РРМ2Б

РРМ2Б
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2VUX, 3HF1, 4DJN
Идентификаторы
Псевдонимы	RRM2B , MTDPS8A, MTDPS8B, P53R2, индуцируемая субъединица M2B, регуляторная рибонуклеотидредуктазой TP53, RCDFRD
Внешние идентификаторы	Опустить : 604712 ; МГИ : 2155865 ; Гомологен : 56723 ; GeneCards : RRM2B ; ОМА : RRM2B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	102,238,961 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	37,961,562 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; deltoid muscle; ; islet of Langerhans; ; quadriceps femoris muscle; ; vastus lateralis muscle; ; germinal epithelium; ; tibialis anterior muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; palpebral conjunctiva; ; pars reticulata;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; Rostral migratory stream; ; sciatic nerve; ; cingulate gyrus; ; substantia nigra; ; habenula; ; iris;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; protein binding; oxidoreductase activity; ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor;
Cellular component	mitochondrion; nucleus; nucleoplasm; cytoplasm; cytosol; ribonucleoside-diphosphate reductase complex;
Biological process	deoxyribonucleoside triphosphate metabolic process; renal system process; kidney development; response to oxidative stress; mitochondrial DNA replication; cellular response to DNA damage stimulus; deoxyribonucleotide biosynthetic process; DNA replication; negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; response to amine; DNA repair; nucleobase-containing small molecule interconversion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	50484
	382985
	ENSG00000048392
	ENSMUSG00000022292
	Q7LG56
	Q6PEE3
	НМ_015713 ; НМ_001172477 ; НМ_001172478
	НМ_199476 ; НМ_001357022 ; НМ_001357023
	НП_001165948 ; НП_001165949 ; НП_056528
	НП_955770 ; НП_001343951 ; НП_001343952
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица рибонуклеотид-дифосфатредуктазы M2 B представляет собой фермент , который у человека кодируется RRM2B геном . ^[5]^[6]^[7]^[8] Ген, кодирующий белок RRM2B, расположен на хромосоме 8 , в положении 8q23.1. Ген и его продукты также известны под обозначениями MTDPS8A, MTDPS8B и p53R2.

Функция

RRM2B кодирует одну из двух версий субъединицы R2 рибонуклеотидредуктазы , которая генерирует предшественники нуклеотидов, необходимые для репликации ДНК, путем восстановления до рибонуклеозиддифосфатов дезоксирибонуклеозиддифосфатов. Версия R2, кодируемая RRM2B, индуцируется р53 и необходима для нормальной репарации ДНК и синтеза мтДНК в непролиферирующих клетках. Другая форма R2 экспрессируется только в делящихся клетках. ^[9]

Взаимодействия

Было показано, что RRM2B взаимодействует с Mdm2. ^[10] и атаксия телеангиэктазия мутировали . ^[10]

Клиническая значимость

Нарушения в этом гене являются одной из причин синдрома истощения митохондриальной ДНК (MDDS). ^[11]^[12] Неонатальная гипотония , задержка развития , энцефалопатия с судорогами , глухота и лактоацидоз были связаны с мутациями в этом гене. MDDS приводит к летальному исходу: смерть наступает от дыхательной недостаточности в раннем детстве. ^[13]^[14]

Это было связано с некоторыми случаями острой печеночной недостаточности у детей . ^[15]

Было показано, что мутации в этом гене вызывают прогрессирующую внешнюю офтальмоплегию . ^[16]

Повышенная экспрессия RRM2B коррелирует с резистентностью к гемцитабину в клетках холангиокарциномы человека. ^[17] и может быть предиктором отсутствия клинической пользы от гемцитабина при раке человека.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000048392 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022292 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Танака Х., Аракава Х., Ямагути Т., Сираиси К., Фукуда С., Мацуи К., Такей Ю., Накамура Ю. (март 2000 г.). «Ген рибонуклеотидредуктазы, участвующий в p53-зависимой контрольной точке клеточного цикла на предмет повреждения ДНК». Природа . 404 (6773): 42–9. Бибкод : 2000Natur.404...42T . дои : 10.1038/35003506 . ПМИД 10716435 . S2CID 4327888 .
^ Накано К., Балинт Э., Эшкрофт М., Вусден К.Х. (август 2000 г.). «Ген рибонуклеотидредуктазы является мишенью транскрипции р53 и р73» . Онкоген . 19 (37): 4283–9. дои : 10.1038/sj.onc.1203774 . ПМИД 10980602 .
^ Бурдон А., Минай Л., Серр В., Жайс Дж.П., Сарзи Э., Обер С., Кретьен Д., де Лонле П., Пакис-Флаклингер В., Аракава Х., Накамура Ю., Мюнних А., Рётиг А. (июнь 2007 г.). «Мутация RRM2B, кодирующего p53-контролируемую рибонуклеотидредуктазу (p53R2), вызывает серьезное истощение митохондриальной ДНК». Природная генетика . 39 (6): 776–80. дои : 10.1038/ng2040 . ПМИД 17486094 . S2CID 22103978 .
^ «Ген Энтрез: рибонуклеотидредуктаза RRM2B M2 B (индуцируемая TP53)» .
^ Коупленд ЧМ (2012). «Дефекты репликации митохондриальной ДНК и болезни человека» . Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 47 (1): 64–74. дои : 10.3109/10409238.2011.632763 . ПМК 3244805 . ПМИД 22176657 .
^ Jump up to: ^а ^б Чанг Л., Чжоу Б., Ху С., Го Р., Лю Х, Джонс С.Н., Йен Ю (ноябрь 2008 г.). «АТМ-опосредованное фосфорилирование серина 72 стабилизирует белок малой субъединицы рибонуклеотидредуктазы p53R2 против MDM2 и повреждения ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (47): 18519–24. Бибкод : 2008PNAS..10518519C . дои : 10.1073/pnas.0803313105 . ПМЦ 2587585 . ПМИД 19015526 .
^ Горман Г.С., Тейлор Р.В. (17 апреля 2014 г.). «Митохондриальные заболевания, связанные с RRM2B» . Джин Обзоры . Вашингтонский университет, Сиэтл. ПМИД 24741716 .
^ «Синдром истощения митохондриальной ДНК, связанный с RRM2B, энцефаломиопатическая форма с почечной тубулопатией» . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 13 июля 2017 г. .
^ Ахам-Рошиц Б., Плечко Б., Линдбихлер Ф., Биттнер Р., Маше С.Дж., Сперл В., Майр Дж.А. (ноябрь 2009 г.). «Новая мутация гена RRM2B у младенца с ранней фатальной энцефаломиопатией, центральной гипомиелинизацией и тубулопатией». Молекулярная генетика и обмен веществ . 98 (3): 300–4. дои : 10.1016/j.ymgme.2009.06.012 . ПМИД 19616983 .
^ Кропач Н., Шкалим-Земер В., Оренштейн Н., Шойерман О., Штраусберг Р. (май 2017 г.). «Новая мутация RRM2B и серьезное истощение митохондриальной ДНК: отчет о двух случаях и обзор литературы». Нейропедиатрия . 48 (6): 456–462. дои : 10.1055/s-0037-1601867 . ПМИД 28482374 . S2CID 7809119 .
^ Валенсия, Калифорния, Ван X, Ван Дж, Питерс А, Симмонс-младший, Моран MC, Матур А, Хусами А, Цянь Ю, Шеридан Р, Бове К.Е., Витте Д, Хуанг Т, Митке А.Г. (2016). «Глубокое секвенирование выявляет новые генетические варианты у детей с острой печеночной недостаточностью и тканевые доказательства нарушения энергетического метаболизма» . ПЛОС ОДИН . 11 (8): e0156738. Бибкод : 2016PLoSO..1156738V . дои : 10.1371/journal.pone.0156738 . ПМЦ 4970743 . ПМИД 27483465 .
^ Таката А., Като М., Накамура М., Ёсикава Т., Канба С., Сано А., Като Т. (сентябрь 2011 г.). «Секвенирование экзома идентифицирует новый миссенс-вариант RRM2B, связанный с аутосомно-рецессивной прогрессирующей наружной офтальмоплегией» . Геномная биология . 12 (9): Р92. дои : 10.1186/gb-2011-12-9-r92 . ПМК 3308055 . ПМИД 21951382 .
^ Сато Дж., Кимура Т., Сайто Т., Аназава Т., Кендзё А., Сато Ю., Цучия Т., Гото М. (сентябрь 2011 г.). «Анализ экспрессии генов для прогнозирования устойчивости к гемцитабину при холангиокарциноме человека». Журнал гепато-билиарно-панкреатических наук . 18 (5): 700–11. дои : 10.1007/s00534-011-0376-7 . ПМИД 21451941 . S2CID 19975519 .

Дальнейшее чтение

Гитте О, Хоканссон П, Воеводская Н, Фрид С, Греслунд А, Аракава Х, Накамура Ю, Теландер Л (ноябрь 2001 г.). «Белок p53R2 млекопитающих образует активную рибонуклеотидредуктазу in vitro с белком R1, которая экспрессируется как в покоящихся клетках в ответ на повреждение ДНК, так и в пролиферирующих клетках» . Журнал биологической химии . 276 (44): 40647–51. дои : 10.1074/jbc.M106088200 . ПМИД 11517226 .
Ямагути Т., Мацуда К., Сагия Ю., Ивадате М., Фуджино М.А., Накамура Ю., Аракава Х. (ноябрь 2001 г.). «p53R2-зависимый путь синтеза ДНК в контрольной точке клеточного цикла, регулируемой p53». Исследования рака . 61 (22): 8256–62. ПМИД 11719458 .
Янамото С., Кавасаки Г., Ёситоми И., Мизуно А. (февраль 2003 г.). «Экспрессия p53R2, новой мишени p53 в нормальном эпителии полости рта, эпителиальной дисплазии и плоскоклеточном раке». Письма о раке . 190 (2): 233–43. дои : 10.1016/S0304-3835(02)00588-8 . ПМИД 12565178 .
Сюэ Л, Чжоу Б, Лю Х, Цю В, Цзинь Цз, Йен Ю (март 2003 г.). «Р53 дикого типа регулирует рибонуклеотидредуктазу человека путем белок-белкового взаимодействия с p53R2, а также субъединицами hRRM2». Исследования рака . 63 (5): 980–6. ПМИД 12615712 .
Чжоу Б, Лю X, Мо X, Сюэ Л, Дарвиш Д, Цю В, Ши Дж, Хву ЭБ, Лу Ф, Йен Ю (октябрь 2003 г.). «Субъединица рибонуклеотидредуктазы человека hRRM2 дополняет p53R2 в ответ на УФ-индуцированную репарацию ДНК в клетках с мутантным p53». Исследования рака . 63 (20): 6583–94. ПМИД 14583450 .
Шао Дж., Чжоу Б., Чжу Л., Цю В., Юань Ю.К., Си Б., Йен Ю. (январь 2004 г.). «In vitro характеристика ферментативных свойств и ингибирование субъединицы p53R2 рибонуклеотидредуктазы человека» . Исследования рака . 64 (1): 1–6. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-03-3048 . ПМИД 14729598 .
Себальос Э., Муньос-Алонсо М.Дж., Бервангер Б., Акоста Х.К., Эрнандес Р., Краузе М., Хартманн О., Эйлерс М., Леон Дж. (июнь 2005 г.). «Ингибирующее действие c-Myc на апоптоз, индуцированный р53, в клетках лейкемии. Анализ микрочипов выявляет дефектную индукцию генов-мишеней р53 и активацию генов-шаперонов». Онкоген . 24 (28): 4559–71. дои : 10.1038/sj.onc.1208652 . ПМИД 15856024 . S2CID 21190604 .
Дэн З.Л., Се Д.В., Бостик Р.М., Мяо XJ, Гонг Ю.Л., Чжан Дж.Х., Варгович М.Дж. (сентябрь 2005 г.). «Новые генетические вариации гена p53R2 у пациентов с колоректальной аденомой и контрольной группы» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 11 (33): 5169–73. doi : 10.3748/wjg.v11.i33.5169 (неактивен 31 января 2024 г.). ПМК 4320390 . ПМИД 16127747 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка )
Оно К., Танака-Адзума Ю., Йонеда Ю., Ямада Т. (декабрь 2005 г.). «Тест-система генотоксичности, основанная на экспрессии гена p53R2 в клетках человека: исследование с использованием 80 химических веществ». Мутационные исследования . 588 (1): 47–57. doi : 10.1016/j.mrgentox.2005.09.002 . ПМИД 16236544 .
Цю В., Чжоу Б., Дарвиш Д., Шао Дж., Йен Ю. (февраль 2006 г.). «Характеристика ферментативных свойств голофермента рибонуклеотидредуктазы человека, восстановленного in vitro из субъединиц hRRM1, hRRM2 и p53R2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 340 (2): 428–34. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.12.019 . ПМИД 16376858 .
Окумура Х., Нацугоэ С., Ёкомакура Н., Кита Ю., Мацумото М., Утикадо Ю., Сетояма Т., Оваки Т., Исигами С., Айко Т. (июнь 2006 г.). «Экспрессия p53R2 связана с прогнозом у пациентов с плоскоклеточным раком пищевода». Клинические исследования рака . 12 (12): 3740–5. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2416 . ПМИД 16778101 . S2CID 15106205 .
Йен Ю, Чу Б, Йен С, Ши Дж, Чжоу Б (2007). «Анализ ферментативных свойств субъединицы p53R2 рибонуклеотидредуктазы человека». Достижения в регуляции ферментов . 46 : 235–47. дои : 10.1016/j.advenzreg.2006.01.016 . ПМИД 16846634 .
Лембо Д., Доналисио М., Корналья М., Аццимонти Б., Демуртас А., Ландольфо С. (декабрь 2006 г.). «Влияние онкобелков вируса папилломы человека высокого риска на экспрессию гена p53R2 после повреждения ДНК». Вирусные исследования . 122 (1–2): 189–93. doi : 10.1016/j.virusres.2006.06.011 . ПМИД 16872707 .
Ёкомакура Н., Нацугоэ С., Окумура Х., Икеда Р., Учикадо Ю., Матаки Ю., Такатори Х., Мацумото М., Оваки Т., Исигами С., Айко Т. (сентябрь 2007 г.). «Улучшение радиочувствительности с помощью небольшой интерферирующей РНК, нацеленной на p53R2 при плоскоклеточном раке пищевода» . Отчеты онкологии . 18 (3): 561–7. дои : 10.3892/или.18.3.561 . ПМИД 17671702 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000048392 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022292 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10716435-5] Танака Х., Аракава Х., Ямагути Т., Сираиси К., Фукуда С., Мацуи К., Такей Ю., Накамура Ю. (март 2000 г.). «Ген рибонуклеотидредуктазы, участвующий в p53-зависимой контрольной точке клеточного цикла на предмет повреждения ДНК». Природа . 404 (6773): 42–9. Бибкод : 2000Natur.404...42T . дои : 10.1038/35003506 . ПМИД 10716435 . S2CID 4327888 .

[pmid10980602-6] Накано К., Балинт Э., Эшкрофт М., Вусден К.Х. (август 2000 г.). «Ген рибонуклеотидредуктазы является мишенью транскрипции р53 и р73» . Онкоген . 19 (37): 4283–9. дои : 10.1038/sj.onc.1203774 . ПМИД 10980602 .

[pmid17486094-7] Бурдон А., Минай Л., Серр В., Жайс Дж.П., Сарзи Э., Обер С., Кретьен Д., де Лонле П., Пакис-Флаклингер В., Аракава Х., Накамура Ю., Мюнних А., Рётиг А. (июнь 2007 г.). «Мутация RRM2B, кодирующего p53-контролируемую рибонуклеотидредуктазу (p53R2), вызывает серьезное истощение митохондриальной ДНК». Природная генетика . 39 (6): 776–80. дои : 10.1038/ng2040 . ПМИД 17486094 . S2CID 22103978 .

[entrez-8] «Ген Энтрез: рибонуклеотидредуктаза RRM2B M2 B (индуцируемая TP53)» .

[9] Коупленд ЧМ (2012). «Дефекты репликации митохондриальной ДНК и болезни человека» . Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 47 (1): 64–74. дои : 10.3109/10409238.2011.632763 . ПМК 3244805 . ПМИД 22176657 .

[pmid19015526-10] Jump up to: ^а ^б Чанг Л., Чжоу Б., Ху С., Го Р., Лю Х, Джонс С.Н., Йен Ю (ноябрь 2008 г.). «АТМ-опосредованное фосфорилирование серина 72 стабилизирует белок малой субъединицы рибонуклеотидредуктазы p53R2 против MDM2 и повреждения ДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (47): 18519–24. Бибкод : 2008PNAS..10518519C . дои : 10.1073/pnas.0803313105 . ПМЦ 2587585 . ПМИД 19015526 .

[11] Горман Г.С., Тейлор Р.В. (17 апреля 2014 г.). «Митохондриальные заболевания, связанные с RRM2B» . Джин Обзоры . Вашингтонский университет, Сиэтл. ПМИД 24741716 .

[12] «Синдром истощения митохондриальной ДНК, связанный с RRM2B, энцефаломиопатическая форма с почечной тубулопатией» . Национальная медицинская библиотека США . Проверено 13 июля 2017 г. .

[13] Ахам-Рошиц Б., Плечко Б., Линдбихлер Ф., Биттнер Р., Маше С.Дж., Сперл В., Майр Дж.А. (ноябрь 2009 г.). «Новая мутация гена RRM2B у младенца с ранней фатальной энцефаломиопатией, центральной гипомиелинизацией и тубулопатией». Молекулярная генетика и обмен веществ . 98 (3): 300–4. дои : 10.1016/j.ymgme.2009.06.012 . ПМИД 19616983 .

[14] Кропач Н., Шкалим-Земер В., Оренштейн Н., Шойерман О., Штраусберг Р. (май 2017 г.). «Новая мутация RRM2B и серьезное истощение митохондриальной ДНК: отчет о двух случаях и обзор литературы». Нейропедиатрия . 48 (6): 456–462. дои : 10.1055/s-0037-1601867 . ПМИД 28482374 . S2CID 7809119 .

[15] Валенсия, Калифорния, Ван X, Ван Дж, Питерс А, Симмонс-младший, Моран MC, Матур А, Хусами А, Цянь Ю, Шеридан Р, Бове К.Е., Витте Д, Хуанг Т, Митке А.Г. (2016). «Глубокое секвенирование выявляет новые генетические варианты у детей с острой печеночной недостаточностью и тканевые доказательства нарушения энергетического метаболизма» . ПЛОС ОДИН . 11 (8): e0156738. Бибкод : 2016PLoSO..1156738V . дои : 10.1371/journal.pone.0156738 . ПМЦ 4970743 . ПМИД 27483465 .

[pmid21951382-16] Таката А., Като М., Накамура М., Ёсикава Т., Канба С., Сано А., Като Т. (сентябрь 2011 г.). «Секвенирование экзома идентифицирует новый миссенс-вариант RRM2B, связанный с аутосомно-рецессивной прогрессирующей наружной офтальмоплегией» . Геномная биология . 12 (9): Р92. дои : 10.1186/gb-2011-12-9-r92 . ПМК 3308055 . ПМИД 21951382 .

[pmid21451941-17] Сато Дж., Кимура Т., Сайто Т., Аназава Т., Кендзё А., Сато Ю., Цучия Т., Гото М. (сентябрь 2011 г.). «Анализ экспрессии генов для прогнозирования устойчивости к гемцитабину при холангиокарциноме человека». Журнал гепато-билиарно-панкреатических наук . 18 (5): 700–11. дои : 10.1007/s00534-011-0376-7 . ПМИД 21451941 . S2CID 19975519 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

v т и Другие оксидоредуктазы ( КФ 1,15–1,21)
1.15 : Действие супероксида как акцептора.	Супероксиддисмутаза СОД1 СОД2 СОД3
1.16 : Окисление металлов ионов	Церулоплазмин (Метионинсинтаза)редуктаза
1.17 : Воздействие на группы CH или CH2	Ксантиноксидаза Рибонуклеотидредуктаза 4-Гидрокси-3-метилбут-2-енилдифосфатредуктаза 7-гидроксиметилхлорофилларедуктаза
1.18 : Воздействие на железо-серные белки как на доноров	Нитрогеназа
1.19 : Действие восстановленного флаводоксина в качестве донора	Нитрогеназа (флаводоксин)
1.20 : Воздействие фосфора или мышьяка на доноров	Глутаредоксин ГЛРКС GLRX2 GLRX3 GLRX5
1.21 : Воздействие на XH и YH с образованием связи XY.	Изопенициллин-N-синтаза Колумбаминоксидаза Ретикулиноксидаза Сулохриноксидаза (+)-бисдехлоргеодинобразующий (-)-бисдехлоргеодинобразующий Ауреузидинсинтаза Синтаза тетрагидроканнабиноловой кислоты Синтаза каннабидиоловой кислоты Дихлорхромопирролатсинтаза

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )