Гаплогруппа E-M96
Гаплогруппа Е | |
---|---|
Возможное время происхождения | 65 200 лет назад, [1] 69 000 лет назад, [2] или 73000 лет назад [3] |
Возраст слияния | 52 300 лет назад [1] |
Возможное место происхождения | Восточная Африка , [4] [5] [6] [3] Западная Африка , [7] или Евразия [8] [9] |
Предок | ИЗ |
Потомки | Э-П147 , Э-М75 |
Определение мутаций | L339, L614, M40/SRY4064/SRY8299, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162, P168, P169, P170, P171, P172, P173, P174, P175, P176 |
Гаплогруппа E-M96 — гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека . Это одна из двух основных ветвей старой и наследственной гаплогруппы DE , другой основной ветвью является гаплогруппа D. Клада E-M96 делится на два основных субклада : более распространенный E-P147 и менее распространенный E-M75 .
Происхождение
[ редактировать ]Андерхилл (2001) предположил, что гаплогруппа E могла возникнуть в Восточной Африке . [10] Некоторые авторы, такие как Чандрасекар (2007), принимают более раннюю позицию Хаммера (1997) о том, что гаплогруппа E, возможно, возникла в Западной Азии . [11] при условии:
- E представляет собой кладу гаплогруппы DE , а другая основная клада, гаплогруппа D , распространена исключительно в Азии.
- DE — это клада внутри M168, а две другие основные клады, C и F, считаются уже имеющими евразийское происхождение.
Однако считается, что несколько открытий, сделанных после статей в Хаммере, делают азиатское происхождение менее вероятным:
- Андерхилл и Кивисилд (2007) продемонстрировали, что C и F имеют общего предка, а это означает, что DE имеет только одного брата или сестру, который не является африканцем. [12]
- DE* встречается как в Азии, так и в Африке, а это означает, что не только один, но и несколько братьев и сестер D встречаются в Азии и Африке.
- Карафет (2008), соавтором которого является Хаммер, значительно изменил оценки времени, что привело к «новым интерпретациям географического происхождения древних субкладов». [13] Среди прочего, в этой статье предложен гораздо более древний возраст гаплогруппы E-M96, чем считалось ранее, что придает ей возраст, аналогичный гаплогруппе D и самой DE, а это означает, что больше нет веских причин рассматривать ее как ответвление DE, что, должно быть, произошло намного позже того, как DE возникла и проникла в Азию. [13]
Коль и др. (2009) предположили западноафриканское происхождение гаплогруппы E, заявив: «Из 20 основных гаплогрупп в дереве гаплогрупп Y-хромосомы только 5 были обнаружены в проанализированной амхарской популяции в Эфиопии. Гаплогруппа A находится недалеко от корней дерева и встречается только среди мужчин на африканском континенте. Основной обнаруженной гаплогруппой была E. Гаплогруппа E возникла в Западной Африке . Из-за иммиграции гаплогруппа A , которая первоначально доминировала в Эфиопии , была частично заменена. [7]
В 2015 году Позник и Андерхилл и др. утверждал, что гаплогруппа E возникла за пределами Африки, утверждая, что «эта модель географической сегрегации внутри клады CT требует только одного континентального обмена гаплогруппами (E в Африку), а не трех (D, C и F из Африки). это предполагаемое возвращение в Африку между появлением гаплогруппы E и ее дифференциацией внутри Африки на 58 тыс. лет назад согласуется с предположениями, основанными на данных не-Y-хромосомы, об обильном потоке генов между Африкой и Аравией на протяжении 50–80 тыс. лет назад». [8]
В 2015 году Тробетта и др. предположил восточноафриканское происхождение гаплогруппы E, заявив: «наш филогеографический анализ, основанный на тысячах образцов по всему миру, предполагает, что излучение гаплогруппы E началось около 58 тыс. лет назад, где-то в Африке к югу от Сахары, с более высокой апостериорной вероятностью (0,73). за восточноафриканское происхождение». [6]
Кабрера и др. (2018) выдвигает гипотезу о евразийском центре происхождения и распространения гаплогруппы E на основании одинакового возраста родительской гаплогруппы DE клады и гаплогруппы L3 мтДНК . Согласно этой гипотезе, после первоначальной миграции из Африки ранних анатомически современных людей около 125 тысяч лет назад гаплогруппа DE диверсифицировалась вокруг Гималаев и в Тибет или к западу от него , после чего мужчины, несущие E, предположительно, совершили обратную миграцию. от места происхождения отцовской гаплогруппы в Евразии около 70 тысяч лет назад вместе с женщинами, несущими материнскую гаплогруппу L3 , которая, как предполагает исследование, также возникла в Евразии, в Африку. Затем было высказано предположение, что эти новые евразийские линии в значительной степени заменили старые автохтонные мужские (такие как гаплогруппа B-M60 ) и женские африканские линии. [9]
Хабер и др. (2019) исследование предположило африканское происхождение гаплогруппы E на основе анализа филогенетической структуры Y-хромосомы, времени расхождения гаплогрупп и недавно обнаруженной гаплогруппы D0, обнаруженной у трех нигерийцев, дополнительной ветви линии DE, рано расходящейся от гаплогруппы D. Авторы поддерживают африканское происхождение гаплогруппы DE и иммиграцию гаплогрупп C , D и FT из Африки около 50 300–81 000 лн. Ранние даты расхождения, обнаруженные в исследовании для DE, E и D0 (все датированы примерно 71-76 тыс. лет назад), которые, как определено, предшествуют миграции из Африки предков евразийцев (датированы примерно 50-50 тыс. лет назад). 60 тыс. лет назад), авторы также считают, что они подтверждают африканское происхождение этих гаплогрупп. [3]
Древняя ДНК
[ редактировать ]Было обнаружено, что останки докерамического неолита B из Леванта несли гаплогруппу E (1/7; ~ 14%). [14]
В каменном убежище Ньяринди в Кении обитали два человека, датированные позднем каменным веком (3500 лет назад); один нес гаплогруппу L4b2a , а другой - гаплогруппу E (E-M96, E-P162). [15] [16]
В Киндоки, в Демократической Республике Конго , было три человека, датированные протоисторическим периодом (230 г. до н. э., 150 г. до н. э., 230 г. до н. э.); один нес гаплогруппы E1b1a1a1d1a2 (E-CTS99, E-CTS99) и L1c3a1b , другой нес гаплогруппу E (E-M96, E-PF1620), а последний нес гаплогруппы R1b1 (R-P25 1, R-M415) и L0a1b1a1 . [15] [16]
Распределение
[ редактировать ]Большинство представителей гаплогруппы Е-М96 относятся к Е1, тогда как гаплогруппа Е2-М75 встречается редко. Гаплогруппа E1a разделена на две основные ветви: E1a1 (E-M44), которая в основном встречается в Европе , Западной Азии и среди евреев-ашкенази ; и E1a2 (E-Z958), который был идентифицирован исключительно в странах Африки к югу от Сахары . [17] Гаплогруппа E-M2 является наиболее распространенным субкладом E в Африке к югу от Сахары и тесно связана с распространением носителей банту .
E-M215 встречается с высокой частотой в Северной Африке , Западной Азии , Восточной Африке и Европе . E-M215 наиболее распространен среди говорящих на афро-азиатском языке на Ближнем Востоке , в Северной Африке и на Африканском Роге , а также встречается среди некоторых говорящих на нило-сахарском и нигерско-конголезском языках в Северо-Восточной Африке и Судане . E-M215 гораздо менее распространен в Западной, Центральной и Южной Африке, хотя он наблюдался среди некоторых койсанского языка. носителей [18] и среди говорящих на Нигере и Конго в Сенегамбии , [19] Гвинея-Бисау , [20] Буркина-Фасо , [21] Гана , Габон , [22] Демократическая Республика Конго , Руанда , [23] Намибия и Южная Африка .
Субклады
[ редактировать ]Э-М96*
[ редактировать ]Парагруппа E-M96* относится к линиям, принадлежащим к кладе E, но которые не могут быть отнесены к какой-либо известной ветви. E(xE1-P147, E2-M75) - то есть E, который дал отрицательный результат как на P147, так и на M75 - был зарегистрирован у 3 мужчин из Ливана . [24] 2 амхара из Эфиопии , [25] 2 мужчины из Сирии , [26] 2 мужчины из Саудовской Аравии , [27] и у одного мужчины, говорящего на языке банту, из Южной Африки . [13] E(xE1a-M33, E1b1-P2, E2-M75) был зарегистрирован среди нескольких популяций Южной Африки и у египтянина; [28] E(xE1a-M33, E1b1a1-M2, E1b1b-M215, E2-M75) также наблюдался среди пигмеев и банту из Камеруна и Габона ; [22] а также в Буркина-Фасо [29] и мужчина фульбе из Нигера . [30]
Недавно было обнаружено, что 3 восточноафриканских мужчины, ранее классифицированные только как E*-M96, могут быть отнесены к новой ветви E-V44, которая является дочерней ветвью E1-P147; E-P147 и E-V44 имеют общую мутацию V3725, что делает E2-M75 и E-V3725 двумя известными первичными ветвями E. [31] Два из Саудовской Аравии частных тестировщика из Мекки и Джизана также оказались принадлежащими к этой неуловимой и редкой ветви. [32] Неизвестно, попадут ли некоторые (или все) другие E*(xE1,E2) в предыдущих исследованиях также в V44.
E-P147
[ редактировать ]E-P147 (также известный как E1) на сегодняшний день является самой многочисленной и широко распространенной ветвью E-M96. Он имеет две основные ветви: E-M132 (E1a) и E-P177 (E1b). Гаплогруппа E1a разделена на две ветви: E1a1 (E-M44), которая в основном встречается в Европе , Западной Азии и среди евреев-ашкенази ; и E1a2 (E-Z958), который был идентифицирован исключительно в странах Африки к югу от Сахары . [33]
Гаплогруппа E-P2 (E1b1) является наиболее частым вариантом E-M96 и наиболее распространенной линией Y-ДНК в Африке с двумя основными потомками: E-V38 (E1b1a) и E-M215 (E1b1b). Гаплогруппа E (xE3b,E3a) - то есть E дал отрицательный результат как для M35, так и для M2, была обнаружена у 11 мужчин из Марокко в Zalloua et al. (2008б). [34]
Гаплогруппа E-V38 является предком E-M2 (E1b1a1), который является наиболее распространенным субкладом E во всей Африке к югу от Сахары и тесно связан с распространением носителей банту по всей Центральной и Южной Африке. Другой потомок E-V38, E-M329 (E1b1a2), наблюдался у эфиопского охотника-собирателя с 4200 лн и в основном встречается у мужчин с Африканского Рога и Аравийского полуострова . [35]
С другой стороны, гаплогруппа E-M215 (E1b1b) с высокой частотой распространена по всей Северной Африке , Западной Азии , Восточной Африке и Европе . Гаплогруппа E-Z827 была обнаружена в натуфийских образцах (E-Z830+), датированных 10 000 лн из Палестины , и обычно встречается в Западной Азии , Северной Африке , Европе и Эфиопии . Гаплогруппа E-V68 также часто наблюдается в Северной Африке и Западной Азии и была обнаружена в останках иберомавров, датируемых 15 000 лн из Марокко , при этом ее плодовитый потомок E-V32 доминировал в мужских линиях на Африканском Роге .
Э-М75
[ редактировать ]E-M75 (также известный как E2) присутствует по всей субэкваториальной Африке, особенно в Великих африканских озерах и Центральной Африке . Самая высокая концентрация гаплогруппы обнаружена среди алур (66,67%), [28] Юг (38,89%), [28] Римайбе (27,03%), [21] Коза (25,00%), [21] Назад (22,22%), [21] Эвия (20,83%), [22] Зулу (20,69%), [28] и кенийские банту (17,24%). [23]
Гаплогруппа E-M75(xM41,M54) обнаружена у 6% (1/18) дама из Намибии. [28] 4% (1/26) Ганда из Уганды, [28] 3% (1/39) мандинки из Гамбии/Сенегала, [28] и 2% (1/49) Сены из Мозамбика. [28]
Частное коммерческое тестирование ДНК в «Семейном древе» ДНК выявило множество мужчин E-M75, происходящих с Аравийского полуострова ( Саудовская Аравия , Бахрейн , Кувейт , Йемен и Объединенные Арабские Эмираты ), а также среди евреев-ашкенази . [36] E-M75 также был идентифицирован у ливанского мужчины. [37]
Филогенетика
[ редактировать ]Филогенетическая история
[ редактировать ]До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
YCC 2002/2008 (сокращенно) | (а) | (б) | (с) | (г) | (е) | (г) | (или) | YCC 2002 (от руки) | YCC 2005 (от руки) | YCC 2008 (от руки) | YCC 2010r (от руки) | ИСОГГ 2006 г. | ИСОГГ 2007 | ИСОГГ 2008 | ИСОГГ 2009 | ИСОГГ 2010 | ИЗОГГ 2011 | ИЗОГГ 2012 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
E-P29 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | И* | И | И | И | И | И | И | И | И | И | И |
Э-М33 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е1* | Е1 | Е1а | Е1а | Е1 | Е1 | Е1а | Е1а | Е1а | Е1а | Е1а |
Э-М44 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е1а | Е1а | Е1а1 | Е1а1 | Е1а | Е1а | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 |
Э-М75 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е2а | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 |
Э-М54 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е2б | Е2б | Е2б | E2b1 | - | - | - | - | - | - | - |
Е-П2 | 25 | III | 4 | 14 | Еу3 | Н2 | Б | Е3* | Е3 | Е1б | E1b1 | Е3 | Е3 | E1b1 | E1b1 | E1b1 | E1b1 | E1b1 |
Э-М2 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а* | Е3а | E1b1 | E1b1a | Е3а | Е3а | E1b1a | E1b1a | E1b1a | E1b1a1 | E1b1a1 |
Э-М58 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а1 | Е3а1 | E1b1a1 | E1b1a1 | Е3а1 | Е3а1 | E1b1a1 | E1b1a1 | E1b1a1 | E1b1a1a1a | E1b1a1a1a |
Э-М116.2 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | E3a2 | E3a2 | E1b1a2 | E1b1a2 | E3a2 | E3a2 | E1b1a2 | E1b1a2 | E1ba12 | удаленный | удаленный |
Э-М149 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а3 | Е3а3 | E1b1a3 | E1b1a3 | Е3а3 | Е3а3 | E1b1a3 | E1b1a3 | E1b1a3 | E1b1a1a1c | E1b1a1a1c |
Э-М154 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а4 | Е3а4 | E1b1a4 | E1b1a4 | Е3а4 | Е3а4 | E1b1a4 | E1b1a4 | E1b1a4 | E1b1a1a1g1c | E1b1a1a1g1c |
Э-М155 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а5 | Е3а5 | E1b1a5 | E1b1a5 | Е3а5 | Е3а5 | E1b1a5 | E1b1a5 | E1b1a5 | E1b1a1a1d | E1b1a1a1d |
Э-М10 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а6 | Е3а6 | E1b1a6 | E1b1a6 | Е3а6 | Е3а6 | E1b1a6 | E1b1a6 | E1b1a6 | E1b1a1a1e | E1b1a1a1e |
Э-М35 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b* | E3b | E1b1b1 | E1b1b1 | E3b1 | E3b1 | E1b1b1 | E1b1b1 | E1b1b1 | удаленный | удаленный |
Э-М78 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b1* | E3b1 | E1b1b1a | E1b1b1a1 | E3b1a | E3b1a | E1b1b1a | E1b1b1a | E1b1b1a | E1b1b1a1 | E1b1b1a1 |
Э-М148 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b1a | E3b1a | E1b1b1a3a | E1b1b1a1c1 | E3b1a3a | E3b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a1c1 | E1b1b1a1c1 |
Э-М81 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2* | E3b2 | E1b1b1b | E1b1b1b1 | E3b1b | E3b1b | E1b1b1b | E1b1b1b | E1b1b1b | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a |
Э-М107 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2a | E3b2a | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a | E3b1b1 | E3b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a | E1b1b1b1a1 |
Э-М165 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2b | E3b2b | E1b1b1b2 | E1b1b1b1b1 | E3b1b2 | E3b1b2 | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b1a2a |
Э-М123 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b3* | E3b3 | E1b1b1c | E1b1b1c | E3b1c | E3b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1b2a |
Э-М34 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b3a* | E3b3a | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E3b1c1 | E3b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1b2a1 |
Э-М136 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b3a1 | E3b3a1 | E1b1b1c1a | E1b1b1c1a1 | E3b1c1a | E3b1c1a | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1b2a1a1 |
Научные публикации
[ редактировать ]Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.
Филогенетические деревья
[ редактировать ]Это филогенетическое древо субкладов гаплогрупп основано на дереве Консорциума Y-хромосом (YCC), [38] дерево гаплогрупп ISOGG Y-ДНК, [39] и последующие опубликованные исследования.
Е ( М96 ) | |
См. также
[ редактировать ]Генетика
[ редактировать ]- Африканская примесь в Европе
- Генетическая генеалогия
- Гаплогруппа D
- Гаплогруппа DE
- Гаплогруппа
- Гаплотип
- Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
- Молекулярная филогенетика
- Парагруппа
- Субклад
- Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
- Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
- Гаплогруппы Y-ДНК в населении стран Африки к югу от Сахары
Y-ДНК и субклады
[ редактировать ]- Гаплогруппа E-L485
- Гаплогруппа E-M123
- Гаплогруппа E-M180
- Гаплогруппа E-M215
- Гаплогруппа E-M33
- Гаплогруппа E-M521
- Гаплогруппа E-M75
- Гаплогруппа E-M96
- Гаплогруппа E-P147
- Гаплогруппа E-P177
- Гаплогруппа E-P2
- Гаплогруппа E-V12
- Гаплогруппа E-V13
- Гаплогруппа E-V22
- Гаплогруппа E-V38
- Гаплогруппа E-M2
- Гаплогруппа E-V65
- Гаплогруппа E-V68
- Гаплогруппа E-Z820
- Гаплогруппа E-Z827
Основополагающее дерево Y-ДНК
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б "Е YTree" .
- ^ Камин М., Сааг Л., Винсенте М. и др. (апрель 2015 г.). «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосом совпало с глобальными изменениями в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. дои : 10.1101/гр.186684.114 . ПМЦ 4381518 . ПМИД 25770088 .
- ^ Перейти обратно: а б с Хабер М., Джонс А.Л., Коннел Б.А., Асан, Арсьеро Э., Хуанмин Ю., Томас М.Г., Сюэ Ю., Тайлер-Смит С. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее значение для расселения современного человека за пределы Африки» . Генетика . 212 (4): 1421–1428. дои : 10.1534/genetics.119.302368 . ПМК 6707464 . ПМИД 31196864 .
- ^ Семино, Орнелла; Магри, Кьяра; Бенуцци, Джорджия; Лин, Алиса А.; Аль-Захери, Надя; Батталья, Винченца; Макчиони, Лилиана; Триантафиллидис, Костас; и др. (2004). «Происхождение, распространение и дифференциация гаплогрупп E и J Y-хромосомы: выводы о неолитизации Европы и более поздних миграционных событиях в Средиземноморье» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1023–34. дои : 10.1086/386295 . ПМК 1181965 . ПМИД 15069642 .
- ^ Кьярони, Дж.; Андерхилл, Пенсильвания; Кавалли-Сфорца, LL (2009). «Разнообразие Y-хромосомы, человеческая экспансия, дрейф и культурная эволюция» . Труды Национальной академии наук . 106 (48): 20174–9. Бибкод : 2009PNAS..10620174C . дои : 10.1073/pnas.0910803106 . ПМЦ 2787129 . ПМИД 19920170 .
- ^ Перейти обратно: а б Тромбетта и др. 2015, Филогеографическое уточнение и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E Y-хромосомы человека дают новое представление о расселении первых скотоводов на африканском континенте.
- ^ Перейти обратно: а б Коль, М.; и др. (13 ноября 2009 г.). «Распределение Y-хромосомных SNP-гаплогрупп между мужчинами из Эфиопии» . Forensic Science International: Серия дополнений по генетике . 2 (1): С435-436. дои : 10.1016/j.fsigss.2009.08.051 . ISSN 1875-1768 . OCLC 4934346091 . S2CID 85094284 .
- ^ Перейти обратно: а б Позник, Г. Дэвид; и др. (2016). «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру» . Природная генетика . 48 (6): 593–599. дои : 10.1038/ng.3559 . ПМЦ 4884158 . ПМИД 27111036 .
- ^ Перейти обратно: а б Кабрера, Висенте; Марреро, Патрисия; Абу-Амеро, Халед; Ларруга, Хосе (2019). «Носители базальных линий макрогаплогруппы L3 митохондриальной ДНК мигрировали обратно в Африку из Азии около 70 000 лет назад» . Эволюционная биология BMC . 18 (98): 98. дои : 10.1186/s12862-018-1211-4 . ПМК 6009813 . ПМИД 29921229 .
- ^ Андерхилл, Пенсильвания; Пассарино, Г.; Лин, А.А.; Шен, П.; Миразон Лар, М.; Фоли, РА; Оефнер, П.Дж.; Кавалли-Сфорца, LL (2001). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций» . Анналы генетики человека . 65 (Часть 1): 43–62. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . ПМИД 11415522 . S2CID 9441236 .
- ^ Чандрасекар; Сахеб, Ю.Ю.; Гангопадьяя, П.; Гангопадьяйя, С.; Мукерджи, А.; Басу, Д.; Лакшми, Греция; Сахани, АК; Дас, Б.; Баттачарья, С.; Кумар, С.; Ксавьер, Д.; Сан, Д.; Рао, В.Р.; и др. (сентябрь – октябрь 2007 г.). «Подпись вставки YAP в Южной Азии». Анналы биологии человека . 34 (5): 582–6. дои : 10.1080/03014460701556262 . ПМИД 17786594 . S2CID 11860142 .
- ^ Андерхилл, Питер А.; Кивисилд, Тоомас (2007). «Использование структуры популяции Y-хромосомы и митохондриальной ДНК для отслеживания миграций человека». Ежегодный обзор генетики . 41 : 539–64. дои : 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407 . ПМИД 18076332 .
- ^ Перейти обратно: а б с Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
- ^ Мартиниано, Руи; Санктис, Бьянка Де; Халласт, Таблетки; Дурбин, Ричард (20 декабря 2020 г.). «Дополнительный материал: размещение древних последовательностей ДНК в эталонных филогениях» . Молекулярная биология и эволюция . 39 (2):2020.12.19.423614. bioRxiv 10.1101/2020.12.19.423614 . дои : 10.1093/molbev/msac017 . ПМЦ 8857924 . ПМИД 35084493 . S2CID 229549849 .
- ^ Перейти обратно: а б Ван, Кэ; и др. (2020). «Древние геномы раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары» . Достижения науки . 6 (24): eaaz0183. Бибкод : 2020SciA....6..183W . дои : 10.1126/sciadv.aaz0183 . ISSN 2375-2548 . OCLC 8616876709 . ПМЦ 7292641 . ПМИД 32582847 . S2CID 219604401 .
- ^ Перейти обратно: а б Ван, Кэ; и др. (2020). «Дополнительные материалы по древним геномам раскрывают сложные закономерности перемещения, взаимодействия и замещения населения в странах Африки к югу от Сахары» (PDF) . Достижения науки . 6 (24): eaaz0183. Бибкод : 2020SciA....6..183W . дои : 10.1126/sciadv.aaz0183 . ISSN 2375-2548 . OCLC 8616876709 . ПМЦ 7292641 . ПМИД 32582847 . S2CID 219604401 .
- ^ E1a-M132 (Yполный)
- ^ Кручиани, Фульвио; Ла Фратта, Роберта; Сантоламазца, Пьеро; Селитто, Даниэле; Пасконе, Роберто; Мораль, Педро; Уотсон, Элизабет; Гид Валентина; и др. (2004). «Филогеографический анализ Y-хромосом гаплогруппы E3b (E-M215) выявляет множественные миграционные события внутри Африки и из нее» . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 1014–22. дои : 10.1086/386294 . ПМК 1181964 . ПМИД 15042509 .
- ^ Вуд, Элизабет Т; Стовер, Дарин А; Эрет, Кристофер; Дестро-Бисоль, Джованни; Спедини, Габриэлла; Маклеод, Ховард; Луи, Лесли; Бамшад, Майк; и др. (2005). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: доказательства демографических процессов с учетом пола» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–76. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . ПМИД 15856073 . (см. Приложение A: Частоты гаплотипов Y-хромосомы)
- ^ Роза, Александра; Орнелас, Каролина; Джоблинг, Марк А; Брем, Антониу; Виллемс, Ричард (2007). «Y-хромосомное разнообразие населения Гвинеи-Бисау: многоэтническая перспектива» . Эволюционная биология BMC . 7 : 124. дои : 10.1186/1471-2148-7-124 . ЧВК 1976131 . ПМИД 17662131 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Кручиани, Фульвио; Сантоламазца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олкерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; и др. (2002). «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением» . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1197–214. дои : 10.1086/340257 . ПМЦ 447595 . ПМИД 11910562 .
- ^ Перейти обратно: а б с Берниэль-Ли, Г.; Калафель, Ф.; Бош, Э.; Хейер, Э.; Сика, Л.; Мугиама-Дауда, П.; Ван дер Вин, Л.; Омберт, Ж.-М.; и др. (2009). «Генетические и демографические последствия экспансии банту: данные по отцовским линиям человека» . Молекулярная биология и эволюция . 26 (7): 1581–9. дои : 10.1093/molbev/msp069 . ПМИД 19369595 .
- ^ Перейти обратно: а б Луис, Дж; Роуолд, Д; Регейро, М; Каейро, Б; Чинниоглу, К; Роузман, К; Андерхилл, П; Каваллисфорса, Л; Эррера, Р. (2004). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей» . Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–44. дои : 10.1086/382286 . ПМЦ 1182266 . ПМИД 14973781 .
- ^ Заллуа, Пьер (2008). «Y-хромосомное разнообразие в Ливане структурировано недавними историческими событиями» . Ам Джей Хум Жене . 82 (4): 873–882. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.01.020 . ПМЦ 2427286 . ПМИД 18374297 .
- ^ Абу-Амеро, Халед К.; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А. (2011). «Вариации Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и идентификационных меток в Эфиопии» . UCL Дискавери . 10:59 . дои : 10.1186/1471-2156-10-59 . ПМК 2759955 . ПМИД 19772609 .
- ^ Заллуа, Пьер (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье» . Ам Джей Хум Жене . 83 (5): 633–642. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.10.012 . ПМК 2668035 . ПМИД 18976729 .
- ^ Абу-Амеро, Халед К.; Хеллани, Али; Гонсалес, Ана М; Ларруга, Хосе М; Кабрера, Висенте М; Андерхилл, Питер А. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы Саудовской Аравии и его связь с близлежащими регионами» . БМК Генетика . 10:59 . дои : 10.1186/1471-2156-10-59 . ПМК 2759955 . ПМИД 19772609 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час Вуд (2005). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с учетом пола» . Eur J Hum Genet . 13 (7): 867–76. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . ПМИД 15856073 .
- ^ де Филиппо (2011). «Y-хромосомная вариация в Африке к югу от Сахары: взгляд на историю групп Нигера и Конго» . Мол Биол Эвол . 28 (3): 1255–1269. дои : 10.1093/molbev/msq312 . ПМЦ 3561512 . ПМИД 21109585 .
- ^ Бучкова (2013). «Множественный и дифференцированный вклад в мужской генофонд скотоводческого и фермерского населения африканского Сахеля». Am J Phys Anthropol . 151 (1): 10–21. дои : 10.1002/ajpa.22236 . ПМИД 23460272 .
- ^ Тромбетта (2015). «Филогеографическое уточнение и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E Y-хромосомы человека дают новое представление о расселении ранних скотоводов на африканском континенте» . Геном Биол Эвол . 7 (7): 1940–50. дои : 10.1093/gbe/evv118 . ПМЦ 4524485 . ПМИД 26108492 .
- ^ E-FTA45776
- ^ E1a-M132
- ^ Заллуа, Пьер (2008). «Выявление генетических следов исторической экспансии: финикийские следы в Средиземноморье» . Ам Джей Хум Жене . 83 (5): 633–642. дои : 10.1016/j.ajhg.2008.10.012 . ПМК 2668035 . ПМИД 18976729 .
- ^ E-M329
- ^ Публичное гаплодерево генеалогического древа ДНК, гаплогруппа E-M75
- ^ Платт, Д.Э., Артиниан, Х., Музайя, Ф. и др. Аутосомная генетика и гаплогруппа Y-хромосомы L1b-M317 показывают, что марониты Горного Ливана являются постоянно неэмигрирующей популяцией . Eur J Hum Genet 29 , 581–592 (2021). 10.1038/s41431-020-00765-х
- ^ Кран, Томас. «Дерево YCC» . Хьюстон, Техас: FTDNA. Архивировано из оригинала 26 июля 2011 года . Проверено 16 мая 2011 г.
- ^ Международное общество генетической генеалогии. «Дерево гаплогрупп Y-ДНК» . Проверено 20 декабря 2012 г.
Источники таблиц преобразования
[ редактировать ]- Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и др. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891 .
- Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360 .
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
- Каладжиева, Люба; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у Vlax Roma, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД 11313742 . S2CID 21432405 .
- Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы» . Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299 . ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588 .
- Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494. 1155 , ПМИД 11073453
- Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Y-хромосома свидетельствует о миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926 .
- Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685 . ПМИД 11062480 . S2CID 12893406 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Арреди, Б; Полони, Э; Параккини, С; Зержал, Т; Фаталлах, Д; Макрелуф, М; Паскали, В; Новеллетто, А; Тайлерсмит, К. (2004). «Преимущественно неолитическое происхождение вариаций ДНК Y-хромосомы в Северной Африке» . Американский журнал генетики человека . 75 (2): 338–45. дои : 10.1086/423147 . ПМК 1216069 . ПМИД 15202071 .
- Кручиани, Фульвио; Сантоламазца, Пьеро; Шен, Пейдун; Маколей, Винсент; Мораль, Педро; Олкерс, Антонель; Модиано, Дэвид; Холмс, Сьюзен; и др. (2002). «Обратная миграция из Азии в страны Африки к югу от Сахары подтверждается анализом гаплотипов Y-хромосомы человека с высоким разрешением» . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1197–214. дои : 10.1086/340257 . ПМЦ 447595 . ПМИД 11910562 .
- Кручиани, Ф; Ла Фратта, Р.; Тромбетта, Б; Сантоламазца, П; Селитто, Д; Коломб, Э.Б.; Дюгужон, Ж.М.; Кривелларо, Ф; и др. (2007). «Отслеживание прошлых человеческих перемещений мужчин в Северной / Восточной Африке и Западной Евразии: новые подсказки по гаплогруппам Y-хромосомы E-M78 и J-M12» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (6): 1300–11. дои : 10.1093/molbev/msm049 . ПМИД 17351267 . См. также Дополнительные данные .
- Хаммер, МФ; Блэкмер, Ф; Гарриган, Д; Нахман, М.В.; Уайлдер, Дж. А. (2003). «Структура человеческой популяции и ее влияние на выборку вариаций последовательности Y-хромосомы» . Генетика . 164 (4): 1495–1509. дои : 10.1093/генетика/164.4.1495 . ПМЦ 1462677 . ПМИД 12930755 .
- Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 . . Опубликовано в Интернете 2 апреля 2008 г. См. также дополнительные материалы.
- Санчес, Джей-Джей; Халленберг, К; Бёрстинг, К; Эрнандес, А; Морлинг, Н. (2005). «Высокая частота линий Y-хромосомы, характеризующихся E3b1, DYS19-11, DYS392-12 у сомалийских мужчин» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 856–866. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201390 . ПМИД 15756297 . . Опубликовано в Интернете 9 марта 2005 г.
- Тромбетта (2015). «Филогеографическое уточнение и крупномасштабное генотипирование гаплогруппы E Y-хромосомы человека дают новое представление о расселении ранних скотоводов на африканском континенте» . Геномная биология и эволюция . 7 (7): 1940–1950. дои : 10.1093/gbe/evv118 . ПМЦ 4524485 . ПМИД 26108492 .
- Вуд ET (2005). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с учетом пола» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . ПМИД 15856073 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Филогенетическое дерево и карты распространения гаплогруппы E Y-ДНК
[ редактировать ]- Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады по данным ISOGG 2008.
- Карта распространения E1b1b1 в Европе
- Распространение E1b1a/E3a в Африке
- Частотное распределение гаплогруппы E Y-ДНК и ее субкладов - с видеоуроком