Белок 4, связанный с драгоценными камнями

БЛИЗНЕЦ4
Идентификаторы
Псевдонимы	GEMIN4 , HC56, HCAP1, HHRF-1, p97, белок 4, связанный с ядерной органеллой драгоценного камня, NEDMCR
Внешние идентификаторы	Опустить : 606969 ; МГИ : 2449313 ; Гомологен : 69193 ; Генные карты : GEMIN4 ; ОМА : GEMIN4 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	753,999 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	76,108,490 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; left testis; ; right testis; ; skin of abdomen; ; skin of leg; ; gonad; ; gingival epithelium; ; left ovary; ; body of stomach; ; right ovary;
	Top expressed in
	spermatid; ; testicle; ; epiblast; ; esophagus; ; embryo; ; embryo; ; yolk sac; ; spermatocyte; ; mesencephalon; ; uterus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	SMN-Sm protein complex; cytosol; nucleolus; small nuclear ribonucleoprotein complex; extracellular exosome; membrane; gemini of coiled bodies; nucleoplasm; SMN complex; nucleus; cytoplasm; nuclear body;
Biological process	mRNA processing; RNA splicing; import into nucleus; spliceosomal snRNP assembly; rRNA processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	50628
	276919
	ENSG00000179409
	ENSMUSG00000049396
	P57678
	Q6P6L6
	НМ_015721
	НМ_177367
	НП_056536
	НП_796341
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 4, ассоциированный с драгоценными камнями, — это белок , который у человека кодируется GEMIN4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Продукт этого гена является частью белкового комплекса SMN , локализованного в цитоплазме, ядрышках и дискретных ядерных тельцах, называемых тельцами Близнецов (гемс) . Комплекс участвует в сборке сплайсосомных мяРНП в цитоплазме и регенерирует сплайсосомы, необходимые для сплайсинга пре-мРНК в ядре. Кодируемый белок напрямую взаимодействует с белком DEAD-бокса и несколькими коровыми белками сплайсосомы. Были описаны альтернативные варианты сплайсированных транскриптов, но их биологическая ценность не определена. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что GEMIN4 взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179409 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049396 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б Шарру Б., Пелиццони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (апрель 2000 г.). «Gemin4: новый компонент комплекса Smn, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . J Клеточная Биол . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4, связанный с драгоценным камнем GEMIN4 (ядерной органеллой)» .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мурелатос З., Дости Дж., Паушкин С., Шарма А., Шарру Б., Абель Л., Раппсилбер Дж. , Манн М., Дрейфусс Г. (март 2002 г.). «МиРНП: новый класс рибонуклеопротеинов, содержащий многочисленные микроРНК» . Генс Дев . 16 (6): 720–8. дои : 10.1101/gad.974702 . ПМК 155365 . ПМИД 11914277 .
^ Нельсон П.Т., Хацигеоргиу А.Г., Мурелатос З. (март 2004 г.). «Ассоциация миРНП: мРНК в полирибосомах в линии нейрональных клеток человека» . РНК . 10 (3): 387–94. дои : 10.1261/rna.5181104 . ПМК 1370934 . ПМИД 14970384 .
^ Пак Дж.В., Восс П.Г., Грабски С., Ван Дж.Л., Паттерсон Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (17): 3595–602. дои : 10.1093/нар/29.17.3595 . ПМК 55878 . ПМИД 11522829 .
^ Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Хм. Мол. Жене . 9 (13): 1977–86. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .

Дальнейшее чтение

Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (2000). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Хм. Мол. Жене . 9 (13): 1977–86. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .
Пеллиццони Л., Шарру Б., Раппсильбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом мотонейронов выживания и РНК-полимеразой II» . Дж. Клеточная Биол . 152 (1): 75–85. дои : 10.1083/jcb.152.1.75 . ПМЦ 2193649 . ПМИД 11149922 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных кДНК человека, кодирующих белки» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Пак Дж.В., Восс П.Г., Грабски С., Ван Дж.Л., Паттерсон Р.Дж. (2001). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (17): 3595–602. дои : 10.1093/нар/29.17.3595 . ПМК 55878 . ПМИД 11522829 .
Цинь WX, Ван Ф, Сунь ФЮ, Чжан П. П., Хань Л. В., Хуан Ю, штаб-квартира Цзян, Чжао XT, Хэ М, Е Ю, Конг ВМ, Ву MC, Чжан Л. С., Ян Н. В., Гу JR (2002). «Клонирование и характеристика нового гена (C17orf25) из области делеции хромосомы 17p13.3 при гепатоцеллюлярной карциноме» . Сотовый Res . 11 (3): 209–16. дои : 10.1038/sj.cr.7290088 . ПМИД 11642406 .
Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А., Массне С., Песиридис Г.С., Ван Дуйн Г., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (2001). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Мол. Клетка. Биол . 21 (24): 8289–300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .
Губиц А.К., Мурелатос З., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (2002). «Gemin5, новый белковый компонент повторов WD комплекса SMN, который связывает белки Sm» . Ж. Биол. Хим . 277 (7): 5631–6. дои : 10.1074/jbc.M109448200 . ПМИД 11714716 .
Пеллицони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (2002). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Ж. Биол. Хим . 277 (9): 7540–5. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Бэккон Дж., Пелиццони Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Г. (2002). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов» . Ж. Биол. Хим . 277 (35): 31957–62. дои : 10.1074/jbc.M203478200 . ПМИД 12065586 .
Ди Ю, Ли Дж, Чжан Ю, Хэ Х, Лу Х, Сюй Д, Лин Дж, Хо К, Ван Д, Ли Ю, Гу Дж (2004). «HCC-ассоциированный белок HCAP1, вариант GEMIN4, взаимодействует с белками цинковых пальцев». Дж. Биохим . 133 (6): 713–8. дои : 10.1093/jb/mvg091 . ПМИД 12869526 .
Ван Д., Хэ М., Ван Дж., Цю Икс, Чжоу В., Луо З., Чэнь Дж., Гу Дж. (2004). «Два варианта гена HCAP1, связанного с гепатоцеллюлярной карциномой человека, и их влияние на рост линии клеток рака печени человека Hep3B». Гены Хромосомы Рак . 39 (1): 48–58. дои : 10.1002/gcc.10293 . ПМИД 14603441 . S2CID 20451424 .
Нельсон П.Т., Хацигеоргиу А.Г., Мурелатос З. (2004). «Ассоциация миРНП: мРНК в полирибосомах в линии нейрональных клеток человека» . РНК . 10 (3): 387–94. дои : 10.1261/rna.5181104 . ПМК 1370934 . ПМИД 14970384 .
Шпаргель КБ, Матера АГ (2006). «Белки-гемины необходимы для эффективной сборки рибонуклеопротеинов Sm-класса» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (48): 17372–7. дои : 10.1073/pnas.0508947102 . ПМК 1297697 . ПМИД 16301532 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Серажевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо Ю, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дювел. Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Маскат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин ГБ, Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000179409 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049396 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10725331-5] Перейти обратно: ^а ^б Шарру Б., Пелиццони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (апрель 2000 г.). «Gemin4: новый компонент комплекса Smn, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . J Клеточная Биол . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 4, связанный с драгоценным камнем GEMIN4 (ядерной органеллой)» .

[pmid11914277-7] Перейти обратно: ^а ^б Мурелатос З., Дости Дж., Паушкин С., Шарма А., Шарру Б., Абель Л., Раппсилбер Дж. , Манн М., Дрейфусс Г. (март 2002 г.). «МиРНП: новый класс рибонуклеопротеинов, содержащий многочисленные микроРНК» . Генс Дев . 16 (6): 720–8. дои : 10.1101/gad.974702 . ПМК 155365 . ПМИД 11914277 .

[pmid14970384-8] Нельсон П.Т., Хацигеоргиу А.Г., Мурелатос З. (март 2004 г.). «Ассоциация миРНП: мРНК в полирибосомах в линии нейрональных клеток человека» . РНК . 10 (3): 387–94. дои : 10.1261/rna.5181104 . ПМК 1370934 . ПМИД 14970384 .

[pmid11522829-9] Пак Дж.В., Восс П.Г., Грабски С., Ван Дж.Л., Паттерсон Р.Дж. (сентябрь 2001 г.). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (17): 3595–602. дои : 10.1093/нар/29.17.3595 . ПМК 55878 . ПМИД 11522829 .

[pmid10942426-10] Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б., Зобава М., Лотспайх Ф., Фишер У. (август 2000 г.). «Характеристика ядерного комплекса 20S, содержащего белок выживания двигательных нейронов (SMN) и определенное подмножество сплайсосомных белков Sm» . Хм. Мол. Жене . 9 (13): 1977–86. дои : 10.1093/hmg/13.09.1977 . ПМИД 10942426 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]