Jump to content

Глицин — тРНК-лигаза

(Перенаправлено с ГАРС (ген) )
Глицин — тРНК-лигаза
Идентификаторы
Номер ЕС. 6.1.1.14
Номер CAS. 9037-62-1
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
Экспаси Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins
ГАРС1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы GARS1 , CMT2D, DSMAV, GlyRS, HMN5, SMAD1, глицил-тРНК-синтетаза, GARS, глицил-тРНК-синтетаза 1, HMN5A, SMAJI
Внешние идентификаторы Опустить : 600287 ; МГИ : 2449057 ; Гомологен : 1547 ; Генные карты : GARS1 ; ОМА : GARS1 – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_002047
НМ_001316772

НМ_180678

RefSeq (белок)

НП_001303701
НП_002038

НП_851009

Местоположение (UCSC) Чр 7: 30,58 – 30,63 Мб Чр 6: 55.01 – 55.06 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Глицин-тРНК-лигаза, также известная как глицил-тРНК-синтетаза, представляет собой фермент , который у человека кодируется GARS1 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Этот ген кодирует глицил-тРНК-синтетазу, одну из аминоацил-тРНК-синтетаз, которые заряжают тРНК родственными им аминокислотами. Кодируемый фермент представляет собой (альфа)2-димер, который принадлежит к семейству тРНК-синтетаз класса II. [ 7 ]

В энзимологии глицин -тРНК-лигаза ( EC 6.1.1.14 ) — фермент химическую , катализирующий реакцию .

АТФ + глицин + тРНКГли АМФ + дифосфат + глицил-тРНКГли

Тремя субстратами этого фермента являются АТФ , глицин и тРНК(Gly) , тогда как тремя его продуктами являются АМФ , дифосфат и глицил-тРНК(Gly) .

Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , а именно тех, которые образуют связи углерод-кислород в аминоацил-тРНК и родственных соединениях. Систематическое название этого класса ферментов — глицин:тРНКГлилигаза (АМФ-образующая) . Другие широко используемые названия включают глицил-тРНК-синтетазу , глицил-переносящую рибонуклеатсинтетазу , глицил-переносящую РНК-синтетазу , глицил-переносящую рибонуклеиновую кислоту -синтетазу и глицилтранслазу . Этот фермент участвует в метаболизме глицина, серина и треонина, а также в биосинтезе аминоацил-трна .

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что глицил-тРНК-синтетаза взаимодействует с EEF1D . [ 8 ] мутантные формы белка, связанные с заболеваниями периферических нервов Было показано, что , аберрантно связываются с трансмембранными рецепторными белками нейропилином 1. [ 9 ] и Trk-рецепторы AC. [ 10 ]

Клиническая значимость

[ редактировать ]

Было показано, что глицил-тРНК-синтетаза является мишенью аутоантител при аутоиммунных заболеваниях человека, полимиозите или дерматомиозите . [ 7 ]

Заболевания периферических нервов, болезнь Шарко-Мари-Тута типа 2D (CMT2D) и дистальная спинальная мышечная атрофия типа V (dSMA-V), относятся к доминантным мутациям в GARS . [ 11 ] [ 12 ] ШМТ 2 типа обычно проявляется в подростковом возрасте и приводит к мышечной слабости преимущественно в руках и ногах. [ 13 ] Две мышиные модели CMT2D были использованы для лучшего понимания заболевания и установили, что расстройство вызвано токсическим усилением функции мутантного белка глицин-тРНК-лигазы. [ 14 ] У мышей CMT2D наблюдается аксонов периферических нервов. дегенерация [ 15 ] [ 16 ] и неполноценное развитие [ 17 ] и функция [ 18 ] > нервно-мышечного соединения .

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000106105 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029777 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Николс Р.К., Пай С.И., Ге К., Таргофф И.Н., Плотц П.Х., Лю П. (ноябрь 1995 г.). «Локализация двух генов аутоантигена человека с помощью ПЦР-скрининга и гибридизации in situ: глицил-тРНК-синтетаза локализуется в 7p15, а аланил-тРНК-синтетаза локализуется в 16q22» . Геномика . 30 (1): 131–2. дои : 10.1006/geno.1995.0028 . ПМИД   8595897 .
  6. ^ Ионасеску В., Сирби С., Шеффилд В.К., Роклина Т., Нишимура Д., Ионасеску Р. (сентябрь 1996 г.). «Аутосомно-доминантная аксональная невропатия Шарко-Мари-Тута, картированная на хромосоме 7p (CMT2D)». Молекулярная генетика человека . 5 (9): 1373–5. CiteSeerX   10.1.1.588.4502 . дои : 10.1093/hmg/5.9.1373 . ПМИД   8872480 .
  7. ^ Jump up to: а б с «Ген Энтрез: GARS-глицил-тРНК-синтетаза» .
  8. ^ Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х., Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия аминоацил-тРНК-синтетаз человека и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 291 (1): 158–64. дои : 10.1006/bbrc.2002.6398 . ПМИД   11829477 .
  9. ^ Хе В, Бай Г, Чжоу Х, Вэй Н, Уайт НМ, Лауэр Дж, Лю Х, Ши Ю, Думитру КД, Леттьери К, Шубаев В, Иорданова А, Гергельчева В, Гриффин П.Р., Бёрджесс Р.В., Пфафф С.Л., Ян XL (2015). «Нейропатия CMT2D связана с неоморфной связывающей активностью глицил-тРНК-синтетазы» . Природа . 526 (7575): 710–4. Бибкод : 2015Natur.526..710H . дои : 10.1038/nature15510 . ПМЦ   4754353 . ПМИД   26503042 .
  10. ^ Сани Дж.Н., Дауэс Дж.М., Вест С.Дж., Вэй Н., Сполдинг Э.Л., Гомес-Мартин А., Чжан К., Берджесс Р.В., Кадер М.З., Талбот К., Ян XL, Беннетт Д.Л., Скьяво Г. (2017). «Передача сигналов рецептора Trk и судьба сенсорных нейронов нарушаются при нейропатии человека, вызванной мутациями Gars» . Proc Natl Acad Sci США . 114 (16): E3324–E3333. Бибкод : 2017PNAS..114E3324S . дои : 10.1073/pnas.1614557114 . ПМК   5402433 . ПМИД   28351971 .
  11. ^ Мотли В.В., Талбот К., Фишбек К.Х. (февраль 2010 г.). «Аксонопатия GARS: чашка тРНК не в каждом нейроне» . Тенденции в нейронауках . 33 (2): 59–66. дои : 10.1016/j.tins.2009.11.001 . ПМЦ   2822721 . ПМИД   20152552 .
  12. ^ Антонеллис А, Эллсуорт Р.Э., Самбугин Н., Пульс И., Абель А., Ли-Лин С.К., Иорданова А., Кременский И., Христодулу К., Миддлтон Л.Т., Сивакумар К., Ионасеску В., Фуналот Б., Вэнс Дж.М., Гольдфарб Л.Г., Фишбек К.Х., Зеленый ЭД (2003). «Мутации глицил-тРНК-синтетазы при болезни Шарко-Мари-Тута типа 2D и дистальной спинальной мышечной атрофии типа V» . Американский журнал генетики человека . 72 (5): 1293–9. дои : 10.1086/375039 . ПМК   1180282 . ПМИД   12690580 .
  13. ^ Сивакумар К., Кириакидес Т., Пульс И., Николсон Г.А., Фуналот Б., Антонеллис А., Самбуугин Н., Христодулу К., Беггс Дж.Л., Замба-Папаниколау Е., Ионасеску В., Далакас М.К., Грин Э.Д., Фишбек К.Х., Гольдфарб Л.Г. (октябрь 2005 г.) . «Фенотипический спектр нарушений, связанных с мутациями глицил-тРНК-синтетазы» . Мозг . 128 (Часть 10): 2304–14. дои : 10.1093/brain/awh590 . ПМИД   16014653 .
  14. ^ Мотли В.В., Себерн К.Л., Наваз М.Х., Майерс К.Е., Ченг Дж., Антонеллис А., Грин Э.Д., Талбот К., Ян XL, Фишбек К.Х., Берджесс Р.В. (декабрь 2011 г.). «Мутантный GARS, сцепленный с Шарко-Мари-Тутом, токсичен для периферических нейронов независимо от уровней GARS дикого типа» . ПЛОС Генетика . 7 (12): e1002399. дои : 10.1371/journal.pgen.1002399 . ПМЦ   3228828 . ПМИД   22144914 .
  15. ^ Себерн К.Л., Нэнгл Л.А., Кокс Г.А., Шиммель П., Берджесс Р.В. (сентябрь 2006 г.). «Активная доминантная мутация глицил-тРНК-синтетазы вызывает нейропатию в 2D-модели мышей Шарко-Мари-Тута» . Нейрон . 51 (6): 715–26. дои : 10.1016/j.neuron.2006.08.027 . ПМИД   16982418 . S2CID   11035583 .
  16. ^ Ачилли Ф, Брос-Фасер В, Уильямс Х.П., Бэнкс ГТ, АльКатари М, Чиа Р., Туччи В., Гровс М., Николс К.Д., Себерн К.Л., Кендалл Р., Кадер М.З., Талбот К., ван Миннен Дж., Берджесс Р.В., Бранднер С. , Мартин Дж. Э., Кольценбург М., Гринсмит Л., Нолан П. М., Фишер Э. М. (июль – август 2009 г.). «Вызванная ENU мутация в мышиной глицил-тРНК-синтетазе (GARS) вызывает периферические сенсорные и моторные фенотипы, создавая модель периферической невропатии Шарко-Мари-Тута 2D типа» . Модели и механизмы заболеваний . 2 (7–8): 359–73. дои : 10.1242/dmm.002527 . ПМК   2707104 . ПМИД   19470612 .
  17. ^ Сани Дж.Н., Грайс С.Дж., Берджесс Р.В., Талбот К., Кадер М.З. (май 2014 г.). «Дефекты созревания нервно-мышечных соединений предшествуют нарушению связи нижних мотонейронов у мышей Шарко-Мари-Тута типа 2D» . Молекулярная генетика человека . 23 (10): 2639–50. дои : 10.1093/hmg/ddt659 . ПМК   3990164 . ПМИД   24368416 .
  18. ^ Сполдинг Э.Л., Сани Дж.Н., Морелли К.Х., Пинтер М.Дж., Берджесс Р.В., Себерн К.Л. (2016). «Синаптический дефицит в нервно-мышечных соединениях у двух мышей с типом Шарко-Мари-Тута 2d» . Журнал неврологии . 36 (11): 3254–67. doi : 10.1523/JNEUROSCI.1762-15.2016 . ПМЦ   4792937 . ПМИД   26985035 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 607fb9869df2ab7d5e6098a0ca88abe6__1701546480
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/60/e6/607fb9869df2ab7d5e6098a0ca88abe6.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Glycine—tRNA ligase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)