Jump to content

Эвриархеота

(Перенаправлено с Эвриархеоты )

Эвриархеота
Галобактерия сп. штамм NRC-1, длина каждой клетки около 5 мкм.
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Архея
Королевство: Эвриархеота
Вёзе , Кандлер и Уилис , 1990 г. [1]
Фила [2]
Синонимы
  • не Euryarchaeota ss Гаррити и Холт 2002 г.
  • Эвриархеида Лукета 2012 г.
  • Метанокреатрисы Маргулис и Шварц, 1982 г.

Эвриархеота (от древнегреческого εὐρύς eurús, «широкий, широкий») царство архей . [3] Эвриархеоты весьма разнообразны и включают метаногены , вырабатывающие метан и часто обнаруживаемые в кишечнике; галобактерии , выживающие при экстремальных концентрациях соли ; и некоторые чрезвычайно термофильные аэробы и анаэробы, которые обычно живут при температуре от 41 до 122 °C. Их отделяют от других архей главным образом на основе последовательностей рРНК и их уникальной ДНК-полимеразы. [4]

Описание

[ редактировать ]

Эвриархеоты разнообразны по внешнему виду и метаболическим свойствам. Тип содержит организмы различной формы, включая палочки и кокки . Эвриархеоты могут проявляться как грамположительными, так и грамотрицательными в зависимости от того, присутствует ли псевдомуреин в клеточной стенке. [5] Эвриархеоты также демонстрируют разнообразный образ жизни, включая метаногенов, галофилов, сульфатредукторов и крайних термофилов. [5] Другие живут в океане, наполненные планктоном и бактериями. Хотя эти морские эвриархеоты трудно культивировать и изучать в лаборатории, геномное секвенирование позволяет предположить, что они являются подвижными гетеротрофами . [6]

Хотя ранее считалось, что эвриархеоты обитают только в экстремальных условиях (с точки зрения температуры, содержания соли и/или pH), статья Корженкова и др., опубликованная в январе 2019 года, показала, что эвриархеоты также живут в умеренных условиях, например, в низкотемпературных условиях. кислые среды. В некоторых случаях количество эвриархей превышало численность присутствующих бактерий. [7] Эвриархеоты также были обнаружены в других умеренных средах, таких как водные источники, болота, почва и ризосферы . [8] Некоторые эвриархеоты хорошо адаптируются; Отряд под названием Halobacteriales обычно встречается в чрезвычайно соленой и богатой серой среде, но может также расти и при такой низкой концентрации соли, как морская вода (2,5%). [8] В ризосферах присутствие эвриархей, по-видимому, зависит от присутствия микоризных грибов ; более высокая популяция грибов коррелировала с более высокой частотой и разнообразием эвриархей, тогда как отсутствие микоризных грибов коррелировало с отсутствием эвриархеот. [8]

Номенклатура

[ редактировать ]

В 2022 году предложенное царство Methanobacteriati было введено вместо Euryarchaeota, которое было признано таксономически недействительным. [9]

Филогения

[ редактировать ]

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [10] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [11]

на основе 16S рРНК ДП _12_2021. [12] [13] [14]
Архея

Другие филогенетические анализы показали, что археи клады DPANN также могут принадлежать к Euryarchaeota и что они могут даже представлять собой полифилетическую группу, занимающую разные филогенетические позиции внутри Euryarchaeota. Также обсуждается, тип Altiarchaeota в DPANN или Euryarchaeota. следует ли классифицировать [15] Кладограмма, обобщающая это предложение, представлена ​​ниже. [16] [17] Группы, отмеченные в кавычках, представляют собой линии, отнесенные к DPANN, но филогенетически отделенные от остальных.

Домбровский и др. 2019, [15] Джордан и др. 2017 год [16] и Кавальер-Смит 2020. [17]

Третья филогения, 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214. [18] [19] [20]

Эвриархеота сс

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Вёзе Ч.Р., Кандлер О., Уилис М.Л. (июнь 1990 г.). «На пути к естественной системе организмов: предложение по доменам архей, бактерий и эукариев» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (12): 4576–9. Бибкод : 1990PNAS...87.4576W . дои : 10.1073/pnas.87.12.4576 . ПМК   54159 . ПМИД   2112744 .
  2. ^ Кастель Си Джей, Банфилд Дж. Ф. (2018). «Основные новые группы микробов расширяют разнообразие и меняют наше понимание Древа Жизни» . Клетка . 172 (6): 1181–1197. дои : 10.1016/j.cell.2018.02.016 . ПМИД   29522741 .
  3. ^ Хоган CM (2010). Э. Моноссон, К. Кливленд (ред.). «Архея» . Энциклопедия Земли . Национальный совет по науке и окружающей среде . Проверено 18 августа 2017 г.
  4. ^ Линкольн С.А., Вай Б., Эппли Дж.М., Чёрч М.Дж., Summons RE, DeLong EF (июль 2014 г.). «Планктонные эвриархеоты являются важным источником архейных тетраэфирных липидов в океане» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (27): 9858–63. Бибкод : 2014PNAS..111.9858L . дои : 10.1073/pnas.1409439111 . ПМК   4103328 . ПМИД   24946804 .
  5. ^ Jump up to: а б Гэррити, Холт Дж.Г. (2015). «Euryarchaeota phy. nov.». В Whitman WB (ред.). Руководство Берджи по систематике архей и бактерий . Джон Уайли и сыновья . дои : 10.1002/9781118960608 . ISBN  9781118960608 .
  6. ^ Айверсон В., Моррис Р.М., Фразар К.Д., Бертиаум К.Т., Моралес Р.Л., Армбруст Е.В. (февраль 2012 г.). «Распутывание геномов из метагеномов: выявление некультивируемого класса морских эвриархей». Наука . 335 (6068): 587–90. Бибкод : 2012Sci...335..587I . дои : 10.1126/science.1212665 . ПМИД   22301318 . S2CID   31381073 .
  7. ^ Корженков А.А., Тощаков С.В., Баржела Р., Гиббард Х., Феррер М., Теплюк А.В., Джонс Д.Л., Кубланов И.В., Голышин П.Н., Голышина О.В. (январь 2019 г.). «Археи доминируют в микробном сообществе в экосистеме с температурой от низкой до умеренной и чрезвычайной кислотностью» . Микробиом . 7 (1): 11. дои : 10.1186/s40168-019-0623-8 . ПМК   6350386 . ПМИД   30691532 .
  8. ^ Jump up to: а б с Бомберг М., Тимонен С. (октябрь 2007 г.). «Распространение крен- и эвриархеот в микоризосферах сосны обыкновенной и гумусе бореальных лесов». Микробная экология . 54 (3): 406–16. Бибкод : 2007MicEc..54..406B . дои : 10.1007/s00248-007-9232-3 . ПМИД   17334967 . S2CID   19425171 .
  9. ^ Гёкер, Маркус; Орен, Аарон (22 января 2024 г.). «Действительная публикация названий двух доменов и семи царств прокариотов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 74 (1). дои : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN   1466-5026 .
  10. ^ Эузеби Ж.П. «Эвриархеота» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). Архивировано из оригинала 9 августа 2017 г. Проверено 9 августа 2017 г.
  11. ^ Сэйерс; и др. «Эвриархеота» . Браузер таксономии . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 августа 2017 г.
  12. ^ «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2021 г.
  13. ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 23 февраля 2021 г.
  14. ^ «Примечания к выпуску LTP_12_2021» (PDF) . Проверено 23 февраля 2021 г.
  15. ^ Jump up to: а б Нина Домбровски, Джун-Хо Ли, Том А. Уильямс, Пьер Оффре, Аня Спан (2019). Геномное разнообразие, образ жизни и эволюционное происхождение архей DPANN . Природа.
  16. ^ Jump up to: а б Джордан Т. Берд, Бретт Дж. Бейкер, Александр Дж. Пробст, Мирча Подар, Карен Г. Ллойд (2017). Независимые от культуры сравнения геномов выявили адаптацию Altiarchaeales к окружающей среде . Границы.
  17. ^ Jump up to: а б Кавалер-Смит, Томас; Чао, Эма Э-Юнг (2020). «Мультидоменные рибосомальные белковые деревья и планктобактериальное происхождение неомуры (эукариоты, архебактерии)» . Протоплазма . 257 (3): 621–753. дои : 10.1007/s00709-019-01442-7 . ПМК   7203096 . ПМИД   31900730 .
  18. ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 6 декабря 2021 г.
  19. ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
  20. ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 6 декабря 2021 г.
  21. ^ Анья Спанг, Ева Ф. Касерес, Тийс Дж. Г. Эттема: Геномное исследование разнообразия, экологии и эволюции архейной области жизни . В: Science Volume 357 Issue 6351, eaaf3883, 11 августа 2017 г., doi:10.1126/science.aaf3883
  22. ^ Sometines с ошибкой в ​​написании Theinoarchaea: Кэтрин Бадель, Гаэль Эраузо, Анника Л. Гомес, Райан Кэтчпол, Матье Гонне, Жак Оберто, Патрик Фортер, Виолетт Да Кунья: Глобальное распространение и история эволюции семейства архейных плазмид pT26-2 . В кн.: Экологическая микробиология. sfam 10 сентября 2019 г. doi:10.1111/1462-2920.14800
  23. ^ NCBI: Кандидат Посейдония (класс)

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 948a3528d9dea3f09f27094500da57e0__1721237040
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/94/e0/948a3528d9dea3f09f27094500da57e0.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Euryarchaeota - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)