Белок-аргинин-дейминаза
| Белок-аргинин-дейминаза | |||
|---|---|---|---|
 Белок-аргинин Дейминаза 4, Димер, Человек | |||
| Идентификаторы | |||
| ЕС №. | 3.5.3.15 | ||
| CAS №. | 75536-80-0 | ||
| Базы данных | |||
| Intenz | Intenz View | ||
| Бренда | Бренда вход | ||
| Расширение | Вид Nicezyme | ||
| Кегг | Кегг вход | ||
| Метатический | Метаболический путь | ||
| Напрямую | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
| Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
| |||
В фермере , белок-аргинин-аргинин-деиминаза ( EC 3.5.3.15 ) представляет собой фермент , который катализирует форму пост-трансляционной модификации, называемой аргинином де-иминации или цитруллинации :
- белок L -аргинин + H 2 O белок L -цитраллин + NH 3
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются белок L -аргинин (остаток аргинина внутри белка) и H 2 O , тогда как его двумя продуктами являются белок L -цитруллин и NH 3 :
Этот фермент относится к семейству гидролаз , которые действуют на углерод-азотные связи , отличные от пептидных связей , особенно в линейных амидинах . Систематическим названием этого класса ферментов является белок-L-аргинин-иминогидролаза . Этот фермент также называется пептидиларгининовой деиминазой .
Структурные исследования
[ редактировать ]В конце 2007 года семь структур для этого класса ферментов было решено в ПДБ , с кодами вступления 1WD8 , 1WD9 , 1WDA , 2DEW , 2DEX , 2DEY и 2DW5 .
Белки млекопитающих
[ редактировать ]У млекопитающих есть 5 белок-аргининин деминазы с символами
За исключением грызунов , там по -прежнему отличается буква:
- PADI1, PADI2, PADI3, PADI4, PADI6 [ 3 ]
Различный случай - это просто исторический артефакт. Это не указывает на то, что белки грызунов являются особенными.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Sams, KL; Мукай, C; Марки, ба; Миттал, C; Деметра, EA; Нелиссен, S; Grenier, JK; Тейт, аэ; Ахмед, F; Coonrod, SA (октябрь 2022 г.). «Задержка полового созревания, аномалии гонадотропина и сложность у самцов мышей с двойным нокаутом PADI2/PADI4» . Воспроизведение биол эндокринол . 20 (1): 150. DOI : 10.1186/S12958-022-01018-W . PMC 9555066 . PMID 36224627 .
- ^ «Результаты поиска для« пептидил -аргинин деминаза » » . Комитет по номенклатуру гена позвоночных . Получено 9 февраля 2022 года .
- ^ «Протеиновая суперсемейство детали: белок-аргинин_дейминаза» . Мышиная информация.
- Fujisaki M, Sugawara K (январь 1981 г.). «Свойства пептидиларгинин -деиминазы из эпидермиса новорожденных крыс». J. Biochem . 89 (1). Токио: 257–63. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a133189 . PMID 7217033 .
- белок-аргинин+deiminase в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)
