ТОПБП1

ТОПБП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1WF6, 2XNH, 2XNK, 3AL2, 3AL3, 3JVE, 3OLC, 3PD7, 3UEN, 3UEO
Идентификаторы
Псевдонимы	TOPBP1 , TOP2BP1, белок 1, связывающий топоизомеразу (ДНК) II, белок 1, связывающий ДНК-топоизомеразу II, Dpb11
Внешние идентификаторы	Опустить : 607760 ; МГИ : 1920018 ; Гомологен : 38262 ; GeneCards : TOPBP1 ; OMA : TOPBP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	133,662,380 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	103,227,627 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; bone marrow; ; bone marrow cells; ; rectum; ; Achilles tendon; ; appendix; ; monocyte; ; lymph node;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; otic placode; ; genital tubercle; ; abdominal wall; ; saccule; ; otic vesicle; ; primitive streak; ; dermis; ; mandibular prominence; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; protein C-terminus binding; protein binding; identical protein binding; isomerase activity;
Cellular component	PML body; spindle pole; male germ cell nucleus; nucleoplasm; microtubule organizing center; chromosome; condensed nuclear chromosome; actin cytoskeleton; cytoskeleton; nucleus; cytoplasm; nuclear body;
Biological process	response to ionizing radiation; DNA metabolic process; cellular response to DNA damage stimulus; DNA repair; DNA replication initiation; mitotic G2 DNA damage checkpoint signaling; mitotic DNA replication checkpoint signaling; DNA replication; regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11073
	235559
	ENSG00000163781
	ENSMUSG00000032555
	Q92547
	Q6ZQF0
	НМ_007027 ; НМ_001363889
	НМ_176979
	НП_008958 ; НП_001350818 ; НП_008958.2
	НП_795953
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, связывающий ДНК-топоизомеразу 2 (TOPBP1), представляет собой каркасный белок , который у человека кодируется TOPBP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

TOPBP1 был впервые идентифицирован как белок-связывающий партнер ДНК- топоизомеразы-IIβ с помощью дрожжевого 2-гибридного скрининга, что и дало ему название. ^{[ 8 ]} TOPBP1 участвует во множестве ядерных событий. К ним относятся восстановление повреждений ДНК , репликация ДНК , регуляция транскрипции и активация контрольных точек клеточного цикла . TOPBP1 в первую очередь регулирует реакцию восстановления повреждения ДНК посредством своей способности активировать киназу ответа на повреждение, мутированную атаксию-телеангиэктазию и связанную с RAD3 (ATR) . Он также играет решающую роль в инициации репликации ДНК и регуляции клеточного цикла. Изменения в экспрессии гена TOPBP1 связаны с легочной гипертензией , раком молочной железы , глиобластомой , немелкоклеточным раком легких и саркомами . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Структура

BRCT домены

Ген TOPBP1 кодирует каркасный белок , который облегчает взаимодействие между различными белками в определенное время и в определенных местах. Он осуществляет эти взаимодействия с другими белками-партнерами через C-концевые домены гена 1, ассоциированного с раком молочной железы ( BRCT ). ^{[ 10 ]} Домен BRCT структурно определяется 4-членным β-листом , который закручен одной α-спиралью (α2) и двумя другими α-спиралями (α1 и α3). Аминокислотные остатки, составляющие эти основные функции, высококонсервативны, при этом в петлях, соединяющих эти субъединицы, происходят специфические для белка отклонения. ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} Домены BRCT канонически действуют парами, причем один домен действует как акцептор фосфорилированных партнеров по связыванию , а другой домен обладает мотивом связывания, обеспечивающим специфичность. Эти пары разделены линкерной последовательностью, которая варьируется в зависимости от белка. Парные домены связываются посредством гидрофобных упаковочных взаимодействий, которые происходят между спиралью α2 N-концевого домена BRCT и спиралями α1 и α3 C-концевого домена BRCT. Эти взаимодействия облегчают связывание домена BRCT с фосфорилированными партнерами по связыванию. ^{[ 13 ]} Напротив, домены BRCT также могут существовать либо в виде отдельных доменов, либо в виде слияния двух разных доменов.

Человеческий TOPBP1 имеет девять уникальных доменов BRCT, четыре из которых консервативны у гомолога почкующихся дрожжей Dpb11 (т.е. BRCT1,2 и BRCT4,5). ^{[ 15 ]} В человеческом TOPBP1 домены BRCT0, BRCT1 и BRCT2 уникально существуют в форме тройного домена, что отличается от канонического двойного домена дрожжей Dpb11. Только домены BRCT3 и BRCT6 существуют в виде отдельных доменов и могут быть не способны связываться с партнерами-фосфопротеинами. ^{[ 10 ]}^{[ 13 ]} TOPBP1 также содержит домен активации ATR (AAD), который расположен между доменами BRCT6 и BRCT7. ^{[ 10 ]}^{[ 15 ]} Благодаря этим BRCT-специфичным взаимодействиям TOPBP1 опосредует восстановление повреждений ДНК, репликацию ДНК, транскрипцию и митоз. ^{[ 10 ]}

**Белки, взаимодействующие с TOPBP1**
	Восстановление ДНК	Репликация ДНК	Транскрипционная регуляция	Клеточный цикл
БРКТ0/1/2	БРЦА1 , ^{[ 16 ]} МДЦ1 , ^{[ 16 ]} Рад9 ^{[ 13 ]}	Треслин, ^{[ 10 ]} CDC45 ^{[ 16 ]}		Рад9 , ^{[ 10 ]} 53БП1 ^{[ 16 ]}
БРКТ4/5	БЛМ , ^{[ 10 ]} БРЦА1 ^{[ 16 ]}			МДЦ1 , ^{[ 10 ]} 53БП1 ^{[ 10 ]}
БРКТ6		CDC45 ^{[ 16 ]}	Э2Ф-1 , ^{[ 10 ]} ПАРП1 , ^{[ 10 ]} СПБП, ^{[ 10 ]} Е2 ^{[ 10 ]}
БРКТ7/8	БРЦА1 , ^{[ 16 ]} ПЛК1 , ^{[ 16 ]} ТОП2А ^{[ 16 ]}	RecQ4 ^{[ 10 ]}	ТОПБП1, ^{[ 10 ]} р53 , ^{[ 10 ]} Миз1 , ^{[ 10 ]} Е2 ^{[ 10 ]}	ФанкДж , ^{[ 10 ]}^{[ 16 ]} ТОП2А
ААД	ATR ^{[ 16 ]}			ATR ^{[ 10 ]}
Н/Д	SLX4 ^{[ 16 ]}			SLX4 ^{[ 16 ]}

Было обнаружено, что для регулирования своей активности TOPBP1 самоолигомеризуется в доменах BRCT7/8, поскольку он реагирует на репликативный стресс. ^{[ 16 ]}

Функция

восстановление повреждений ДНК

TOPBP1 был впервые идентифицирован как белок, повреждающий ДНК , благодаря его ассоциации с BRCA1 , белком, который в значительной степени участвует в патологии рака молочной железы. TOPBP1 был обнаружен в комплексе с BRCA1 в сайтах, независимых от репликационных вилок (т.е. идентифицированных ядерным антигеном пролиферирующих клеток репликации ДНК ) во время нормальной S-фазы . Когда повреждение ДНК было вызвано на более высоких уровнях γ-облучением , наблюдалось увеличение TOPBP1/BRCA1 в сайтах, удаленных от репликационных вилок. Напротив, когда репликационные вилки останавливались гидроксимочевиной для создания стресса репликации ДНК , TOPBP1/BRCA1 обнаруживались в местах репликационных вилок. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Это показало специфическую роль повреждения ДНК в рекрутировании TOPBP1 как на сайтах репликации, так и на сайтах нерепликации. Было обнаружено, что, опосредуя эти аспекты репарации ДНК, TOPBP1 связывается с Rad9 , который образует комплекс с Rad1 и Hus1 , названный здесь зажимом репарации ДНК 9-1-1. ^{[ 13 ]}^{[ 15 ]}^{[ 17 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]} TOPBP1 связывается с Rad9 с помощью своих доменов BRCT0/1/2. Было обнаружено, что домен BRCT1 несет прямую ответственность за обеспечение зависимого от фосфорилирования взаимодействия с Rad9. ^{[ 13 ]}

Восстановление повреждений ДНК инициируется и поддерживается двумя киназами: мутированной атаксией-телеангиэктазией (ATM) и ATR , причем ATR оказывается более важным для поддержания генома. ^{[ 17 ]} Было показано, что TOPBP1 является активатором ATR, что приводит к увеличению киназной активности ATR. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} После случаев повреждения ДНК, которые приводят к двухцепочечным разрывам (DSB) и последующей репарационной резекции, обнажаются длинные последовательности одноцепочечной ДНК (оцДНК). Эта оцДНК будет покрыта репликационным белком А (RPA) . ATR успешно дорабатывается до оцДНК, покрытой RPA, с помощью белка, взаимодействующего с ATR (ATRIP). Соединение оцДНК, покрытой RPA, и интактной двухцепочечной ДНК (дцДНК) является местом рекрутирования TOPBP1 и зажима 9-1-1. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]} Было обнаружено, что в дополнение к TOPBP1 ATR активируется специфичным для оцДНК белком ETAA1, взаимодействующим с RPA. ^{[ 21 ]}

Рекрутирование TOPBP1/9-1-1 осуществляется независимо от ATRIP/ATR, который служит регуляторным механизмом, предотвращающим как преждевременную, так и неспецифическую активацию пути ответа на повреждение ДНК. ^{[ 20 ]}^{[ 22 ]} TOPBP1 взаимодействует с ATR через свой активирующий домен ATR (AAD), который расположен между доменами BRCT 6 и 7. ^{[ 13 ]}^{[ 17 ]} Домен AAD TOPBP1 сам по себе достаточен для активации активности киназы ATR in vitro. Нокдаун экспрессии гена TOPBP1 приводит к снижению фосфорилирования нижестоящих мишеней киназы ATR. ^{[ 17 ]} Конкретный механизм активации ATR до сих пор неизвестен, но считается, что связывание TOPBP1 с ATR вызывает конформационные изменения, которые способствуют катализу, превышающему исходную киназную активность. ^{[ 17 ]}^{[ 19 ]} После активации ATR он способен фосфорилировать нижестоящие факторы, связанные с повреждением ДНК, при этом основным эффектором является киназа Chk1. ^{[ 17 ]}^{[ 20 ]}^{[ 23 ]}

Рекомбинантного белка TOPBP1 достаточно для активации ATR, а это означает, что регуляция активности TOPBP1 не осуществляется за счет посттрансляционных модификаций . Таким образом, считается, что он регулируется либо субклеточной локализацией (т.е. перемещением к ядру для активации), либо концентрацией белка. ^{[ 17 ]} Это дополнительно подтверждается тем фактом, что TOPBP1 снижает K _m ATR для различных субстратов. ^{[ 22 ]} Кроме того, TOPBP1 может фосфорилироваться с помощью ATM, что повышает эффективность TOPBP1-опосредованной активации ATR. ^{[ 20 ]}

репликация ДНК

Человеческий TOPBP1 необходим для инициации репликации ДНК посредством его ассоциации с белками Treslin, CDC45 и RecQ4 . Было показано, что у дрожжей гомолог TOPBP1 Dpb11 рекрутирует ДНК-полимеразу ε (Polε) и комплекс GINs в точку начала репликации , которая была предварительно загружена комплексом поддержания минихромосомы ( MCM ). Это достигается путем связывания с Sld2 (фактором, связанным с Polε) и Sld3 (фактором, связанным с CDC45) в циклин-зависимой киназы (CDK) зависимости от фосфорилирования . Это приводит к образованию преинициаторного комплекса – репликативной хеликазы CDC45–MCM–GINS (CMG). Таким образом, TOPBP1 действует как каркасный белок, который облегчает взаимодействия, необходимые для формирования комплекса предварительной инициации репликации ДНК. У людей механизм еще не до конца понятен, но TOPBP1 взаимодействует с RecQ4 (Sld2) и Треслином (Sld3). ^{[ 10 ]}^{[ 19 ]}

Также было показано, что TOPBP1 взаимодействует с другой ДНК-хеликазой, ДНК-хеликазой B (HELB), которая является частью суперсемейства геликаз 1B и участвует как в репликации, так и в репарации ДНК. Это взаимодействие между TOPBP1 и HELB также участвует в CDC45-опосредованной инициации репликации ДНК. ^{[ 24 ]}

Транскрипционная регуляция

TOPBP1 регулирует транскрипцию генов посредством прямого взаимодействия с факторами транскрипции, например E2F-1 и Miz1. Семейство транскрипционных факторов E2F опосредует экспрессию множества генов, участвующих в различных функциях. К ним относятся пролиферация клеток, развитие, реакция на повреждение ДНК и апоптоз. Он активно участвует в пути репликации ДНК посредством регуляции генов в ретинобластомы (Rb) пути супрессора опухоли . Одним из таких примеров является E2F-1 , который обеспечивает переход от фазы G1 к фазе S. ^{[ 17 ]}^{[ 25 ]} При обнаружении повреждения ДНК TOPBP1 связывается с E2F-1 через свой домен BRCT6. Это будет ингибировать способность E2F-1 индуцировать опосредованный транскрипцией апоптоз и переход в S-фазу. ^{[ 17 ]} Считается, что индукция репрессивного состояния транскрипции в генах, связанных с апоптозом, происходит в результате опосредованного TOPBP1 рекрутирования машин ремоделирования хроматина, например, деацетилаз гистонов (HDAC). ^{[ 10 ]} Связывание TOPBP1 с E2F-1 зависит как от Akt- опосредованного фосфорилирования Ser1159 на TOPBP1, так и от олигомеризации TOPBP1 в его 7-м и 8-м доменах BRCT. ^{[ 17 ]}

Клеточный цикл

Стресс репликации возникает, когда репликационная вилка останавливается и не может развиваться. Это явление может быть вызвано онкогенно-индуцированной активацией, трудно реплицируемыми структурами, столкновениями транскрипции/репликации, разобщением полимеразы, голоданием dNTP и другими причинами. В этих случаях клетки перейдут к митозу до завершения репликации. Пытаясь завершить затянувшуюся репликацию ДНК, клетка инициирует митотический синтез ДНК (MiDAS). TOPBP1 отвечает за рекрутирование необходимого каркасного белка MiDAS SLX4 , который образует большой нуклеазный комплекс. ^{[ 16 ]} Предполагаемые механизмы MiDAS, опосредованного TOPBP1/SLX4, представляют собой либо перезапуск репликационной вилки, либо разрешение гомологичных промежуточных продуктов рекомбинации , которые были ответственны за завершение репликации. ^{[ 16 ]} По мере прогрессирования митоза количество ДНК, связанной с TOPBP1, уменьшается, что указывает на восстановленную ДНК.

Во время митоза сестринские хроматиды могут перепутаться и не могут быть разделены, поскольку начинается нормальная анафаза . Эти запутанные структуры называются хроматиновыми мостиками , и если их не разрешить, они могут привести к анеуплоидии . ^{[ 8 ]} Особым подмножеством этих запутанных хроматид являются ультратонкие анафазные мостики (UFB). Они характеризуются отсутствием гистонов и невозможностью обнаружения обычными методами окрашивания ДНК. ^{[ 26 ]} Имеются доказательства того, что топоизомераза II-α (TOP2A) способна расщеплять UFB на центромере , поскольку истощение TOP2A приводит к увеличению количества UFB после митоза. Эти центромерные UFB обычно обнаруживаются во время митоза, но их количество уменьшается по мере нормального течения клеточного цикла. Это говорит о том, что UFB являются нормальным результатом митоза и что TOP2A может играть роль в их разрешении до того, как клетка выйдет из клеточного цикла, тем самым предотвращая неблагоприятные исходы. ^{[ 8 ]} Было обнаружено, что TOPBP1 локализуется как в UFB, так и совместно с TOP2A, что представляет собой консервативное взаимодействие, обнаруженное в дрожжевом гомологе Dpb11. Поскольку TOPBP1 является известным каркасным белком, он, по-видимому, привлекает TOP2A к UFB для их окончательного разрешения. Было обнаружено, что связывание TOPBP1 с UFB действует через высококонсервативный остаток лизина 704 в домене BRCT5. ^{[ 8 ]} Однако до сих пор точно неизвестно, как TOPBP1 затем вербует TOP2A в UFB. Было показано, что домены BRCT7/8 TOPBP1 взаимодействуют с TOP2A, но эти домены не обнаружены в дрожжевом гомологе Dpb11, поэтому предполагается, что линкерная область, обнаруженная между BRCT7 и BRCT8, может быть ответственна за рекрутирование TOP2A. ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Рак

Изменения в экспрессии гена TOPBP1 связаны с раком молочной железы , глиобластомой , немелкоклеточным раком легкого и саркомами . ^{[ 10 ]}^{[ 17 ]}^{[ 11 ]} В одном исследовании повышенные уровни белка TOPBP1 были обнаружены в 46 из 79 (58,2%) исследованных образцов первичного рака молочной железы, причем это увеличение экспрессии было связано со снижением выживаемости пациентов (40 против 165 месяцев; p = 0,003) и увеличение гистологической степени рака (66,7% против 35,5%; p = 0,007). ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} В здоровой ткани молочной железы экспрессия белка TOPBP1 была обнаружена только в 2 из 47 (4,26%) собранных образцов. В отличие от этого результата, другое исследование обнаружило снижение экспрессии гена TOPBP1 с помощью RT-PCR у 127 пациентов с раком молочной железы. Хотя экспрессия белка TOPBP1 в этой когорте не изменилась. Кроме того, это исследование показало, что TOPBP1 аберрантно экспрессируется в цитоплазме у этой группы пациентов с семейным раком молочной железы. Уровни цитоплазматического TOPBP1 положительно коррелировали с гистологической степенью опухоли. ^{[ 10 ]}^{[ 17 ]}

Сверхэкспрессия TOPBP1 связана с саркомами поздней стадии, метастазами в легкие и химиорезистентностью к препаратам платины (например, цисплатину ). ^{[ 11 ]}

Гетерозиготный полиморфизм в TOPBP1 (мутация Arg309Cys между BRCT2 и BRCT3) был обнаружен в когорте из 125 финских семей, больных раком молочной железы и/или яичников (15,2% имели мутацию, 7% контрольной группы имели мутацию). ^{[ 10 ]}^{[ 17 ]} Хотя более крупное когортное исследование немецких пациентов с раком молочной железы не обнаружило связи между этим полиморфизмом и риском развития рака молочной железы. ^{[ 10 ]}

Легочная гипертензия

Используя общедоступные наборы данных секвенирования всего экзома , была обнаружена связь между мутациями TOPBP1 и легочной гипертензией (ЛАГ). ^{[ 9 ]}^{[ 27 ]} Были идентифицированы три мутантных аллеля TOPBP1, специфичных для ФАГ: p.S817L, p.N1042S и p.R309C. Хотя прогнозировалось, что аллель p.R309C потенциально может вызывать заболевания, все три аллели, связанные с заболеванием, по-прежнему имели высокие частоты в контрольной популяции, поэтому мутации TOPBP1 вряд ли будут единственной причиной ЛАГ. ^{[ 27 ]} В последующих исследованиях нокдаун TOPBP1 с помощью миРНК привел к увеличению обнаруживаемых повреждений ДНК и апоптоза в здоровых эндотелиальных клетках легких. Спасение с помощью плазмид , несущих TOPBP1, привело к восстановлению здоровья эндотелиальных клеток. ^{[ 9 ]} Это указывает на повреждение ДНК в патологии ЛАГ.

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163781 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032555 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ямане К., Кавабата М., Цуруо Т. (декабрь 1997 г.). «ДНК-топоизомераза-II-связывающий белок с восемью повторяющимися областями, подобными ферментам репарации ДНК и регулятору клеточного цикла» . Европейский журнал биохимии . 250 (3): 794–799. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x . ПМИД 9461304 .
^ Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси Ю., Охара О. и др. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из клеточной линии KG-1 и головного мозга» . Исследование ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. дои : 10.1093/dnares/3.5.321 . ПМИД 9039502 .
^ «Ген Энтрез: белок 1, связывающий топоизомеразу (ДНК) II TOPBP1» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Бродерик Р., Недзведз В. (12 августа 2015 г.). «Декатенация сестринских хроматид: устранение пробелов в наших знаниях» . Клеточный цикл . 14 (19): 3040–3044. дои : 10.1080/15384101.2015.1078039 . ПМЦ 4825568 . ПМИД 26266709 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Раншу Б., Мелош Дж., Полен Р., Бушера О., Провеншер С., Бонне С. (июнь 2016 г.). «Повреждение ДНК и легочная гипертензия» . Международный журнал молекулярных наук . 17 (6): 990. дои : 10.3390/ijms17060990 . ПМЦ 4926518 . ПМИД 27338373 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб Уордлоу С.П., Карр А.М., Оливер А.В. (октябрь 2014 г.). «TopBP1: белок-каркас BRCT, функционирующий во многих клеточных путях». Восстановление ДНК . 22 : 165–174. дои : 10.1016/j.dnarep.2014.06.004 . ПМИД 25087188 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д То М., Нгеоу Дж. (сентябрь 2021 г.). «Дефицит гомологичной рекомбинации: предрасположенность к раку и последствия лечения» . Онколог . 26 (9): е1526–е1537. дои : 10.1002/onco.13829 . ПМЦ 8417864 . ПМИД 34021944 .
^ «Структуры PDB домена TopBP1 BRCT» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Люнг CC, Гловер Дж. Н. (август 2011 г.). «Домены BRCT: просто как раз, два, три» . Клеточный цикл . 10 (15): 2461–2470. дои : 10.4161/cc.10.15.16312 . ПМК 3180187 . ПМИД 21734457 .
^ Герлофф Д.Л., Вудс Н.Т., Фараго А.А., Монтейро А.Н. (август 2012 г.). «Домены BRCT: немного больше, чем родные, и меньше, чем добрые» . Письма ФЭБС . 586 (17): 2711–2716. дои : 10.1016/j.febslet.2012.05.005 . ПМЦ 3413754 . ПМИД 22584059 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Гарсия В., Фуруя К., Карр А.М. (ноябрь 2005 г.). «Идентификация и функциональный анализ TopBP1 и его гомологов». Восстановление ДНК . 4 (11): 1227–1239. дои : 10.1016/j.dnarep.2005.04.001 . ПМИД 15897014 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п Багге Дж., Остергаард В.Х., Лисби М. (май 2021 г.). «Функции TopBP1 в сохранении целостности генома во время митоза». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . Стабильность генома. 113 : 57–64. дои : 10.1016/j.semcdb.2020.08.009 . ПМИД 32912640 . S2CID 221623288 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п Сокка М., Парккинен С., Поспих Х., Сюваоя Дж.Е. (2010). «Функция TopBP1 в стабильности генома». В Нашеуере HP (ред.). Стабильность генома и болезни человека . Субклеточная биохимия. Том. 50. Дордрехт: Springer Нидерланды. стр. 119–141. дои : 10.1007/978-90-481-3471-7_7 . ISBN 978-90-481-3471-7 . ПМИД 20012580 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Наваджи-Патил В.М., Burgers PM (сентябрь 2009 г.). «История о двух хвостах: активация киназы Mec1/ATR контрольной точки повреждения ДНК зажимом 9-1-1 и Dpb11/TopBP1» . Восстановление ДНК . 8 (9): 996–1003. дои : 10.1016/j.dnarep.2009.03.011 . ПМК 2725207 . ПМИД 19464966 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и День М, Оливер А.В., Перл Л.Х. (декабрь 2021 г.). «Зависимая от фосфорилирования сборка систем реагирования на повреждения ДНК и центральная роль TOPBP1» . Восстановление ДНК . 108 : 103232. doi : 10.1016/j.dnarep.2021.103232 . ПМЦ 8651625 . ПМИД 34678589 . S2CID 239472193 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Цимприч К.А., Кортес Д. (август 2008 г.). «ATR: важный регулятор целостности генома» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 9 (8): 616–627. дои : 10.1038/nrm2450 . ПМЦ 2663384 . ПМИД 18594563 .
^ Ма М, Родригес А, Сугимото К (апрель 2020 г.). «Активация ATR-связанной протеинкиназы при распознавании повреждения ДНК» . Современная генетика . 66 (2): 327–333. дои : 10.1007/s00294-019-01039-w . ПМК 7073305 . ПМИД 31624858 .
^ Jump up to: ^а ^б Нам Э.А., Кортес Д. (июнь 2011 г.). «Сигнализация ATR: больше, чем встреча на развилке» . Биохимический журнал . 436 (3): 527–536. дои : 10.1042/BJ20102162 . ПМЦ 3678388 . ПМИД 21615334 .
^ Ян С., Майкл В.М. (сентябрь 2009 г.). «TopBP1 и альфа-опосредованное ДНК-полимеразой рекрутирование комплекса 9-1-1 в остановившиеся репликационные вилки: значение для механизма, основанного на перезапуске репликации, для активации контрольной точки ATR» . Клеточный цикл . 8 (18): 2877–2884. дои : 10.4161/cc.8.18.9485 . ПМИД 19652550 . S2CID 23609711 .
^ Хейзслип Л., Зафар М.К., Чаухан М.З., Берд А.К. (май 2020 г.). «Поддержание генома с помощью ДНК-хеликазы B» . Гены . 11 (5): 578. doi : 10.3390/genes11050578 . ПМК 7290933 . ПМИД 32455610 .
^ Маникавинаяхам С., Велес-Круз Р., Бисвас А.К., Чен Дж., Го Р., Джонсон Д.Г. (сентябрь 2020 г.). «Фактор транскрипции E2F1 и лунный свет супрессора опухоли RB как факторы репарации ДНК» . Клеточный цикл . 19 (18): 2260–2269. дои : 10.1080/15384101.2020.1801190 . ПМЦ 7513849 . ПМИД 32787501 .
^ Чан Ю.В., Западная Южная Каролина (2 сентября 2018 г.). «Новый класс ультратонких анафазных мостиков, созданных путем гомологичной рекомбинации» . Клеточный цикл . 17 (17): 2101–2109. дои : 10.1080/15384101.2018.1515555 . ПМК 6226235 . ПМИД 30253678 .
^ Jump up to: ^а ^б Аббаси И., Джаббари Дж., Джаббари Р., Глинге С., Изадьяр С.Б., Шпикеркоттер Э. и др. (сентябрь 2018 г.). «Данные Exome затуманивают патогенность генетических вариантов легочной артериальной гипертензии» . Молекулярная генетика и геномная медицина . 6 (5): 835–844. дои : 10.1002/mgg3.452 . ПМК 6160702 . ПМИД 30084161 .

Дальнейшее чтение

Ямане К., Цуруо Т. (сентябрь 1999 г.). «Консервативные области BRCT TopBP1 и супрессора опухоли BRCA1 связывают разрывы цепей и концы ДНК» . Онкоген . 18 (37): 5194–5203. дои : 10.1038/sj.onc.1202922 . ПМИД 10498869 .
Мякиниеми М., Хиллуккала Т., Тууса Дж., Рейни К., Ваара М., Хуанг Д. и др. (август 2001 г.). «Белок TopBP1, содержащий домен BRCT, участвует в репликации ДНК и реакции на повреждение» . Журнал биологической химии . 276 (32): 30399–30406. дои : 10.1074/jbc.M102245200 . ПМИД 11395493 .
Хонда И., Тодзё М., Мацузаки К., Анан Т., Мацумото М., Андо М. и др. (февраль 2002 г.). «Сотрудничество убиквитинлигазы hHYD домена HECT и белка, связывающего ДНК-топоизомеразу II, для реакции на повреждение ДНК» . Журнал биологической химии . 277 (5): 3599–3605. дои : 10.1074/jbc.M104347200 . ПМИД 11714696 .
Ямане К., Ву X, Чен Дж (январь 2002 г.). «Для выживания клеток необходим белок TopBP1, содержащий BRCT, регулирующий повреждение ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (2): 555–566. doi : 10.1128/MCB.22.2.555-566.2002 . ПМК 139754 . ПМИД 11756551 .
Бонер В., Тейлор Э.Р., Циримонаки Э., Ямане К., Кампо М.С., Морган И.М. (июнь 2002 г.). «Функциональное взаимодействие между фактором транскрипции/репликации вируса папилломы человека 16 E2 и белком реакции на повреждение ДНК TopBP1» . Журнал биологической химии . 277 (25): 22297–22303. дои : 10.1074/jbc.M202163200 . ПМИД 11934899 .
Герольд С., Ванзель М., Бойгер В., Фром С., Бёль Д., Хиллуккала Т. и др. (сентябрь 2002 г.). «Негативная регуляция реакции млекопитающих на УФ-излучение с помощью Myc посредством ассоциации с Miz-1» . Молекулярная клетка . 10 (3): 509–521. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00633-0 . ПМИД 12408820 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (ноябрь 2002 г.). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геномные исследования . 12 (11): 1773–1784. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Лю К., Лин Ф.Т., Руперт Дж.М., Лин В.К. (май 2003 г.). «Регуляция E2F1 с помощью белка TopBP1, содержащего домен BRCT» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (9): 3287–3304. дои : 10.1128/MCB.23.9.3287-3304.2003 . ПМЦ 153207 . ПМИД 12697828 .
Сюй ZX, Тиманова-Атанасова А, Чжао РХ, Чанг К.С. (июнь 2003 г.). «PML колокализуется с белком реакции на повреждение ДНК TopBP1 и стабилизирует его» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (12): 4247–4256. дои : 10.1128/MCB.23.12.4247-4256.2003 . ПМК 156140 . ПМИД 12773567 .
Ямане К., Чен Дж., Кинселла Т.Дж. (июнь 2003 г.). «Как белок 1, связывающий ДНК-топоизомеразу II, так и BRCA1 регулируют контрольную точку клеточного цикла G2-M». Исследования рака . 63 (12): 3049–3053. ПМИД 12810625 .
Грир Д.А., Бесли Б.Д., Кеннеди К.Б., Дэйви С. (август 2003 г.). «hRad9 быстро связывает ДНК, содержащую двухцепочечные разрывы, и необходим для формирования фокуса белка 1, связывающего бета-связывающий топоизомеразу II». Исследования рака . 63 (16): 4829–4835. ПМИД 12941802 .
Манке И.А., Лоури Д.М., Нгуен А., Яффе М.Б. (октябрь 2003 г.). «Повторы BRCT как фосфопептидсвязывающие модули, участвующие в нацеливании на белки». Наука . 302 (5645): 636–639. Бибкод : 2003Sci...302..636M . дои : 10.1126/science.1088877 . ПМИД 14576432 . S2CID 21866417 .
Ю Х, Чини CC, Хэ М, Мер Г, Чен Дж (октябрь 2003 г.). «Домен BRCT представляет собой домен, связывающий фосфобелок». Наука . 302 (5645): 639–642. Бибкод : 2003Sci...302..639Y . дои : 10.1126/science.1088753 . ПМИД 14576433 . S2CID 29407635 .
Лю К., Луо Ю, Лин Ф.Т., Лин В.К. (март 2004 г.). «TopBP1 привлекает Brg1/Brm для подавления апоптоза, индуцированного E2F1, нового pRb-независимого и E2F1-специфического контроля выживания клеток» . Гены и развитие . 18 (6): 673–686. дои : 10.1101/gad.1180204 . ПМЦ 387242 . ПМИД 15075294 .
Рейни К., Уитто Л., Перера Д., Моенс П.Б., Фрейре Р., Сюваоя Дж.Е. (май 2004 г.). «TopBP1 локализуется в центросомах при митозе и в ядрах хромосом при мейозе». Хромосома . 112 (7): 323–330. дои : 10.1007/s00412-004-0277-5 . ПМИД 15138768 . S2CID 30094 .
Хассель С., Эйхнер А., Якимович М., Хеллман У., Кнаус П., Сушельницкий С. (май 2004 г.). «Белки, связанные с костным морфогенетическим белковым рецептором типа II (BMPR-II), идентифицированные с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». Протеомика . 4 (5): 1346–1358. дои : 10.1002/pmic.200300770 . ПМИД 15188402 . S2CID 6773754 .
Ёсида К., Иноуэ I (август 2004 г.). «Экспрессия MCM10 и TopBP1 регулируется пролиферацией клеток и УФ-облучением через фактор транскрипции E2F» . Онкоген . 23 (37): 6250–6260. дои : 10.1038/sj.onc.1207829 . ПМИД 15195143 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163781 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032555 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9461304-5] Ямане К., Кавабата М., Цуруо Т. (декабрь 1997 г.). «ДНК-топоизомераза-II-связывающий белок с восемью повторяющимися областями, подобными ферментам репарации ДНК и регулятору клеточного цикла» . Европейский журнал биохимии . 250 (3): 794–799. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x . ПМИД 9461304 .

[pmid9039502-6] Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси Ю., Охара О. и др. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из клеточной линии KG-1 и головного мозга» . Исследование ДНК . 3 (5): 321–9, 341–54. дои : 10.1093/dnares/3.5.321 . ПМИД 9039502 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: белок 1, связывающий топоизомеразу (ДНК) II TOPBP1» .

[:63-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Бродерик Р., Недзведз В. (12 августа 2015 г.). «Декатенация сестринских хроматид: устранение пробелов в наших знаниях» . Клеточный цикл . 14 (19): 3040–3044. дои : 10.1080/15384101.2015.1078039 . ПМЦ 4825568 . ПМИД 26266709 .

[:103-9] Jump up to: ^а ^б ^с Раншу Б., Мелош Дж., Полен Р., Бушера О., Провеншер С., Бонне С. (июнь 2016 г.). «Повреждение ДНК и легочная гипертензия» . Международный журнал молекулярных наук . 17 (6): 990. дои : 10.3390/ijms17060990 . ПМЦ 4926518 . ПМИД 27338373 .

[:08-10] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб Уордлоу С.П., Карр А.М., Оливер А.В. (октябрь 2014 г.). «TopBP1: белок-каркас BRCT, функционирующий во многих клеточных путях». Восстановление ДНК . 22 : 165–174. дои : 10.1016/j.dnarep.2014.06.004 . ПМИД 25087188 .

[:93-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д То М., Нгеоу Дж. (сентябрь 2021 г.). «Дефицит гомологичной рекомбинации: предрасположенность к раку и последствия лечения» . Онколог . 26 (9): е1526–е1537. дои : 10.1002/onco.13829 . ПМЦ 8417864 . ПМИД 34021944 .

[12] «Структуры PDB домена TopBP1 BRCT» .

[:36-13] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Люнг CC, Гловер Дж. Н. (август 2011 г.). «Домены BRCT: просто как раз, два, три» . Клеточный цикл . 10 (15): 2461–2470. дои : 10.4161/cc.10.15.16312 . ПМК 3180187 . ПМИД 21734457 .

[14] Герлофф Д.Л., Вудс Н.Т., Фараго А.А., Монтейро А.Н. (август 2012 г.). «Домены BRCT: немного больше, чем родные, и меньше, чем добрые» . Письма ФЭБС . 586 (17): 2711–2716. дои : 10.1016/j.febslet.2012.05.005 . ПМЦ 3413754 . ПМИД 22584059 .

[:43-15] Jump up to: ^а ^б ^с Гарсия В., Фуруя К., Карр А.М. (ноябрь 2005 г.). «Идентификация и функциональный анализ TopBP1 и его гомологов». Восстановление ДНК . 4 (11): 1227–1239. дои : 10.1016/j.dnarep.2005.04.001 . ПМИД 15897014 .

[:14-16] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п Багге Дж., Остергаард В.Х., Лисби М. (май 2021 г.). «Функции TopBP1 в сохранении целостности генома во время митоза». Семинары по клеточной биологии и биологии развития . Стабильность генома. 113 : 57–64. дои : 10.1016/j.semcdb.2020.08.009 . ПМИД 32912640 . S2CID 221623288 .

[:25-17] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п Сокка М., Парккинен С., Поспих Х., Сюваоя Дж.Е. (2010). «Функция TopBP1 в стабильности генома». В Нашеуере HP (ред.). Стабильность генома и болезни человека . Субклеточная биохимия. Том. 50. Дордрехт: Springer Нидерланды. стр. 119–141. дои : 10.1007/978-90-481-3471-7_7 . ISBN 978-90-481-3471-7 . ПМИД 20012580 .

[:83-18] Jump up to: ^а ^б ^с Наваджи-Патил В.М., Burgers PM (сентябрь 2009 г.). «История о двух хвостах: активация киназы Mec1/ATR контрольной точки повреждения ДНК зажимом 9-1-1 и Dpb11/TopBP1» . Восстановление ДНК . 8 (9): 996–1003. дои : 10.1016/j.dnarep.2009.03.011 . ПМК 2725207 . ПМИД 19464966 .

[:54-19] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и День М, Оливер А.В., Перл Л.Х. (декабрь 2021 г.). «Зависимая от фосфорилирования сборка систем реагирования на повреждения ДНК и центральная роль TOPBP1» . Восстановление ДНК . 108 : 103232. doi : 10.1016/j.dnarep.2021.103232 . ПМЦ 8651625 . ПМИД 34678589 . S2CID 239472193 .

[:124-20] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Цимприч К.А., Кортес Д. (август 2008 г.). «ATR: важный регулятор целостности генома» . Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 9 (8): 616–627. дои : 10.1038/nrm2450 . ПМЦ 2663384 . ПМИД 18594563 .

[21] Ма М, Родригес А, Сугимото К (апрель 2020 г.). «Активация ATR-связанной протеинкиназы при распознавании повреждения ДНК» . Современная генетика . 66 (2): 327–333. дои : 10.1007/s00294-019-01039-w . ПМК 7073305 . ПМИД 31624858 .

[:72-22] Jump up to: ^а ^б Нам Э.А., Кортес Д. (июнь 2011 г.). «Сигнализация ATR: больше, чем встреча на развилке» . Биохимический журнал . 436 (3): 527–536. дои : 10.1042/BJ20102162 . ПМЦ 3678388 . ПМИД 21615334 .

[23] Ян С., Майкл В.М. (сентябрь 2009 г.). «TopBP1 и альфа-опосредованное ДНК-полимеразой рекрутирование комплекса 9-1-1 в остановившиеся репликационные вилки: значение для механизма, основанного на перезапуске репликации, для активации контрольной точки ATR» . Клеточный цикл . 8 (18): 2877–2884. дои : 10.4161/cc.8.18.9485 . ПМИД 19652550 . S2CID 23609711 .

[24] Хейзслип Л., Зафар М.К., Чаухан М.З., Берд А.К. (май 2020 г.). «Поддержание генома с помощью ДНК-хеликазы B» . Гены . 11 (5): 578. doi : 10.3390/genes11050578 . ПМК 7290933 . ПМИД 32455610 .

[25] Маникавинаяхам С., Велес-Круз Р., Бисвас А.К., Чен Дж., Го Р., Джонсон Д.Г. (сентябрь 2020 г.). «Фактор транскрипции E2F1 и лунный свет супрессора опухоли RB как факторы репарации ДНК» . Клеточный цикл . 19 (18): 2260–2269. дои : 10.1080/15384101.2020.1801190 . ПМЦ 7513849 . ПМИД 32787501 .

[26] Чан Ю.В., Западная Южная Каролина (2 сентября 2018 г.). «Новый класс ультратонких анафазных мостиков, созданных путем гомологичной рекомбинации» . Клеточный цикл . 17 (17): 2101–2109. дои : 10.1080/15384101.2018.1515555 . ПМК 6226235 . ПМИД 30253678 .

[:112-27] Jump up to: ^а ^б Аббаси И., Джаббари Дж., Джаббари Р., Глинге С., Изадьяр С.Б., Шпикеркоттер Э. и др. (сентябрь 2018 г.). «Данные Exome затуманивают патогенность генетических вариантов легочной артериальной гипертензии» . Молекулярная генетика и геномная медицина . 6 (5): 835–844. дои : 10.1002/mgg3.452 . ПМК 6160702 . ПМИД 30084161 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]