Orc1

Orc1
Идентификаторы
Псевдонимы	ORC1 , HSORC1L, PARC1, Комплекс распознавания происхождения.
Внешние идентификаторы	Омим : 601902 ; MGI : 1328337 ; Гомологен : 31221 ; GeneCards : ORC1 ; OMA : ORC1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	52,404,423 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	108,472,030 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	testicle; ; ventricular zone; ; gonad; ; ganglionic eminence; ; bone marrow; ; mucosa of transverse colon; ; secondary oocyte; ; rectum; ; stromal cell of endometrium; ; bone marrow cells;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; primary oocyte; ; epiblast; ; tail of embryo; ; genital tubercle; ; primitive streak; ; embryo; ; embryo; ; blastocyst;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding; nucleotide binding; chromatin binding; protein binding; ATP binding; DNA replication origin binding; metal ion binding;
Cellular component	nuclear origin of replication recognition complex; plasma membrane; nucleolus; origin recognition complex; nucleus; nucleoplasm; cytosol;
Biological process	G1 phase; DNA replication; regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; DNA replication initiation; G1/S transition of mitotic cell cycle; mitotic cell cycle; mitotic DNA replication checkpoint signaling;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4998
	18392
	ENSG00000085840
	Ensmusg00000028587
	Q13415
	Q9Z1N2
	NM_001190818 ; NM_001190819 ; NM_004153
	NM_001014425 ; NM_011015
	NP_001177747 ; NP_001177748 ; NP_004144
	NP_035145
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Комплекс распознавания происхождения. Субъединица 1 - это белок , который у людей кодируется ORC1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Он тесно связан с CDC6 , и оба являются одним и тем же белком в археи . ^{[ 7 ]}

Функция

Комплекс распознавания происхождения (ORC) представляет собой высококонсервативный белковой комплекс шести субъединиц, необходимый для инициации репликации ДНК в эукариотических клетках. Исследования на дрожжах показали, что ORC связывается специально с происхождением репликации и служит платформой для сборки комплекса предварительного репликации , который включает в себя дополнительные факторы инициации, такие как CDC6 и MCM белки . Белок, кодируемый этим геном, является самой большой субъединицей комплекса распознавания происхождения. В то время как другие субъединицы ORC являются стабильными во всем клеточном цикле , уровни этого белка варьируются во время клеточного цикла, что, как было показано, контролируется убиквитин-опосредованным протеолизом после инициации репликации ДНК. Обнаружено, что этот белок селективно фосфорилируется во время митоза . Также сообщается, что он взаимодействует с гистон -ацетилтрансферазой 2 (MYST2/HBO1), белком, участвующим в контроле молчания транскрипции. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ORC1 взаимодействует :

Связанный с CDC45 белок ^{[ 8 ]} и
Cdc6 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}
Цикл клеточного деления 7-связанный протеинкиназа , ^{[ 8 ]}
Циклин-зависимая киназа 2 , ^{[ 10 ]}
McM2 , ^{[ 8 ]}
McM4 , ^{[ 8 ]}
McM6 , ^{[ 8 ]}
McM7 , ^{[ 8 ]}
Myst2 , ^{[ 11 ]}
Orc2 , ^{[ 8 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 10 ]}
Orc4 , ^{[ 8 ]}
Orc5 , ^{[ 8 ]} и
SKP2 . ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000085840 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000028587 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Эки Т., Окумура К., Амин А., Ишиай М., Абэ М., Ногами М., Тагучи Х., Хервиц Дж., Мураками Ю., Ханаока Ф (сентябрь 1996 г.). «Картирование человеческого гомолога (ORC1L) гена комплекса распознавания дрожжевого происхождения субъединицы 1 к хромосомной полосе 1P32». Геномика . 36 (3): 559–61. doi : 10.1006/geno.1996.0511 . PMID 8884289 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC1L, субъединица 1-подобная (дрожжи)» .
^ Ausiannikava, Darya; Аллерс, Торстен (31 января 2017 г.). «Разнообразие репликации ДНК в археи» . Гены . 8 (2): 56. doi : 10.3390/genes8020056 . PMC 5333045 . PMID 28146124 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (Mar 2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пре-репликативных комплексных белков в клетках дрожжей и мыши». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111–28. doi : 10.1016/s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .
^ Saha P, Chen J, Thome KC, Lawlis SJ, Hou ZH, Hendricks M, Parvin JD, Dutta A (май 1998). «Человеческий CDC6/CDC18 ассоциируется с ORC1 и Cyclin-CDK и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2758–67. doi : 10.1128/mcb.18.5.2758 . PMC 110655 . PMID 9566895 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Méendz J, Zou-Yang XH, Kim Sy, в настоящее время Полем Молекулярный Cel 9 (3): 481–91. doi : 10.1016/s1097-2765 ( 020467-7-7 11931757PMID
^ Iizuka M, Stillman B (август 1999 г.). «Гистонцетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 белка инициатора человека» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23027–34. doi : 10.1074/jbc.274.33.23027 . PMID 10438470 .
^ Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10354–61. doi : 10.1074/jbc.m111398200 . PMID 11779870 .
^ Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (Jul 2001). «Сборка комплекса распознавания человеческого происхождения» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26666–73. doi : 10.1074/jbc.m102493200 . PMID 11323433 .

Дальнейшее чтение

Гэвин К.А., Хидака М., Стиллман Б (декабрь 1995). «Консервативные белки инициатора у эукариот». Наука . 270 (5242): 1667–71. Bibcode : 1995sci ... 270.1667g . doi : 10.1126/science.270.5242.1667 . PMID 7502077 . S2CID 43633493 .
Ohtani K, Degregori J, Leone G, Herendeen DR, Kelly TJ, Nevins Jr (Dec 1996). «Экспрессия гена HSORC1, человеческого гомолога ORC1, регулируется пролиферацией клеток через транскрипционный фактор E2F» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 6977–84. doi : 10.1128/mcb.16.12.6977 . PMC 231701 . PMID 8943353 .
Saha P, Chen J, Thome KC, Lawlis SJ, Hou ZH, Hendricks M, Parvin JD, Dutta A (май 1998). «Человеческий CDC6/CDC18 ассоциируется с ORC1 и Cyclin-CDK и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2758–67. doi : 10.1128/mcb.18.5.2758 . PMC 110655 . PMID 9566895 .
Iizuka M, Stillman B (август 1999 г.). «Гистонцетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 белка инициатора человека» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23027–34. doi : 10.1074/jbc.274.33.23027 . PMID 10438470 .
Цзян В., Макдональд Д., Хоуп Т.Дж., Охотник Т (октябрь 1999). «Комплекс протеинкиназы CDC7-DBF4 млекопитающих необходим для инициации репликации ДНК» . Embo Journal . 18 (20): 5703–13. doi : 10.1093/emboj/18.20.5703 . PMC 1171637 . PMID 10523313 .
Tatsumi Y, Tsurimoto T, Shirahige K, Yoshikawa H, Obuse C (февраль 2000 г.). «Ассоциация комплекса распознавания человеческого происхождения 1 с хроматиновой ДНК и нуклеазой, устойчивыми к ядерным структурам» . Журнал биологической химии . 275 (8): 5904–10. doi : 10.1074/jbc.275.8.5904 . PMID 10681582 .
Том К.С., Дхар С.К., Кинтана Д.Г., Дельмолино Л., Шахсафей А., Датта А (ноябрь 2000). «Подмножества субъединиц распознавания человеческого происхождения (ORC) экспрессируются в непролификационных клетках и ассоциируются с белками без ОРК» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35233–41. doi : 10.1074/jbc.m005765200 . PMID 10954718 .
Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (Jul 2001). «Сборка комплекса распознавания человеческого происхождения» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26666–73. doi : 10.1074/jbc.m102493200 . PMID 11323433 .
Laman H, Peters G, Jones N (Dec 2001). «Циклин-опосредованный экспорт человеческого ORC1». Экспериментальные исследования клеток . 271 (2): 230–7. doi : 10.1006/excr.2001.5360 . PMID 11716535 .
Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10354–61. doi : 10.1074/jbc.m111398200 . PMID 11779870 .
Ladenburger EM, Keller C, Knippers R (февраль 2002 г.). «Идентификация области связывания для белков 1 и 2 распознавания человека, которые совпадают с происхождением репликации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (4): 1036–48. doi : 10.1128/mcb.22.4.1036-1048.2002 . PMC 134626 . PMID 11809796 .
Méendz J, Zou-Yang XH, Kim Sy, в настоящее время Полем Молекулярный Cel 9 (3): 481–91. doi : 10.1016/s1097-2765 ( 020467-7 11931757PMID
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (Mar 2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пре-репликативных комплексных белков в клетках дрожжей и мыши». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111–28. doi : 10.1016/s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .
Ohta S, Tatsumi Y, Fujita M, Tsurimoto T, Obuse C (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: II. Динамические изменения в комплексе ORC человека во время клеточного цикла» . Журнал биологической химии . 278 (42): 41535–40. doi : 10.1074/jbc.m307535200 . PMID 12909626 .
Tatsumi Y, Ohta S, Kimura H, Tsurimoto T, Obuse C (октябрь 2003 г.). «Цикл ORC1 в клетках человека: I. Целевой цикл-регулируемые колебания ORC1 человека» . Журнал биологической химии . 278 (42): 41528–34. doi : 10.1074/jbc.m307534200 . PMID 12909627 .
Абдурашидова Г., Данайлов М.Б., Охем А., Трило Г., Джелиова В., Радулеску С., Виндинги А., Рива С., Философия А (август 2003 г.). «Локализация белков, связанных с репликационным происхождением человеческой ДНК вдоль цикла » Embo Journal 22 (16): 4294–3 Doi : 10.1093/ emboj/ cdg4 175794PMC 12912926PMID
Рамачандран Н., Хейнсворт Е., Бхуллар Б., Эйзенштейн С., Розен Б., Лау Ай, Уолтер Дж.С., Лабаер Дж. (Июль 2004). «Самосборщик белка микрочипов». Наука . 305 (5680): 86–90. Bibcode : 2004sci ... 305 ... 86r . doi : 10.1126/science.1097639 . PMID 15232106 . S2CID 20936301 .
Lidonnici MR, Rossi R, Paixão S, Mendoza-Maldonado R, Paolinelli R, Arcangeli C, Giacca M, Biamonti G, Montecucco A (октябрь 2004 г.). «Субноклеарное распределение крупнейшей субъединицы комплекса распознавания человеческого происхождения во время клеточного цикла» . Журнал сотовой науки . 117 (Pt 22): 5221–31. doi : 10.1242/jcs.01405 . PMID 15454574 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q13415 (комплексная субъединица 1) в PDBE-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q9Z1N2 (комплекс распознавания мышиного происхождения 1) в PDBE-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000085840 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: ENSMUSG00000028587 - ENSEMBL , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8884289-5] Эки Т., Окумура К., Амин А., Ишиай М., Абэ М., Ногами М., Тагучи Х., Хервиц Дж., Мураками Ю., Ханаока Ф (сентябрь 1996 г.). «Картирование человеческого гомолога (ORC1L) гена комплекса распознавания дрожжевого происхождения субъединицы 1 к хромосомной полосе 1P32». Геномика . 36 (3): 559–61. doi : 10.1006/geno.1996.0511 . PMID 8884289 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: комплекс распознавания происхождения ORC1L, субъединица 1-подобная (дрожжи)» .

[pmid28146124-7] Ausiannikava, Darya; Аллерс, Торстен (31 января 2017 г.). «Разнообразие репликации ДНК в археи» . Гены . 8 (2): 56. doi : 10.3390/genes8020056 . PMC 5333045 . PMID 28146124 .

[pmid12614612-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (Mar 2003). «Взаимодействие и сборка мышиных пре-репликативных комплексных белков в клетках дрожжей и мыши». Журнал молекулярной биологии . 327 (1): 111–28. doi : 10.1016/s0022-2836 (03) 00079-2 . PMID 12614612 .

[pmid9566895-9] Saha P, Chen J, Thome KC, Lawlis SJ, Hou ZH, Hendricks M, Parvin JD, Dutta A (май 1998). «Человеческий CDC6/CDC18 ассоциируется с ORC1 и Cyclin-CDK и выборочно удаляется из ядра в начале S-фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2758–67. doi : 10.1128/mcb.18.5.2758 . PMC 110655 . PMID 9566895 .

[pmid11931757-10] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Méendz J, Zou-Yang XH, Kim Sy, в настоящее время Полем Молекулярный Cel 9 (3): 481–91. doi : 10.1016/s1097-2765 ( 020467-7-7 11931757PMID

[pmid10438470-11] Iizuka M, Stillman B (август 1999 г.). «Гистонцетилтрансфераза HBO1 взаимодействует с субъединицей ORC1 белка инициатора человека» . Журнал биологической химии . 274 (33): 23027–34. doi : 10.1074/jbc.274.33.23027 . PMID 10438470 .

[pmid11779870-12] Fujita M, Ishimi Y, Nakamura H, Kiyono T, Tsurumi T (март 2002 г.). «Ядерная организация белков инициации репликации ДНК в клетках млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10354–61. doi : 10.1074/jbc.m111398200 . PMID 11779870 .

[pmid11323433-13] Vashee S, Simancek P, Challberg MD, Kelly TJ (Jul 2001). «Сборка комплекса распознавания человеческого происхождения» . Журнал биологической химии . 276 (28): 26666–73. doi : 10.1074/jbc.m102493200 . PMID 11323433 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]