Гаплогруппа E-V38
Гаплогруппа E-V38 (бывшая E3a/E1b1a) | |
---|---|
Возможное время происхождения | 41 400 лет назад [ 1 ] |
Возраст слияния | 39 200 лет назад [ 1 ] |
Возможное место происхождения | Восточная Африка [ 2 ] [ 3 ] |
Предок | Е-П2 |
Потомки | Э-М2 , Э-М329 |
Определение мутаций | Л222.1, В38, В100 |
Гаплогруппа E-V38 , также известная как E1b1a-V38 , является основной гаплогруппой ДНК Y-хромосомы человека . E-V38 в основном распространяется в Африке . E-V38 имеет две базальные ветви: E-M329 и E-M2 . [ 2 ] [ а ] [ б ] E-M329 — субклад, который в основном встречается в Восточной Африке . [ 2 ] Е-М2 — преобладающий субклад в Западной Африке , Центральной Африке , Южной Африке и районе Великих африканских озер ; он также встречается с умеренной частотой в Северной Африке , Западной Азии и Южной Европе .
Происхождение
[ редактировать ]Открытие двух SNP (V38 и V100) Тромбеттой и др. (2011) существенно переопределили филогенетическое древо E-V38. Это заставило авторов предположить, что E-V38 мог возникнуть в Восточной Африке. V38 присоединяется к Западной Африкой E-M2, связанному с , и E-M329, связанному с Северо-Восточной Африкой, с более ранним общим предком, который, как и E-P2, возможно, также произошел из Восточной Африки . [ 2 ] SNP E-M180, расположенный ниже по течению, возможно, возник во влажных южной и центральной Сахары саваннах / лугах в Северной Африке между 14 000 и 10 000 лет назад. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] По данным Вуда и др. (2005) и Роза и др. (2007), такие перемещения населения изменили ранее существовавшее хромосомное разнообразие Y популяции в Центральной , Южной и Юго-Восточной Африке , заменив предыдущие частоты гаплогрупп (гаплогруппы A и B-M60 ) в этих областях на ныне доминирующие линии E1b1a1 . Однако следы более ранних жителей сегодня можно наблюдать в этих регионах по наличию гаплогрупп Y-ДНК A1a , A1b, A2, A3 и B-M60, которые распространены в определенных популяциях, таких как мбути и койсан . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] Шрайнер и др. (2018) также предполагает, что гаплогруппа E1b1a-V38 мигрировала через Зеленую Сахару с востока на запад около 19 000 лет назад, где E1b1a1-M2, возможно, впоследствии возникла в Западной Африке или Центральной Африке . Шрайнер и др. (2018) также прослеживает эту миграцию посредством серповидноклеточной мутации , которая, вероятно, возникла в период Зеленой Сахары. [ 3 ]
Древняя ДНК
[ редактировать ]Гад и др. (2021) указывает на то, что древнеегипетские мумии Рамсеса III и Неизвестного человека E, возможно, Пентавера , несли гаплогруппу E1b1a. [ 11 ]
В Кабесу-да-Аморейра, в Португалии , порабощенный мужчина из Западной Африки , который, возможно, был родом из сенегамбийского прибрежного региона Гамбии , Мавритании или Сенегала и носил гаплогруппы E1b1a и L3b1a , был похоронен среди обломков ракушек между 16 веком н.э. 18 век нашей эры. [ 12 ]
Распределение
[ редактировать ]Частота и разнообразие E-V38 являются самыми высокими в Западной Африке. В Африке E-V38 демонстрирует клинальное распространение с запада на восток, а также с юга на север. Другими словами, частота гаплогруппы уменьшается по мере продвижения от западной и южной Африки к восточной и северной частям Африки. [ 13 ]
Субклады
[ редактировать ]Э-М2
[ редактировать ]E1b1a1 определяется маркерами DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43 и V95. E-M2 — разнообразная гаплогруппа со множеством ответвлений.
Э-М329
[ редактировать ]E1b1a2 определяется мутацией SNP M329. [ с ] E-M329 в основном встречается в Восточной Африке . [ 2 ] E-M329 также часто встречается в Юго-Западной Эфиопии , особенно среди языке омот . населения, говорящего на [ 14 ] [ 15 ]
Филогенетика
[ редактировать ]Филогенетическая история
[ редактировать ]До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть прежде всего своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.
YCC 2002/2008 (сокращенно) | (а) | (б) | (с) | (г) | (е) | (г) | (или) | YCC 2002 (от руки) | YCC 2005 (от руки) | YCC 2008 (от руки) | YCC 2010r (от руки) | ИСОГГ 2006 г. | ИСОГГ 2007 | ИСОГГ 2008 | ИСОГГ 2009 | ИСОГГ 2010 | ИЗОГГ 2011 | ИЗОГГ 2012 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
E-P29 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | И* | И | И | И | И | И | И | И | И | И | И |
Э-М33 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е1* | Е1 | Е1а | Е1а | Е1 | Е1 | Е1а | Е1а | Е1а | Е1а | Е1а |
Э-М44 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е1а | Е1а | Е1а1 | Е1а1 | Е1а | Е1а | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 | Е1а1 |
Э-М75 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е2а | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 | Е2 |
Э-М54 | 21 | III | 3А | 13 | Еу3 | Н2 | Б | Е2б | Е2б | Е2б | E2b1 | - | - | - | - | - | - | - |
Е-П2 | 25 | III | 4 | 14 | Еу3 | Н2 | Б | Е3* | Е3 | Е1б | E1b1 | Е3 | Е3 | E1b1 | E1b1 | E1b1 | E1b1 | E1b1 |
Э-М2 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а* | Е3а | E1b1 | E1b1a | Е3а | Е3а | E1b1a | E1b1a | E1b1a | E1b1a1 | E1b1a1 |
Э-М58 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а1 | Е3а1 | E1b1a1 | E1b1a1 | Е3а1 | Е3а1 | E1b1a1 | E1b1a1 | E1b1a1 | E1b1a1a1a | E1b1a1a1a |
Э-М116.2 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | E3a2 | E3a2 | E1b1a2 | E1b1a2 | E3a2 | E3a2 | E1b1a2 | E1b1a2 | E1ba12 | удаленный | удаленный |
Э-М149 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а3 | Е3а3 | E1b1a3 | E1b1a3 | Е3а3 | Е3а3 | E1b1a3 | E1b1a3 | E1b1a3 | E1b1a1a1c | E1b1a1a1c |
Э-М154 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а4 | Е3а4 | E1b1a4 | E1b1a4 | Е3а4 | Е3а4 | E1b1a4 | E1b1a4 | E1b1a4 | E1b1a1a1g1c | E1b1a1a1g1c |
Э-М155 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а5 | Е3а5 | E1b1a5 | E1b1a5 | Е3а5 | Е3а5 | E1b1a5 | E1b1a5 | E1b1a5 | E1b1a1a1d | E1b1a1a1d |
Э-М10 | 8 | III | 5 | 15 | ЕС2 | Н2 | Б | Е3а6 | Е3а6 | E1b1a6 | E1b1a6 | Е3а6 | Е3а6 | E1b1a6 | E1b1a6 | E1b1a6 | E1b1a1a1e | E1b1a1a1e |
Э-М35 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b* | E3b | E1b1b1 | E1b1b1 | E3b1 | E3b1 | E1b1b1 | E1b1b1 | E1b1b1 | удаленный | удаленный |
Э-М78 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b1* | E3b1 | E1b1b1a | E1b1b1a1 | E3b1a | E3b1a | E1b1b1a | E1b1b1a | E1b1b1a | E1b1b1a1 | E1b1b1a1 |
Э-М148 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b1a | E3b1a | E1b1b1a3a | E1b1b1a1c1 | E3b1a3a | E3b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a3a | E1b1b1a1c1 | E1b1b1a1c1 |
Э-М81 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2* | E3b2 | E1b1b1b | E1b1b1b1 | E3b1b | E3b1b | E1b1b1b | E1b1b1b | E1b1b1b | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a |
Э-М107 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2a | E3b2a | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a | E3b1b1 | E3b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1 | E1b1b1b1a | E1b1b1b1a1 |
Э-М165 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b2b | E3b2b | E1b1b1b2 | E1b1b1b1b1 | E3b1b2 | E3b1b2 | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b2a | E1b1b1b1a2a |
Э-М123 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b3* | E3b3 | E1b1b1c | E1b1b1c | E3b1c | E3b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1c | E1b1b1b2a |
Э-М34 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3b3a* | E3b3a | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E3b1c1 | E3b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1c1 | E1b1b1b2a1 |
Э-М136 | 25 | III | 4 | 14 | Еу4 | Н2 | Б | E3ba1 | E3b3a1 | E1b1b1c1a | E1b1b1c1a1 | E3b1c1a | E3b1c1a | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1c1a1 | E1b1b1b2a1a1 |
Научные публикации
[ редактировать ]Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании дерева YCC.
Филогенетические деревья
[ редактировать ]Это филогенетическое древо субкладов гаплогрупп основано на дереве 2008 года Консорциума Y-хромосом (YCC), [ 16 ] дерево гаплогруппы E ISOGG Y-ДНК, [ 5 ] и последующие опубликованные исследования.
- E1b1a (L222.1, V38, V100)
- E1b1a1 (DYS271/M2/SY81, M291, P1/PN1, P189, P293, V43, V95, Z1101, Z1107, Z1116, Z1120, Z1122, Z1123, Z1124, Z1125, Z1127, Z1130, Z1133)
- E1b1a2 (M329)
См. также
[ редактировать ]
Генетика
[ редактировать ]- Африканская примесь в Европе
- Генетическая генеалогия
- Гаплогруппа D
- Гаплогруппа DE
- Гаплогруппа
- Гаплотип
- Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
- Молекулярная филогенетика
- Парагруппа
- Субклад
- Гаплогруппы Y-хромосомы в популяциях мира
- Гаплогруппы Y-ДНК по этническим группам
- Гаплогруппы Y-ДНК в населении стран Африки к югу от Сахары
Y-ДНК и субклады
[ редактировать ]- Гаплогруппа E-L485
- Гаплогруппа E-M123
- Гаплогруппа E-M180
- Гаплогруппа E-M215
- Гаплогруппа E-M33
- Гаплогруппа E-M521
- Гаплогруппа E-M75
- Гаплогруппа E-M96
- Гаплогруппа E-P147
- Гаплогруппа E-P177
- Гаплогруппа E-P2
- Гаплогруппа E-V12
- Гаплогруппа E-V13
- Гаплогруппа E-V22
- Гаплогруппа E-V38
- Гаплогруппа E-M2
- Гаплогруппа E-V65
- Гаплогруппа E-V68
- Гаплогруппа E-Z820
- Гаплогруппа E-Z827
Основополагающее дерево Y-ДНК
[ редактировать ]Примечания
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «E-V38 YTree» .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Тромбетта, Бениамино; Фульвио Кручиани; Даниэле Селитто; Розария Скоццари (6 января 2011 г.). Маколей, Винсент (ред.). «Новая топология гаплогруппы E1b1 (E-P2) Y-хромосомы человека, выявленная с помощью недавно охарактеризованных бинарных полиморфизмов» . ПЛОС ОДИН . 6 (1): e16073. Бибкод : 2011PLoSO...616073T . дои : 10.1371/journal.pone.0016073 . ПМК 3017091 . ПМИД 21253605 .
- ^ Перейти обратно: а б Шрайнер, Дэниел; Ротими, Чарльз (2018). «Гаплотипы, основанные на полногеномных последовательностях, раскрывают единое происхождение аллели серпа во время влажной фазы голоцена» . Американский журнал генетики человека . 102 (4). Ам Дж Хум Генет: 547–556. дои : 10.1016/j.ajhg.2018.02.003 . ПМЦ 5985360 . ПМИД 29526279 .
- ^ «E-V43 YTree» .
- ^ Перейти обратно: а б Международное общество генетической генеалогии (3 февраля 2010 г.). «Гаплогруппа E Y-ДНК и ее субклады - 2010» . Проверено 17 декабря 2010 г.
- ^ Адамс, Джонатан. «Африка за последние 150 000 лет» . Архивировано из оригинала 1 мая 2006 года . Проверено 26 января 2011 г.
- ^ Монтано, Валерия; Джанмарко Ферри; Вероника Маркари; Кьяра Батини; Окори Аньяэле; Джованни Дестро-Бисоль; Дэвид Комас (1 июля 2011 г.). «Экспансия банту вновь обратилась к новому анализу вариаций Y-хромосомы в Центральной Западной Африке». Молекулярная экология . 20 (13): 2693–2708. дои : 10.1111/j.1365-294X.2011.05130.x . ПМИД 21627702 . S2CID 9951365 .
- ^ Роза, Александра; Каролина Орнелас; Марк Джоблинг; Антонио Брем; Ричард Виллемс (27 июля 2007 г.). «Y-хромосомное разнообразие населения Гвинеи-Бисау: многоэтническая перспектива» . Эволюционная биология BMC . 7 : 124. дои : 10.1186/1471-2148-7-124 . ЧВК 1976131 . ПМИД 17662131 .
- ^ Вуд, Элизабет Т; Дэрин А. Стовер, Кристофер Эрет, Джованни Дестро-Бисоль, Габриэлла Спедини, Ховард Маклеод, Лесли Луи, Майк Бэмшад, Беверли И Страссманн, Химла Судьял и Майкл Ф. Хаммер (27 апреля 2005 г.). «Контрастные закономерности вариаций Y-хромосомы и мтДНК в Африке: свидетельства демографических процессов с учетом пола» . Европейский журнал генетики человека . 13 (7): 867–876. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201408 . ПМИД 15856073 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Андерхилл, Пенсильвания; Пассарино Дж., Лин А.А., Шен П., Мирасон Лар М., Фоли Р.А., Офнер П.Дж., Кавалли-Сфорца Л.Л. (январь 2001 г.). «Филогеография бинарных гаплотипов Y-хромосомы и происхождение современных человеческих популяций» . Анналы генетики человека . 65 (1): 43–62. дои : 10.1046/j.1469-1809.2001.6510043.x . ПМИД 11415522 . S2CID 9441236 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Гад, Йехия З; и др. (2021). «Результаты древнего анализа ДНК египетских человеческих мумий: ключ к разгадке болезней и родства» . Молекулярная генетика человека . 30 (R1): R24–R28. дои : 10.1093/hmg/ddaa223 . ISSN 0964-6906 . OCLC 8681412353 . ПМИД 33059357 . S2CID 222824170 .
- ^ Пейротео-Стьерна, Рита; и др. (21 февраля 2022 г.). «Мультидисциплинарное расследование выявило человека западноафриканского происхождения, похороненного в португальской мезолитической раковине, заваленной четыре столетия назад» . Журнал археологической науки: отчеты . 42 : 103370. doi : 10.1016/j.jasrep.2022.103370 . OCLC 1337974923 . S2CID 247045502 .
- ^ Луис, младший; DJRowold (март 2004 г.). «Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей» . Американский журнал генетики человека . 74 (3): 532–544. дои : 10.1086/382286 . ПМЦ 1182266 . ПМИД 14973781 .
- ^ Пластер и др. Субклады Y-ДНК E
- ^ Калифорния, Гипс (28 сентября 2011 г.). «Вариации Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и идентификационных меток в Эфиопии» . Discovery.ucl.ac.uk . Проверено 27 июня 2018 г.
- ^ Карафет Татьяна М.; Фернандо Л. Мендес; Моника Б. Мейлерман; Питер А. Андерхилл; Стивен Л. Зегура; Майкл Ф. Хаммер (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–838. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
Источники таблиц преобразования
[ редактировать ]- Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и др. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891 .
- Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . ПМИД 11420360 .
- Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
- Каладжиева, преп.; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у влакс-рома, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . ПМИД 11313742 .
- Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы» . Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299 . ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588 .
- Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494. 1155 , PMID 11073453
- Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Свидетельства Y-хромосомы о миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926 .
- Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685 . ПМИД 11062480 . S2CID 12893406 .