Гистон H3
| Гистон H3, семейство 3A (H3.3A) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | H3F3A | ||
| Альт. символы | H3F3 | ||
| ген NCBI | 3020 | ||
| HGNC | 4764 | ||
| МОЙ БОГ | 601128 | ||
| RefSeq | НМ_002107 | ||
| ЮниПрот | Q66I33 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Хр. 1 q41 | ||
| |||
| Гистон H3, семейство 3B (H3.3B) | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | H3F3B | ||
| ген NCBI | 3021 | ||
| HGNC | 4765 | ||
| МОЙ БОГ | 601058 | ||
| RefSeq | НМ_005324 | ||
| ЮниПрот | P84243 | ||
| Другие данные | |||
| Локус | Хр. 17 q25 | ||
| |||
Гистон H3 — один из пяти основных гистонов, участвующих в структуре хроматина эукариотических клеток . [1] [2] Обладая основным глобулярным доменом и длинным N-концевым хвостом , H3 участвует в структуре нуклеосом структуры «бусинки на нити». Гистоновые белки сильно модифицируются посттрансляционно, однако гистон H3 является наиболее модифицированным из пяти гистонов. Сам по себе термин «Гистон H3» намеренно неоднозначен, поскольку в нем не проводится различие между вариантами последовательности или состоянием модификации. Гистон H3 является важным белком в развивающейся области эпигенетики , где варианты его последовательности и различные состояния модификации, как полагают, играют роль в динамической и долгосрочной регуляции генов.
Эпигенетика и посттрансляционные модификации
[ редактировать ]N -конец H3 выступает из ядра глобулярной нуклеосомы и подвержен посттрансляционной модификации, влияющей на клеточные процессы. Эти модификации включают ковалентное присоединение метильных или ацетильных групп к лизину и аргинину аминокислотам и фосфорилирование серина или треонина . Ди- и триметилирование лизина 9 связано с репрессией и гетерохроматином (см. H3K9me2 и H3K9me3 ), тогда как монометилирование K4 (K4 соответствует остатку лизина в 4-м положении) (см. H3K4me1 ) связано с активными генами. [3] [4] Ацетилирование гистона H3 по нескольким позициям лизина в хвосте гистона осуществляется ферментами гистон-ацетилтрансферазы (HAT). Ацетилирование лизина14 обычно наблюдается в генах, которые активно транскрибируются в РНК (см. H3K14ac ).
Варианты последовательности
[ редактировать ]Клетки млекопитающих имеют семь известных вариантов последовательности гистона H3. Они обозначены как гистон H3.1, гистон H3.2, гистон H3.3, гистон H3.4 (H3T), гистон H3.5, гистон H3.X и гистон H3.Y, но имеют высококонсервативные последовательности, отличающиеся только мало аминокислот. [5] [6] Было обнаружено, что гистон H3.3 играет важную роль в поддержании целостности генома во время развития млекопитающих. [7] Варианты гистонов разных организмов, их классификацию и особенности вариантов можно найти в базе данных «HistoneDB - with Variants» .
Генетика
[ редактировать ]Гистоны H3 кодируются несколькими генами в геноме человека, в том числе:
- H3.1: HIST1H3A , HIST1H3B , HIST1H3C , HIST1H3D , HIST1H3E , HIST1H3F , HIST1H3G , HIST1H3H , HIST1H3I , HIST1H3J
- H3.2: HIST2H3A , HIST2H3C , HIST2H3D
- H3.3: H3F3A , H3F3B
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Бхасин М., Рейнхерц Э.Л., Рече П.А. (2006). «Распознавание и классификация гистонов с использованием машины опорных векторов» (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 13 (1): 102–12. дои : 10.1089/cmb.2006.13.102 . ПМИД 16472024 .
- ^ Хартл Д.Л., Фрайфельдер Д., Снайдер Л.А. (1988). Базовая генетика . Бостон: Издательство Jones and Bartlett. ISBN 978-0-86720-090-4 .
- ^ Розенфельд Дж. А., Ван З., Шонес Д.Э., Чжао К., ДеСалле Р., Чжан М.К. (март 2009 г.). «Определение обогащенных модификаций гистонов в негенных частях генома человека» . БМК Геномика . 10 :143. дои : 10.1186/1471-2164-10-143 . ПМЦ 2667539 . ПМИД 19335899 .
- ^ Лакнер М., О'Кэрролл Д., Ри С., Мехтлер К., Дженувейн Т. (март 2001 г.). «Метилирование гистона H3 лизина 9 создает сайт связывания для белков HP1» . Природа . 410 (6824): 116–20. Бибкод : 2001Natur.410..116L . дои : 10.1038/35065132 . ПМИД 11242053 . S2CID 4331863 .
- ^ Марзлафф В.Ф., Гонгиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Малтаис Л.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Гистоны человека и мыши, зависимые от репликации» . Геномика . 80 (5): 487–98. дои : 10.1016/S0888-7543(02)96850-3 . ПМИД 12408966 .
- ^ Хейк С.Б., Гарсия Б.А., Дункан Э.М., Кауэр М., Деллер Дж., Шабановиц Дж., Базетт-Джонс Д.П., Эллис К.Д., Хант Д.Ф. (январь 2006 г.). «Схемы экспрессии и посттрансляционные модификации, связанные с вариантами гистона H3 млекопитающих» . Журнал биологической химии . 281 (1): 559–68. дои : 10.1074/jbc.M509266200 . ПМИД 16267050 .
- ^ Джанг К.В., Шибата И., Стармер Дж., Йи Д., Магнусон Т. (июль 2015 г.). «Гистон H3.3 поддерживает целостность генома во время развития млекопитающих» . Гены и развитие . 29 (13): 1377–92. дои : 10.1101/gad.264150.115 . ПМЦ 4511213 . ПМИД 26159997 .