Гаплогруппа КТ

Гаплогруппа КТ
Гаплогруппа КТ
Возможное время происхождения	~70 000 лет назад, ~100 000 лет назад, или ~ 101 000 лет назад
Возможное место происхождения	Африка , возможно, Северо-Восточная Африка
Предок	Гаплогруппа БТ
Потомки	Гаплогруппа CF , Гаплогруппа DE
Определение мутаций	P9.1, M168, M294, V9, V41, V54, V189 и V226.

Гаплогруппа CT — гаплогруппа Y-хромосомы человека . CT имеет две базальные ветви: CF и DE . DE разделен на преимущественно распространенную в Азии гаплогруппу D-CTS3946 и преимущественно распространенную в Африке гаплогруппу E-M96 , тогда как CF разделен на гаплогруппу C-M130 из Восточной Азии, коренных американцев и Океании и гаплогруппу F-M89 , которая доминирует. большинство неафриканского населения.

Распределение

Мужчины-носители клады CT имеют Y-хромосомы с SNP- мутацией M168, а также P9.1 и M294. Эти мутации присутствуют во всех современных мужских линиях человека, за исключением A и B-M60 , которые встречаются почти исключительно в Африке .

Самый последний общий предок мужской линии (TMRCA) всех современных мужчин CT, вероятно, предшествовал недавнему африканскому происхождению современных людей , миграции, в которой участвовали некоторые из его потомков. Поэтому считается, что до предполагаемой миграции он жил в Африке. ^{[ 1 ]}^{[ 5 ]}^{[ 4 ]} В соответствии с концепцией « Y-хромосомного Адама », данной предку всех живых людей по отцовской линии, CT-M168 поэтому в популярных источниках также упоминается как линия «евразийского Адама» или «Адама из Африки». ; потому что, наряду со многими африканскими Y-линиями, от нее происходят все неафриканские Y-линии. ^{[ 8 ]}^{[ 7 ]}^{[ 6 ]}

Ни один самец парагруппы CT* никогда не был обнаружен в современных популяциях. Это означает, что все мужчины, несущие эту гаплогруппу, также относятся к одной из нескольких основных ветвящихся клад . Все известные выжившие потомки CT находятся в одном из двух основных субкладов, CF и DE . В свою очередь, DE делится на преимущественно распространенную в Азии гаплогруппу D-CTS3946 и преимущественно распространенную в Африке гаплогруппу E-M96 , тогда как CF делится на гаплогруппу C-M130 и гаплогруппу F-M89 из Восточной Азии, коренных американцев и Океании. , который доминирует над большинством неафриканского населения. ^{[ 6 ]}

Субклады

CF

Гаплогруппа CF является субкладом гаплогруппы CT.

ИЗ

Гаплогруппа DE является субкладом гаплогруппы CT.

Филогенетические деревья

Гаплогруппа CT (M168/PF1416)

CF (P143/PF2587, CTS3818/M3690/PF2668, CTS6376/M3711/PF2697) Шанцы
- C (M130/Page51/RPS4Y711, M216) Азия , Океания и Северная Америка
  - С1 F3393/Z1426
    - C1a CTS11043
      - C1a1 ранее C1 (M8, M105, M131) Япония
      - C1a2 Очень низкая частота в Западной Евразии (включая Костенки 38 000 лет назад)
    - C1b
      - C1b1
        C1b1a
        C1b1a1 ранее C5 (M356) Южная Азия , Центральная Азия и Юго-Западная Азия
      - C1b2
        C1b2a ранее C2 (M38) Индонезия , Новая Гвинея , Меланезия , Микронезия и Полинезия.
        
        C1b2b ранее C4 (M347) Коренные австралийцы
  - C2, ранее C3 (M217, P44) Встречается по всей Евразии и Северной Америке, но особенно среди монголов , казахов , тунгусских народов , палеосибирцев и на-дене. народов, говорящих
- F (M89, M213) Встречается по всей Евразии , Океании и Америке.
  - Ф1 (Р91, Р104)
  - Ф2 (М427, М428)
  - F3 (P96)
  - Ф4 (М481)
- GHIJK F1329/M3658/PF2622/YSC0001299, CTS2254/M3680/PF2657, FGC2045/Z12203 По всей Евразии ; также Америка ; на низком уровне/среди меньшинств в Африке и Океании
  - G M201, P257 Преимущественно Кавказ ; также на низком уровне/среди меньшинств в Европе, Северной Африке, Юго-Западной Азии и Центральной Азии.
  - HIJK по всей Евразии; также Америка; на низком уровне/среди меньшинств в Африке и Океании
    - H M69, M370 Южная Азия , Центральная Азия и Юго-Западная Азия
    - IJK L15/S137, L16/S138 Евразия, Северная Африка, Океания, Америка и Восточная Африка
    - IJ M429/P125 Европа , Западная Азия , Северная Африка и Восточная Африка
      - I M170, M258, P19, P38, P212, U179 Европа
      - J 12f2.1, M304 Европа , Западная Азия , Южная Азия , Северная Африка и Восточная Африка
    - K M9 Встречается по всей Евразии ; также важен в Америке и Океании ; на более низких уровнях в Северной Африке и Восточной Африке
      - ЛТ ( К1 ) L298/P326
        L M11, M20, M22, M61, M185, M295 Индийский субконтинент
        
        TM70 , M184/USP9Y+3178, M193, M272 (ранее K2) Юго-Западная Азия , Южная Азия , Северная Африка , Африканский Рог , бассейн Чада и Южная Европа
      - K2 M526 Евразия , Океания , Америка , некоторые коренные австралийцы и некоторые меньшинства в Африке.
        NO ( K2a ) M214 Сообщается, что обнаружен у небольшого количества мужчин буйи и японцев .
        N M231 Восточная Европа , Северная Азия и Восточная Азия
        
        O M175 Океания , Юго-Восточная Азия и Восточная Азия
        
        K2b ранее MPS P331 Евразия, Америка, Океания и меньшинства в Африке
        K2b1 ранее MS P397/P399 Меланезийцы, микронезийцы , коренные австралийцы и полинезийцы.
        M P256 Восточная Индонезия , Папуа-Новая Гвинея и Меланезия
        
        S M230, P202, P204 (ранее K5) Восточная Индонезия , Папуа-Новая Гвинея и Меланезия.
        
        P ( K2b2 ) 92R7, M45, M74/N12, P27.1/P207 По всей Евразии , Америке и некоторым меньшинствам в Африке.
        Q M242 Америка и Евразия
        
        R M207/UTY2, M306/S1 Европа, Ближний Восток, Южная Азия, бассейн Чада, Канарские острова
        
        K2c P261 Низкие уровни на Бали
        
        K2d P402/P403 Низкие уровни в Java
        
        K2e M147 Низкие уровни в Южной Азии
Гаплогруппа DE (M1/YAP, M145/P205, M203/Page36, P144, P153, P165, P167, P183) Азия, Африка, Южная и Восточная Европа; также на низких уровнях в Океании
- Гаплогруппа D (M174) В первую очередь жители Японии , Тибета и Андаманских островов ; также на низком уровне/среди меньшинств в Восточной Азии, Центральной Азии, Микронезии и Меланезии
  - Гаплогруппа D1 (CTS11577) В основном Тибет; меньшинства в Центральной Азии, Восточной Азии и Юго-Восточной Азии
    - Гаплогруппа D1a Z27276 Восточная и Центральная Азия
      - D1a1 (M15) (бывший D1) Цян люди ; также на низком уровне по всей Восточной и Центральной Азии
      - Гаплогруппа D1a2 P99 (ex-D3) Тибет и Центральная Азия
    - Гаплогруппа D1b (ex-D2) (M64.1/Page44.1, M55, M57, M179/Page31, M359.1/P41.1, P37.1, P190, 12f2.2) В основном Япония; также на низком уровне/среди меньшинств в Корее, Китае, Микронезии и Меланезии
  - Гаплогруппа D2 L1366 (бывший D1a) Филиппины
- Гаплогруппа E (M40, M96) Африка, Ближний Восток, Южная и Восточная Европа.
  - Гаплогруппа E1 (P147) На высоком уровне по всей Африке; на более низких уровнях на Ближнем Востоке и в Европе
    - Гаплогруппа E1a (ранее E1) (M132) Преимущественно Африка
    - Гаплогруппа E1b (P177/PF1939)
      - Гаплогруппа E1b1 (ранее E3) (P2, DYS391p)
        Гаплогруппа E1b1a (V38)
        
        Гаплогруппа E1b1a1 (ранее E3a) (M2) Западная Африка, Центральная Африка, Юго-Восточная Африка и Южная Африка
        
        Гаплогруппа E1b1b (ранее E3b) (M215) Африканский Рог ( эфиопы , сомалийцы , Эритрея ), Северная Африка ( берберы , арабы) ^{[ 9 ]}), Ближний Восток, Европа (особенно районы вблизи Средиземного моря)
  - Гаплогруппа E2 (M75) Восточная Африка

Источники

ИЗОГГ :

См. также

Генетика

Субклады Y-ДНК C

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Карафет и др. (2008) дают «70 000», ссылаясь на «68 500 ± 6000 лет» из Хаммера и Зегуры (2002). Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Мейлерман М.Б., Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер М.Ф. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 . . Раскол между CF и DE (который в отсутствие парагруппы CT* эквивалентен возрасту CT) был датирован 70 000–75 000 лет назад в геноме верхнепалеолита Сибири, что свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев , Nature 505, 87– 91 (2 января 2014 г.)
^ Jump up to: ^а ^б Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (апрель 2015 г.). «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. дои : 10.1101/гр.186684.114 . ПМЦ 4381518 . ПМИД 25770088 .
^ Хабер М., Джонс А.Л., Коннел Б.А., Асан, Арсьеро Э., Хуанмин Ю., Томас М.Г., Сюэ Ю., Тайлер-Смит С. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее значение для расселения современного человека за пределы Африки» . Генетика . 212 (4): 1421–1428. дои : 10.1534/genetics.119.302368 . ПМК 6707464 . ПМИД 31196864 .
^ Jump up to: ^а ^б Андерхилл и Кивисилд; Кивисилд, Т (2007). «Использование структуры популяции Y-хромосомы и митохондриальной ДНК для отслеживания миграций человека». Анну. Преподобный Жене . 41 (1): 539–64. дои : 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407 . ПМИД 18076332 . S2CID 24904955 .
^ Jump up to: ^а ^б Стоун, Линда; Пол Ф. Люркен; Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (2007). «Путешествия, доисторические расселения человека» . Гены, культура и эволюция человека . Уайли. п. 187. ИСБН 978-1-4051-5089-7 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Карафет; и др. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
^ Jump up to: ^а ^б Дарвиновские детективы: раскрытие естественной истории генов и геномов , Норман А. Джонсон, 2007 г., ISBN 0-19-530675-9 , ISBN 978-0-19-530675-0
^ Гены, культура и эволюция человека: синтез , Линда Стоун, Пол Ф. Лурквин, 2007, ISBN 1-4051-5089-0 , стр. 187
^ Перейра и др. (2010), Связывание генофондов стран к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников-туарегов из африканского Сахеля , Европейский журнал генетики человека (2010) 18, 915–923; два : 10.1038/ejhg.2010.21

[Karafet-1] Jump up to: ^а ^б Карафет и др. (2008) дают «70 000», ссылаясь на «68 500 ± 6000 лет» из Хаммера и Зегуры (2002). Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Мейлерман М.Б., Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер М.Ф. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 . . Раскол между CF и DE (который в отсутствие парагруппы CT* эквивалентен возрасту CT) был датирован 70 000–75 000 лет назад в геноме верхнепалеолита Сибири, что свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев , Nature 505, 87– 91 (2 января 2014 г.)

[A_recent_bottleneck_of_Y_chromosome-2] Jump up to: ^а ^б Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (апрель 2015 г.). «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. дои : 10.1101/гр.186684.114 . ПМЦ 4381518 . ПМИД 25770088 .

[3] Хабер М., Джонс А.Л., Коннел Б.А., Асан, Арсьеро Э., Хуанмин Ю., Томас М.Г., Сюэ Ю., Тайлер-Смит С. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее значение для расселения современного человека за пределы Африки» . Генетика . 212 (4): 1421–1428. дои : 10.1534/genetics.119.302368 . ПМК 6707464 . ПМИД 31196864 .

[UnderhillandKivisild-4] Jump up to: ^а ^б Андерхилл и Кивисилд; Кивисилд, Т (2007). «Использование структуры популяции Y-хромосомы и митохондриальной ДНК для отслеживания миграций человека». Анну. Преподобный Жене . 41 (1): 539–64. дои : 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407 . ПМИД 18076332 . S2CID 24904955 .

[stone-5] Jump up to: ^а ^б Стоун, Линда; Пол Ф. Люркен; Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (2007). «Путешествия, доисторические расселения человека» . Гены, культура и эволюция человека . Уайли. п. 187. ИСБН 978-1-4051-5089-7 .

[Karafet1-6] Jump up to: ^а ^б ^с Карафет; и др. (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .

[Johnson-7] Jump up to: ^а ^б Дарвиновские детективы: раскрытие естественной истории генов и геномов , Норман А. Джонсон, 2007 г., ISBN 0-19-530675-9 , ISBN 978-0-19-530675-0

[8] Гены, культура и эволюция человека: синтез , Линда Стоун, Пол Ф. Лурквин, 2007, ISBN 1-4051-5089-0 , стр. 187

[Pereira2010-9] Перейра и др. (2010), Связывание генофондов стран к югу от Сахары и Западной Евразии: материнское и отцовское наследие кочевников-туарегов из африканского Сахеля , Европейский журнал генетики человека (2010) 18, 915–923; два : 10.1038/ejhg.2010.21

[vanOven2014-10] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome". Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.

[ISOGG2015-11] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)

[A0-T-12] Haplogroup A0-T is also known as A-L1085 (and previously as A0'1'2'3'4).

[A1-13] Haplogroup A1 is also known as A1'2'3'4.

[F-Y27277-14] F-Y27277, sometimes known as F2'4, is both the parent clade of F2 and F4 and a child of F-M89.

[LT-15] Haplogroup LT (L298/P326) is also known as Haplogroup K1.

[K2-16] Between 2002 and 2008, Haplogroup T-M184 was known as "Haplogroup K2". That name has since been re-assigned to K-M526, the sibling of Haplogroup LT.

[K2b-17] Haplogroup K2b (M1221/P331/PF5911) is also known as Haplogroup MPS.

[K2b1-18] Haplogroup K2b1 (P397/P399) is also known as Haplogroup MS, but has a broader and more complex internal structure.

[P-19] Haplogroup P (P295) is also klnown as K2b2.

[K-M2313-20] K-M2313*, which as yet has no phylogenetic name, has been documented in two living individuals, who have ethnic ties to India and South East Asia. In addition, K-Y28299, which appears to be a primary branch of K-M2313, has been found in three living individuals from India. See: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Access date of these pages: 9 December 2017)

[S-21] Haplogroup S, as of 2017, is also known as K2b1a. (Previously the name Haplogroup S was assigned to K2b1a4.)

[M-22] Haplogroup M, as of 2017, is also known as K2b1b. (Previously the name Haplogroup M was assigned to K2b1d.)

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ х 1 ]

[ х 2 ]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]