Тепловой эллипсоид

Модель термического эллипсоида одной стабильной конформации органической O. Углероды (C) показаны молекулы, дифенилового эфира , формулы C ₁₂ H ₁₀ O *или* (C ₆ H ₅ ) ₂ O, сокращенно Ph ₂ черным цветом, водороды (H) серо-белый, а кислород (O) красный. Тепловые эллипсоиды установлены на уровне вероятности 50%, а положения атомов и анизотропия положений, отраженная в эллипсоидах, обусловлены кристаллической структурой молекулы. ^[1]

Модель теплового эллипсоида ^[2] координационного окружения атома хлора в ClO ⁺
₂ ( хлорильный катион ), в кристаллическом хлорилгексафторантимонате , формула [ClO ₂ ][SbF ₆ ]. Атом хлора (Cl) находится в степени окисления +5 и имеет ярко-зеленый цвет в центре; два атома кислорода (O) выделены красным цветом, а четыре фторид-аниона из гексафторантимоната (SbF ₆⁻) анионы, координирующие электроположительный атом хлора, показаны желтовато-зеленым цветом на периферии справа (светлые линии указывают на координирующие взаимодействия F-Cl. Это реакционноспособное соединение получают обработкой FClO ₂ перфтор- кислотой Льюиса , СбФ ₅ . ^[3]

Тепловые эллипсоиды , более формально называемые смещения атомов или параметрами анизотропного смещения , представляют собой эллипсоиды, используемые в кристаллографии для обозначения величин и направлений тепловых колебаний атомов параметрами в кристаллических структурах . Поскольку колебания обычно анизотропны (разные величины в разных направлениях пространства), эллипсоид является удобным способом визуализации вибрации и, следовательно, симметрии и усредненного по времени положения атома в кристалле. Их теоретическая основа была представлена Д.В. Дж. Круикшанком в 1956 году, а концепция была популяризирована посредством программы ORTEP (Программа термического эллипсоида Ок-Риджа), впервые выпущенной в 1965 году. ^[4]

Тепловые эллипсоиды можно определить с помощью тензора , математического объекта, который позволяет определять величину и ориентацию вибрации относительно трех взаимно перпендикулярных осей . Три главные оси тепловых колебаний атома обозначены $U_{1}$ , $U_{2}$ , и $U_{3}$ , а на основе этих осей построен соответствующий тепловой эллипсоид. Размер эллипсоида масштабируется так, чтобы он занимал то пространство, в котором существует определенная вероятность обнаружения электронной плотности атома. Частная вероятность обычно составляет 50%. ^[5]

См. также [ править ]

Фактор Дебая – Уоллера

Ссылки [ править ]

^ Ангшуман Р. Чоудхури, Кабирул Ислам, Майкл Т. Киршнер, Говердхан Мехта и Тайур Н. Гуру Роу, 2004, «Криокристаллизация дифенилового эфира in situ: полиморфные формы, опосредованные C-H···π», J. Am. хим. Соц. , 126 (39), стр. 12274–12275, DOI: 10.1021/ja046134k, см. [1] , по состоянию на 23 июня 2105 г.
^ Леманн, Джон Ф.; Ридель, Себастьян; Шробильген, Гэри Дж. (2008). «Поведение BrO3F и ClO3F по отношению к сильным кислотам Льюиса и характеристика [XO2][SbF6] (X = Cl, Br) методами монокристаллической рентгеновской дифракции, рамановской спектроскопии и вычислительного метода». Неорганическая химия . 47 (18): 8343–8356. дои : 10.1021/ic800929h . ПМИД 18700751 .
^ КО Кристе; Си Джей Шак (1976). Гарри Юлиус Эмелеус , А. Г. Шарп (ред.). Оксифториды хлора . Достижения неорганической химии и радиохимии, Том 18. Академическое издательство. стр. 319–399, особенно. п. 357ф. ISBN 978-0-12-023618-3 . Проверено 23 июня 2015 г.
^ «ОРТЕП» . www.umass.edu . Проверено 21 апреля 2022 г.
^ Масса, Вернер (2004). Определение кристаллической структуры (2-е изд.). Спрингер-Верлаг. стр. 35–37. ISBN 978-3540206446 .

[1] Ангшуман Р. Чоудхури, Кабирул Ислам, Майкл Т. Киршнер, Говердхан Мехта и Тайур Н. Гуру Роу, 2004, «Криокристаллизация дифенилового эфира in situ: полиморфные формы, опосредованные C-H···π», J. Am. хим. Соц. , 126 (39), стр. 12274–12275, DOI: 10.1021/ja046134k, см. [1] , по состоянию на 23 июня 2105 г.

[2] Леманн, Джон Ф.; Ридель, Себастьян; Шробильген, Гэри Дж. (2008). «Поведение BrO3F и ClO3F по отношению к сильным кислотам Льюиса и характеристика [XO2][SbF6] (X = Cl, Br) методами монокристаллической рентгеновской дифракции, рамановской спектроскопии и вычислительного метода». Неорганическая химия . 47 (18): 8343–8356. дои : 10.1021/ic800929h . ПМИД 18700751 .

[3] КО Кристе; Си Джей Шак (1976). Гарри Юлиус Эмелеус , А. Г. Шарп (ред.). Оксифториды хлора . Достижения неорганической химии и радиохимии, Том 18. Академическое издательство. стр. 319–399, особенно. п. 357ф. ISBN 978-0-12-023618-3 . Проверено 23 июня 2015 г.

[4] «ОРТЕП» . www.umass.edu . Проверено 21 апреля 2022 г.

[5] Масса, Вернер (2004). Определение кристаллической структуры (2-е изд.). Спрингер-Верлаг. стр. 35–37. ISBN 978-3540206446 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]