Крис Сандер (ученый)
Крис Сандер | |
|---|---|
 Крис Сандер выступает на ISMB в 2010 году. | |
| Рожденный | |
| Альма-матер | Берлинский университет Калифорнийский университет, Беркли [ 5 ] |
| Известный | Биоинформатика Вычислительная биология Геномика рака [ 6 ] |
| Награды | |
| Научная карьера | |
| Учреждения | Институт рака Даны Фарбер [ 2 ] Мемориальный онкологический центр Слоана-Кеттеринга Рокфеллеровский университет Корнелльский университет Научный институт Вейцмана [ 3 ] |
| Диссертация | Аналитические свойства волновых функций связанного состояния (1975) |
| Докторанты | |
| Веб-сайт | www |
Крис Сандер — компьютерный биолог из Онкологического центра Дана-Фарбер и Гарвардской медицинской школы. Ранее он возглавлял программу вычислительной биологии в Мемориальном онкологическом центре Слоана-Кеттеринга в Нью-Йорке . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] В 2015 году он перенес свою лабораторию в Институт рака Даны-Фарбера. [ 14 ] и факультет клеточной биологии Гарвардской медицинской школы . [ 15 ]
Образование
[ редактировать ]Первоначально Сандер получил образование физика, получив степень бакалавра в Берлинском университете в 1967 году. [ 2 ] После периода обучения в Калифорнийском университете в Беркли и Институте Нильса Бора в Копенгагене, [ 2 ] [ 16 ] он получил степень доктора философии по теоретической физике в Государственном университете Нью-Йорка в 1975 году. Его диссертация называлась «Аналитические свойства волновых функций связанного состояния» . [ 17 ]
Исследовать
[ редактировать ]Сандер приписывает свой переход от теоретической физики к вычислительной биологии знаковой статье Фреда Сэнгера 1977 года в журнале Nature : [ 18 ] в котором была опубликована нуклеотидная последовательность бактериофага φX174 . [ 2 ] Сандер внес большой вклад в область структурной биоинформатики , включая разработку таких инструментов, как база данных семейств структурно сходных белков (FSSP). [ 19 ] и алгоритм DSSP для присвоения вторичной структуры аминокислотам белка с учетом координат этого белка с атомным разрешением. [ 20 ]
Сандер был основателем программы биокомпьютеров в Европейской лаборатории молекулярной биологии в Гейдельберге, а затем перенес программу в Европейский институт биоинформатики в Кембридже. Он работал директором по информационным технологиям биофармацевтической компании Millennium Pharmaceuticals и был советником компании IBM Deep Computing Initiative, которая выпустила шахматный компьютер Deep Blue . [ 21 ]
Награды и почести
[ редактировать ]Сандер — бывший исполнительный редактор журнала «Биоинформатика» . В 2014 году он был назначен одним из первых почётных редакторов журнала «Биоинформатика» . [ 22 ]
В 2010 году Сандер был удостоен награды ISCB за достижения старшего научного сотрудника . [ 16 ] Он был удостоен премии ДеЛано 2018 года в области вычислительных биологических наук . [ 23 ]
Личная жизнь
[ редактировать ]Сандер — брат немецкого актера Отто Сандера . [ 24 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Маккей, Б.М.; Сансом, К. (2010). «Премия ISCB Овертона 2010 года вручена Стивену Э. Бреннеру» . PLOS Вычислительная биология . 6 (6): e1000831. Бибкод : 2010PLSCB...6E0831M . дои : 10.1371/journal.pcbi.1000831 . ПМЦ 2891695 . ПМИД 20585610 .
- ^ Jump up to: а б с д «Сандер Лаборатория» .
- ^ Лифсон, Шнейор; Сандер, Кристиан (1979). «Антипараллельные и параллельные β-цепи различаются по предпочтениям аминокислотных остатков». Природа . 282 (5734): 109–111. Бибкод : 1979Natur.282..109L . дои : 10.1038/282109a0 . ПМИД 503185 . S2CID 4284088 .
- ^ Узунис, Христос (1993). Роль консервации последовательности в предсказании структуры белка (кандидатская диссертация). Университет Йорка. OCLC 53486615 . EThOS uk.bl.ethos.387193 .
- ^ «На работе: руководитель программы вычислительной биологии Крис Сандер | Мемориальный онкологический центр Слоан-Кеттеринг» . Архивировано из оригинала 21 февраля 2013 г.
- ^ Холм, Л.; Сандер, К. (1993). «Сравнение структуры белков путем выравнивания матриц расстояний». Журнал молекулярной биологии . 233 (1): 123–138. дои : 10.1006/jmbi.1993.1489 . ПМИД 8377180 . S2CID 9040631 .
- ^ Крис Сандер на DBLP библиографическом сервере
- ^ Публикации Криса Сандера, индексируемые Google Scholar.
- ^ Публикации Криса Сандера , индексируемые Microsoft Academic
- ^ Сандер, публикации Криса А., индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Джон, Б.; Энрайт, Эй Джей; Аравин А.; Тушль, Т.; Сандер, К.; Маркс, Д.С. (2004). «Мишени человеческих микроРНК» . ПЛОС Биология . 2 (11): е363. дои : 10.1371/journal.pbio.0020363 . ПМК 521178 . ПМИД 15502875 .
- ^ Рост, Б.; Сандер, К. (1993). «Прогнозирование вторичной структуры белка с точностью более 70%». Журнал молекулярной биологии . 232 (2): 584–599. CiteSeerX 10.1.1.17.1418 . дои : 10.1006/jmbi.1993.1413 . ПМИД 8345525 .
- ^ Сандер, К. ; Шульц, GE (1979). «Вырожденность информации, содержащейся в аминокислотных последовательностях: данные наложенных генов». Журнал молекулярной эволюции . 13 (3): 245–252. Бибкод : 1979JMolE..13..245S . дои : 10.1007/BF01739483 . ПМИД 228047 . S2CID 22606882 .
- ^ «Крис Сандер, доктор философии - DF/HCC» . www.dfhcc.harvard.edu . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ «Крис Сандер | Кафедра КЛЕТОЧНОЙ БИОЛОГИИ» . cellbio.med.harvard.edu . Проверено 1 января 2019 г.
- ^ Jump up to: а б «Достижение награды старшего ученого 2010 года — Крис Сандер» .
- ^ Сандер, К. (1975). «Поиск в коллекции INIS — единственный результат» . п. 155 . Проверено 13 августа 2015 г.
- ^ Сэнгер, Ф.; Воздух, GM; Баррелл, Б.Г.; Браун, Нидерланды; Коулсон, Арканзас; Фиддес, Дж. К.; Хатчисон, Калифорния; Слокомб, премьер-министр; Смит, М. (24 февраля 1977 г.). «Нуклеотидная последовательность ДНК бактериофага φX174». Природа . 265 (5596): 687–695. Бибкод : 1977Natur.265..687S . дои : 10.1038/265687a0 . ПМИД 870828 . S2CID 4206886 .
- ^ Холм Л., Узунис С., Сандер С., Тупарев Г., Вриенд Г. (1992). «База данных семейств белковых структур с общими мотивами сворачивания» . Белковая наука . 1 (12): 1691–1698. дои : 10.1002/pro.5560011217 . ПМК 2142138 . ПМИД 1304898 .
- ^ Кабш, В.; Сандер, К. (1983). «Словарь вторичной структуры белков: распознавание образов водородных связей и геометрических особенностей». Биополимеры . 22 (12): 2577–2637. дои : 10.1002/bip.360221211 . ПМИД 6667333 . S2CID 29185760 .
- ^ «Мир био-ИТ: Горизонты - Крис Сандер» . Архивировано из оригинала 23 сентября 2015 года . Проверено 13 августа 2015 г.
- ^ «15 лет «Биоинформатике» ». Биоинформатика . 30 (6): 747. 2014. doi : 10.1093/bioinformatics/btu076 . ПМИД 24642573 .
- ^ «Премия ДеЛано в области вычислительных биологических наук» . www.asbmb.org . Проверено 15 сентября 2017 г.
- ^ Биография Отто Сандера на IMDb . Проверено 13 августа 2015 г.
