Десмонд Дж. Хиггинс
Дес Хиггинс | |
---|---|
Рожденный | Десмонд Джерард Хиггинс 17 июля 1959 г. [ 7 ] |
Альма-матер | Тринити-колледж, Дублин (доктор философии) |
Известный | |
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | |
Диссертация | Численная систематика крыловидных насекомых (1988). |
Научные консультанты | Пол М. Шарп [ 5 ] [ 6 ] |
Веб-сайт |
Хиггинс — профессор биоинформатики Десмонд Джерард Университетского колледжа Дублина . [ 3 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] широко известен благодаря CLUSTAL , [ 15 ] серия компьютерных программ для выполнения множественного выравнивания последовательностей . Согласно журналу Nature , статьи Хиггинса, описывающие CLUSTAL [ 10 ] [ 11 ] входят в десятку самых цитируемых научных работ всех времен. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]
Образование
[ редактировать ]Хиггинс получил образование в Тринити-колледже в Дублине. [ 19 ] где в 1988 году ему была присуждена степень доктора философии за исследования в области числовой систематики крыловидных насекомых . [ 20 ]
Исследовать
[ редактировать ]Исследования в лаборатории Хиггинса [ 3 ] фокусируется на разработке новых биоинформатических и статистических инструментов для эволюционной биологии . Программа CLUSTAL для множественного выравнивания последовательностей была разработана в лаборатории Хиггинса, а программное обеспечение T-Coffee изначально было разработано в лаборатории совместно с Седриком Нотредамом. Многомерная статистика используется для анализа наборов данных микрочипов и молекулярной эволюции, такой как эволюция промоторов , интронов и некодирующей РНК . [ 12 ] [ 19 ]
Награды и почести
[ редактировать ]Хиггинс был избран членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB) в 2015 году. [ 1 ] В 2016 году он был награжден премией Кимуры Мотоо за вклад в развитие эволюционной биологии и молекулярной филогении. [ 21 ] В 2018 году Хиггинс получил Премию Бенджамина Франклина за открытый доступ в области наук о жизни. [ 2 ] В марте 2023 года Хиггинс был награжден премией Леннарта Филипсона в знак признания его большого вклада в развитие биоинформатических технологий, основанных на множественном выравнивании последовательностей. [ 22 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Стипендиаты ISCB» . Международное общество вычислительной биологии. Архивировано из оригинала 15 апреля 2015 года.
- ^ Jump up to: а б «Премия Бенджамина Франклина — Bioinformatics.org» . www.bioinformatics.org . Проверено 16 марта 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с Публикации Десмонда Г. Хиггинса, проиндексированные Google Scholar
- ^ Jump up to: а б Нотредам, CD; Хиггинс, Д.Г.; Херинга, Дж. (2000). «Т-кофе: новый метод быстрого и точного выравнивания множественных последовательностей». Журнал молекулярной биологии . 302 (1): 205–17. дои : 10.1006/jmbi.2000.4042 . ПМИД 10964570 . S2CID 10189971 .
- ^ «Дес Хиггинс, доктор философии: Дерево вычислительной биологии» . Academictree.org . Архивировано из оригинала 14 июля 2017 года.
- ^ Шарп, Пол М.; Коу, Элизабет; Хиггинс, Десмонд Г .; Шилдс, Денис К.; Вулф, Кеннет Х .; Райт, Фрэнк (1988). «Способы использования кодонов у Escherichia coli, Bacillus subtilis, Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Drosophila melanogaster и Homo sapiens; обзор значительного внутривидового разнообразия» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (17): 8207–8211. дои : 10.1093/нар/16.17.8207 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 338553 . ПМИД 3138659 .
- ^ Дес Хиггинс в Библиотеке Конгресса
- ^ Хиггинс, Десмонд Г.; Шарп, Пол М. (1988). «CLUSTAL: пакет для выполнения множественного выравнивания последовательностей на микрокомпьютере». Джин . 73 (1): 237–244. дои : 10.1016/0378-1119(88)90330-7 . ПМИД 3243435 .
- ^ Хиггинс, Десмонд Г.; Шарп, Пол М. (1989). «Быстрое и чувствительное выравнивание множественных последовательностей на микрокомпьютере». Биоинформатика . 5 (2): 151–153. дои : 10.1093/биоинформатика/5.2.151 . ПМИД 2720464 .
- ^ Jump up to: а б Томпсон, доктор медицинских наук; Гибсон, Ти Джей; Плевняк, Ф.; Жанмуген, Ф.; Хиггинс, Д.Г. (1997). «Оконный интерфейс CLUSTAL_X: гибкие стратегии выравнивания множественных последовательностей с помощью инструментов анализа качества» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (24): 4876–4882. дои : 10.1093/нар/25.24.4876 . ПМК 147148 . ПМИД 9396791 .
- ^ Jump up to: а б Томпсон, доктор медицинских наук; Хиггинс, Д.Г.; Гибсон, Ти Джей (1994). «CLUSTAL W: Улучшение чувствительности прогрессивного множественного выравнивания последовательностей за счет взвешивания последовательностей, штрафов за пробелы для конкретной позиции и выбора весовой матрицы» . Исследования нуклеиновых кислот . 22 (22): 4673–4680. дои : 10.1093/нар/22.22.4673 . ПМК 308517 . ПМИД 7984417 .
- ^ Jump up to: а б «Профессор Десмонд Джерард Хиггинс, бакалавр (мод.), доктор философии» . Дублин: Университетский колледж Дубина. Архивировано из оригинала 5 апреля 2015 года.
- ^ «Лаборатория Деса Хиггинса» . Университетский колледж Дублина. Архивировано из оригинала 14 декабря 2014 года.
- ^ Десмонда Г. Хиггинса Публикации из Европы PubMed Central
- ^ Дес Хиггинс: Визуализация множественных выравниваний последовательностей на YouTube , Broad Institute
- ^ Ван Ноорден, Р.; Махер, Б.; Нуццо, Р. (2014). «100 лучших статей: Nature исследует самые цитируемые исследования всех времен» . Природа . 514 (7524): 550–3. дои : 10.1038/514550a . ПМИД 25355343 .
- ^ Гори, Колм (2014). «Ирландский профессор Дес Хиггинс в десятке самых цитируемых статей всех времен» . Дублин: Siliconerepublic.com. Архивировано из оригинала 5 июня 2015 года.
- ^ Публикации Десмонда Г. Хиггинса , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Jump up to: а б Дес Хиггинс ОРЦИД 0000-0002-3952-3285
- ^ Хиггинс, Дес (1981). Численная систематика крыловидных насекомых (кандидатская диссертация). Тринити-колледж, Дублин. OCLC 842505334 . ПроКвест 301410442 .
- ^ «Профессор Дес Хиггинс получит премию Кимуры Мотоо» . Медицинская школа UCD . Проверено 31 мая 2021 г.
- ^ «Объявлены награды выпускников EMBL на 2023 год» . Награды выпускников EMBL . 29 марта 2023 г. Проверено 31 марта 2023 г.