). «Новый белковый комплекс SMC у Schizosaccharomyces pombe содержит белок репарации ДНК Rad18» . Журнал ЭМБО . 19 (7): 1691–702. дои : 10.1093/emboj/19.7.1691 . ПМК   310237 . ПМИД   10747036 .
  8. ^ Леманн А.Р., Валика М., Гриффитс Д.Д., Мюррей Дж.М., Уоттс Ф.З., Маккриди С., Карр А.М. (декабрь 1995 г.). «Ген rad18 Schizosaccharomyces pombe определяет новую подгруппу суперсемейства SMC, участвующую в репарации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (12): 7067–80. дои : 10.1128/mcb.15.12.7067 . ПМК   230962 . ПМИД   8524274 .
  9. ^ Палечек Дж., Видот С., Фенг М., Доэрти А.Дж., Леманн А.Р. (декабрь 2006 г.). «Комплекс репарации ДНК Smc5-Smc6: соединение головок Smc5-Smc6 с помощью KLEISIN, Nse4 и неклейзиновых субъединиц» . Журнал биологической химии . 281 (48): 36952–36959. дои : 10.1074/jbc.M608004200 . ПМИД   17005570 .
  10. ^ Забради К., Адамус М., Вондрова Л., Ляо С., Скупилова Х., Новакова М., Юрцисинова Л., Альт А., Оливер А.В., Леманн А.Р., Палечек Дж.Дж. (февраль 2016 г.). «Ассоциация хроматина комплекса SMC5/6 зависит от связывания его субъединицы NSE3 с ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (3): 1064–1079. дои : 10.1093/nar/gkv1021 . ПМЦ   4756808 . ПМИД   26446992 .
  11. ^ Вондрова Л., Колесар П., Адамус М., Носиар М., Оливер А.В., Палечек Дж.Дж. (июнь 2020 г.). «Роль клейзина Nse4 и субъединиц Nse1/Nse3 KITE в АТФазном цикле SMC5/6 » Научные отчеты 10 (1): Бибкод : 2020NatSR..10.9694V 9694. doi : 10.1038/s41598-020-66647-w . ПМЦ   7297730 . ПМИД   32546830 .
  12. ^ Поттс PR, Ю Х (2007). «Комплекс SMC5/6 поддерживает длину теломер в раковых клетках ALT посредством SUMOylation белков, связывающих теломеры». Нат. Структура. Мол. Биол . 14 (7): 581–90. дои : 10.1038/nsmb1259 . ПМИД   17589526 . S2CID   7915836 .
  13. ^ Ян, Шуньпин; Ван, Вэй; Маркес, Хорхе; Мохан, Раджникант; Салех, Абделати; Даррант, Венди Э.; Сун, Цзюньци; Донг, Синьнянь (21 ноября 2013 г.). «Салициловая кислота активирует реакцию на повреждение ДНК, усиливая иммунитет растений» . Молекулярная клетка . 52 (4): 602–610. doi : 10.1016/j.molcel.2013.09.019 . ISSN   1097-2765 . ПМЦ   3863363 . ПМИД   24207055 .
  14. ^ Диас, Мариана; Печинка, Алесь (12 января 2018 г.). «Основа для ремонта: понимание молекулярных функций комплекса SMC5/6» . Гены . 9 (1): 36. doi : 10.3390/genes9010036 . ISSN   2073-4425 . ПМЦ   5793187 . ПМИД   29329249 .
  15. ^ Оравцова, Мартина; Не, Минхуа; Зилио, Никола; Маэда, Синтаро; Джами-Алахмади, Ясаман; Лаццерини-Денки, Эрос; Вольшлегель, Джеймс А.; Ульрих, Хелле Д; Отомо, Таканори; Бодди, Майкл Н. (14 ноября 2022 г.). Чиоло, Ирен Э; Тайлер, Джессика К. (ред.). «Nse5/6-подобный комплекс SIMC1-SLF2 локализует SMC5/6 в центрах репликации вируса» . электронная жизнь . 11 : e79676. doi : 10.7554/eLife.79676 . ISSN   2050-084X . ПМК   9708086 . ПМИД   36373674 .
  16. ^ Цзян, Цземин; Мао, Нин; Ху, Хуан; Тан, Цзяхан; Хан, Данлу; Лю, Сун; Ву, Цянь; Лю, Иян; Пэн, Чанглян; Лай, Цзяньбинь; Ян, Ченгвэй (23 июля 2019 г.). «Субъединица SWI/SNF регулирует хромосомную диссоциацию комплекса поддержания структуры 5 во время репарации ДНК в растительных клетках» . Труды Национальной академии наук . 116 (30): 15288–15296. Бибкод : 2019PNAS..11615288J . дои : 10.1073/pnas.1900308116 . ISSN   0027-8424 . ПМК   6660752 . PMID   31285327 .
  17. ^ Ю, Ты; Ли, Шибай; Сер, Чжэн; Куанг, Хуэйхуэй; Тан, Тейн; Гуань, Даньин; Чжао, Сяолань; Патель, Диншоу Дж. (07 июня 2022 г.). «Крио-ЭМ-структура связанного с ДНК Smc5/6 обнаруживает зажатие ДНК, вызванное конформационными изменениями нескольких субъединиц» . Труды Национальной академии наук . 119 (23): e2202799119. Бибкод : 2022PNAS..11902799Y . дои : 10.1073/pnas.2202799119 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   9191643 . PMID   35648833 .
  18. ^ Хонг Ю, Сонневилль Р, Агостиньо А, Мейер Б, Ван Б, Блоу Джей Джей, Гартнер А (2016). «Комплекс SMC-5/6 и геликаза HIM-6 (BLM) синергически способствуют промежуточному процессингу мейотической рекомбинации и созреванию хромосом во время мейоза Caenorhabditis elegans» . ПЛОС Генет . 12 (3): e1005872. дои : 10.1371/journal.pgen.1005872 . ПМК   4807058 . ПМИД   27010650 .
  19. ^ Хван Дж., Сунь Ф., О'Брайен М., Эппиг Дж.Дж., Хэндель М.А., Джордан П.В. (2017). «SMC5/6 необходим для формирования компетентных к сегрегации двухвалентных хромосом во время мейоза I в ооцитах мыши» . Разработка . 144 (9): 1648–1660. дои : 10.1242/dev.145607 . ПМК   5450844 . ПМИД   28302748 .
  20. ^ Онода Ф., Такеда М., Секи М., Маэда Д., Тадзима Дж., Уи А., Яги Х., Эномото Т. (2004). «SMC6 необходим для MMS-индуцированной межхромосомной и сестринской рекомбинации хроматид у Saccharomyces cerevisiae». Восстановление ДНК (Амст.) . 3 (4): 429–39. дои : 10.1016/j.dnarep.2003.12.007 . ПМИД   15010319 .
  21. ^ ван дер Краббен С.Н., Хеннус М.П., ​​МакГрегор Г.А., Риттер Д.И., Нагамани С.С., Уэллс О.С., Харакалова М., Чинн И.К., Альт А., Вондрова Л., Хохстенбах Р., ван Монфранс Дж.М., Терхегген-Лагро С.В., ван Лисхаут С., ван Русмален MJ, Ренкенс I, Дюран К., Нийман И.Дж., Клоостерман В.П., Хеннекам Э., Оранж Дж.С., ван Хасселт П.М., Уиллер Д.А., Палечек Дж.Дж., Леманн А.Р., Оливер А.В., Перл Л.Х., Плон С.Э., Мюррей Дж.М., ван Хаафтен Г (2016 г.) ). «Дестабилизированный комплекс SMC5/6 приводит к синдрому разрыва хромосом с тяжелым заболеванием легких» . Дж. Клин. Инвестируйте . 126 (8): 2881–92. дои : 10.1172/JCI82890 . ПМЦ   4966312 . ПМИД   27427983 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: a39e6e3befcd4878263b4de9477db30d__1701556020
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/a3/0d/a39e6e3befcd4878263b4de9477db30d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SMC6 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)