Jump to content

Кинетика Михаэлиса – Ментен

(Перенаправлено с Михаэлиса-Ментена )
Кривая уравнения Михаэлиса-Ментен, обозначенная в соответствии с рекомендациями IUBMB.

В биохимии кинетика Михаэлиса-Ментен , названная в честь Леонор Михаэлис и Мод Ментен , представляет собой простейший случай кинетики ферментов , применяемый к катализируемым ферментами реакциям одного субстрата и одного продукта. Оно принимает форму дифференциального уравнения, описывающего скорость реакции (скорость образования продукта Р, при концентрации ) к , концентрация субстрата IUBMB A (используя символы, рекомендованные ) . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Его формула задается уравнением Михаэлиса – Ментен :

, который часто записывают как , [ 5 ] представляет собой предельную скорость , к которой приближается система при насыщающей концентрации субстрата для данной концентрации фермента. Константа Михаэлиса определяется как концентрация субстрата, при которой скорость реакции составляет половину . [ 6 ] Часто предполагается, что биохимические реакции с участием одного субстрата следуют кинетике Михаэлиса-Ментен, без учета основных предположений модели. Лишь небольшая часть реакций, катализируемых ферментами, имеет только один субстрат, но уравнение по-прежнему часто применимо, если изменяется концентрация только одного субстрата.

«Заговор Михаэлиса-Ментен»

[ редактировать ]
Полулогарифмический график данных Михаэлиса – Ментен

Сюжет против даже в последнее время его часто называют «заговором Михаэлиса-Ментен». [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] но это заблуждение, потому что Михаэлис и Ментен такого сюжета не использовали. Вместо этого они задумали против , что имеет некоторые преимущества перед обычными способами построения данных Михаэлиса-Ментен. Он имеет в качестве зависимой переменной и, таким образом, не искажает экспериментальные ошибки в . Михаэлис и Ментен не пытались оценить непосредственно от предела, к которому приближаются при высоком , что трудно сделать точно с данными, полученными с помощью современных методов, и почти невозможно с их данными. Вместо этого они воспользовались тем фактом, что кривая почти прямая в среднем диапазоне и имеет максимальный наклон то есть . При точном значении это было легко определить от точки на кривой, соответствующей .

Сегодня этот график практически никогда не используется для оценки и свойства изоферментов, , но он по-прежнему представляет большой интерес, поскольку обладает еще одним ценным свойством: он позволяет сравнивать на одном графике катализирующих одну и ту же реакцию, но активных в очень разных диапазонах концентраций субстрата. Например, четыре изофермента гексокиназы млекопитающих наполовину насыщены глюкозой в концентрациях от примерно 0,02 мМ для гексокиназы А (мозговой гексокиназы) до примерно 50 мМ для гексокиназы D («глюкокиназы», ​​печеночной гексокиназы), что составляет более 2000-2000 мМ. диапазон сгиба. Было бы невозможно показать кинетическое сравнение между четырьмя изоферментами на одном из обычных графиков, но это легко сделать на полулогарифмическом графике. [ 10 ]

За десять лет до Михаэлиса и Ментена Виктор Анри обнаружил, что ферментативные реакции можно объяснить, предположив связывающее взаимодействие между ферментом и субстратом. [ 11 ] Его работу подхватили Михаэлис и Ментен, которые исследовали кинетику инвертазы катализирующего фермента, гидролиз сахарозы фруктозу на глюкозу и . [ 12 ] В 1913 году они предложили математическую модель реакции. [ 13 ] Он включает связывание фермента E с субстратом A с образованием комплекса EA, который высвобождает продукт P, восстанавливающий исходную форму фермента. [ 6 ] Схематически это можно представить как

где (константа прямого курса), (обратная константа скорости) и (каталитическая константа скорости) обозначают константы скорости , [ 14 ] двойные стрелки между A (субстрат) и EA (комплекс фермент-субстрат) обозначают тот факт, что связывание фермент-субстрат является обратимым процессом, а одинарная стрелка вперед представляет образование P (продукта).

При определенных предположениях , например, когда концентрация фермента намного меньше концентрации субстрата, скорость образования продукта определяется выражением

в котором – начальная концентрация фермента. Порядок реакции зависит от относительной величины двух членов в знаменателе. При низкой концентрации субстрата , так что скорость линейно зависит от концентрации субстрата ( кинетика первого порядка в ). [ 15 ] Однако при более высоком , с , реакция приближается к независимости от (кинетика нулевого порядка в ), [ 15 ] асимптотически приближаясь к предельной скорости . Эта скорость, которая никогда не достигается, относится к гипотетическому случаю, когда все молекулы фермента связаны с субстратом. , известный как число оборотов или каталитическая константа , обычно выражается в с –1 , — предельное число молекул субстрата, превращающихся в продукт на одну молекулу фермента в единицу времени. Дальнейшее добавление субстрата не приведет к увеличению скорости, и фермент считается насыщенным.

Константа Михаэлиса не зависит от концентрации или чистоты фермента. [ 16 ] Его значение зависит как от природы фермента и субстрата, так и от таких условий, как температура и pH.

Модель используется в различных биохимических ситуациях, помимо взаимодействия фермент-субстрат, включая связывание антиген-антитело , гибридизацию ДНК-ДНК и белок-белковое взаимодействие . [ 17 ] [ 18 ] Его можно использовать для характеристики общей биохимической реакции точно так же, как уравнение Ленгмюра можно использовать для моделирования общей адсорбции биомолекулярных частиц. [ 18 ] Когда эмпирическое уравнение такой формы применяется к росту микробов, его иногда называют уравнением Моно .

Кинетика Михаэлиса-Ментен также применялась к множеству тем, помимо биохимических реакций. [ 14 ] включая альвеолярное очищение от пыли, [ 19 ] богатство видовых пулов, [ 20 ] очистка крови от алкоголя , [ 21 ] взаимосвязь фотосинтеза и облучения и бактериальная фаговая инфекция. [ 22 ]

Уравнение также можно использовать для описания взаимосвязи между ионного канала проводимостью и лигандов . концентрацией [ 23 ] а также, например, к ограничению роста питательных веществ и фитопланктона в мировом океане. [ 24 ]

Специфика

[ редактировать ]

специфичности Константа (также известная как каталитическая эффективность ) является мерой того, насколько эффективно фермент превращает субстрат в продукт. Хотя это соотношение и это самостоятельный параметр, более фундаментальный, чем . Ферменты, ограниченные диффузией , такие как фумараза , работают при теоретическом верхнем пределе 10. 8  – 10 10 М −1 с −1 , ограниченный диффузией субстрата в активный центр . [ 25 ]

Если мы обозначим константу специфичности для конкретного субстрата A как уравнение Михаэлиса–Ментен можно записать в виде и следующее:

Реакция меняется от примерно первого порядка по концентрации субстрата при низких концентрациях до примерно нулевого порядка при высоких концентрациях.

При малых концентрациях субстрата это приближается к зависимости скорости от концентрации субстрата первого порядка:

И наоборот, он приближается к зависимости нулевого порядка от когда концентрация субстрата высока:

Способность фермента различать два конкурирующих субстрата, оба из которых следуют кинетике Михаэлиса-Ментен, зависит только от константы специфичности, а не от какого-либо другого фактора. или один. положить для подложки и для конкурирующего субстрата , то две скорости, когда обе присутствуют одновременно, будут следующими:

Хотя оба знаменателя содержат константы Михаэлиса, они одинаковы и, таким образом, сокращаются, когда одно уравнение делится на другое:

и поэтому соотношение скоростей зависит только от концентраций двух субстратов и констант их специфичности.

Номенклатура

[ редактировать ]

Поскольку уравнение было создано Анри, а не Михаэлисом и Ментен, правильнее называть его уравнением Анри-Михаэлиса-Ментен: [ 26 ] хотя именно Михаэлис и Ментен поняли, что анализ реакций с точки зрения начальной скорости будет проще и, как следствие, более продуктивным, чем анализ временного хода реакции, как пытался Анри. Хотя Анри вывел это уравнение, он не предпринял попыток его применить. Кроме того, Михаэлис и Ментен понимали необходимость буферов для контроля pH, а Анри — нет.

Приложения

[ редактировать ]

Значения параметров широко варьируются между ферментами. Вот некоторые примеры: [ 27 ]

Фермент (М) −1 ) −1 с −1 )
Химотрипсин 1.5 × 10 −2 0.14 9.3
Пепсин 3.0 × 10 −4 0.50 1.7 × 10 3
тРНК-синтетаза 9.0 × 10 −4 7.6 8.4 × 10 3
Рибонуклеаза 7.9 × 10 −3 7.9 × 10 2 1.0 × 10 5
Карбоангидраза 2.6 × 10 −2 4.0 × 10 5 1.5 × 10 7
Фумараза 5.0 × 10 −6 8.0 × 10 2 1.6 × 10 8

Равновесное приближение

[ редактировать ]

В своем анализе Михаэлис и Ментен (а также Анри) предположили, что субстрат находится в мгновенном химическом равновесии с комплексом, что подразумевает [ 13 ] [ 28 ]

где e — концентрация свободного фермента (а не общая концентрация), а x — концентрация фермент-субстратного комплекса ЕА.

Для консервации фермента необходимо, чтобы [ 28 ]

где теперь это общая концентрация фермента. После объединения двух выражений простая алгебраическая обработка приводит к следующему выражению для концентрации фермент-субстратного комплекса:

где константа диссоциации фермент-субстратного комплекса. Следовательно, уравнение скорости представляет собой уравнение Михаэлиса – Ментен: [ 28 ]

где соответствует каталитической константе и предельная скорость равна . Аналогично в предположении равновесия константа Михаэлиса .

Необратимый первый шаг

[ редактировать ]

Изучая уреазу примерно в то же время, когда Михаэлис и Ментен изучали инвертазу, Дональд Ван Слайк и Дж. Е. Каллен [ 29 ] сделал по существу противоположное предположение, рассматривая первую стадию не как равновесие, а как необратимую реакцию второго порядка с константой скорости. . Поскольку их подход сегодня никогда не используется, достаточно привести окончательное уравнение скорости:

и отметить, что оно функционально неотличимо от уравнения Анри – Михаэлиса – Ментен. Изучив кинетическое поведение, нельзя сказать, является ли равно или чтобы или к чему-то еще.

Стационарное приближение

[ редактировать ]

Дж.Э. Бриггс и Дж.Б.С. Холдейн провели анализ, который гармонизировал подходы Михаэлиса и Ментен, а также Ван Слайка и Каллена. [ 30 ] [ 31 ] и сегодня считается основным подходом к кинетике ферментов. Они предположили, что концентрация промежуточного комплекса не меняется в масштабе времени, в течение которого измеряется образование продукта. [ 32 ] Это предположение означает, что . Полученное уравнение скорости выглядит следующим образом:

где

Это обобщенное определение константы Михаэлиса. [ 33 ]

Предположения и ограничения

[ редактировать ]

Все приведенные выводы рассматривают начальный этап связывания с точки зрения закона действия масс , который предполагает свободную диффузию через раствор. Однако в среде живой клетки, где существует высокая концентрация белков , цитоплазма часто ведет себя скорее как вязкий гель , чем как сыпучая жидкость, ограничивая молекулярные движения за счет диффузии и изменяя скорость реакции. [ 34 ] Однако обратите внимание, что, хотя эта гелеобразная структура серьезно ограничивает большие молекулы, такие как белки, ее влияние на малые молекулы, как и на многие метаболиты, которые участвуют в центральном метаболизме, гораздо меньше. [ 35 ] Поэтому на практике рассмотрение движения субстратов с точки зрения диффузии вряд ли приведет к серьезным ошибкам. Тем не менее, Шнелл и Тернер считают, что более уместно моделировать цитоплазму как фрактал , чтобы уловить кинетику ее ограниченной подвижности. [ 36 ]

Оценка параметров Михаэлиса–Ментен.

[ редактировать ]

Графические методы

[ редактировать ]

Определение параметров уравнения Михаэлиса-Ментен обычно включает проведение серии ферментных анализов при различных концентрациях субстрата. и измерение начальных скоростей реакции , т. е. скорости реакций измеряются через период времени, достаточно короткий, чтобы можно было предположить, что комплекс фермент-субстрат образовался, но концентрация субстрата остается почти постоянной, и поэтому приближение равновесия или квазистационарного состояния остается действительным. [ 37 ] Параметры можно получить, построив график зависимости скорости реакции от концентрации и используя нелинейную регрессию уравнения Михаэлиса-Ментен с правильным взвешиванием, основанным на известных свойствах распределения ошибок скорости.

До того, как стали доступны вычислительные средства для выполнения нелинейной регрессии, использовались графические методы, включающие линеаризацию уравнения. Было предложено несколько из них, в том числе Иди-Хофсти график против , [ 38 ] [ 39 ] сюжет Ханса против , [ 40 ] и график Лайнуивера-Бёрка (также известный как график двойной взаимности ) против . [ 41 ] Из них [ 42 ] График Хейнса наиболее точен, когда подвержен ошибкам с равномерным стандартным отклонением. [ 43 ] С точки зрения визуализации данных график Иди–Хофсти обладает важным свойством: весь возможный диапазон значения из к занимает конечный диапазон шкалы ординат, что делает невозможным выбор осей, скрывающих плохой план эксперимента.

Однако, хотя все три линейных графика полезны для визуализации, они искажают структуру ошибок данных и дают менее точные оценки и чем правильно взвешенная нелинейная регрессия. Предполагая ошибку на обратное представление приводит к ошибке на ( Распространение неопределенности ), подразумевая, что линейная регрессия графика двойной взаимности должна включать веса . Это хорошо понимали Лайнуивер и Берк. [ 41 ] которые консультировались с выдающимся статистиком У. Эдвардсом Демингом, прежде чем анализировать свои данные. [ 44 ] В отличие от почти всех исследователей с тех пор, Берк провел экспериментальное исследование распределения ошибок и обнаружил, что оно соответствует равномерной стандартной ошибке в , прежде чем принять решение о соответствующих весах. [ 45 ] Этот аспект работы Лайнуивера и Берка в то время практически не удостоился внимания и впоследствии был забыт.

Прямой линейный график — это графический метод, в котором наблюдения представляются прямыми линиями в пространстве параметров с осями и : каждая линия рисуется с пересечением на ось и на ось. Точка пересечения линий для разных наблюдений дает значения и . [ 46 ]

Взвешивание

[ редактировать ]

Многие авторы, например Греко и Хакала, [ 47 ] утверждали, что нелинейная регрессия всегда превосходит регрессию линейных форм уравнения Михаэлиса-Ментен. Однако это верно только в том случае, если используется соответствующая схема взвешивания, желательно на основе экспериментальных исследований, чего почти никогда не делается. Как отмечалось выше, Берк [ 45 ] провел соответствующее расследование и обнаружил, что структура ошибок его данных соответствует единому стандартному отклонению в . Более поздние исследования показали, что единый коэффициент вариации (стандартное отклонение, выраженное в процентах) был ближе к истине при использовании методов, использовавшихся в 1970-х годах. [ 48 ] [ 49 ] Однако эта истина может оказаться более сложной, чем любая зависимость от один может представлять. [ 50 ]

Равномерное стандартное отклонение . Если считается, что ставки имеют равномерное стандартное отклонение, соответствующий вес для каждого значение для нелинейной регрессии равно 1. Если используется график двойной взаимности, каждое значение должен иметь вес , тогда как если используется график Хейнса, каждое значение должен иметь вес .

Равномерное изменение коэффициента . Если считается, что ставки имеют равномерное изменение коэффициентов, соответствующий вес для каждого значение нелинейной регрессии равно . Если используется график двойной взаимности, каждое значение должен иметь вес , тогда как если используется график Хейнса, каждое значение должен иметь вес .

В идеале в каждом из этих случаев должно быть истинное значение, но оно всегда неизвестно. Однако после предварительной оценки можно использовать расчетные значения. для уточнения оценки. На практике структура ошибок кинетических данных ферментов очень редко исследуется экспериментально, поэтому почти никогда не известна, а просто предполагается. Однако можно составить представление о структуре ошибки на основе внутренних данных. [ 51 ] Делать это вручную утомительно, но можно легко сделать на компьютере.

Уравнение закрытой формы

[ редактировать ]

Сантьяго Шнелл и Клаудио Мендоса предложили решение в замкнутой форме для анализа кинетики Михаэлиса-Ментен с течением времени, основанное на решении W-функции Ламберта . [ 52 ] А именно,

где W — W-функция Ламберта и

Вышеупомянутое уравнение, известное в настоящее время как уравнение Шнеля-Мендозы, [ 53 ] был использован для оценки и из данных о ходе времени. [ 54 ] [ 55 ]

Реакции с более чем одним субстратом

[ редактировать ]

Лишь небольшое меньшинство реакций, катализируемых ферментами, имеет только один субстрат, и даже это число увеличивается, если рассматривать реакции с двумя субстратами, в которых одним субстратом является вода, как реакции с одним субстратом, число которых все еще невелико. Соответственно, можно было бы предположить, что уравнение Михаэлиса-Ментен, обычно записываемое только с одним субстратом, имеет ограниченную полезность. Однако это предположение ошибочно. Одно из распространенных уравнений реакции двух субстратов можно записать следующим образом, чтобы выразить в пересчете на две концентрации субстрата и :

остальные символы представляют кинетические константы. Предположим теперь, что варьируется в зависимости от держался постоянным. Тогда удобно реорганизовать уравнение следующим образом:

Это имеет в точности форму уравнения Михаэлиса – Ментен.

с видимыми значениями и определяется следующим образом:


Линейное торможение

[ редактировать ]

Линейные (простые) типы ингибирования можно классифицировать с помощью общего уравнения смешанного ингибирования при определенной концентрации ингибитора. :

в котором константа конкурентного ингибирования и константа неконкурентного ингибирования . Это уравнение включает в себя другие типы торможения как частные случаи:

  • Если вторая скобка в знаменателе приближается и результирующее поведение [ 56 ] торможение конкурентное .
  • Если первая скобка в знаменателе приближается и результирующее поведение представляет собой неконкурентное торможение .
  • Если оба и конечны, поведение представляет собой смешанное торможение .
  • Если Получающийся в результате частный случай представляет собой чистое неконкурентное ингибирование .

Чистое неконкурентное ингибирование встречается очень редко и в основном ограничивается воздействием протонов и ионов некоторых металлов. Клеланд осознал это и изменил определение термина «неконкурентный» на «смешанный» . [ 57 ] Некоторые авторы последовали ему в этом отношении, но не все, поэтому при чтении любой публикации нужно проверять, какое определение используют авторы.

Во всех случаях кинетические уравнения имеют форму уравнения Михаэлиса – Ментен с кажущимися константами, как можно увидеть, записав приведенное выше уравнение следующим образом:

с видимыми значениями и определяется следующим образом:

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ «Символика и терминология в кинетике ферментов. Рекомендации 1981 г.» . Евро. Дж. Биохим . 128 (2–3): 281–291. 1982. doi : 10.1111/j.1432-1033.1982.tb06963.x .
  2. ^ «Символика и терминология в кинетике ферментов. Рекомендации 1981 г.». Арх. Биохим. Биофиз . 234 (2): 732–740. 1983. doi : 10.1016/0003-9861(83)90262-X .
  3. ^ «Символика и терминология в кинетике ферментов. Рекомендации 1981 г.» . Биохим. Дж . 213 (3): 561–571. 1982. дои : 10.1042/bj2130561 . ПМЦ   1152169 . ПМИД   6615450 .
  4. ^ Корниш-Боуден, А. (2014). «Текущие рекомендации IUBMB по номенклатуре и кинетике ферментов» . Перспективы в науке . 1 (1–6): 74–87. Бибкод : 2014PerSc...1...74C . дои : 10.1016/j.pisc.2014.02.006 .
  5. ^ Часто используемый индекс max и термин «максимальная скорость» (или «максимальная скорость») не совсем подходят, поскольку это не максимум в математическом смысле.
  6. ^ Jump up to: а б Корниш-Боуден, Атель (2012). Основы кинетики ферментов (4-е изд.). Уайли-Блэквелл, Вайнхайм. стр. 25–75. ISBN  978-3-527-33074-4 .
  7. ^ Буш, Т.; Петерсен, М. (2021). «Идентификация и биохимическая характеристика тирозинаминотрансферазы Anthoceros agrestis открывает возможную точку входа в биосинтез розмариновой кислоты в роголистниках» . Планта . 253 (5): 98. дои : 10.1007/s00425-021-03623-2 . ПМК   8041713 . ПМИД   33844079 . S2CID   233212717 .
  8. ^ М. А. Крисман; М. Дж. Голдкэмп; А.Н. Родс; Дж. Риффл (2023). «Изучение кинетики Михаэлиса-Ментена и ингибирования катализа в синтетическом имитаторе катехолоксидазы: эксперимент для лаборатории неорганической химии или биохимии». Дж. Хим. Образование . 100 (2): 893–899. Бибкод : 2023JChEd.100..893C . doi : 10.1021/acs.jchemed.9b01146 . S2CID   255736240 .
  9. ^ Хуанг, ГГ; Кондикт, Л.; Ричардсон, С.Дж.; Бреннан, CS; Касапис, С. (2023). «Изучение механизма ингибирования п-кумаровой кислоты α-амилазы с помощью мультиспектроскопического анализа, анализа ферментативного ингибирования и молекулярного докинга». Пищевые гидроколлоиды . 139 :19)08524. doi : 10.1016/j.foodhyd.2023.108524 . S2CID   256355620 .
  10. ^ Карденас, МЛ; Корниш-Боуден, А.; Урета, Т. (1998). «Эволюция и регуляторная роль гексокиназ». Биохим. Биофиз. Акта . 1401 (3): 242–264. дои : 10.1016/S0167-4889(97)00150-X . ПМИД   9540816 .
  11. ^ Анри, Виктор (1903). Общие закономерности действия диастазов . Париж: Германн.
  12. ^ «Виктор Анри» . Кто редактировал? . Проверено 24 мая 2011 г.
  13. ^ Jump up to: а б Михаэлис, Л.; Ментен, МЛ (1913). «Кинетика инвертирования». Биохим З. 49 : 333–369. ( недавний перевод и более старый частичный перевод )
  14. ^ Jump up to: а б Чен, WW; Нейпель, М.; Зоргер, ПК (2010). «Классические и современные подходы к моделированию биохимических реакций» . Генс Дев . 24 (17): 1861–1875. дои : 10.1101/gad.1945410 . ПМЦ   2932968 . ПМИД   20810646 .
  15. ^ Jump up to: а б Лейдлер К.Дж. и Мейзер Дж.Х. Физическая химия (Бенджамин/Каммингс, 1982), стр.430 ISBN   0-8053-5682-7
  16. ^ Нинфа, Александр; Баллоу, Дэвид П. (1998). Фундаментальные лабораторные подходы в области биохимии и биотехнологии . Бетесда, Мэриленд: Fitzgerald Science Press. ISBN  978-1-891786-00-6 . ОСЛК   38325074 .
  17. ^ Ленинджер, Алабама; Нельсон, Д.Л.; Кокс, ММ (2005). Ленингерские принципы биохимии . Нью-Йорк: WH Freeman. ISBN  978-0-7167-4339-2 .
  18. ^ Jump up to: а б Чакраборти, С. (23 декабря 2009 г.). Микрофлюидика и микропроизводство (1-е изд.). Спрингер. ISBN  978-1-4419-1542-9 .
  19. ^ Ю, РЦ; Раппапорт, С.М. (1997). «Модель задержки в легких, основанная на кинетике Михаэлиса-Ментен» . Перспектива здоровья окружающей среды . 105 (5): 496–503. дои : 10.1289/ehp.97105496 . ПМЦ   1469867 . ПМИД   9222134 .
  20. ^ Китинг, штат Калифорния; Куинн, Дж. Ф. (1998). «Оценка видового богатства: новый взгляд на модель Михаэлиса-Ментен». Ойкос . 81 (2): 411–416. дои : 10.2307/3547060 . JSTOR   3547060 .
  21. ^ Джонс, AW (2010). «Доказательное исследование скорости выведения этанола из крови с применением в судебно-медицинской экспертизе». Судебно-медицинская экспертиза Int . 200 (1–3): 1–20. doi : 10.1016/j.forsciint.2010.02.021 . ПМИД   20304569 .
  22. ^ Абедон, ST (2009). «Кинетика фагового биоконтроля бактерий». Дис . возбудителя пищевого происхождения. 6 (7): 807–15. дои : 10.1089/fpd.2008.0242 . ПМИД   19459758 .
  23. ^ Дин, Шинхуа; Сакс, Фредерик (1999). «Одноканальные свойства пуринорецепторов P2X2» . Журнал общей физиологии . 113 (5): 695–720. дои : 10.1085/jgp.113.5.695 . ПМК   2222910 . ПМИД   10228183 .
  24. ^ Дагдейл, RCJ (1967). «Ограничение питательных веществ в море: динамика, идентификация и значение» . Лимнология и океанография . 12 (4): 685–695. Бибкод : 1967LimOc..12..685D . дои : 10.4319/lo.1967.12.4.0685 .
  25. ^ Стропполо, Мэн; Фалькони, М.; Каккури, AM; Дезидери, А. (сентябрь 2001 г.). «Сверхэффективные ферменты» . Cell Mol Life Sci . 58 (10): 1451–60. дои : 10.1007/PL00000788 . ПМЦ   11337273 . ПМИД   11693526 . S2CID   24874575 .
  26. ^ Дайхманн, У.; Шустер, С.; Мазат, Ж.-П.; Корниш-Боуден, А. (2013). «В память о статье Михаэлиса-Ментена 1913 года Die Kinetik der Invertinwirkung : три перспективы» . ФЕБС Дж . 281 (2): 435–463. дои : 10.1111/февраль 12598 . ПМИД   24180270 . S2CID   5183178 .
  27. ^ Мэтьюз, КК; ван Холде, Кентукки; Ахерн, КГ (10 декабря 1999 г.). Биохимия (3-е изд.). Прентис Холл. ISBN  978-0-8053-3066-3 .
  28. ^ Jump up to: а б с Кинер, Дж.; Снейд, Дж. (2008). Математическая физиология: I: Клеточная физиология (2-е изд.). Спрингер. ISBN  978-0-387-75846-6 .
  29. ^ Ван Слайк, доктор медицинских наук; Каллен, GE (1914). «Способ действия уреазы и ферментов вообще» . Ж. Биол. Хим . 19 (2): 141–180. дои : 10.1016/S0021-9258(18)88300-4 .
  30. ^ Бриггс, GE ; Холдейн, JBS (1925). «Заметка о кинетике действия ферментов» . Биохим Дж . 19 (2): 338–339. дои : 10.1042/bj0190338 . ПМК   1259181 . ПМИД   16743508 .
  31. ^ Лейдлер, Кейт Дж. (1978). Физическая химия с биологическими приложениями . Бенджамин/Каммингс. стр. 428–430. ISBN  0-8053-5680-0 .
  32. ^ В продвинутых работах это известно как предположение о квазистационарном состоянии или гипотеза псевдостационарного состояния, но в элементарных исследованиях предположения об устойчивом состоянии достаточно.
  33. ^ Мюррей, доктор юридических наук (2002). Математическая биология: I. Введение (3-е изд.). Спрингер. ISBN  978-0-387-95223-9 .
  34. ^ Чжоу, HX; Ривас, Г.; Минтон, AP (2008). «Макромолекулярная скученность и удержание: биохимические, биофизические и потенциальные физиологические последствия» . Анну Рев Биофиз . 37 (1): 375–97. doi : 10.1146/annurev.biophys.37.032807.125817 . ПМЦ   2826134 . ПМИД   18573087 .
  35. ^ Мастро, AM; Бабич, М.А.; Тейлор, штат Вирджиния; Кейт, AD (1984). «Диффузия небольшой молекулы в цитоплазме клеток млекопитающих» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 81 (11): 3414–3418. Бибкод : 1984PNAS...81.3414M . дои : 10.1073/pnas.81.11.3414 . ПМЦ   345518 . ПМИД   6328515 .
  36. ^ Шнелл, С.; Тернер, Т.Э. (2004). «Кинетика реакций во внутриклеточных средах с скоплением макромолекул: моделирование и законы скорости». Прога Биофиз Мол Биол . 85 (2–3): 235–60. CiteSeerX   10.1.1.117.1997 . doi : 10.1016/j.pbiomolbio.2004.01.012 . ПМИД   15142746 .
  37. ^ Сигел, Луизиана; Слемрод, М. (1989). «Предположение о квазистационарном состоянии: пример возмущения» . Обзор СИАМ . 31 (3): 446–477. дои : 10.1137/1031091 .
  38. ^ Иди, GS (1942). «Ингибирование холинэстеразы физостигмином и простигмином» . Ж. Биол. Хим . 146 (1): 85–93. дои : 10.1016/S0021-9258(18)72452-6 .
  39. ^ Хофсти, BHJ (1953). «Специфика эстераз» . Ж. Биол. Хим . 199 (1): 357–364. дои : 10.1016/S0021-9258(18)44843-0 .
  40. ^ Ханес, CS (1932). «Исследования растительных амилаз. I. Влияние концентрации крахмала на скорость гидролиза амилазой проросшего ячменя» . Биохим. Дж . 26 (2): 1406–1421. дои : 10.1042/bj0261406 . ПМК   1261052 . ПМИД   16744959 .
  41. ^ Jump up to: а б Лайнуивер, Х.; Берк, Д. (1934). «Определение констант диссоциации ферментов» . Журнал Американского химического общества . 56 (3): 658–666. дои : 10.1021/ja01318a036 .
  42. Имя Барнета Вулфа часто сочетается с именем Хейнса, но не с двумя другими. в 1932 году приписали все три Вульфу Однако Холдейн и Стерн в своей книге Allgemeine Chemie der Enzyme , примерно в то же время, что и Хейнс, и явно раньше, чем остальные.
  43. ^ Это не обязательно так!
  44. ^ Лайнуивер Х., Берк Д., Деминг В.Е. (1934). «Константа диссоциации азот-нитрогеназы у Azobacter ». Дж. Амер. хим. Соц . 56 : 225–230. дои : 10.1021/ja01316a071 .
  45. ^ Jump up to: а б Берк, Д. «Нитрогеназа». Результаты исследования ферментов . 3 :23–56.
  46. ^ Эйзенталь, Р.; Корниш-Боуден, А. (1974). «Прямой линейный график: новая графическая процедура оценки кинетических параметров ферментов» . Биохим. Дж . 139 (3): 715–720. дои : 10.1042/bj1390715 . ПМЦ   1166335 . ПМИД   4854723 .
  47. ^ Греко, WR; Хакала, Монтана (1979). «Оценка методов оценки константы диссоциации ингибиторов ферментов прочного связывания» . J Биол Хим . 254 (23): 12104–12109. дои : 10.1016/S0021-9258(19)86435-9 . ПМИД   500698 .
  48. ^ Сторер, AC; Дарлисон, Миннесота; Корниш-Боуден, А. (1975). «Природа экспериментальной ошибки в измерениях кинетики ферментов» . Биохим. Дж . 151 (2): 361–367. дои : 10.1042/bj1510361 . ПМЦ   1172366 . ПМИД   1218083 .
  49. ^ Аскелёф, П; Корсфельдт, М; Маннервик, Б (1975). «Структура ошибок ферментативных кинетических экспериментов: последствия для взвешивания в регрессионном анализе экспериментальных данных» . Евро. Дж. Биохим . 69 (1): 61–67. дои : 10.1111/j.1432-1033.1976.tb10858.x . ПМИД   991863 .
  50. ^ Маннервик, Б.; Якобсон И.; Уорхольм, М. (1986). «Структура ошибок в зависимости от концентрации субстрата и ингибитора в экспериментах по кинетике ферментов» . Биохим. Дж . 235 (3): 797–804. дои : 10.1042/bj2350797 . ПМК   1146758 . ПМИД   3753447 .
  51. ^ Корниш-Боуден, А; Эндреньи, Л. (1986). «Надежная регрессия данных кинетики ферментов» . Биохим. Дж . 234 (1): 21–29. дои : 10.1042/bj2340021 . ПМЦ   1146522 . ПМИД   3707541 .
  52. ^ Шнелл, С.; Мендоса, К. (1997). «Решение в закрытой форме для зависящей от времени кинетики ферментов». Журнал теоретической биологии . 187 (2): 207–212. Бибкод : 1997JThBi.187..207S . дои : 10.1006/jtbi.1997.0425 .
  53. ^ Олп, доктор медицины; Калоус, Канзас; Смит, Британская Колумбия (2020). «ICEKAT: интерактивный онлайн-инструмент для расчета начальных показателей на основе непрерывных кинетических следов ферментов» . БМК Биоинформатика . 21 (1): 186. дои : 10.1186/s12859-020-3513-y . ПМК   7222511 . ПМИД   32410570 . S2CID   218624836 .
  54. ^ Гудар, Коннектикут; Соннад, младший; Дагглби, Р.Г. (1999). «Оценка параметров с использованием прямого решения интегрированного уравнения Михаэлиса – Ментен». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1429 (2): 377–383. дои : 10.1016/s0167-4838(98)00247-7 . ПМИД   9989222 .
  55. ^ Гудар, Коннектикут; Харрис, СК; Макинерни, MJ; Суфлита, Дж. М. (2004). «Анализ кривой прогресса ферментных и микробных кинетических реакций с использованием явных решений, основанных на W -функции Ламберта». Журнал микробиологических методов . 59 (3): 317–326. дои : 10.1016/j.mimet.2004.06.013 . ПМИД   15488275 .
  56. ^ Согласно Рекомендациям IUBMB, торможение классифицируется операционально , т.е. с точки зрения наблюдаемого, а не с точки зрения его интерпретации.
  57. ^ Клеланд, WW (1963). «Кинетика ферментативно-катализируемых реакций с двумя или более субстратами или продуктами: II. Ингибирование: номенклатура и теория». Биохим. Биофиз. Акта . 67 (2): 173–187. дои : 10.1016/0926-6569(63)90226-8 . ПМИД   14021668 .
[ редактировать ]

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 5081a5207842a292c63f2635ba7b29c0__1724637660
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/50/c0/5081a5207842a292c63f2635ba7b29c0.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Michaelis–Menten kinetics - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)