AIR-синтетаза (FGAM-циклаза)

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Фосфорибозилформилглицинамидинциклолигаза
Фосфорибозилформилглицинамидинциклолигаза
Идентификаторы
Номер ЕС.	6.3.3.1
Номер CAS.	9023-53-4
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
Экспаси	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Фосфорибозилформилглицинамидинциклолигаза ( AIR-синтетаза ) — пятый фермент ( EC 6.3.3.1 ) в de novo синтезе пуриновых нуклеотидов . Он катализирует реакцию образования 5-аминоимидазолриботида (AIR) из формилглицинамидинрибонуклеотида FGAM. Эта реакция замыкает кольцо и образует 5-членное имидазольное кольцо пуринового ядра (AIR):

АТФ + 2-(формамидо)-N1-(5-фосфо-β-D-рибозил)ацетамидин

\rightleftharpoons

АДФ + 5-амино-1-(5-фосфо-β-D-рибозил)имидазол + фосфат + H ⁺

АИР-синтетаза катализирует перенос кислорода формильной группы на фосфат. Это последовательный механизм, при котором АТФ сначала связывается с ферментом, а АДФ высвобождается последним. Этот фермент гидролизует АТФ, активируя кислород амида и осуществляя нуклеофильную атаку азота. У людей и многих других животных этот фермент содержится в трехфункциональном пуриновом биосинтетическом белке-полипептиде аденозин-3 .

Номенклатура

Систематическое название этого класса ферментов — 2-(формамидо)-N1-(5-фосфорибозил)ацетамидинциклолигаза (АДФ-образующая). Другие широко используемые имена включают:

АИР-синтетаза,
5'-аминоимидазолрибонуклеотидсинтетаза,
2-(формамидо)-1-N-(5-фосфорибозил)ацетамидинциклолигаза (АДФ-образующая),
фосфорибозиламиноимидазолсинтетаза и
фосфорибозилформилглицинамидинциклолигаза.

Синтез пуринов

Пурины — один из двух типов азотистых гетероциклических оснований, которые являются одним из трех компонентов нуклеотидов, входящих в состав нуклеиновых кислот. Синтез может происходить de novo или вторично — AIR-синтетаза является компонентом пути de novo . Первый обязательный этап пути de novo начинается с фосфорибозилпирофосфата (PRPP), а конечным продуктом является инозинмонофосфат (ИМФ). ИМФ в конечном итоге превращается в пурины АМФ или ГМФ. Пуриновая кольцевая структура состоит из присоединения 1 или 2 атомов одновременно к сахару рибозы. Путь de novo , как правило, сохраняется у большинства организмов.

Синтетаза AIR вигны

AIR-синтетаза обнаружена как в митохондриях , так и в пластидах ; митохондриальная форма содержит на 5 аминокислот больше, чем пластидная форма. ^{[ 1 ]} В вигне фермент кодируется одним геном, несмотря на то, что он существует в разных формах в пластидах и митохондриях. Это предполагает, что разные версии могут быть получены из одного транскрипта. Одно исследование предполагает, что существует жесткий транскрипционный контроль pur5, гена, кодирующего AIR-синтетазу. ^{[ 2 ]}

Ссылки

^ Гоггин Д.Е., Липскомб Р., Федорова Е., Миллар А.Х., Манн А., Аткинс К.А., Смит П.М. (март 2003 г.). «Двойная внутриклеточная локализация и нацеливание аминоимидазолрибонуклеотидсинтетазы в вигне» . Физиол растений . 131 (3): 1033–41. дои : 10.1104/стр.102.015081 . ПМЦ 166869 . ПМИД 12644656 .
^ Смит П.М., Манн А.Дж., Гоггин Д.Е., Аткинс Калифорния (апрель 1998 г.). «AIR-синтетаза в клубеньках вигны: продукт одного гена, нацеленный на две органеллы?». Завод Мол. Биол . 36 (6): 811–20. дои : 10.1023/А:1005969830314 . ПМИД 9520274 .

Дальнейшее чтение

Левенберг Б., Бьюкенен Дж. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XII. Структура, ферментативный синтез и метаболизм 5-аминоимидазолриботида». Ж. Биол. Хим . 224 (2): 1005–18. ПМИД 13405929 .
Левенберг Б., Бьюкенен Дж. М. (1957). «Биосинтез пуринов. XIII. Структура, ферментативный синтез и метаболизм (альфа-N-формил)-глицинамидинриботида». Ж. Биол. Хим . 224 (2): 1019–27. ПМИД 13405930 .
Ли С., Каппок Т.Дж., Стаббе Дж., Уивер Т.М., Илик С.Е. (1999). «Рентгеновская кристаллическая структура аминоимидазолрибонуклеотидсинтетазы (PurM) пути биосинтеза пуринов Escherichia coli при разрешении 2,5 А» . Структура . 7 (9): 1155–66. дои : 10.1016/S0969-2126(99)80182-8 . PMID 10508786 .

Внешние ссылки

AIR + синтетаза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[pmid12644656-1] Гоггин Д.Е., Липскомб Р., Федорова Е., Миллар А.Х., Манн А., Аткинс К.А., Смит П.М. (март 2003 г.). «Двойная внутриклеточная локализация и нацеливание аминоимидазолрибонуклеотидсинтетазы в вигне» . Физиол растений . 131 (3): 1033–41. дои : 10.1104/стр.102.015081 . ПМЦ 166869 . ПМИД 12644656 .

[pmid9520274-2] Смит П.М., Манн А.Дж., Гоггин Д.Е., Аткинс Калифорния (апрель 1998 г.). «AIR-синтетаза в клубеньках вигны: продукт одного гена, нацеленный на две органеллы?». Завод Мол. Биол . 36 (6): 811–20. дои : 10.1023/А:1005969830314 . ПМИД 9520274 .

[ 1 ]

[ 2 ]

v т и Ферменты : CO CS и CN лигазы ( EC 6.1-6.3)
6.1: Carbon-Oxygen	Aminoacyl tRNA synthetase Alanine Arginine Asparagine Aspartate Cysteine D-alanine—poly(phosphoribitol) ligase Glutamate Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine
6.2: Carbon-Sulfur	Succinyl coenzyme A synthetase Acetyl—CoA synthetase Long-chain-fatty-acid—CoA ligase
6.3: Carbon-Nitrogen	Glutamine synthetase Ubiquitin ligase Cullin Von Hippel–Lindau tumor suppressor UBE3A Mdm2 Anaphase-promoting complex UBR1 Glutathione synthetase CTP synthetase Adenylosuccinate synthase Argininosuccinate synthase Holocarboxylase synthetase GMP synthase Asparagine synthetase Carbamoyl phosphate synthetase I II Glutamate–cysteine ligase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)